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黄连属药用植物的数量分类学研究

中国药学杂志 1995年第1期30卷 7-9页

作者：孙红祥张昌禧吴远文浙江医科大学生药教研室浙江金华卫生学校

以黄连属药用植物７种２变种和１个待定种为１０个分类单位，以形态为主兼顾组织结构，列出３３项性状，对这些植物进行了数量分类。用单链法、全链法、中间距离法（β＝０，一０．２５）、重心法、类平均法等系统聚类方法，探索了这些... 详细信息

以黄连属药用植物７种２变种和１个待定种为１０个分类单位，以形态为主兼顾组织结构，列出３３项性状，对这些植物进行了数量分类。用单链法、全链法、中间距离法（β＝０，一０．２５）、重心法、类平均法等系统聚类方法，探索了这些植物彼此间的亲缘关系，认为西藏黄连与云南黄连有别，云南黄连应予成立。本研究结果为黄连属药用植物的分类和鉴定作参考。

关键词：黄连属药用植物数量分类

黄连属部分药用植物遗传多样性与亲缘关系的SCoT分析

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中国中药杂志 2017年第3期42卷 473-477页

作者：陈大霞王钰张雪潘媛李隆云重庆市中药研究院重庆400065 重庆市中药良种选育与评价工程技术研究中心重庆400065 重庆市中药资源学重点实验室重庆400065 中国中医科学院中药资源中心重庆分中心重庆400065

采用SCoT分子标记分析4种黄连属药用植物的遗传多样性和亲缘关系,并用POPGENE计算遗传参数,TREECONW软件进行聚类分析。结果表明:28条引物共检测到434条带,其中多态性条带430条;各遗传参数均表明黄连属药用植物种间的遗传多样性极为丰富... 详细信息

采用SCoT分子标记分析4种黄连属药用植物的遗传多样性和亲缘关系,并用POPGENE计算遗传参数,TREECONW软件进行聚类分析。结果表明:28条引物共检测到434条带,其中多态性条带430条;各遗传参数均表明黄连属药用植物种间的遗传多样性极为丰富(种间PPB=99.1%,N_a=1.990 6,N_e=1.329 3,H=0.212 2,I=0.337 8),但种内遗传多样性较低(种内PPB=16.8%,N_a=1.168 2,N_e=1.073 0,H=0.043 7,I=0.067 7);遗传分化系数G_(st)=0.794 0,说明79.4%的遗传变异来源于种间;同种黄连属药用植物的不同植株均聚在一起,证实SCoT分子标记可作为黄连属药用植物亲缘关系研究的有效方法之一。

关键词：黄连属 SCoT 药用植物亲缘关系

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黄连属(毛茛科)花的形态发生

植物学通报 2007年第1期24卷 80-86页

作者：辜天琪任毅陕西师范大学生命科学学院教育部药用植物资源与天然药物化学重点实验室陕西理工学院汉中723001

本文运用扫锚电子显微镜(SEM)观察了黄连属(Coptis)植物花的形态发生和发育过程,结果表明,该属植物所有的花部器官均为螺旋状发生,雄蕊为向心式发育,花瓣原基有微弱的延迟发育,心皮原基为对折型(即马蹄形),子房为半封闭类型,子房柄是在... 详细信息

本文运用扫锚电子显微镜(SEM)观察了黄连属(Coptis)植物花的形态发生和发育过程,结果表明,该属植物所有的花部器官均为螺旋状发生,雄蕊为向心式发育,花瓣原基有微弱的延迟发育,心皮原基为对折型(即马蹄形),子房为半封闭类型,子房柄是在发育过程中形成的。通过与其它具T-型染色体类群在花形态发生上的比较,认为黄连属表现出了某些原始的性状,这一结果与分子系统学研究认为黄连属为毛茛科的基部类群的结论一致。

关键词：黄连属毛莨科花形态发生

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黄连属植物DNA条形码研究

江西农业大学学报 2017年第6期39卷 1089-1095页

作者：李波刘俊闵道长何小慧李波超朱昌兰张志勇袁庆军吴丁江西农业大学农学院江西南昌330045 中国中医科学院中药资源中心北京100700 景德镇学院江西景德镇333000

本研究基于黄连属(Coptis Salisb.)的大尺度取样,全面评估了叶绿体DNA序列psb A-trn H和ycf1,及核DNA序列ITS和ETS在黄连属物种鉴定中的有效性。综合分析了不同候选序列的特征,计算种内种间遗传距离,评估序列的条形码间距,及构建邻接树... 详细信息

本研究基于黄连属(Coptis Salisb.)的大尺度取样,全面评估了叶绿体DNA序列psb A-trn H和ycf1,及核DNA序列ITS和ETS在黄连属物种鉴定中的有效性。综合分析了不同候选序列的特征,计算种内种间遗传距离,评估序列的条形码间距,及构建邻接树,发现各片段种内变异率都远小于种间变异率,4个片段都不存在明显的条形码间距,单一片段鉴定效率仅在47%~63%,而片段组合中,双片段组合ITS+ycf1具有最高的分辨率(达到79%),与3片段组合ITS+ETS+ycf1及4片段组合(ITS+ETS+ycf1+psb A-trn H)鉴定率相同,且能成功鉴定中药黄连的原植物,即三角叶黄连(***)、云南黄连(***)和黄连(***)。因此,笔者建议将ITS+ycf1序列组合作为中药黄连鉴定的标准条形码。

关键词： DNA条形码分子鉴定中药黄连属

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黄连属植物研究进展

安徽农业科学 2005年第7期33卷 1248-1250页

作者：杨俊宝彭正松杨军赵梅西华师范大学生命科学学院四川南充637002 南充市第五中学四川南充637000

从种类资源、产地分布、化学成分、生物学特性、组织细胞培养、分子水平的研究和保护措施等方面综述了黄连属植物的研究进展。由于黄莲属植物应用范围广,需求量大,特别是过度采挖已造成黄连属植物严重破坏,导致有些种已濒临绝灭。为此,... 详细信息

从种类资源、产地分布、化学成分、生物学特性、组织细胞培养、分子水平的研究和保护措施等方面综述了黄连属植物的研究进展。由于黄莲属植物应用范围广,需求量大,特别是过度采挖已造成黄连属植物严重破坏,导致有些种已濒临绝灭。为此,提出对黄连属植物应亟待开展的基础研究和应采取的相关保护措施。

关键词：黄连属种质资源进展

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国产黄连属植物的染色体核型分析

西北植物学报 2013年第5期33卷 931-938页

作者：黄骥陈浙夏志华商晗武上海师范大学生命与环境科学学院上海200234 中国计量学院浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室杭州310018

中国黄连属6种1变种分属叶掌状三全裂和叶掌状五全裂2个类群,前者包括三角叶黄连、峨眉黄连、云南黄连、黄连和其变种短萼黄连;而分布于滇东南的五裂黄连和产于台湾的五叶黄连则归于后者。采用根尖压片法和卡宝品红染色法,对除五叶黄连... 详细信息

中国黄连属6种1变种分属叶掌状三全裂和叶掌状五全裂2个类群,前者包括三角叶黄连、峨眉黄连、云南黄连、黄连和其变种短萼黄连;而分布于滇东南的五裂黄连和产于台湾的五叶黄连则归于后者。采用根尖压片法和卡宝品红染色法,对除五叶黄连外的中国黄连属5种1变种,以及日本黄连进行染色体核型比较分析,从细胞学角度为探讨中国黄连属植物的系统分类提供新的线索和证据。结果表明:(1)五裂黄连(2n=2x=18=2M+16m)、短萼黄连(2n=2x=18=8m+10sm)和日本黄连(2n=2x=18=12m+6sm)的染色体数目和核型均为首次报道。(2)7个材料的染色体基数均为9,除三角叶黄连为三倍体外,其余均为二倍体。(3)叶为掌状三全裂的二倍体种核型一致,为2A型,染色体类型以及不对称系数均很相似;叶为掌状五全裂的五裂黄连与五叶黄连的核型更接近,为1A型,核型特征的共性表明了这2个类群的自然属性。(4)三倍体三角叶黄连的不对称程度较高,核型为3A型,其染色体大小与峨眉黄连最接近。(5)根据核型不对称程度和染色体大小,结合地理分布,推测叶掌状五全裂种为本属的原始类群。

关键词：黄连属核型染色体亲缘关系

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黄连属植物系统发育及分类修订

黄连属植物系统发育及分类修订

作者：郑琛江西农业大学

学位级别：硕士

黄连属(Coptis Salisb)是毛茛科(Ranunculaceae)黄连族(***)多年生草本植物,全球有11-18种,主要分布于东亚和北美的暖温带和寒冷的针叶林。黄连属植物具有重要的药用价值,其中黄连是我国传统大宗中药,最早在《神农本草经》中被列为上品... 详细信息

黄连属(Coptis Salisb)是毛茛科(Ranunculaceae)黄连族(***)多年生草本植物,全球有11-18种,主要分布于东亚和北美的暖温带和寒冷的针叶林。黄连属植物具有重要的药用价值,其中黄连是我国传统大宗中药,最早在《神农本草经》中被列为上品,到现在为止有两千多年的入药史,然而,由于历代古籍记载的多样、民间各地主流用药的不同,中药黄连的植物来源错综复杂,伪混品较多,良莠不齐,正确鉴定中药材是中药材质量、安全用药及临床疗效的保障和前提。同时,受研究范围、研究方法、取样条件等影响,前人关于黄连属的系统发育研究尚不全面,物种间亲缘关系没有得到有效解析,属下分类系统也不完善,物种界定存在争议。为了全面探究黄连属的系统发育关系,确定本属物种数目,明确物种划分标准,本研究从全球范围内收集了111份黄连属植物样品,涵盖17种5变种,选取4个叶绿体DNA片段(mat K、rbc L、trn L-F和psb A-trn H)和1个核DNA片段(ITS),以黄连属的姊妹类群Xanthorhiza simphcissima为外类群,并利用最大似然法和贝叶斯法分别对核DNA矩阵和叶绿体DNA联合矩阵重建黄连属的系统发育关系,并以此为依据,结合文献考证、标本研究、形态学和解剖学观察,对黄连属进行全面的分类修订,主要研究结果如下:1、分别基于ITS矩阵和cp DNA联合矩阵构建的BI树和ML树均支持黄连属为一个单系类群,且所得到的拓扑结构总体一致:黄连属可以确定2个单系分支,CladeⅠ和Clade II。Clade I由2个小分支构成,其中一支包含所有三叶黄连***的个体,另一支由五叶黄连***及其近缘种***、***、***、*** ***、***、***构成。CladeⅡ由3个小分支构成,第一支包含特产北美的三个物种***、***和***,第二支是特产中国的五裂黄连***,第三支包括日本黄连***(Thunb.)Makino及其变种、***及中国大陆的5个种及1个变种。2、三角叶黄连***在ITS序列分析中与峨眉黄连构成姊妹群,而在叶绿体联合序列分析中与黄连亲缘关系更近,结合前人研究发现其为三倍体的结果,本文推测三角叶黄连很可能是黄连和峨眉黄连杂交而成,其中母本为黄连,父本为峨眉黄连。3、前人研究中***、***、***、***、***、*** ***与***仅存在形态上的差异,在本实验分别基于ITS序列和cp DNA序列构建的BI树和ML树显示,它们的个体没有聚成单独的单系分支,而是全部均嵌合在***的代表中,因此可以推断这些依据微小形态差异建立的种并不成立,它们实际上仅仅是***不同居群和个体间的变异,因此将它们全部处理为***的异名。4、传统分类中根据叶片形状的不同将日本地区黄连划分为2种3变种,分别为*** ***、*** ***、*** ***和***。本实验分别基于ITS序列和cp DNA序列构建的BI树和ML树的结果它们的个体在系统树上相互交错,整体上构成一个单系分支,但是每个类群的代表都无法聚为单独的小支,因此本文建议将*** ***、*** ***和***处理为***的异名。基于上述研究结果,本文最终确定全球黄连属植物有11种1变种:Coptis chinensis、Coptis chinensis ***、Coptis omeiensis、Coptis deltoidea、Coptis teeta、Coptis japonica、Coptis quinquesecta、Coptis laciniata、Coptis aspleniifolia、Coptis occidentalis、Coptis quinquefolia、Coptis trifolia,考证了各个名称的原始文献,基于标本对每个物种提供了详细的形态描述和地理分布,并编

关键词：黄连属毛茛科分子系统学系统发育分析分类学修订

黄连属植物叶绿体基因组序列分析及系统进化研究

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黄连属植物叶绿体基因组序列分析及系统进化研究

作者：袁婧西南大学

学位级别：硕士

黄连属（Coptis）是毛茛科（Ranunculaceae）的多年生草本植物,共约14种,主要分布在北温带,而多数产于亚洲东部。黄连属植物地下根茎常作为中药材,在《神农本草经》中列为上品,有清热燥湿,泻火解毒之功效,具较高的经济价值和较好的市场... 详细信息

黄连属（Coptis）是毛茛科（Ranunculaceae）的多年生草本植物,共约14种,主要分布在北温带,而多数产于亚洲东部。黄连属植物地下根茎常作为中药材,在《神农本草经》中列为上品,有清热燥湿,泻火解毒之功效,具较高的经济价值和较好的市场前景。目前中药材市场比较混乱,产品质量的优劣并存,混伪品普遍存在,为保证用药安全和人们的身体健康,中药材真伪鉴定和质量检测的技术越来越受到学者的关注和研究。在以往研究中黄连的鉴定主要集中在形态鉴定和活性物质检测上,具有样品要求高、花费时间长、结果人为性等特点。而分子鉴定具有精准、快速、成本低等优点,现已成为鉴定领域的常用手段和研究热点。叶绿体是植物细胞中重要的细胞器,其基因组具有序列高保守性和低碱基替换率。因此叶绿体基因组的研究便于筛选该属植物的高变异序列片段,是研究物种鉴定及系统进化发育的强有力工具。本研究中,我们组装并注释了短萼黄连（Coptis chinensis ***,MT773634）、三角叶黄连（Coptis deltoidea,MT576696）、峨眉黄连（Coptis omeiensis,MT773636）、日本黄连（Coptis japonica,MT773635）、云南黄连（Coptis teeta,MT773638）、五裂黄连（Coptis quinquesecta,MT773637）六种植物的叶绿体基因组,最终的基因组序列均提交至NCBI官网,同时下载了黄连（Coptis chinensis）的基因组序列（MK569483.1）,运用生物信息学技术对黄连7个种植物的叶绿体基因组进行比较分析、序列片段鉴定能力评估以及该属系统发育分析。最终本文为该属叶绿体基因组的进一步深入研究提供了数据支持,为物种鉴定提供了新思路,也为毛茛科植物系统进化发育提供了研究基础。本研究的主要内容及结果如下:（1）黄连属7个物种的叶绿体基因组呈现四分体结构（LSC/IRa/SSC/IRb）,各物种长度存在较小差异（154,156 bp-154,985 bp）。其叶绿体基因组共编码131个基因,其中包括86个蛋白编码基因,37个t RNA基因和8个r RNA基因。其中23个含内含子的基因共含有27个内含子,包含rps12这个反式剪切基因。蛋白编码基因的密码子数目差异性较小（26,494-26,652个）。编码最多的氨基酸是亮氨酸,最少的是半胱氨酸。蛋白编码基因编码的RSCU值相似,均有31种偏好密码子（RSCU＞1）。叶绿体基因组中共识别出直接重复65个、串联重复77个、回文重复97个。此外,还识别出单核苷酸SSR（1004个）、二核苷酸SSR（96个）、三核苷酸SSR（41个）、四核苷酸SSR（60个）、五核苷酸SSR（5个）以及六核苷酸SSR（4个）。此外,黄连属7个物种的叶绿体基因组在IR/SC边界存在较小差异。（2）黄连属7个物种叶绿体基因组的序列相似性分析表明其存在差异。编码区比非编码区保守,IR区域的核苷酸多态性明显低于LSC区和SSC区。ycf1基因具有多个变异位点,是高度变异的基因。本研究中,推荐变异率最高而长度适中的trn H-GUG-psb A、pet A-psb J、ccs A-ndh D、ndh F-rpl32等4个基因间隔区作为黄连属植物的特异性DNA条形码。系统发育分析表明,7种黄连聚在一起,形成一个单系群。在我们的两个系统发育树（ML树和NJ树）中,五裂黄连处于最基部,其次是日本黄连,云南黄连和峨眉黄连。三角叶黄连、黄连和短萼黄连遗传距离差距很小,这三个物种可能具有较为紧密的亲缘关系。

关键词：叶绿体基因组物种鉴定系统发育分析 DNA条形码黄连属

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基于群体遗传学的黄连属DNA条形码研究

基于群体遗传学的黄连属DNA条形码研究

作者：刘晓光山东中医药大学

学位级别：硕士

目的：基于群体遗传学的黄连属DNA条形码研究：①验证DNA条形码用于黄连属药用植物种间鉴别的可行性,进而探讨DNA条形码用于药用植物近缘种鉴别的可行性,特别是对栽培药用植物种间鉴别的可行性;②构建黄连属下各种间的遗传进化关系;③... 详细信息

目的：基于群体遗传学的黄连属DNA条形码研究：①验证DNA条形码用于黄连属药用植物种间鉴别的可行性,进而探讨DNA条形码用于药用植物近缘种鉴别的可行性,特别是对栽培药用植物种间鉴别的可行性;②构建黄连属下各种间的遗传进化关系;③推断三角叶黄连和黄连的栽培起源。方法：我国黄连属共有6种和1变种,本研究共采集了分布于我国大陆地区的黄连属中常药用的4种和1变种[峨眉黄连Coptis omeiensis’(Chen) C. Y. Chenf、三角叶黄连Copt is deltoidea C. Y. Cheng et Hsiao、云南黄连Coptis teeta Wall、黄连Coptis chinensis Franch及短萼黄连Coptis chinensis var. brevisepala]的230株个体,提取DNA后进行叶绿体基因片段rbcL、matK、trnH-psbA和核基因片段ITS的PCR扩增和测序,ITS片段测序中出现杂合现象的个体进行单克隆后再次测序。所有测序结果用ContigExpress和BioEdit v.7进行序列比对。在MEGA4中基于K2P(Kimura2-parameter)模型计算所得测序结果的种内平均遗传距离和种间平均遗传距离,用于评价黄连属种内及种间的变异关系。运用DnaSP软件分析所选4条片段序列中所包含的基因型,并用Network4.***.0.0.软件构建基因型网状进化树。结果：ITS,matK, trnH-psbA和rbcL4个条片段仅能将黄连属4种1变种中的云南黄连与其它种区分开,3条叶绿体基因片段对黄连属药用植物的种间鉴别能力均为20%, ITS核内基因片段的鉴别能力为20%-40%,所以4个片段均不适于黄连属内种间水平的区分。运用DnaSP软件在4条片段(rbcL、matK、trnH-psbA和ITS)序列汇总矩阵中总结出所包含的基因型数目分别为6,12,19和11种,各基因型代表序列已提交至Gen-Bank中并获得了相应的序列号。运用Network4.***.0.0.软件构建的4个片段基因型网状进化树显示除云南黄连外的3个种和1个变种并未分布在单一进化枝上,峨眉黄连、三角叶黄连和黄连具有共有基因型。由黄连属中栽培居群单克隆后数据可知,黄连属栽培居群的个体中出现核内基因ITS片段基因型具有较高多样性的特征,并且种间具有较多共有基因型。结论：①本研究基于群体遗传学的黄连属DNA条形码研究表明,4条候选片段均不能将黄连属各种区分开,与近年来在同一种内的采样个体数量不足的情况下的黄连属DNA条形码研究中获得的结果并不一致。要运用DNA条形码技术对以黄连属为代表的药用植物近缘种特别是栽培种进行鉴别时,应该基于群体遗传学进行DNA条形码的研究,根据所得数据分析种间及种内遗传进化关系而后检验所研究对象是否具有单系性,而后再进一步进行种间鉴别。 ②分析所得基因型网状进化树可知,黄连、峨眉黄连、三角叶黄连和短萼黄连具有共有基因型,此3种和1变种在遗传进化上并未分布在单一进化枝上,并未表现出单系性而表现为多系群。分析黄连属中栽培居群单克隆后数据可知,黄连属栽培居群的个体中出现核内基因ITS片段基因型具有较高多样性的特征,并且种间具有较多共有基因型,由此可推断栽培过程中黄连属种间种质混杂导致种间反复杂交并且不断处于致同进化不完全状态。 ③分析本研究所得基因型网状进化树后,可知三角叶黄连分别与黄连和峨眉黄连具有较多共有基因型,短萼黄连与黄连也具有共有基因型,由此可初步推断三角叶黄连是由黄连和峨眉黄连杂交起源而来,短萼黄连可能是黄连栽培起源的祖先之一。

关键词：黄连属 DNA条形码药用植物群体遗传学