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瓜类果斑病菌致病基因及靶标基因的预测

植物保护 2012年第5期38卷 100-104页

作者：严婉荣王铁霖戴良英杨玉文王建玉赵廷昌湖南农业大学生物安全科学技术学院长沙410128 中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室北京100193 新疆兵团农六师农科所五家渠831300

哈密瓜果斑病是严重危害瓜类的种传细菌性病害,其病原菌为嗜酸菌属西瓜种(Acidovorax citrulli)。本文首先用Bioedit软件建立瓜类果斑病菌全氨基酸序列本地资源库,运用比较基因组学的方法,通过大量查找嗜酸菌属、欧文氏菌属、假单胞菌... 详细信息

哈密瓜果斑病是严重危害瓜类的种传细菌性病害,其病原菌为嗜酸菌属西瓜种(Acidovorax citrulli)。本文首先用Bioedit软件建立瓜类果斑病菌全氨基酸序列本地资源库,运用比较基因组学的方法,通过大量查找嗜酸菌属、欧文氏菌属、假单胞菌属、黄单胞菌属、劳尔氏菌属、土壤杆菌属、木质部小菌属中的致病基因和参考文献中已报道的致病基因,下载相关致病基因的氨基酸序列,与瓜类果斑病菌的全氨基酸序列进行localblast,取E基因,得到果斑病菌中与致病性相关的基因,并对未知蛋白进行产物预测。同时,根据已经公布的靶标基因,用同样的比对方法,得到果斑病菌中潜在的靶标基因。本研究通过保守估计,得到77个致病性相关蛋白,预测了其中7个未知蛋白的产物,得到46个靶标蛋白。致病基因和靶标基因的分析预测,对以后研究此类基因提供了指导作用,为更好地防治该病害提供了理论基础。

关键词：瓜类果斑病菌致病基因靶标基因

miR825/825*靶标基因在蜡质芽孢杆菌AR156诱导植物抗病中的功能及水稻OsAGO18互作蛋白的筛选

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miR825/825*靶标基因在蜡质芽孢杆菌AR156诱导植物抗病中的功能及...

作者：李夏南京农业大学

学位级别：硕士

蜡质芽孢杆菌（Bacillus cereus）AR156作为植物根围促生细菌（Plant Growth-Promoting Rhizobacterium,PGPR）,最主要的作用机制是诱导植物产生系统诱导抗病性（induced systemic resistance,ISR）,有效防治多种病害。小分子RNA是植物参与防卫反应的关键调节因子,课题组前期发现miR825/825*负调控AR156诱导拟南芥产生的ISR。本文主要探究miR825的靶标基因At5G44940和miR825*的靶标基因At5G38850、At3G04220、At5G40910在AR156介导的拟南芥ISR中的作用,以便进一步深入研究miRNA参与ISR的作用机制。小分子RNA与Argonaute（AGO）蛋白在植物与病原菌的相互作用中发挥重要的调节作用。已有实验证明OsAGO18参与水稻抗病毒防卫反应。本研究利用酵母双杂交和亲和纯化技术筛选水稻OsAGO18的互作蛋白,为深入研究OsAGOs参与植物防卫反应的分子机制提供基础。本文主要内容如下:1、miR825/825*靶标基因在AR156诱导拟南芥抗病中的功能。ISR是植物响应病原菌侵染的一种有效的防卫反应,而植物内源小分子RNA参与调控ISR的机理尚不明晰。本研究以AR156为生防菌,以拟南芥为模式植物,以灰霉病灰葡萄孢菌（Botrytis cinerea）和丁香假单胞菌番茄致病变种（Pseudomonay *** DC3000）为模式病原,进行互作研究,探究AR156的生防机理。本实验首先通过AR156对拟南芥灌根预处理后接种***,发现AR156能够诱导拟南芥产生有效的ISR来抵抗死体营养型病原菌灰霉菌的侵染,进一步揭示了 AR156介导植物产生对多种病原菌的诱导抗病性的作用机制。前期研究表明,AR156可以通过抑制miR825和miR825*的表达,激活其靶标基因,参与下游防卫反应,从而介导拟南芥产生抵抗细菌的ISR。为深入研究miR825/825*靶标基因参与AR156诱导ISR的调控机制,本研究选取miR825的靶标基因At5G44940（泛素蛋白连接酶）和miR825*的靶标基因At5G38850（R 基因,TIR-NBS-LRR 类）、At3G04220（R 基因,TIR-NBS-LRR 类）、At5G40910（R基因,TIR-NBS-LRR类）的T-DNA插入突变体,使用AR156灌根预处理Col-0野生型和这四种缺失突变体后接种Pst DC3000,通过致病性测定、防卫基因的表达、ROS积累和胼胝质沉积检测发现,这四种靶标突变体对Pst DC3000的抗性较Col-0野生型减弱;AR156预处理能够提升这四种靶标突变体对Pst DC3000的抗性。综上所述,miR825/825*靶标基因参与AR156诱导拟南芥抵抗细菌侵染的ISR。2、水稻OsAGO18互作蛋白的筛选与鉴定。本文通过研究OsAGO18与其互作蛋白之间的关系,旨在进一步探究OsAGO18参与植物抗病反应的作用机制。本研究尝试了利用酵母双杂交技术,构建水稻日本晴cDNA文库,筛选诱饵蛋白OsAGO18的互作蛋白。在酵母筛选培养基上初步筛选得到的70个酵母单菌落。后期一对一酵母双杂互作验证结果显示这些蛋白并非真正与OsAGO18互作的蛋白。因此本实验又使用了免疫共沉淀结合液相色谱-串联质谱的方法鉴定了 OsAGO18物理互作蛋白。共得到257个互作蛋白。我们对其中的8个候选蛋白（蛋白翻译起始因子OsIF4A1、OsIF3G;延伸因子OsEF1D1;抗坏血酸过氧化物酶OsAPX2;14-3-3类似蛋白OsGF14F;超氧化物歧化酶OsSODA1;热激蛋白OsHAP81-3;过氧化氢酶OsCatA）进行了结构分析,并通过Co-IP方法验证了 OsIF4A1与OsAGO18的互作关系。该成果为后续研究OsAGO18的功能提供基础。

关键词： miR825/825* 靶标基因蜡质芽孢杆菌AR156 诱导系统抗病性 OsAGO18 互作蛋白

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二斑叶螨抗药性监测及靶标基因突变频率研究

二斑叶螨抗药性监测及靶标基因突变频率研究

作者：徐丹丹中国农业科学院

学位级别：硕士

二斑叶螨Tetranychus urticae Koch是一种世界性的重要农业害螨,其寄主范围广泛,可以危害至少1100种作物,常见的寄主植物包括蔬菜、果树、花卉、棉花、玉米等。二斑叶螨常以成螨和幼若螨群集在植物叶背进行为害,通过口针穿破植物叶片的... 详细信息

二斑叶螨Tetranychus urticae Koch是一种世界性的重要农业害螨,其寄主范围广泛,可以危害至少1100种作物,常见的寄主植物包括蔬菜、果树、花卉、棉花、玉米等。二斑叶螨常以成螨和幼若螨群集在植物叶背进行为害,通过口针穿破植物叶片的表皮细胞来刺吸植物汁液,最终致使植物叶片干枯、脱落,从而影响作物的质量和产量。化学药剂是目前防控二斑叶螨的主要措施之一,但生产上常存在施药随意、不科学不合理的选择施药、或单一使用某类化学药剂等问题,由此导致二斑叶螨对多种化学药剂均产生了不同程度的抗药性。靶标抗性是叶螨抗药性最重要的抗性机制之一,近年来已有研究报道叶螨抗性靶标基因的点突变可导致叶螨产生抗药性。在本研究中,首先采用优化的琼脂浸叶法监测了我国二斑叶螨不同田间种群对12种杀虫杀螨剂的抗性水平,明确了不同地区田间二斑叶螨的抗药性现状;针对二斑叶螨的阿维菌素抗性田间种群,建立了二斑叶螨对阿维菌素抗性相关的酶切扩增多态性序列(Cleaved Amplified Polymorphic Sequence,简称CAPS)和环介导等温扩增法(Loop-Mediated Isothermal Amplification,简称LAMP)快速检测技术,实现了田间二斑叶螨种群对阿维菌素抗性的快速检测和早期预警;采用分子生物学方法对二斑叶螨田间种群不同抗性靶标基因的点突变及其频率进行普查和检测,揭示了我国二斑叶螨对不同化学药剂产生抗药性的分子基础。本研究主要内容和结果如下。1.通过优化的琼脂浸叶法对7个二斑叶螨田间种群开展12种药剂的抗药性监测,结果表明,与室内相对敏感种群相比,所有检测种群均对阿维菌素表现为高或极高水平抗性(最高可达1809.51倍);对传统杀虫剂中的哒螨灵、联苯菊酯和丙溴磷三种药剂的抗性倍数很低,但其LC值很高(最高的达2783.89mg/L),说明这三种药剂对二斑叶螨的毒力低;对新型杀螨剂中的乙唑螨腈和乙基多杀菌素均表现为敏感度下降或敏感水平(RF基因,比较分析抗性和敏感种群中GluCl3序列的差异,确认了我国二斑叶螨田间种群中存在该基因326位置处甘氨酸到谷氨酸的突变(G326E)。基于该点突变,建立了二斑叶螨对阿维菌素抗性的CAPS和LAMP快速分子检测技术。CAPS检测技术中,将PCR产物用Hinf I限制性内切酶进行酶切,通过酶切后的条带个数直接判断所检测个体的基因型;LAMP检测技术中,可根据反应产物呈现的颜色来判定测试个体是否产生了明显抗性。3.基于二斑叶螨的抗性机制研究,采用多种分子生物学检测技术,对7个田间二斑叶螨种群的13个抗药性靶标基因的点突变进行了频率检测。结果表明,二斑叶螨室内相对敏感种群中并未检测到阿维菌素靶标基因GluCl相关的G314D或G326E点突变,7个田间种群中这两个位点的突变频率分别为28.33%-63.64%和0%-95%;对于有机磷类杀虫剂靶标基因Ace相关的G119S和A201S两个突变,敏感种群中存在50%的G119S突变频率,而7个田间种群中这两个位点的突变频率分别为33.33%-56.67%和5.00%-43.33%;对于菊酯类杀虫剂相关的靶标基因VGSC的L1024V、A1215D和F1538I三个突变位点,所有种群中均未检测到L1024V突变,而敏感种群中A1215D和F1538I两突变的突变频率分别为25%和81.67%,田间种群两位点的突变频率达70%以上。另外,所有测试的二斑叶螨种群,与联苯肼酯抗性相关的Cytb基因未发生突变。

关键词：二斑叶螨抗性监测靶标基因酶切扩增多态性序列(CAPS) 突变频率

植物病原黄单胞菌tal基因的分离与靶标基因的鉴定

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植物病原黄单胞菌tal基因的分离与靶标基因的鉴定

作者：黄坤炫上海交通大学

学位级别：硕士

棉花细菌性角斑病、大豆斑疹病以及菜豆和豇豆的细菌性疫病均是作物生态系统中重要的致灾性细菌性病害,分别由黄单胞菌属的棉花角斑病菌(Xanthomonas campestris ***,Xcm)、大豆斑疹病菌(*** ***,Xag)、菜豆细菌性疫病菌(*** ***,Xcp)... 详细信息

棉花细菌性角斑病、大豆斑疹病以及菜豆和豇豆的细菌性疫病均是作物生态系统中重要的致灾性细菌性病害,分别由黄单胞菌属的棉花角斑病菌(Xanthomonas campestris ***,Xcm)、大豆斑疹病菌(*** ***,Xag)、菜豆细菌性疫病菌(*** ***,Xcp)和豇豆细菌性疫病菌(*** ***,Xav)引起。与稻黄单胞菌等其他病原黄单胞菌一样,这些病原细菌都是通过体内保守的Ⅲ型分泌系统(Type-III secretion system,T3SS)将III型效应子(T3SS-secreted effectors,T3SEs)分泌到寄主细胞内,抑制寄主植物的免疫反应从而使寄主植物产生抗病性或感病性。T3SEs主要有两类,一类是转录活化类似因子(Transcription activation-like effectors,TALEs),另一类是Non-TALE效应蛋白,也称为Xop(Xanthomonas outer proteins)蛋白。已有研究发现,TALE蛋白通过作用于寄主植物中的靶标基因,决定了植物病害的症状和植物的抗(感)性。然而,棉花细菌性角斑病菌、大豆斑疹病菌以及菜豆和豇豆细菌性疫病菌中的TALE类型、数量和多样性,这些TALE蛋白在细菌致病性中的作用以及它们在寄主植物中的靶标基因,还少见报道。为此,本文以这4种黄单胞菌为对象,对它们中的tal基因进行了分离,并对它们在寄主植物中的作用靶标进行了鉴定。主要研究结果如下。1.四种黄单胞菌遗传操作体系的构建为了探明tal基因是否能够进行knock-out和knock-in等遗传学操作,本研究选择四种黄单胞菌代表菌株,即大豆斑疹病菌(Xag)的ATCC43911菌株、辣椒斑点病菌(Xav)ATCC19865菌株、菜豆细菌性疫病菌(Xcp)的ATCC49119菌株和棉花角斑病菌(Xcm)的Xss-V-18菌株,作为出发菌株。根据tal基因的高度保守性,构建了可用于同源交换的含转座子Tn5的p B-C8B::Tn5质粒。通过电转化法转入上述受体菌细胞中,再进行Km抗性筛选,发现该质粒可以进入该四种黄单胞菌中。鉴于C8B是来源于稻黄单胞菌的tal基因,推测具有Km抗性的克隆可能发生了tal基因间的同源重组。进一步提取大豆斑疹病菌(Xag)ATCC43911菌株中具有Km抗性的克隆的基因组,以tal基因中间区域的Sph I片段构建探针,进行Southern杂交。结果显示,ATCC43911菌株含有6个tal基因,在Tn5转座子插入后,tal基因的位置发生了变化,杂交信号条带数目增加,并且存在Tn5的单拷贝和双拷贝插入两种形式。这表明Tn5转座子成功插入了tal基因。tal基因Tn5插入突变体的构建为进一步分离和敲除tal基因以及鉴定其在致病性中的作用奠定了工作系统。2.棉花角斑病菌tal基因缺失突变体的获得和其在棉花上致病性的测定基于携带tal基因的Tn5转座子突变技术获得的黄单胞菌,只能实现tal基因的插入突变。为了获得tal基因的敲除,在自杀质粒p KMS1载体上构建了融合tal基因重复区域外左右两段臂的载体p KMSA1和p KMSA2。将p KMSA1通过电转化的方法导入Xss-V-18细胞中,通过Km抗性和蔗糖培养基筛选,获得了在NA上生长但对Km敏感的突变体。经过菌落-PCR筛选,获得了含tal基因融合片段的候选突变体。提取候选突变体的基因组,经Bam HI酶切后与tal基因的Sph I片段为探针进行Southern杂交,根据tal基因带谱,获得了M1、M2、M3和M4突变体。与野生型菌株tal基因带谱相比,M1突变体缺失tal3基因,M2缺失tal2基因,M3缺失tal2和tal4基因,M4缺失tal2、tal4、tal5和tal6基因。以M4为出发菌,利用p KMSA2进行剩余tal基因的敲除,按照上述筛选步骤,经过Southern杂交,获得了M5和M6突变体。M5突变体缺失了tal3,M6缺失全部6个tal基因。将突变体注射接种棉花子叶上,发现与野生型菌株相比,缺失了tal2的M2、缺失了tal2和tal4的M3、仅含有tal1的M5以及tal-free的M6菌株,其在棉花上的致病力明显降低,而M1和M4突变体在棉花上的致病力没有明显变化,推测tal2和tal1基因在决定棉花角斑病症状中发挥重要作用。相应地,棉花子叶中细菌生长量测定结果发现,在接种后的第四天,突变体的生长量显著低于野生型,而突变体之间无显著性差异。按照同样策略,还对菜豆细菌性疫病菌(Xcp)和豇豆细菌性疫病菌(Xav)的tal基因进行了敲除,获得了tal

关键词：棉花角斑病菌大豆斑疹病菌豆科细菌性疫病菌 tal基因靶标基因

Osa-miR 1436靶标基因的生物信息学分析

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贵州农业科学 2023年第3期51卷 66-72页

作者：胡嘉敏蒋鑫磊刘少春付海辉江西农业大学作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室江西南昌330045

【目的】水稻稻瘟病感染过程0 h、24 h与48 h的叶片miRNA进行高通量测序发现Osa-miR1436差异表达,探明miRNAs在水稻稻瘟病中的潜在功能,为Osa-miR1436在水稻稻瘟病发生中的功能与机理研究奠定分子基础。【方法】利用生物信息学软件psRNA... 详细信息

【目的】水稻稻瘟病感染过程0 h、24 h与48 h的叶片miRNA进行高通量测序发现Osa-miR1436差异表达,探明miRNAs在水稻稻瘟病中的潜在功能,为Osa-miR1436在水稻稻瘟病发生中的功能与机理研究奠定分子基础。【方法】利用生物信息学软件psRNA Target对前期研究发现的1个miRNA表达水平发生显著变化的Osa-miR1436靶向基因进行预测,并对这些靶标基因进行GO、KEGG富集。【结果】通过预测发现70个靶标基因,这些基因主要富集在细胞大分子复合体组装(cellular macromolecular complex assembly)、DNA复制(DNA replication)、细胞应激反应(cellular response to stress)等与水稻抗逆相关生物学过程。靶标基因均显著富集了3种motif,且motif数量呈motif 1>motif 2>motif 3。【结论】Osa-miR 1436可能通过靶向抗逆相关基因调控水稻稻瘟病的发生。

关键词： Osa-miR1436 水稻靶标基因生物信息学抗逆稻瘟病

结直肠癌患者靶标基因检测与化疗敏感性的相关性研究

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检验医学与临床 2018年第12期15卷 1817-1820页

作者：郭轶廖刚卢小刚重庆市中医院普外科 400021 重庆医科大学附属第一医院胃肠外科 400016

目的探讨结直肠癌(CRC)患者靶标基因检测与化疗敏感性的相关性及其临床意义。方法将2014年10月至2016年2月在重庆市中医院和重庆医科大学附属第一医院行术前新辅助化疗或术前术后伴远处转移化疗的85例CRC患者分为常规化疗组(41例)和基... 详细信息

目的探讨结直肠癌(CRC)患者靶标基因检测与化疗敏感性的相关性及其临床意义。方法将2014年10月至2016年2月在重庆市中医院和重庆医科大学附属第一医院行术前新辅助化疗或术前术后伴远处转移化疗的85例CRC患者分为常规化疗组(41例)和基因检测组(44例),常规化疗组按美国国家综合癌症网络指南制定化疗方案化疗,基因检测组按基因检测结果制定化疗方案,于2个周期后比较两组化疗效果及化疗不良反应。结果常规化疗组采用奥沙利铂、亚叶酸钙、氟尿嘧啶方案(FOLFOX方案)18例(43.9%),奥沙利铂、卡培他滨方案(XELOX方案)17例(41.5%),伊立替康、亚叶酸钙、氟尿嘧啶方案(FOLFIRI方案)6例(14.6%);基因检测组患者用FOLFOX方案12例(27.3%),XELOX方案11例(25.0%),FOLFIRI方案10例(22.7%),卡培他滨单药化疗11例(25.0%),两组化疗方案比较差异有统计学意义(P0.05)。常规化疗组化疗不良反应发生率高于基因检测组,差异有统计学意义(P基因检测可有效个体化评估化疗相关药物的有效性及毒性,制定更优化的化疗方案,减少联合用药,可以有效减少化疗不良反应,提高患者耐受性及依从性。

关键词：结直肠癌靶标基因化疗敏感性化疗不良反应

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基于靶标基因的鼠类系统分类学研究

中国媒介生物学及控制杂志 2016年第5期27卷 520-524页

作者：吴炳耀周鹏程何江崔北金陈峰孙立新江苏出入境检验检疫局医学媒介生物监测实验室/卫生监督处南京210001 安徽理工大学医学院安徽淮南232001 南通出入境检验检疫局江苏南通226000

随着生命遗传物质的破解,基于基因特征的生物分类学研究的迅速发展,适于生物分类学研究的各种靶标基因不断被发现。通过对鼠类分类学研究中的线粒体基因组和核基因组相关靶标基因的应用进行归纳与综述,为鼠类分类学鉴定与研究提供参考。

关键词：鼠类靶标基因分类学研究

苹果蠹蛾对颗粒体病毒抗性相关的microRNA及其靶标基因分析

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苹果蠹蛾对颗粒体病毒抗性相关的microRNA及其靶标基因分析

宁波市新型冠状病毒肺炎确诊病例SARS-CoV-2靶标基因水平及影响因素分析

第五届全国入侵生物学大会——入侵生物与生态安全

作者：席羽黄聪武强邢龙生万方浩中国农业科学院深圳农业基因组研究所中国农业科学院植物保护研究所

苹果蠹蛾(Codling moth,Cydiapomonella L.)是我国国家重点控制的检疫性外来入侵物种,对苹果、梨等仁果类水果产业造成巨大经济损失。苹果蠹蛾颗粒体病毒(Cydiapomonellagranulovirus,CpGV)制剂的应用是有机果园控制苹果蠹蛾的一项主要... 详细信息

苹果蠹蛾(Codling moth,Cydiapomonella L.)是我国国家重点控制的检疫性外来入侵物种,对苹果、梨等仁果类水果产业造成巨大经济损失。苹果蠹蛾颗粒体病毒(Cydiapomonellagranulovirus,CpGV)制剂的应用是有机果园控制苹果蠹蛾的一项主要生物防治措施。目前已有40多个果园中的苹果蠹蛾种群被报道产生了不同程度的抗性。研究发现不同种群的苹果蠹蛾对不同病毒株系的抗性机制存在差异,目前发现的多数种群抗性为性染色体Z连锁并显性遗传的I型抗性,但产生高抗性的分子机制仍未阐明,对病毒侵染的防御反应所涉及的作用通路与关键作用因子也未明确。microRNA (miRNA)作为生物体内重要的调控因子,在昆虫的抗病毒防御反应中发挥重要作用。在病毒侵染的过程中,miRNA及其靶标基因对昆虫和病毒间的相互作用和协同进化具有重要影响。本研究比较分析了敏感品系(CpS)和I型抗性品系(Cp RR1)经Cp GV-M病毒株系侵染前后的miRNA测序数据,确定了485个miRNA及其对应的1925个靶标基因。其中,敏感品系CpS侵染病毒后5个miRNA上调表达,18个miRNA下调表达;抗性品系CpRR1侵染病毒后16个miRNA上调表达,16个miRNA下调表达。结果分析表明,25个miRNA可能与CpGV病毒侵染相关;其中12个miRNA的预测靶标基因定位在Z染色体,可能与苹果蠹蛾对CpGV的抗性产生有关。目前miRNA以及靶标基因的验证工作以及进一步分析仍在进行中,但通过初步数据分析,仍可为我们进一步理解miRNA在病毒侵染过程中的潜在功能,以及阐明苹果蠹蛾对CpGV抗性机制提供数据支持及分析思路。

关键词：苹果蠹蛾苹果蠹蛾颗粒体病毒病毒侵染抗性 microRNA 靶标基因

来源： cnki会议评论

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预防医学 2020年第12期32卷 1213-1216页

作者：张丹丹傅小红焦素黎顾文珍许国章宁波市疾病预防控制中心浙江宁波315010

目的分析宁波市新型冠状病毒肺炎(COVID-19)病例确诊时严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)靶标基因水平及影响因素。方法通过中国疾病预防控制信息系统收集2020年1月21日—2月20日宁波市报告的COVID-19确诊病例人口学信息和临... 详细信息

目的分析宁波市新型冠状病毒肺炎(COVID-19)病例确诊时严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)靶标基因水平及影响因素。方法通过中国疾病预防控制信息系统收集2020年1月21日—2月20日宁波市报告的COVID-19确诊病例人口学信息和临床资料,通过宁波市疾病预防控制中心和定点医院收集确诊时SARS-CoV-2ORF1ab基因和N基因的Ct值;比较不同性别、年龄、症状严重程度、病例类型、病例来源、采样时间和采样部位的Ct值。结果收集157例COVID-19确诊病例资料,40~基因和N基因Ct值分别为29.96±5.28和30.38±4.90,均高于男性病例的27.56±4.94和28.03±4.88 (P基因和N基因的Ct值差异有统计学意义(P基因和N基因的Ct值均最低,分别为27.84±4.80和28.35±4.65。ORF1ab基因(rs=0.288,P=0.001)和N基因(rs=0.296,P=0.001) Ct值均与采样时间呈正相关。咽拭子和痰液标本检测的ORF1ab基因Ct值分别为29.19±4.85和28.74±6.40,N基因Ct值分别为29.61±4.60和29.22±6.10,差异均无统计学意义(P>0.05)。结论采样时间对SARS-CoV-2核酸ORF1ab基因和N基因的Ct值影响较大。

关键词：新型冠状病毒肺炎严重急性呼吸综合征冠状病毒2型核酸检测靶标基因