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用RAPD标记探讨金色果蝇复合种内的遗传分化

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动物学报 2001年第6期47卷 625-631页

作者：赵中明陆剑戴灼华北京大学生命科学学院北京100871

以随机扩增多态性DNA (RAPD)技术分析了金色果蝇复合种的 5个姊妹种 (Drosophileauraria、D .biauraria、D .triauraria、D .quadraria和D .subauraria)共 12个地理种群的遗传变异。在 4 0种 10碱基随机引物中有 3 0种引物对每个种群都... 详细信息

以随机扩增多态性DNA (RAPD)技术分析了金色果蝇复合种的 5个姊妹种 (Drosophileauraria、D .biauraria、D .triauraria、D .quadraria和D .subauraria)共 12个地理种群的遗传变异。在 4 0种 10碱基随机引物中有 3 0种引物对每个种群都可获得令人满意的扩增结果。在 161个RAPD标记中有 12 9个呈多态性。以遗传距离为尺度用UPGMA法构建了该复合种的聚类关系图。聚类分析结果表明 :D .subauraria处于聚类关系图的基部 ,为该复合种中最早分化的种类 ;其后才是D .biauraria的分化 ,而D .auraria和D .quadraria的分化相对较晚。此结果不支持以往认为D .quadraria为金色果蝇复合种祖先种的观点。RAPD分子标记为金色果蝇复合种的系统演化的研究提供了新的、更有价值的信息。

关键词：果蝇金色果蝇复合种 RAPD标记系统关系遗传分化

金色果蝇复合种系统发育与CG33465、CG8399、CG8841的时空表达及功能初探

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金色果蝇复合种系统发育与CG33465、CG8399、CG8841的时空表达及...

作者：李虹岑湖北大学

学位级别：硕士

本文利用所测得的金色果蝇复合种(Drosophila auraria species complex)5个姊妹种(D. auraria、***、***、***、***)的32个标记基因的序列数据,并以***为外群,运用最大似然法(ML)和贝叶斯法(Bayesian)分别独立和联合构建了金色果蝇复合... 详细信息

本文利用所测得的金色果蝇复合种(Drosophila auraria species complex)5个姊妹种(D. auraria、***、***、***、***)的32个标记基因的序列数据,并以***为外群,运用最大似然法(ML)和贝叶斯法(Bayesian)分别独立和联合构建了金色果蝇复合种5个姊妹种之间的系统发育关系树。通过多种检验方法结合最大似然法分析评估了数据质量,结果表明,所有基因数据对于解决金色果蝇复合种的亲缘关系都有较高的贡献值;而且发现联合序列分析构建的系统树相对独立分析更好地揭示了5个姊妹种间的系统发生关系：***最先分化,其次是D. quadraria分化,再次是***和***, ***最后分化,两种建树在果蝇的分化时间上十分相近。运用时空表达(gene expression profile)和p因子敲除法,初步探索了黑腹果蝇CG33465、CG8399、CG8841这3个未知基因的功能。选取卵、1龄幼虫、3龄幼虫、蛹,成虫五个不同时期以及头、胸、腹三个不同部位进行了表达量分析。用含p因子位点果蝇与含转座酶基因的果蝇杂交,筛选敲除目的基因的果蝇并推测基因功能。结果表明：三个基因在果蝇不同时期不同不部位的表达量都有差异,尤其是CG33465基因,其在黑腹果蝇的卵中表达较其它时期明显升高,达到了接近设置上限的相对亮度188.24。从卵到蛹各发育期的表达量都要明显高于成虫期。从组织部位来看,头部略高于胸部,但腹部的表达量明显低于其他两个部位。构建了CG33465基因敲除果蝇品系,观察发现其发育较迟缓,结合Flybase的功能预测、CG33465编码蛋白的三级结构预测以及本文的时空表达模式可以初步推测：CG33465基因主要参与果蝇的变态发育,特别是卵孵化幼虫的过程,可能具有丝氨酸类内肽酶活性(serine-type endopeptidase activity)。

关键词：金色果蝇复合种多基因联合分析系统发育黑腹果蝇时空表达 P转座因子

Drosophila auraria复合种Period基因Thr-Gly区段的初步研究

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Zoological Research 2002年第1期23卷 1-6页

作者：刘仲敏曾庆韬张亚平中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放研究实验室云南昆明650223 湖北大学生命科学学院湖北武汉430062

测定了金色果蝇复合种 (Drosophilaaurariaspeciescomplex) 5个姐妹种 (siblingspecies)和D rufa的period (per)基因的Thr Gly区段序列。该区段序列分析表明 :DNA序列的碱基组成拥有果蝇其他基因的共同特点 ;颠换数多于转换数 ,两两物... 详细信息

测定了金色果蝇复合种 (Drosophilaaurariaspeciescomplex) 5个姐妹种 (siblingspecies)和D rufa的period (per)基因的Thr Gly区段序列。该区段序列分析表明 :DNA序列的碱基组成拥有果蝇其他基因的共同特点 ;颠换数多于转换数 ,两两物种间的颠换率与转换率的总比值为 2～ 5 ,密码子第 3位的颠换与转换的比值为 2 5～ 5 ;同义替换 /异义替换 (Ks/Ka)值远大于 10 ,且有的物种间根本不存在非同义突变 ,低的Ka值说明该复合种的per基因Thr Gly区段在进化过程中可能承受着较强的选择压力。运用所得的核苷酸序列构建Drosophilaauraria复合种的系统发育树。

关键词：金色果蝇复合种 Period基因 Thr-Gly区段系统发生

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中国果蝇mtDNA RFLP的初步分析

遗传 1997年第S1期19卷 19-20页

作者：戴灼华陈娅北京大学生命科学学院细胞生物学及遗传学系

中国果蝇ｍｔＤＮＡＲＦＬＰ的初步分析戴灼华陈娅（北京大学生命科学学院细胞生物学及遗传学系，北京１００８７１）ＳｔｕｄｙｏｎｍｔＤＮＡＲＦＬＰｏｆＤｒｏｓｏｐｈｉｌａｔｒｉａｕｒａｒｉａＤａｉＺｈｕｏｈｕａＣｈｅｎＹａ... 详细信息

中国果蝇ｍｔＤＮＡＲＦＬＰ的初步分析戴灼华陈娅（北京大学生命科学学院细胞生物学及遗传学系，北京１００８７１）ＳｔｕｄｙｏｎｍｔＤＮＡＲＦＬＰｏｆＤｒｏｓｏｐｈｉｌａｔｒｉａｕｒａｒｉａＤａｉＺｈｕｏｈｕａＣｈｅｎＹａ（ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＣｅｌＢ...

关键词： mtDNA 地理种群初步分析金色果蝇复合种限制性类型遗传多态性 RFLP 遗传距离限制性内切酶图谱姊妹种