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自然杂志 1993年第2期 5-5页

继美法科学家分别绘出人类Y染色体和第21染色体长臂的图谱之后,人类基因组计划再传捷报:美国全国卫生研究所和法国人类多态性研究中心的科学家最近合作绘出了一张人类基因组遗传连锁图;紧接着,法国Gene thon工厂的科学家发表了一张“第... 详细信息

继美法科学家分别绘出人类Y染色体和第21染色体长臂的图谱之后,人类基因组计划再传捷报:美国全国卫生研究所和法国人类多态性研究中心的科学家最近合作绘出了一张人类基因组遗传连锁图;紧接着,法国Gene thon工厂的科学家发表了一张“第二代”人类遗传连锁图。这些成果表明人类基因组计划正不可阻挡地向着既定的目标挺进。

关键词：遗传连锁图基因组法国染色体组法兰西共和国人类

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根据遗传连锁图来分析桃子形态性状

国外作物育种 2002年第3期21卷 52-52页

作者：山本俊哉谢国禄等

玉米相对饱和遗传连锁图谱构建与一种新的AFLPs共显性分析方法探讨(英文)

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Acta Genetica Sinica 2005年第9期32卷 960-968页

作者：郝转芳李新海张世煌中国农业科学院作物育种栽培研究所北京100081

利用一个F2作图群体(X178×B73),首先构建了一个含有130个SSRs的玉米连锁框架图,然后用119个AFLPs位点增加图谱密度,得到一个全长1659·3cM,标记间平均间距6·66cM的玉米相对饱和连锁图。同时,对SSRs和AFLPs的一些遗传特性进行了分析,... 详细信息

利用一个F2作图群体(X178×B73),首先构建了一个含有130个SSRs的玉米连锁框架图,然后用119个AFLPs位点增加图谱密度,得到一个全长1659·3cM,标记间平均间距6·66cM的玉米相对饱和连锁图。同时,对SSRs和AFLPs的一些遗传特性进行了分析,探讨了AFLP标记进行共显性分析的一种新方法。分析表明SSRs和AFLPs分子标记具有多态性和可靠性高等特点,是构建高密度分子标记遗传连锁图的有效技术。加密的玉米遗传连锁图谱为比较基因组研究、数量性状位点(quantitativetraitloci,QTLs)克隆、杂种优势机理研究以及标记辅助选择等提供了技术基础。

关键词：玉米 SSR标记 AFLP标记遗传连锁图共显性分析

白菜型油菜和菜薹的InDel标记开发及其RILs群体遗传连锁图谱的构建

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园艺学报 2012年第8期39卷 1491-1500页

作者：孟霖刘博林良斌程峰王晓武武剑云南农业大学农学与生物技术学院昆明650201 中国农业科学院蔬菜花卉研究所北京100081

通过白菜型油菜‘R-O-18’和菜薹‘L58’的基因组重测序数据与白菜基因组的参考序列(‘Chiifu-401-42’的基因组序列)的比对,在全基因组范围内检测到了18479个短插入缺失变异位点(≤5bp)。从中挑选了500个插入/缺失片段为4～5bp的InDel... 详细信息

通过白菜型油菜‘R-O-18’和菜薹‘L58’的基因组重测序数据与白菜基因组的参考序列(‘Chiifu-401-42’的基因组序列)的比对,在全基因组范围内检测到了18479个短插入缺失变异位点(≤5bp)。从中挑选了500个插入/缺失片段为4～5bp的InDel变异位点,将其设计成InDel分子标记并进行试验验证,结果有452个标记通过PCR扩增出单一条带,但仅有106个在‘R-O-18’和‘L58’间表现出多态性,346个没有多态性,48个在PCR中没有扩增。亲本间具有多态性的106个InDel标记可用来检测以‘R-O-18’和‘L58’为亲本构建的RILs基因型,并构建了一张包含99个标记的遗传连锁图谱。

关键词：菜薹油菜白菜插入/缺失全基因组重测序 Illumina测序遗传连锁图

‘百农64’×‘京双16’小麦遗传连锁图谱构建

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西北植物学报 2006年第5期26卷 886-892页

作者：王竹林刘曙东刘惠远何中虎夏先春陈新民西北农林科技大学农学院陕西杨陵712100 中国农业科学院作物科学研究所国家小麦改良中心北京100081

通过对小麦品种‘百农64’×‘京双16’F3家系群体的SSR和AFLP分析,构建了含100个SSR标记(91个引物)和58个AFLP标记(12个引物)的小麦遗传连锁图,158个标记组成20个连锁群,覆盖小麦基因组3 114cM,标记间平均间距为19.7 cM.将前人未定位... 详细信息

通过对小麦品种‘百农64’×‘京双16’F3家系群体的SSR和AFLP分析,构建了含100个SSR标记(91个引物)和58个AFLP标记(12个引物)的小麦遗传连锁图,158个标记组成20个连锁群,覆盖小麦基因组3 114cM,标记间平均间距为19.7 cM.将前人未定位的12个SSR标记定位到了小麦遗传连锁图谱上.为小麦慢白粉病性等农艺性状的QTL分析打下了良好基础.

关键词：小麦遗传连锁图 SSR标记 AFLP标记

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鲤耐寒性状分子标记在遗传连锁图上的定位

大连水产学院学报 2003年第4期18卷 278-281页

作者：梁利群孙效文中国水产科学研究院黑龙江水产研究所黑龙江哈尔滨150070

与鲤Cyprinus(Cyprinus)carpioLinnaeus的抗寒性状相关的RAPD标记有6个,其中2个与荷包红鲤抗寒品系的抗寒性状相关,4个与抗寒大头鲤CyprinuspellegriniTchang的抗寒性状相关,且5N1451c标记被定位在第5号连锁组中。初步研究结果表明,鲤... 详细信息

与鲤Cyprinus(Cyprinus)carpioLinnaeus的抗寒性状相关的RAPD标记有6个,其中2个与荷包红鲤抗寒品系的抗寒性状相关,4个与抗寒大头鲤CyprinuspellegriniTchang的抗寒性状相关,且5N1451c标记被定位在第5号连锁组中。初步研究结果表明,鲤的抗寒性状是一种数量性状。

关键词：鲤耐寒性状遗传连锁图

利用AFLP和RAPD标记构建桃的遗传连锁图谱

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果树学报 2006年第5期23卷 766-769页

作者：乔飞王力荣范崇辉朱更瑞方伟超中国农业科学院郑州果树研究所郑州450009 西北农林科技大学园艺学院陕西杨凌712100

为了给进一步研究桃的遗传标记的定位打下基础,以毛桃北京2—7[Prunus persica(L．)***2-7]、山桃白花山碧桃[Prunus davidiana(Carr．)***]以及2者的F1代为试材,用RAPD、AFLP标记构建了北京2—7和白花山碧桃的遗传连锁图,分别覆盖221．... 详细信息

为了给进一步研究桃的遗传标记的定位打下基础,以毛桃北京2—7[Prunus persica(L．)***2-7]、山桃白花山碧桃[Prunus davidiana(Carr．)***]以及2者的F1代为试材,用RAPD、AFLP标记构建了北京2—7和白花山碧桃的遗传连锁图,分别覆盖221．7 cM(7个连锁群)、1238．8 cM(12个连锁群)。其中北京2—7的连锁图包含19个标记,标记间平均距离为11．7 cM;白花山碧桃的连锁图包含103个标记,标记间平均距离为12．0 cM。

关键词：桃 RAPD标记 AFLP标记遗传连锁图

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鲤遗传连锁图谱的构建

上海海洋大学学报 2011年第5期20卷 641-648页

作者：王宣朋孙效文李文升张天奇李超中国水产科学研究院黑龙江水产研究所黑龙江哈尔滨150070 上海海洋大学水产与生命学院上海201306 大连海洋大学生命科学与技术学院辽宁大连116023

利用JoinMap 4.0软件包,以德国镜鲤选育系为祖父母所培育的自交F2群体的68个个体为作图群体,首次以新型分子标记单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)为主要作图标记,以微卫星(Simple Sequence Repeats,SSR)和表达序列标... 详细信息

利用JoinMap 4.0软件包,以德国镜鲤选育系为祖父母所培育的自交F2群体的68个个体为作图群体,首次以新型分子标记单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)为主要作图标记,以微卫星(Simple Sequence Repeats,SSR)和表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)为辅助标记,采用CP(CrossPollinators)模型构建鲤的遗传连锁图谱。构建的遗传连锁图谱含有560个标记(174个SSR标记、41个EST-SSR标记和345个SNP标记),分布在50个连锁群上,最大连锁群由60个标记组成,最小连锁群仅含2个标记,平均每个连锁群有11.2个标记。最大连锁群的图距为198.1厘摩(centimorgan,cM),最小的连锁群图距为1.5 cM,图谱总图距为3 295.92 cM,标记间平均间距为7.21 cM,图谱覆盖率为76.26%。构建的图谱为中等密度的遗传连锁图谱可为进一步的鲤相关经济性状的QTL定位研究和分子标记辅助选择育种(MAS)打下基础。研究亮点:首次以新型分子标记SNP为主要作图标记并以SSR标记为辅助标记构建鲤遗传连锁图谱;有来自表达基因编码区的41个EST-SSR标记分布在图谱上;构建的图谱标记类型丰富,数量大,密度高,为进一步的鲤重要经济性状的QTL定位和分子标记辅助育种打下基础。

关键词：鲤遗传连锁图 JoinMap4.0 微卫星表达序列标签单核苷酸多态性

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绿豆遗传连锁图谱的构建及其分析利用

绿豆遗传连锁图谱的构建及其分析利用

作者：赵丹中国农业科学院

学位级别：硕士

绿豆[Vigna radiata （L.） Wilczek]是我国的主要食用豆类之一,属于医食两用作物。现今,国内外对绿豆的遗传研究还相对滞后。遗传连锁图是绿豆遗传学研究的重要内容,也是基因定位、克隆乃至基因组结构与功能研究不可缺少的技术平台。然... 详细信息

绿豆[Vigna radiata （L.） Wilczek]是我国的主要食用豆类之一,属于医食两用作物。现今,国内外对绿豆的遗传研究还相对滞后。遗传连锁图是绿豆遗传学研究的重要内容,也是基因定位、克隆乃至基因组结构与功能研究不可缺少的技术平台。然而,在大作物大力发展分子标记辅助育种的今天,绿豆仍面临分子标记匮乏、可共享基因组信息少等诸多问题。本研究在对4种绿豆近缘植物SSR引物在绿豆基因组中可转移性分析的基础上,利用Berken/ACC41重组自交系群体,借助于从澳大利亚引进的RFLP作图数据,构建了绿豆遗传连锁图谱,并对绿豆的抗豆象位点进行了定位分析;另一方面,还对绿豆生育期、株高、百粒重等9个重要农艺性状进行了QTL定位及遗传效应分析,并对检测到的QTL位点与环境间的互作效应进行了分析,以期为绿豆的优良基因聚合育种及分子标记辅助选择育种提供理论依据;另外,基于绿豆、小豆遗传连锁图的共有SSR标记,进行了比较基因组作图研究,以期为绿豆与其近缘植物间的比较基因组学研究提供一定的信息。主要研究结果如下:1.通过对597对绿豆近缘种的SSR引物在绿豆基因组中的可转移性分析,发现约65%小豆、72%黑吉豆、40%菜豆、30%豇豆SSR引物能够有效扩增。多态性分析显示107对SSR引物多态性较好,可以有效用于绿豆分子遗传学的研究。应用作图软件Mapmaker/Exp 3.0b将多态性标记与澳大利亚引进的RFLP标记相整合,构建了一张含12个连锁群的绿豆遗传连锁图谱,总遗传距离为1 869.0 cM。该连锁图谱共含186个分子标记,其中SSR标记98个,RFLP标记76个,RAPD标记3个,STS标记9个,各连锁群标记数在8～40个之间,连锁群长度在51.2～483.9 cM之间,标记间平均遗传距离为10.2 cM。2.利用所构建图谱对绿豆抗豆象主效位点进行定位分析发现,该位点定位于I9连锁群,与梅丽等（2007）的定位结果相比,在原目标区间内新增加了5个SSR标记,它们均来自于菜豆引物序列,其中与抗性位点连锁最紧密的SSR标记C220距目标位点约2.6 cM;对绿豆、小豆遗传连锁图谱的共用SSR标记的分布分析发现:共用标记在连锁群上的排列顺序基本一致,说明二者基因组的同源性较高,仅少量标记的位置和排列顺序在两者间的差异表明绿豆和小豆基因组在进化过程中发生染色体重排。3.利用基于混合线性模型的QTLNetwork 2.0软件,在3个环境（06北京、06广西、09北京）下对绿豆生育期、株高和单株产量等8个性状和在4个环境（06北京、06广西、澳大利亚两环境）下对百粒重进行QTL分析,结果共检测到33个加性效应位点和10对上位性效应位点。这些QTL几乎分布于绿豆全基因组（C3和N连锁群除外）。其中,加性QTL的遗传效应值介于1.1%9.8%之间,效应值大于10%的加性位点有5个。上位性效应位点的遗传效应值介于2%.9%之间。本研究也发现了基因与环境的互作效应。

关键词：绿豆 SSR标记遗传连锁图抗豆象位点比较作图农艺性状 QTL