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广州地区儿童诺如病毒性腹泻的分子流行病学研究

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中华儿科杂志 2008年第12期46卷 899-904页

作者：冯晓敏钟家禹周荣耿岚岚区文玑龚四堂广州市儿童医院消化科 510120 广州市儿童医院中心实验室 510120

目的应用TaqMan实时荧光逆转录聚合酶链反应（real-timeRT—PCR）法检测诺如病毒（norovirus，NV）的发病情况，为儿童NV腹泻的临床治疗或病毒爆发流行的预防、控制及疫苗的研制提供流行病学资料。方法随机收集2006年12月至2007年12月... 详细信息

目的应用TaqMan实时荧光逆转录聚合酶链反应（real-timeRT—PCR）法检测诺如病毒（norovirus，NV）的发病情况，为儿童NV腹泻的临床治疗或病毒爆发流行的预防、控制及疫苗的研制提供流行病学资料。方法随机收集2006年12月至2007年12月广州地区急性腹泻病患儿水样便或蛋花汤样便，应用针对病毒ORF1与ORF2连接区域设计的引物及TaqMan探针进行实时荧光RT—PCR检测标本。并将NV阳性标本进行克隆并测序，结合检测结果以确定此周期内NV的流行情况及优势毒株。结果本研究从1260份标本中检测出NV阳性257份（20．40％），其中GⅠ型87份（6．90％），GⅡ型214份（16．98％），GⅠ和GⅡ混合感染44份。测序分析后发现GI毒株检出率依次为GⅠ-3、GⅠ-2及GⅠ-4；GⅡ毒株检出率依次为GⅡ-4、GⅡ-3及GⅡ-7。NV主要感染年龄为2岁以内婴幼儿，发病高峰期在11至12月。结论NV已经成为广州地区婴幼儿腹泻的重要病原体之一，GⅡ-4型是2007年主要流行病毒株。

关键词：诺罗病毒腹泻儿童逆转录聚合酶链反应

2018年天津市儿童GⅡ型诺如病毒感染的分子流行病学分析

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中华检验医学杂志 2020年第5期43卷 570-575页

作者：何菲方玉莲林书祥侯梦珠王维沈永明司萍彭林天津医科大学儿科临床学院天津市儿童医院检验科天津300070 天津市儿童医院儿科研究所天津300134 天津市儿童医院检验科天津300134 天津市儿童医院天津300134

目的分析2018年天津市儿童医院患儿GⅡ型诺如病毒(NoV)感染的分子流行病学特征。方法单中心研究。2018年1至12月就诊于天津市儿童医院疑似病毒感染引起急性胃肠炎患儿粪便标本2185份,采用实时荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测NoV,对... 详细信息

目的分析2018年天津市儿童医院患儿GⅡ型诺如病毒(NoV)感染的分子流行病学特征。方法单中心研究。2018年1至12月就诊于天津市儿童医院疑似病毒感染引起急性胃肠炎患儿粪便标本2185份,采用实时荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测NoV,对阳性标本的衣壳蛋白VP1(VP1)区进行基因扩增并测序,分析基因型并运用MEGA5.05作系统进化树分析。结果2185份粪便标本中检出NoV阳性标本610份,阳性率为27.9%(610/2185),全部为GⅡ型,共发现7个基因型,以GⅡ.3型和GⅡ.4型为主,分别占46.2%(151/327)和40.1%(131/327),GⅡ.2型占4.6%(15/327),其他亚型占9.1%(30/327)。不同年龄组间NoV检出率差异有统计学意义(χ2=17.050,P=0.002),其中阳性标本中以≤3岁年龄组检出率最高,占阳性标本总数的89.2%,不同月份NoV检出率差异有统计学意义(χ2=225.153,P<0.001),其中11、12月为高发月份。GⅡ.3型和GⅡ.4型NoV感染的患儿在伴随粒细胞减少症方面,两种亚型差异有统计学意义(χ2=11.270,P=0.001),在伴随呼吸道症状方面,两种亚型差异有统计学意义(χ2=7.257,P=0.007)。结论2018年天津地区儿童NoV感染主要以GⅡ.3型和GⅡ.4型为主,基因型呈现多样性,提示本地区在今后应继续加强监测和预防儿童的NoV感染。

关键词：诺罗病毒胃肠炎基因型分子流行病学儿童

安徽省马鞍山市哨点医院食源性疾病患者诺如病毒感染的分子流行病学特征分析

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中华预防医学杂志 2019年第6期53卷 581-585页

作者：洪颖史永林张魁江良梁王蓉王利陈谨陈健陈道利马鞍山市疾病预防控制中心微生物检验科 243000 安徽省疾病预防控制中心微生物检验室合肥230601 马鞍山市临床检验中心 243000

目的了解马鞍山哨点医院食源性疾病病例诺如病毒的感染状况及基因特征。方法收集2015年1月至2018年6月马鞍山3家医院食源性疾病病例流行病学资料和粪便标本,共911例;采用实时荧光定量逆转录PCR法检测GⅠ/GⅡ组诺如病毒,阳性标本使用普... 详细信息

目的了解马鞍山哨点医院食源性疾病病例诺如病毒的感染状况及基因特征。方法收集2015年1月至2018年6月马鞍山3家医院食源性疾病病例流行病学资料和粪便标本,共911例;采用实时荧光定量逆转录PCR法检测GⅠ/GⅡ组诺如病毒,阳性标本使用普通逆转录PCR方法进行扩增,扩增产物测序后采用生物学软件对病毒序列进行序列比对和系统进化分析。结果男女病例分别为504例(55.3%)和402例(44.1%),5例性别不详。诺如病毒阳性率为14.7%(134例),其中GⅠ组7例,GⅡ组124例,GⅠ和GⅡ组混合感染3例;全年均可检出诺如病毒,每年11月至次年4月阳性率较高[24.4%(20/82)~45.3%(24/53)];男性诺如病毒阳性78例(15.5%),女性阳性55例(13.7%)(χ^2=0.58,P=0.448);各年龄组诺如病毒阳性率差异无统计学意义(χ^2=9.55,P=0.089);成功测序79份,GⅠ组4份(5.1%),GⅡ组75份(94.9%),GⅡ.17和GⅡ.4型较多,分别为35和15份;不同年份流行优势株有所不同,2015年以GⅡ.17(30份,68.2%)为主,2016年以GⅡ.4(5/9)为主,2017年以GⅡ.4(8/16)为主,2018年以GⅡ.3(3/6)为主。结论马鞍山的诺如病毒腹泻全年流行,冬春高发;以GⅡ型为主,优势流行株为GⅡ.17和GⅡ.4型,不同年份的流行优势毒株有所不同。

关键词：诺罗病毒基因型食源性疾病进化分析

2009-2011年广州环境与临床标本中诺如病毒的分子流行病学特征

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中华预防医学杂志 2013年第1期47卷 40-43页

作者：罗兰吴新伟刘于飞李巧艳谢华萍伍业健李磊蒋力云杨霞中山大学中山医学院生物化学教研室广州510080 广州市疾病预防控制中心微生物检验科

目的调查2009--2011年广州诺如病毒的分子流行病学特征。方法分别收集广州市2010年1月至2011年5月的环境水样183份、2009年6月至2011年6月的海产品1162份和2009年7月至2010年12月的腹泻患者粪便标本1066份，以实时荧光定量逆转录PCR（qR... 详细信息

目的调查2009--2011年广州诺如病毒的分子流行病学特征。方法分别收集广州市2010年1月至2011年5月的环境水样183份、2009年6月至2011年6月的海产品1162份和2009年7月至2010年12月的腹泻患者粪便标本1066份，以实时荧光定量逆转录PCR（qRT—PCR）检测诺如病毒，对扩增阳性标本测序后与GenBank中的诺如病毒参考株比较，绘制系统进化树。结果环境水样中诺如病毒阳性率为19．67％（36／183），海产品中的阳性率为8．26％（96／1162），腹泻患者粪便标本中的阳性率为37．05％（395／1066）；扩增阳性样品中的诺如病毒可分为10株代表株，其中7个代表株（共208份标本）的基因型为G24型，并且水样、海产品和粪便标本同源性很高，相似度达94％～100％。结论广州诺如病毒流行优势株为G24型，同时标本中阳性率较高。

关键词：诺罗病毒分子流行病学聚合酶链反应

2019年北京市非流行季餐饮服务单位诺如病毒污染状况研究

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中华预防医学杂志 2021年第7期55卷 875-878页

作者：郑阳贾蕾刘白薇高志勇田祎王小莉严寒秋王全意北京市疾病预防控制中心传染病地方病控制所北京市预防医学研究中心北京100013

目的调查北京市餐饮服务单位厨师的诺如病毒隐性感染状况及餐饮服务单位环境中诺如病毒污染情况。方法采用横断面调查方法,按照方便抽样的原则抽取北京市16个行政区内的餐饮服务单位以及三个大型火车站内部的餐饮服务单位,采集环境标本... 详细信息

目的调查北京市餐饮服务单位厨师的诺如病毒隐性感染状况及餐饮服务单位环境中诺如病毒污染情况。方法采用横断面调查方法,按照方便抽样的原则抽取北京市16个行政区内的餐饮服务单位以及三个大型火车站内部的餐饮服务单位,采集环境标本和厨师的肛拭子或便标本,使用实时荧光定量PCR技术对标本进行诺如病毒核酸检测,并分析了餐饮服务单位环境中诺如病毒污染情况和人员隐性感染状况。结果共调查650家餐饮服务单位,采集厨师肛拭子或便标本1302件,环境标本2600件。其中非火车站内部餐饮服务单位644家,厨师肛拭子或便标本1290件,环境标本2576件。非火车站餐饮服务单位厨师诺如病毒隐性感染率为0.85%(11/1290),环境污染率为0.04%(1/2576);火车站餐饮服务单位厨师和环境标本中均未检出诺如病毒。结论在2019年诺如病毒非流行季期间,北京市餐饮服务单位中厨师诺如病毒感染率较低,环境中存在诺如病毒污染情况。

关键词：诺罗病毒无症状感染污染状况横断面调查

集中式供水污染致诺如病毒感染性腹泻暴发的调查

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中华预防医学杂志 2009年第7期43卷 628-631页

作者：郑慧贞郭汝宁李剑森张正敏李晖广东省疾病预防控制中心流行病防治研究所广州510300 广东省疾病预防控制中心微生物检验所广州510300

目的了解一起感染性腹泻暴发的病因、感染来源，采取针对性措施控制疫情蔓延。方法对涉疫的Y镇北部5个村委会的现住居民进行回顾性队列研究，用统一的调查表登记2007年11月20日以来所有有腹泻或呕吐症状之一者。对Y镇北部5个村委会的供... 详细信息

目的了解一起感染性腹泻暴发的病因、感染来源，采取针对性措施控制疫情蔓延。方法对涉疫的Y镇北部5个村委会的现住居民进行回顾性队列研究，用统一的调查表登记2007年11月20日以来所有有腹泻或呕吐症状之一者。对Y镇北部5个村委会的供水系统、3个自然村的环境及部分患者家庭进行现场卫生学调查。面访部分病例。用Real—time PCR和巢式PCR方法检测患者粪便标本诺如病毒核酸。结果2007年11月24日至12月3日，Y镇北部饮用A自备自来水的村民共发生腹泻或呕吐病例435例，发病率12．93％。病例分布在饮用A自备自来水的所有村委会，最高发病率21．23％（100／471），最低5．21％（201／384），饮用A自备自来水与发病之间有关联性（RR：9．246，95％CI：6．25—13．68）。发病时间集中在25-27日，占85．9％（262／305）。调查S2村委会某自然村年龄别发病率分别为，0岁～组20．0％（3／15）、10岁一组17．3％（9／52）、20岁～15．2％（16／105）、60岁以上23．3％（7／30），各年龄组差异无统计学意义（χ^2=1．15，P〉0．05）。病例大多病情较轻，经门诊对症治疗后痊愈，无住院和死亡病例。现场调查和水质日常监测发现水处理过程存在消毒不落实的情况。A自备自来水水质检测细菌学指标不合格。患者2份呕吐物和1份粪便未检出沙门菌、志贺菌和金黄色葡萄球菌，3份患者粪便和3份患者肛拭诺如病毒检测，Real—time PCR 3份阳性，巢式PCR6份阳性。对供水管网进行清洗消毒后病例迅速递减。采取消毒饮用水和健康教育等综合措施后，疫情迅速得到有效控制。结论本次疫情为一起诺如病毒感染性腹泻暴发，可能是因A自备自来水受污染而引起的暴发。

关键词：水污染诺罗病毒疾病暴发流行

杭州市轮状病毒检测阴性的腹泻患儿病原体调查分析

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中华检验医学杂志 2019年第8期42卷 688-693页

作者：吴盛海何劲涛彭朝阳厉小玉徐丽慧王贤军浙江大学医学院附属杭州市第一人民医院检验科杭州310006 浙江大学医学院附属第四医院检验科义乌325000 浙江大学医学院附属儿童医院检验科杭州310000 杭州市儿童医院检验科杭州310003

目的探讨杭州市轮状病毒检测阴性的腹泻患儿病原体分布情况.方法收集2017年3月至2018年6月浙江大学附属杭州市第一人民医院,浙江大学附属儿童医院和杭州市儿童医院儿科门诊605例轮状病毒检测阴性的腹泻患儿粪便样本,回顾分析了常规检测... 详细信息

目的探讨杭州市轮状病毒检测阴性的腹泻患儿病原体分布情况.方法收集2017年3月至2018年6月浙江大学附属杭州市第一人民医院,浙江大学附属儿童医院和杭州市儿童医院儿科门诊605例轮状病毒检测阴性的腹泻患儿粪便样本,回顾分析了常规检测结果并对粪便样本性状采用布里斯托评分.粪便样本采用DNA纯化试剂盒和RNA提取试剂盒提取病原体DNA和/或RNA.病原体DNA和RNA逆转录cDNA作为扩增模板,采用聚合酶链反应(PCR)对7种常见致婴幼儿腹泻病原体进行扩增,扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测.病原体检出阳性率采用卡方检验进行统计学分析.结果605例患儿中,男性患儿375例(28±11)个月,女性患儿230例(29±10)个月.大便样本布里斯托评分主要集中在6型(496,82%),其次为7型(85,14%)和5型(24,4%).大便常规检测结果中,隐血阳性97例,占比16%,白细胞阳性170例,占比28%.605例患儿大便样本病原体目的基因检出阳性452例,阳性率74.7%.319例检出单一病原体基因片段,127例检出了两种病原体基因,6例检出3种病原体基因片段.检出最高的为艰难梭菌毒素B,阳性率48.9%(296/605),其次为沙门菌属(20.0%,121/605)和诺如病毒(10.9%,66/605).艰难梭菌毒素A阳性率为1.0%(6/605).男性患儿和女性患儿病原体检出阳性率分别为86.7%(325/375)和86.5%(199/230),(χ2=0.002,P=0.959).结论杭州地区轮状病毒检测阴性的腹泻患儿以沙门菌属和诺如病毒感染为主.艰难梭菌毒素B阳性率高,但艰难梭菌毒素A阳性率低,可能与婴幼儿胃肠道内艰难梭菌定植相关而非腹泻的病原菌.腹泻病原体检出率无性别差异.

关键词：腹泻沙门菌属诺罗病毒细菌毒素类聚合酶链反应流行病学研究

2016-2017年宁夏急性胃肠炎患者中诺如病毒感染状况及重组类型分析

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中华预防医学杂志 2019年第8期53卷 811-816页

作者：党文马江涛陈慧袁芳马学旻詹军宁夏医科大学公共卫生与管理学院银川750004 宁夏疾病预防控制中心病毒科银川750004

目的了解宁夏急性胃肠炎患者中诺如病毒的感染状况及其重组现象。方法研究对象为2016年1月至2017年12月在宁夏5个市10家监测点医疗机构门急诊就诊的急性胃肠炎病例,共2 334例。收集病例临床资料和患者个人信息,采集粪便标本后统一送往... 详细信息

目的了解宁夏急性胃肠炎患者中诺如病毒的感染状况及其重组现象。方法研究对象为2016年1月至2017年12月在宁夏5个市10家监测点医疗机构门急诊就诊的急性胃肠炎病例,共2 334例。收集病例临床资料和患者个人信息,采集粪便标本后统一送往宁夏疾病预防控制中心,采用实时荧光定量PCR方法进行核酸检测,采用逆转录PCR对诺如病毒GⅡ型阳性标本的聚合酶区和衣壳蛋白区进行扩增、测序及基因分型,用MEGA-X软件进行进化分析,并用Simplot 3.5.1和RDP4软件进行重组分析。结果2 334例病例的年龄M(P25,P75)为1.42(0.68,7.69)岁;2016和2017年分别为1 133和1 201例;男女分别为1 343和991例;诺如病毒GⅠ型阳性率为0.86%(20例),GⅡ型为14.82%(346例)。346株GⅡ型毒株中有78株重组毒株完成测序,共发现12种重组类型,其中GⅡ.Pe/GⅡ.4Sydney_2012和GⅡ.P12/GⅡ.3为主要流行株,分别占35.90%(28株)和32.05%(25株),其次为GⅡ.P16/GⅡ.2,占12.82%(10株);首次在宁夏检出GⅡ.P7/GⅡ.6(2株)、GⅡ.P12/GⅡ.3(6株)、GⅡ.P16/GⅡ.1(2株)、GⅡ.P16/GⅡ.2(5株)、GⅡ.Pe/GⅡ.4(7株)型重组株,均为型间重组,重组位点多位于ORF1区。结论2016-2017年宁夏诺如病毒感染以GⅡ组为主,且均为重组株,GⅡ.Pe/GⅡ.4Sydney_2012和GⅡ.P12/GⅡ.3为主要流行株,其次为GⅡ.P16/GⅡ.2。

关键词：诺罗病毒基因型监测基因重组

新型GⅡ.4诺如病毒重组株感染疫情的分子流行病学研究

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中华预防医学杂志 2013年第12期47卷 1114-1117页

作者：宋灿磊袁佳春曹志城李澜钟海明朱建明高霞上海市金山区疾病预防控制中心急性传染病防制科 201599

目的分析老年护理院诺如病毒（norovirus,NoV）胃肠炎疫情流行病学特征及其所感染病毒的基因型别.方法 2013年1月29日,上海市金山区某老年护理院发生了一起由NoV感染引起的急性胃肠炎疫情,以26例患者作为研究对象,对其进行个案调查.采... 详细信息

目的分析老年护理院诺如病毒（norovirus,NoV）胃肠炎疫情流行病学特征及其所感染病毒的基因型别.方法 2013年1月29日,上海市金山区某老年护理院发生了一起由NoV感染引起的急性胃肠炎疫情,以26例患者作为研究对象,对其进行个案调查.采用单纯随机抽样方法,抽取未经治疗的9例患者,采集其粪便或肛拭子样本9份,再从中抽取4例患者,采集其病房门把手表面涂抹样本或马桶坐垫表面涂抹样本4份.运用荧光RT-PCR对样本进行NoV核酸检测,对核酸检测阳性的样本进行常规RT-PCR,对PCR产物进行纯化回收及测序,测序序列经核酸比对确认,应用Clustal X、MEGA 5.1等软件分析基因序列,构建系统进化树.结果在26例患者中,男性7例,女性19例.经荧光RT-PCR检测的13份样本中,NoV核酸阳性8份.序列比对分析结果显示,获得测序信号的Jinshan08、Jinshan12分离株间核苷酸序列同源性为100％进化树分析结果显示,在RdRp区,Jinshan08 、Jinshan12分离株与GⅡ.e/NV2634/BCN/Spain/2008株等在进化树的同一分支上,可信度为99％,在Capsid的N/S区,2分离株与Lordsdal株等在进化树的同一分支上,可信度为97％.结论本次疫情是由新GⅡ.4型NoV重组株感染引起的急性胃肠炎暴发疫情.

关键词：诺罗病毒胃肠炎基因暴发重组