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基于非靶向脂质组学分析脂蛋白Rv1411c对结核分枝杆菌脂质代谢的影响

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中国防痨杂志 2024年第5期46卷 538-548页

作者：孙玉亭全舒婷孙柏旭田雪綦辉焦伟伟申阿东孙琳国家儿童医学中心/首都医科大学附属北京儿童医院/北京市儿科研究所/儿科学国家重点学科/儿科重大疾病研究教育部重点实验室/国家呼吸系统疾病临床医学研究中心/儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室北京100045

目的:基于非靶向脂质组学探索结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)脂蛋白Rv1411c在该菌脂质代谢中的作用。方法:构建敲除编码脂蛋白Rv1411c基因的MTB(ΔRv1411c)菌株,测定ΔRv1411c与MTB标准株H37Rv的吸光度值(A 600值)并绘... 详细信息

目的:基于非靶向脂质组学探索结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)脂蛋白Rv1411c在该菌脂质代谢中的作用。方法:构建敲除编码脂蛋白Rv1411c基因的MTB(ΔRv1411c)菌株,测定ΔRv1411c与MTB标准株H37Rv的吸光度值(A 600值)并绘制两者生长曲线。提取ΔRv1411c与H37Rv菌液上清脂质成分,使用液相色谱-质谱(LC-MS)联用技术及非靶向脂质组学分析平台对菌株的差异脂质进行分析。采用偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析等方法分析两者的差异脂质代谢产物及差异脂质分子的富集通路。结果:通过色谱分离及质谱分析,从ΔRv1411c与H37Rv菌株中成功鉴定出归属于28种脂质亚类的460个不同的脂质分子,再通过PLS-DA模型分析获得其中归属于17种脂质亚类的158个差异脂质分子[变量权重值(VIP)>1]。以变异倍数(FC)>1.5或脂质分子,其中有12个脂质分子上调,24个脂质分子下调。经KEGG通路富集分析,差异脂质代谢产物主要富集于以下8种通路,即:甘油磷脂代谢、亚麻酸代谢、α-亚麻酸代谢、糖基磷脂酰肌醇(GPI)-锚的生物合成、甘油脂代谢、鞘脂代谢、花生四烯酸代谢及不饱和脂肪酸的生物合成通路;其中又以甘油磷脂的代谢通路最为重要,其次为甘油脂代谢及糖基磷脂酰肌醇(GPI)-锚的生物合成通路。结论:脂蛋白Rv1411c可显著影响MTB的脂质代谢,可能参与MTB脂质代谢的调控。

关键词：分枝杆菌,结核脂蛋白类脂类代谢脂质组

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植物生长和胁迫响应的脂质组学解析:脂质调控综览

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基因组学与应用生物学 2024年第5期43卷 738-754页

作者：沈梦千安昌秦源郑平福建农林大学生命科学学院海峡联合研究院福建省海峡植物应用系统生物学重点实验室福州350002 广西大学农学院南宁530004

脂质组学是一种新的代谢组学技术。脂质作为生命体中重要的化合物,在调节植物应答各种非生物和生物胁迫中有着重要作用。脂质代谢参与各种生殖发育进程,如胚芽和胚珠发育、愈伤组织诱导、开花等,并且在各种植物的不同组织中都存在,无论... 详细信息

脂质组学是一种新的代谢组学技术。脂质作为生命体中重要的化合物,在调节植物应答各种非生物和生物胁迫中有着重要作用。脂质代谢参与各种生殖发育进程,如胚芽和胚珠发育、愈伤组织诱导、开花等,并且在各种植物的不同组织中都存在,无论是花粉还是种皮、胚珠。长期以来,脂质代谢都是解析植物生长发育分子机制的重要研究内容。本综述介绍了脂质组学贯穿于植物的研究领域,重点归纳和总结了植株在响应各种胁迫下脂质重塑,以及植物所可能受到的形态和生理功能的影响。

关键词：脂质组代谢组学胁迫响应植物

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藏猪肝脏脂质组的高通量鉴定与解析

高原农业 2024年第3期8卷 241-249页

作者：辜雪冬常新萍耿放刘磊李通李娟西藏农牧学院食品科学学院西藏特色农牧资源研发省部共建协同创新中心西藏林芝860000 成都大学食品与生物工程学院四川成都610106 西藏自治区农畜产品质量安全检验检测中心西藏拉萨850000 成都农业科技职业学院休闲旅游学院四川成都610030

本研究旨在揭示藏猪肝脏的脂质组成,营养特性,以及响应高海拔环境的生理机制。通过液相色谱-质谱联用的高通量脂质组学分析技术,探究西藏林芝地区约3000 m海拔下的藏猪肝脏中脂质组谱。结果显示:在藏猪肝脏中鉴定到1101种脂质分子,主要... 详细信息

本研究旨在揭示藏猪肝脏的脂质组成,营养特性,以及响应高海拔环境的生理机制。通过液相色谱-质谱联用的高通量脂质组学分析技术,探究西藏林芝地区约3000 m海拔下的藏猪肝脏中脂质组谱。结果显示:在藏猪肝脏中鉴定到1101种脂质分子,主要包括272种甘油三酯(TG)、91种甘油二脂(DG)和87种磷脂酰胆碱(PC)等28种脂质类别;PC是含量最丰富的磷脂类分子,达到总磷脂的38.73%;游离脂肪酸(FFA)中含有38.60%的多不饱和脂肪酸。

关键词：藏猪肝脏脂质组磷脂西藏林芝

集胞藻Synechocystis sp. PCC 6803脂质组的分析

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水生生物学报 2021年第2期45卷 376-386页

作者：郭晓烨李艳华韩丹翔中国科学院水生生物研究所武汉430072 中国科学院大学北京100049

以集胞藻Synechocystis *** 6803为研究对象,研究建立了基于超高效液相色谱耦合串联质谱技术脂质组学分析方法。鸟枪法脂质组学通过电喷雾离子化有效分离油脂粗提物中所含单个脂质分子,在三重四极杆扫描碎片离子,能够利用特征片段离子... 详细信息

以集胞藻Synechocystis *** 6803为研究对象,研究建立了基于超高效液相色谱耦合串联质谱技术脂质组学分析方法。鸟枪法脂质组学通过电喷雾离子化有效分离油脂粗提物中所含单个脂质分子,在三重四极杆扫描碎片离子,能够利用特征片段离子鉴定光合甘油酯的种类和酰基组成,具有高效、灵敏度高和质量准确度高等优点。对不同光强下生长的Synechocystis *** 6803细胞的各脂质组分进行了全定量分析,发现单半乳糖甘油二酯(Monogalactosyldiacylglycerol,MGDG)和磷脂酰甘油(Phosphatidyl glycerol,PG)在高光处理的第2小时即显著积累,增长量分别为34.64%和68.49%,其中以含有从头合成、高度饱和的脂肪酸的种类增长最为快速和显著,而后高不饱和度的脂肪酸组成的种类逐渐积累。双半乳糖甘油二脂(Digalactosyldiacylglycerol,DGDG)在各时间点都持续增长,12h后增长量达26.95%,硫代异鼠李糖甘油二酯(Sulfoquinovosyl diacylglycerol,SQDG)的含量则呈现出不断下降的趋势。研究所建立的脂质组学分析方法对进一步研究Synechocystis *** 6803的脂质代谢及生理功能提供了有力的分析工具。

关键词：脂质组集胞藻Synechocystis sp.PCC 6803 高光适应甘油酯

基于脂质组学探讨二陈汤对高脂饮食小鼠肝线粒体功能的调节作用

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中华中医药杂志 2022年第5期37卷 2531-2535页

作者：丁珊珊廖颖李灿东浅川哲也福建中医药大学福州350122 日本滨松医科大学日本静冈4313192

目的:研究二陈汤对高脂饮食小鼠肝线粒体功能和脂质组的影响。方法:24只SPF级雄性C57BL/6J小鼠随机分为普通饮食组(ND组)、高脂饮食组(HFD组)和二陈汤组(ECD组),每组8只。HFD组和ECD组采用高脂饲料喂养20周,从第17周开始,ECD组给予二陈... 详细信息

目的:研究二陈汤对高脂饮食小鼠肝线粒体功能和脂质组的影响。方法:24只SPF级雄性C57BL/6J小鼠随机分为普通饮食组(ND组)、高脂饮食组(HFD组)和二陈汤组(ECD组),每组8只。HFD组和ECD组采用高脂饲料喂养20周,从第17周开始,ECD组给予二陈汤(8.7 g/kg)灌胃,ND组和HFD组给予0.9%氯化钠溶液灌胃,连续4周。观察小鼠一般情况;检测小鼠血脂含量;HE染色观察肝组织病理变化;Western blot检测线粒体标记蛋白,JC-1探针检测线粒体膜电位,LC-MS检测线粒体脂质组。结果:与ND组比较,HFD组小鼠体质量、腹围显著增加(P组织出现明显脂肪变性及炎症细胞浸润,线粒体膜电位显著下降(P组比较,ECD组小鼠体质量、血脂、肝组织病理变化和线粒体膜电位均显著改善(P脂质组分析结果显示,PC、PE、LPC、SM、LPE、PS、CL、CE、PG、PMeOH、DGTS和DAG的含量在HFD组中较ND组降低,在ECD组中较HFD组升高;HexCer/NS、HexCer/NDS、Cer/NDS、PEtOH的含量在HFD组中较ND组升高,在ECD组中较HFD组降低。结论:二陈汤可能通过调节肝线粒体脂质改善线粒体功能,从而起到化痰调脂功效。

关键词：高脂饮食二陈汤痰证线粒体脂质组膜电位脂代谢化痰调脂

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北京鸭和连城白鸭胸肌脂质组鉴定与分析

中国畜牧兽医 2023年第3期50卷 904-912页

作者：张鹤刘大鹏唐贺贺刘同余大新于思梦盖凯侯水生周正奎中国农业科学院北京畜牧兽医研究所农业农村部动物遗传育种与繁殖(家禽)重点实验室北京100193

【目的】研究鸭胸肌脂质谱,并探究北京鸭和连城白鸭胸肌脂质组差异。【方法】选取6周龄北京鸭和连城白鸭各28只并采集其胸肌组织,采用基于液相色谱-质谱联用方法(liquid chromatography-mass spectrometry,LC-MS)的脂质组学技术检测鸭... 详细信息

【目的】研究鸭胸肌脂质谱,并探究北京鸭和连城白鸭胸肌脂质组差异。【方法】选取6周龄北京鸭和连城白鸭各28只并采集其胸肌组织,采用基于液相色谱-质谱联用方法(liquid chromatography-mass spectrometry,LC-MS)的脂质组学技术检测鸭胸肌中的脂质谱,通过多变量统计分析方法对北京鸭和连城白鸭胸肌脂质组的检测结果进行分析,采用差异倍数、t检验和偏最小二乘判别分析(PLS-DA)筛选差异脂质。【结果】鸭胸肌共被鉴定到950种脂质,涵盖6大类,即甘油磷脂类(GP)395种、甘油脂类(GL)365种、鞘脂类(SP)86种、脂肪酰类(FA)78种、甾醇脂类(ST)23种、异戊烯醇脂类(PR)3种;种类含量最多的脂质亚类为甘油三酯类(TG)283种。与北京鸭相比,连城白鸭中筛选到18种差异显著脂质:7个上调,11个下调;其中TG类最多且在北京鸭中含量高,同时这些TG富含饱和脂肪酸和单不饱和脂肪酸,而含超长链多不饱和脂肪酸(VLC-PUFA)的GP在连城白鸭中含量高。【结论】本研究获得了全面详细的鸭胸肌脂质谱,并筛选出了北京鸭和连城白鸭18种差异脂质标记物,为鸭的肌内脂质代谢、肉质研究及品质育种提供了科学的理论依据。

关键词：北京鸭连城白鸭胸肌脂质组肌内脂质

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急性冷刺激后巴马猪背膘和腹股沟皮下脂肪组织的脂质组比较

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中国畜牧兽医 2020年第9期47卷 2759-2766页

作者：潘建飞郑千涛陶聪赵建国王彦芳中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 中国科学院动物研究所北京100101

本研究旨在获得巴马猪皮下脂肪组织(包括背膘(backfat)和腹股沟皮下脂肪组织(inguinal subcutaneous white adipose tissue,iWAT))在急性冷刺激(4℃、4 h)后其脂质组成应答的差异。正常饲喂的6月龄巴马公猪在急性冷刺激处理后进行屠宰,... 详细信息

本研究旨在获得巴马猪皮下脂肪组织(包括背膘(backfat)和腹股沟皮下脂肪组织(inguinal subcutaneous white adipose tissue,iWAT))在急性冷刺激(4℃、4 h)后其脂质组成应答的差异。正常饲喂的6月龄巴马公猪在急性冷刺激处理后进行屠宰,收集背膘和腹股沟皮下脂肪组织,利用液相二级质谱(LC-MS/MS)高通量脂质组学检测技术分析其脂质组成。结果表明,在巴马猪皮下脂肪组织中,中性脂类、游离脂肪酸、磷脂类和鞘脂类4大类脂质含量差异巨大,其中含量最高的为中性脂类,在腹股沟皮下脂肪组织和背膘中分别占4大脂类总和的97.43%和98.53%;含量最低的为鞘脂类,在腹股沟皮下脂肪组织和背膘中所占比例分别为0.10%和0.07%。在16亚类脂质组成中含量最高的脂质为甘油三酯,在腹股沟皮下脂肪组织和背膘分别占16亚类脂质总和的95.97%和97.33%;含量最低的脂质为磷脂酸,在腹股沟皮下脂肪组织和背膘中所占比例分别为3.98E-04%和1.13E-04%。主成分分析表明,背膘和腹股沟皮下脂肪组织在急性冷刺激后脂质组成存在差异。以∣差异倍数∣>1.5和P组织,其中包括14种甘油三酯、DAG32∶1(16∶1/16∶0)和PE40∶6p;只有2种脂质(CL74∶8(18∶2)和TAG54∶3(16∶0))在背膘中的含量显著高于腹股沟皮下。巴马猪皮下脂肪主要脂质组成为甘油三酯;急性冷刺激后,背膘和腹股沟皮下脂肪组织对急性冷刺激存在不同的应答。

关键词：脂质组背膘腹股沟皮下脂肪组织急性冷刺激巴马猪

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巴氏醋杆菌Ab3响应醋酸压力的脂质组研究

巴氏醋杆菌Ab3响应醋酸压力的脂质组研究

作者：杨洁琼浙江工商大学

学位级别：硕士

醋酸菌耐酸性的高低一直是制约我国食醋酿造产业发展的关键性因素。本文以巴氏醋杆菌Ab3为对象,以不同酸度条件下的菌体为实验材料,研究在不同酸度条件下醋酸菌细胞膜特性(流动性和通透性)的变化;基于此,通过不同酸度条件下醋酸菌细胞... 详细信息

醋酸菌耐酸性的高低一直是制约我国食醋酿造产业发展的关键性因素。本文以巴氏醋杆菌Ab3为对象,以不同酸度条件下的菌体为实验材料,研究在不同酸度条件下醋酸菌细胞膜特性(流动性和通透性)的变化;基于此,通过不同酸度条件下醋酸菌细胞膜脂质组成的测定与分析,探索脂质组成中关键组分的变化与醋酸菌高耐酸之间的关联性。对处于不同酸度环境条件下的巴氏醋杆菌细胞膜进行流动性和通透性分析,结果显示在醋酸发酵过程中随着酸度的增加,细胞膜的相变温度(Tm)升高,荧光偏振度(P)升高,细胞膜的流动性随着酸度的增高而降低。另外,随着酸度的增加,细胞膜的通透性先减弱后增强,总体呈现增强趋势。脂质组数据显示,不同酸度条件下菌体细胞膜脂质组成存在差别。在不同的样品中各类脂质中的分子种在组成上具有一致性,但在数量上存在差异性,菌体可能通过改变脂质组成和数量以适应外界环境的压力。其中,磷脂中的主要组成成分磷脂酰胆碱(PC)的含量随着酸度的增高而增加;甘油酯中甘油二酯(DG)的含量随着酸度的增高而增加,甘油三酯(TG)的含量随着酸度的增高而减少。另外,在样品中检测到了神经酰胺(Cer),其含量随着酸度的增高而增加,可能在醋酸菌的抗逆性中扮演着重要角色。通过分析差异性代谢物发现,环丙烷脂肪酸以及十六烷酸、十八烷酸、十八碳烯酸和十八碳二烯酸等脂肪酸是重要的种子,可能在醋酸菌耐酸性方面在发挥着重要的作用。此外,脂质合成抑制剂的研究发现细胞膜脂质组成的变化对于醋酸菌的抗逆性生存及耐酸性具有重要作用,在不同的乙酸浓度刺激下,菌体的生长及数量发生明显变化,这一现象印证了脂质组分析所得出的结论。巴氏醋杆菌Ab3脂质组学分析研究工作的开展是对其基因组学及蛋白组学研究工作的进一步延伸,研究结果将有助于更全面的理解和认识醋酸菌的高耐酸机理,揭示巴氏醋杆菌基于细胞膜脂质组成变化的特殊耐酸机制。这将有利于高耐酸醋酸菌的选育和构建,对醋酸菌的实际工业化生产具有重要的参考价值。

关键词：巴氏醋杆菌膜流动性膜通透性脂质组神经酰胺环丙烷脂肪酸

加热方式对黄羽肉鸡脂质氧化及其脂质组的影响

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同方学位论文库

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加热方式对黄羽肉鸡脂质氧化及其脂质组的影响

作者：谢东娜南京农业大学

学位级别：硕士

鸡肉消费在肉类消费构成中占很大一部分,不同加工方式、不同温度处理过的鸡肉,其脂类物质会发生不同的变化,从而对肉品品质产生不同影响。本文以黄羽肉鸡为研究对象,通过不同的加热处理,探究不同部位氧化稳定性的差别,并进一步研究氧化... 详细信息

鸡肉消费在肉类消费构成中占很大一部分,不同加工方式、不同温度处理过的鸡肉,其脂类物质会发生不同的变化,从而对肉品品质产生不同影响。本文以黄羽肉鸡为研究对象,通过不同的加热处理,探究不同部位氧化稳定性的差别,并进一步研究氧化稳定性与脂质组成的相关性,以期为寻求鸡肉适合的加热方式提供参考。本研究分为三个部分,具体研究内容和结果如下:1.加热方式对黄羽肉鸡不同部位脂质氧化的影响研究为探讨鸡肉在不同加热方式及冷藏期间的氧化情况,选取黄羽肉鸡的胸肉、腿肉、皮下脂肪为原料,对比3个部位脂肪含量和脂质组成;整鸡分别进行微波加热、烤制加热、煮制加热、蒸制加热,检测其初级代谢产物过氧化值与次级代谢产物丙二醛含量。结果表明:中性脂肪含量在皮下脂肪中含量较高,与腿部、胸部存在明显差异,与磷脂分布规律相反;腿部中的多不饱和脂肪酸与必需脂肪酸含量显著高于其他部位;加工与冷藏显著增加各部位丙二醛的含量。储藏4d,各部位过氧化值先上升后下降,煮制后的各部分鸡肉肉样氧化速度最快,腿部在烤制后丙二醛增长速度最慢,各加热方式间存在明显差异（P＜0.01）。2.加热温度对黄羽肉鸡不同部位脂质氧化的影响研究为探讨鸡肉在不同加热温度及冷藏期间的氧化情况,选取黄羽肉鸡的胸肉、腿肉、皮下脂肪为原料;称取各部位肉样,分别在50℃、60℃、70℃、80℃、90℃、100℃恒温循环水浴中加热15分钟,随后立刻在冰上冷却肉样,对照组为未加热肉。测定其初级代谢产物过氧化值与次级代谢产物丙二醛含量。结果表明:储藏4d,各部位过氧化值先上升后下降,POV值胸部＞腿部＞皮下脂肪;在加热温度50-100℃和冷藏4d范围内,鸡肉各部位MDA值随加热温度的升高和冷藏时间的延长而显著的增加。从70℃开始,MDA值上升速率明显加快,氧化剧烈。3.加热温度对黄羽肉鸡胸部脂质组的影响研究为探讨鸡肉在不同加热温度氧化情况与脂质组成的关系,选取黄羽肉鸡的胸肉为原料,分别在50℃、60℃、70℃、80℃恒温循环水浴中加热15分钟,与对照未加热组共同放置于4℃条件下贮藏3天,通过LC-MS技术测定其脂质组成,对数据进行多元统计分析、差异脂质统计分析、差异脂质层次聚类分析。结果表明:鸡胸肉未加热与加热后的脂质组成分共25类445种,磷脂类占比为50.79%;GM1 26:2;4、PIP2 46:2、LPC O-19:1等脂质随着加热温度逐渐升高,相对含量呈现显著上升趋势;LPC 16:0+AcO、LPE O-19:1、LPC O-16:1等在50、60℃加热后相对含量上升,当温度大于60℃时,含量下降;PA 32:9、LPC 18:0+AcO等在加热温度超过70℃时,成分不存在;通过聚类热图发现70、80℃加热后的鸡胸肉能够与未加热组、50、60℃加热组有明显区分,说明脂质组的变化与鸡胸脂质氧化稳定存在一定关联。

关键词：黄羽肉鸡加热方式加热温度脂质组脂质氧化过氧化值丙二醛