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胞嘧啶…NO复合物结构与性质的理论研究

化学学报 2007年第20期65卷 2266-2272页

作者：张士国刘明李红杨频滨州学院化学与化工系材料化学研究所滨州256603 山西大学分子科学研究所化学生物学与分子工程教育部重点实验室太原030006

用密度泛函理论在BL3YP/6-311+G*基组水平上对胞嘧啶…NO复合物体系进行了理论计算,发现了6个能量极小的复合物.其结合方式是NO的N或O原子与胞嘧啶的N—H键形成氢键,最稳定的复合物的结合能为-9.65kJ/***的N原子与胞嘧啶的结合具有更强... 详细信息

用密度泛函理论在BL3YP/6-311+G*基组水平上对胞嘧啶…NO复合物体系进行了理论计算,发现了6个能量极小的复合物.其结合方式是NO的N或O原子与胞嘧啶的N—H键形成氢键,最稳定的复合物的结合能为-9.65kJ/***的N原子与胞嘧啶的结合具有更强的优势,N结合的复合物中NO的键长缩短,而O结合的复合物中NO键长伸长.同时,对复合物的振动分析发现,在胞嘧啶中所有的与NO结合的N—H键的伸缩频率下降,而所有氨基的面内弯曲振动频率是增加的.

关键词：密度泛函理论 MP2 分子间复合物胞嘧啶一氧化氮

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胞嘧啶稀土配合物的振动光谱和结构研究

化学学报 1991年第7期49卷 671-676页

作者：彭周人谢文磊王流芳兰州大学化学系兰州730000

在无水体系中首次合成三种胞嘧啶稀土配合物Ln(Cyt)_2(NO_3)_3(Ln=La,Ce,Gd).振动光谱的实验频谱分析以及SAS值和量子化学计算结果,表明该系列配合物以两个胞嘧啶分子在N(3)和C(2)=O(1)位同稀土配位,两个硝酸根双齿配位,形成八配位稀土... 详细信息

在无水体系中首次合成三种胞嘧啶稀土配合物Ln(Cyt)_2(NO_3)_3(Ln=La,Ce,Gd).振动光谱的实验频谱分析以及SAS值和量子化学计算结果,表明该系列配合物以两个胞嘧啶分子在N(3)和C(2)=O(1)位同稀土配位,两个硝酸根双齿配位,形成八配位稀土配合物,属C_(2h)分子点群.

关键词：胞嘧啶稀土配合物振动光谱

胞嘧啶核苷键联卟啉的合成及其与牛血清白蛋白的相互作用

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高等学校化学学报 2009年第9期30卷 1724-1728页

作者：江国防高峰张满生刘畅郭灿城化学生物传感与计量学国家重点实验室湖南大学化学化工学院长沙410082 湖南公安高等专科学校长沙410138

基于卟啉化合物的光敏性和对肿瘤细胞有特殊的亲和力以及核苷类化合物的抗肿瘤及抗癌活性,设计合成了胞嘧啶核苷卟啉化合物6和8,其结构由1HNMR,IR,UV-Vis,MS和元素分析表征.同时,利用荧光光谱考察了上述核苷卟啉与牛血清白蛋白(BSA)的... 详细信息

基于卟啉化合物的光敏性和对肿瘤细胞有特殊的亲和力以及核苷类化合物的抗肿瘤及抗癌活性,设计合成了胞嘧啶核苷卟啉化合物6和8,其结构由1HNMR,IR,UV-Vis,MS和元素分析表征.同时,利用荧光光谱考察了上述核苷卟啉与牛血清白蛋白(BSA)的相互作用,结果表明它们对BSA荧光有较强的静态猝灭作用.

关键词：胞嘧啶卟啉牛血清白蛋白荧光光谱

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胞嘧啶与一氧化碳复合物的结构与性质

物理化学学报 2008年第9期24卷 1637-1642页

作者：张士国张立超杨频滨州学院化学与化工系材料化学研究所山东滨州256603 南开大学化学系天津300071 山西大学分子科学研究所化学生物学与分子工程教育部重点实验室太原030006

在B3LYP/6-311+G**水平上对胞嘧啶…CO复合物体系进行了理论计算,发现了6个能量极小的复合物.其结合方式是CO的C或O原子与胞嘧啶的N—H键形成氢键,最稳定的复合物的结合能为-8.72kJ·***的C原子与胞嘧啶的结合具有更强的优势,C原子结合... 详细信息

在B3LYP/6-311+G**水平上对胞嘧啶…CO复合物体系进行了理论计算,发现了6个能量极小的复合物.其结合方式是CO的C或O原子与胞嘧啶的N—H键形成氢键,最稳定的复合物的结合能为-8.72kJ·***的C原子与胞嘧啶的结合具有更强的优势,C原子结合的复合物中CO的键长缩短,而O结合的复合物中CO键长伸长.同时,对复合物的振动分析发现,在C原子结合的复合物中CO的伸缩频率蓝移,而O结合的复合物中CO伸缩频率是红移的.

关键词：密度泛函理论分子间复合物胞嘧啶 CO

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胞嘧啶水溶液体系辐解的瞬态产物研究

物理化学学报 1997年第9期13卷 833-837页

作者：马先勇姚思德王文锋左志华林念芸湖南医科大学肿瘤研究所肿瘤分子生物学研究室长沙410078 中国科学院上海原子核研究所辐射化学开放实验室上海201800

Using the ns pulse radolysis, we studied the characteristic absorption spectrum and kinetic decay of cytosine anion radical (Cyt). Reslults showed that the characteristic absorption of Cyt’ was located at λ=355±5 nm, and decayed following the first order kinetics with T1/2=265 ns at pH=7.0. The decay,became slower and T1/2 rapidly rised with the increment of pH value, Cyt’protonated at C6 in acidic solution, and the characteristic absorption was located at λ=310±5 nm,and decayed following the second order kinetics: Cyt’ protonated at N3 in aqueous solution of pH≥7, and the characteristic absorption was located at λ=295±5 nm, and decayed following the second order kinetics.

关键词：胞嘧啶脉冲辐解特征吸收辐解辐射损伤 DNA

表面增强拉曼光谱研究胞嘧啶在银胶上的吸附行为

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发光学报 2017年第4期38卷 543-551页

作者：聂永惠李盼刘文涵滕渊洁浙江工业大学化学工程学院绿色化学合成技术国家重点实验室培育基地浙江杭州310032

为探讨胞嘧啶(Cytosine,Cy)在基底银表面的吸附特性和规律,采用表面增强拉曼散射(SERS)光谱对其吸附行为进行分析,并结合量子化学密度泛函理论(DFT)/B3LYP计算方法对Cy分子的常规拉曼光谱(NRS)及Cy与Ag团簇吸附的SERS光谱进行计算,与测... 详细信息

为探讨胞嘧啶(Cytosine,Cy)在基底银表面的吸附特性和规律,采用表面增强拉曼散射(SERS)光谱对其吸附行为进行分析,并结合量子化学密度泛函理论(DFT)/B3LYP计算方法对Cy分子的常规拉曼光谱(NRS)及Cy与Ag团簇吸附的SERS光谱进行计算,与测定结果进行比对且对其拉曼峰进行系统指认及归属,理论计算结合实测值探讨了Cy在基底Ag上的增强效应和吸附行为。考察了Cy分子在Ag纳米粒子上的不同吸附时间、浓度、pH等条件对SERS光谱的影响及优化,发现pH影响最大,在中性和强碱性条件下的增强效应明显优于酸性。Cy分子存在2种不同的异构体和3种不同的存在形态,并随酸度变化相互转化而达动态平衡。基于Cy在不同pH时的形态分布和相应的SERS变化规律,结合DFT算得的Cy分子中的电荷分布及在银基底表面的吸附机制,详细探讨了酸碱对Cy分子的SRES光谱影响的内因和吸附机理,指出在中性和弱碱性时,是Cy中的N3和O与Ag形成配位吸附;在pH大于11时,N与Ag形成配位吸附,而O与Ag形成共价吸附。

关键词：胞嘧啶表面增强拉曼光谱吸附行为 DFT

胞嘧啶一水复合物质子转移异构化反应机理的理论研究

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化学通报 2011年第9期74卷 839-845页

作者：任宏江晏志军刘艳王艳丽李婷西安文理学院化学与化工系西安710065 渭南师范学院化学化工系渭南714000 西北工业大学理学院应用化学系西安710129

采用密度泛函B3LYP方法,在6-311+G**基组水平上对胞嘧啶一水复合物质子转移引起的氨-酮式、氨-烯醇式与亚胺-酮式互变异构反应机理进行了计算研究,获得了互变异构过程的反应焓、活化能、活化吉布斯自由能和质子转移反应速率常数等参数。... 详细信息

采用密度泛函B3LYP方法,在6-311+G**基组水平上对胞嘧啶一水复合物质子转移引起的氨-酮式、氨-烯醇式与亚胺-酮式互变异构反应机理进行了计算研究,获得了互变异构过程的反应焓、活化能、活化吉布斯自由能和质子转移反应速率常数等参数。将Onsager反应场溶剂模型用于水相的计算,结果表明,胞嘧啶一水复合物无论在气相中还是水溶剂中,其氨-酮式Cyt1w1是最稳定复合物。氨-酮式向氨-烯醇式和亚胺-酮式异构化共有2条反应通道,水分子参与了质子转移反应机理,降低了活化能垒,增加了氨-酮式向氨-烯醇式、亚胺-酮式转变的可能性,溶剂化作用影响反应活化能的大小。计算结果还表明,氢键作用在增大胞嘧啶一水复合物稳定性方面起着重要作用。

关键词：胞嘧啶质子转移活化能 Onsager模型

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木犀草素与胞嘧啶相互作用的理论研究

化学学报 2011年第17期69卷 1980-1986页

作者：向铮吴秀郑妍蔡皖飞李来才田安民四川师范大学化学与材料学院成都610066 山东大学环境研究院济南250100 四川大学化学学院成都610064

采用密度泛函理论中的B3LYP方法,在6-31+G*基组水平上对木犀草素、胞嘧啶、木犀草素-胞嘧啶复合物进行结构优化和振动频率分析,得到了12种稳定复合物.并应用分子中的原子理论(AIM)分析、自然键轨道(NBO)理论分析得到复合物氢键性质和特... 详细信息

采用密度泛函理论中的B3LYP方法,在6-31+G*基组水平上对木犀草素、胞嘧啶、木犀草素-胞嘧啶复合物进行结构优化和振动频率分析,得到了12种稳定复合物.并应用分子中的原子理论(AIM)分析、自然键轨道(NBO)理论分析得到复合物氢键性质和特征.通过基组重叠误差(BSSE)校正后的相互作用能、成键临界点电荷密度、二阶稳定化能综合分析,得出三氢键复合物C-6结构是最稳定的.

关键词：密度泛函理论氢键基组重叠误差胞嘧啶木犀草素

5-甲基胞嘧啶及胞嘧啶无辐射失活的半经典动力学模拟和CASSCF计算

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物理化学学报 2012年第12期28卷 2803-2808页

作者：袁帅马静张文英舒坤贤豆育升重庆邮电大学生物信息研究所重庆400065

采用半经典动力学方法模拟了5-甲基胞嘧啶(5m-Cyt)和胞嘧啶(Cyt)在267nm紫外光辐射下的光物理失活过程.模拟发现,5m-Cyt和Cyt的激发态通过C5-C6键的扭曲以及甲基(或H5)和H6原子平面外振动失活.失活时,甲基(或H5)和H6原子几乎与环面垂直... 详细信息

采用半经典动力学方法模拟了5-甲基胞嘧啶(5m-Cyt)和胞嘧啶(Cyt)在267nm紫外光辐射下的光物理失活过程.模拟发现,5m-Cyt和Cyt的激发态通过C5-C6键的扭曲以及甲基(或H5)和H6原子平面外振动失活.失活时,甲基(或H5)和H6原子几乎与环面垂直并指向不同方向,形成"双自由基态".由于甲基的体积比H原子的大,振动频率较小,使得C5原子的变形受到抑制,导致5m-Cyt的激发态寿命比胞嘧啶更长.完全活性空间自洽场(CASSCF)计算显示,5m-Cyt的圆锥交叉(CI)点能量比Cyt高0.3eV,这也证明5m-Cyt演化至CI需要克服更大的能垒,因此激发态寿命长于胞嘧啶.

关键词： 5-甲基胞嘧啶胞嘧啶半经典动力学模拟 CASSCF 激发态寿命