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肠道定植耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌分子特征及其感染相关研究

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中国抗生素杂志 2023年第5期48卷 563-572页

作者：孟雪斐张鸿娟宋贵波马志刚李小凤梁媛刘涵禹单斌昆明医科大学第一附属医院云南省医学检验临床医学研究中心昆明650032 云南省中医院昆明650021

目的通过对直肠拭子主动筛查出的耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌(Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE)和对应患者感染后分离出的CRE进行配对分析研究,以探讨CRE定植和感染之间的分子特征异同,为临床CRE感染的防控提供帮助和指导。... 详细信息

目的通过对直肠拭子主动筛查出的耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌(Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE)和对应患者感染后分离出的CRE进行配对分析研究,以探讨CRE定植和感染之间的分子特征异同,为临床CRE感染的防控提供帮助和指导。方法采集2021年1月至2021年12月住院患者直肠拭子标本进行CRE菌株筛查。监测筛查阳性患者的感染发生情况,对感染菌株及其定植菌株同时进行多位点序列分型、耐药基因和毒力基因检测,并进行测序分析。结果CRE主动筛查定植率为2.41%(75/3116),其感染率为45.3%(34/75)。碳青霉烯酶耐药基因检出以bla_(KPC)为主:定植组bla_(KPC)(25/34)、bla_(OXA48)(9/34),感染组bla_(KPC)(25/34)、bla_(OXA48)(10/34),检出率P>0.05;ST分型以ST11型检出率最高,定植组ST11型(25/34)、ST231型(9/34),感染组ST11型(25/34)、ST231型(9/34),检出率P>0.05。毒力基因检出率较高的为:定植组mrkD(34/34)、uge(32/34)、fimH(33/34)、wabG(32/34)、entB(32/34),感染组mrkD(34/34)、fimH(31/34)、uge(34/34)、wabG(31/34)和entB(30/34),检出率P>0.05。定植菌是否发生感染与毒力基因uge、iucA、iutA、rmpA和iroB相关,P≤0.05。结论肠内定植CRE与其感染CRE之间高度同源,主动筛查是防控CRE感染的重要举措,通过CRE主动筛查对高危人群预防CRE感染意义重大。

关键词：耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌肠道定植主动筛查分子特征

肠道定植肠球菌与感染部位肠球菌的基因组及转录组分析

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肠道定植肠球菌与感染部位肠球菌的基因组及转录组分析

作者：黄格长江大学

学位级别：硕士

肠球菌是一种无处不在的革兰阳性细菌,是医院相关性感染的主要病原体,与人类健康密切相关。肠球菌具有适应强和能够利用多种代谢物的特点,能够在恶劣的条件下生存,很好地适应了医疗保健环境。粪肠球菌和屎肠球菌是造成院内感染的两个主... 详细信息

肠球菌是一种无处不在的革兰阳性细菌,是医院相关性感染的主要病原体,与人类健康密切相关。肠球菌具有适应强和能够利用多种代谢物的特点,能够在恶劣的条件下生存,很好地适应了医疗保健环境。粪肠球菌和屎肠球菌是造成院内感染的两个主要物种,这两个物种都表现出对常见抗生素的内在耐药性,能够在医疗环境中抵抗抗生素的压力。抗生素的使用导致肠道微生态的破坏,一旦肠球菌在肠道中建立优势位,则容易导致患者感染。因此我们假设肠道定植的肠球菌具有一定的生物学特性,并通过转录调控、代谢适应后易位造成尿路感染、血流感染、腹膜腔感染等。目的本研究分析肠道定植的肠球菌是否会导致患者的感染,比较肠道定植的肠球菌对于感染部位的基因适应性转录变化,从而为了解肠球菌的临床感染机制提供依据。方法回顾性收集来自同病患肠道定植的肠球菌,并且在菌种库中配对来自同病患的感染部位肠球菌,使用琼脂稀释法与肉汤稀释法检测分离菌株的药物敏感性,采用脉冲场琼脂糖凝胶电泳对具有相似耐药特征的定植肠球菌与感染肠球菌进行同源性分析,并对分离的肠球菌菌株进行全基因组测序,使用生物信息学对基因组进行分析。对肠道定植的屎肠球菌进行体外尿液暴露3h,使用转录组研究易位尿路后的差异表达基因。结果收集到来自24例患者配对的肠球菌感染患者分离的92株肠球菌,感染分离的肠球菌以屎肠球菌为主,占所有肠球菌感染病例的79.2%。共收集肠道定植的肠球菌35株,其中定植屎肠球菌27株,定植粪肠球菌8株。通过对分离的所有肠球菌进行药物敏感性检测,屎肠球菌对β-内酰胺类、四环素的耐药性较高,粪肠球菌对红霉素、四环素、喹诺酮类药物的耐药性较高。配对的24位患者分离的肠道定植肠球菌与感染部位分离的肠球菌耐药谱相似。通过对所有菌株进行脉冲场凝胶电泳分析,16位患者分离的肠道定植肠球菌与感染部位的肠球菌有着相似的条带。对所有菌株进行全基因组测序并结合生物信息学分析,11位患者的定植屎肠球菌与感染部位的屎肠球菌,7位患者的定植粪肠球菌与感染部位的粪肠球菌在进化树上相近,感染的屎肠球菌以ST78型为主,屎肠球菌携带较多的耐药基因,而粪肠球菌携带多种毒力因子。基于RNA-seq转录组分析显示,肠道定植的屎肠球菌通过上调表达PTS、半乳糖代谢、从头核苷酸合成代谢基因以适应尿液环境造成患者感染。结论来自同病患肠道定植的肠球菌与感染部位的肠球菌有着相似的耐药表型,基于PFGE与分子分型发现,一些同病患中感染部位分离的与肠道定植的肠球菌菌株同源,肠道定植的肠球菌作为存储库能够造成患者的感染。屎肠球菌以ST78型为主,而粪肠球菌ST型呈现多样化。基于转录组发现,肠道定植的屎肠球菌易位到尿液中,必须转换底物代谢以适应尿液的营养模式,包括对半乳糖代谢、氨基酸代谢与从头核苷酸的合成基因的上调以维持基本的代谢需要。

关键词：肠球菌肠道定植全基因组测序脉冲场凝胶电泳 RNA-seq

肠道定植耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌筛查价值及其临床应用研究

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肠道定植耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌筛查价值及其临床应用研究

作者：孟雪斐昆明医科大学

学位级别：硕士

[目的]1.了解住院患者耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌（Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE）肠道定植情况以及由定植继发为感染的情况,分析定植菌与感染菌对抗菌药物的耐药情况;探讨CRE肠道定植以及由肠道定植继发为感染的危险因... 详细信息

[目的]1.了解住院患者耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌（Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE）肠道定植情况以及由定植继发为感染的情况,分析定植菌与感染菌对抗菌药物的耐药情况;探讨CRE肠道定植以及由肠道定植继发为感染的危险因素;2.分析肠道定植CRE与继发感染CRE之间MLST分型、耐药基因、毒力基因等分子特征的一致性,为CRE感控提供指导。[方法]1.收集昆明医科大学第一附属医院2021年1月-12月非重复肠道定植CRE菌株,监测其感染情况并收集感染菌株。使用基质辅助激光解吸电离飞行时间（MALDI-TOF）质谱仪对菌株进行菌种鉴定,采用VITEK2 Compact全自动细菌药敏鉴定系统、K-B纸片法和E-test法进行药敏试验;2.通过医院His系统收集CRE肠道定植患者以及定植继发感染患者的临床资料,应用SPSS26.0软件采用logistic回归分析探讨CRE肠道定植以及由定植继发为感染的危险因素;3.PCR扩增定植菌和感染菌耐药基因:碳青霉烯酶基因（blaKPC、blaOXA48、blaNDM、blaIMP、blaVIM）,膜孔蛋白基因（ompk35、ompk36）,喹诺酮类耐药基因（qnrA、qnrB）,氨基糖苷类耐药基因（acc（6’）-1b、rmtB）,β-内酰胺类耐药基因（blaCTX-M-1、blaCTX-M-14、blaCTX-M-3、blaSHV、blaTEM、blaDHA）;毒力基因:黏液相关毒力因子（rmpA）,三价铁离子摄取（kfu）,Ⅰ型菌毛基因（fimH）,Ⅲ型菌毛基因（mrkD）,氮利用（sils）,脂多糖（wabG、uge）,沙门菌素（iroB、iroN）,气杆菌素（iutA、iucA）,尿素囊（allS）,肠杆菌素（entB）,MLST分析定植菌与感染菌分子流行病学特征,并送测序。探讨定植菌与感染菌之间的异同点。[结果]1.对昆明医科大学第一附属医院2021年1-12月住院患者CRE肠道定植情况进行筛查。共3116例患者进行了筛查,筛出CRE直肠拭子阳性患者共75例,筛查阳性率为2.41%。其中65例患者检出肺炎克雷伯菌（占86.7%）、8例患者检出大肠埃希菌（占10.7%）、2例患者检出阴沟肠杆菌（占2.6%）。35例患者同时在其他标本类型中检出CRE。2.肺炎克雷伯菌的定植菌和感染菌对多黏菌素和替加环素的敏感率为100%,对阿米卡星的敏感率分别为23.75%和22.22%,对庆大霉素的敏感率为16.25%和17.46%,对复方新诺明的敏感率为31.25%和39.68%;对头孢菌素、β-内酰胺类、β-内酰胺类酶抑制剂、喹诺酮类、碳青霉烯类抗菌药物几乎100%耐药;定植菌与感染菌对抗菌药物的敏感性没有统计学差异,p＞0.05。3.CRE肠道定植和定植继发感染的危险因素分析结果显示:单因素分析表明CRE肠道定植与酶抑制剂复合制剂、替加环素、万古霉素、利奈唑胺、精神类药物的使用,侵入性呼吸机治疗、胃管留置、导尿管留置、低蛋白血症、泌尿系统疾病等有关,差异具有统计学意义（p＜0.05）;多因素分析表明精神类药物使用和胃管留置是CRE肠道定植的独立危险因素,差异均有统计学意义（p＜0.001）。单因素分析表明CRE由肠道定植继发为感染与褥疮,酶抑制剂复合制剂、碳青霉烯类抗菌药物、替加环素、利奈唑胺等抗菌药物的使用,中心静脉导管等有关,差异均有统计学意义（p＜0.05）;多因素分析显示替加环素的使用是定植继发为感染的独立危险因素,差异有统计学意义（p＜0.001）。4.MLST分型结果显示,ST11型是肠道定植菌和配对感染菌最常见的克隆型别占 64.7%（22/34）,其次是ST231 占 29.4%（10/34）,ST690 占 2.9%（1/34）,ST592 占 2.9%（1/34）;耐药基因检出情况:定植组:bla-KPC（70.6%）、bla-OXA48（29.4%）、acc（6’）-1b（23.5%）、rmtB（58.8%）、qnrA（29.4%）、ompK35（97.1%）、ompK36（91.7%）、blaCTX-M-1（29.4%）、blaCTX-M-14（70.6%）、blaSHV（97.1%）、blaTEM（85.3%）、blaCTX-M-3（50%）;感染组:bla-KPC（80.4%）、bla-OXA48（19.6%）、acc（6’）-1b（23.5%）、rmtB（62.3%）、qnrA（25.5%）、ompK35（98%）、ompK36（90.2%）、blaCTX-M-1（19.6%）、blaCTX-M-14（80.4%）、blaSHV（100%）、blaTEM（90.2%）、blaCTX-M-3（49%）;检出率p＞0.05;毒力基因检出情况:定植组:mrkD（100%）、uge（97.1%）、fimH（97.1%）、

关键词：耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌肠道定植危险因素分子特征

巯基化修饰党参多糖改善鼠李糖乳杆菌LGG肠道黏附定植作用

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食品科学技术学报 2022年

作者：曹恺欣武俊瑞李默韩琦于博祁姝旖王子健乌日娜沈阳农业大学食品学院辽宁省食品发酵技术工程研究中心沈阳市微生物发酵技术创新重点实验室

益生菌的肠道黏附是其实现长期肠道定植的关键因素。为增加外源性益生菌的肠道黏附性，对课题组前期分离所得党参多糖（CPP-2）采用羧甲基化和巯基化两步化学修饰法，制备巯基化党参多糖（sC-CPP-2）。通过体外黏附试验和激光共聚焦显... 详细信息

益生菌的肠道黏附是其实现长期肠道定植的关键因素。为增加外源性益生菌的肠道黏附性，对课题组前期分离所得党参多糖（CPP-2）采用羧甲基化和巯基化两步化学修饰法，制备巯基化党参多糖（sC-CPP-2）。通过体外黏附试验和激光共聚焦显微镜法分析在添加sC-CPP-2情况下肠黏液对鼠李糖乳杆菌（LGG）的黏附效果，利用党参多糖及其修饰组分与海藻酸钠形成的复合薄膜，间接验证sC-CPP-2对LGG的黏附性，并利用流变仪和经典拉伸实验检测sC-CPP-2与肠道黏液之间的相互作用关系。结果表明：羧甲基党参多糖（C-CPP-2）的取代度为0.588±0.026，sC-CPP-2中巯基含量为（279.50±5.97）μmol/g，C-CPP-2经巯基化修饰后处于巯基和羧基共存状态。sC-CPP-2表面巯基可与LGG表面蛋白质上的半胱氨酸形成二硫键，增加LGG的肠道黏附性。sC-CPP-2与肠黏液的最大分离力（MDF）为（101.82±5.78）mN，黏附总功（TWA）为（120.07±6.81）μJ，二者间相互作用力增强，表观黏度变大，黏合力显著增强。证实了sC-CPP-2能够起到连接LGG与肠黏液的中介作用，增强LGG的肠道黏附性，希望可为改善益生菌在肠道中的黏附定植作用提供参考。

关键词：党参多糖巯基化鼠李糖乳杆菌LGG 黏附作用肠道定植

ICU耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌感染菌与肠道定植菌耐药基因及同源性关系

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中华医院感染学杂志 2023年第21期33卷 3213-3218页

作者：夏粉芳张培林何俊凝郭杨柳肖敏谭莎莎刘永芳林家福川北医学院附属医院感染科四川南充637000 大竹县人民医院感染科四川大竹635100 川北医学院附属医院检验科四川南充637000 川北医学院附属医院重症监护室四川南充637000 川北医学院附属医院神经外科四川南充637000 成都市第三人民医院感染科四川成都610031

目的探索重症监护室(ICU)患者耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)感染菌和肠道定植菌耐药基因及同源性关系.方法收集2020年6月1日-2022年11月30日川北医学院附属医院神经外科ICU、中心ICU及急诊ICU患者中从CRKP感染到肠道定植、CRKP肠道定... 详细信息

目的探索重症监护室(ICU)患者耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)感染菌和肠道定植菌耐药基因及同源性关系.方法收集2020年6月1日-2022年11月30日川北医学院附属医院神经外科ICU、中心ICU及急诊ICU患者中从CRKP感染到肠道定植、CRKP肠道定植到感染各20例患者分离的CRKP菌株,对其CRKP菌株进行耐药基因检测,采用肠杆菌科基因间重复序列聚合酶链反应(ERIC-PCR)技术进行同源性分析.结果40例患者共收集CRKP菌株98株.同一患者CRKP定植菌和感染菌株均携带KPC基因.遗传聚类分析显示,98株CRKP可分为A~G型7种不同菌型.同一菌型在同一时间段内不同ICU检出,同一时段不同患者菌株间同源性较高,同一ICU同时段有同一菌型聚集现象.两组各有18例患者定植菌和感染菌间相似系数>0.85,其亲缘关系较近;虽两组各有2例患者定植菌与感染菌之间亲缘关系较远,但其定植菌或感染菌与同科室或不同科室其他患者定植菌或感染菌之间具有较高同源性.结论同一患者CRKP肠道定植菌和感染菌株之间所携带的耐药基因一致,均为KPC型.两组患者自身肠道定植菌和感染菌株之间同源性均较高.存在同一时段的一个CRKP克隆菌株在不同患者间传播流行现象,也存在不同科室间的流行现象.

关键词：重症监护室耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌肠道定植感染耐药基因同源性

老年重症患者肠道定植产KPC-2肺炎克雷伯菌的分子流行病学特征

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中华医院感染学杂志 2022年第16期32卷 2401-2405页

作者：李春梅王城城范永秀昌涛马佳慧皮晓琴四川省中西医结合医院检验科四川成都610041

目的探讨老年重症患者肠道定植产KPC-2肺炎克雷伯菌的分子流行病学特征。方法纳入2019年1月-2020年6月四川省中西医结合医院收治的进行直肠定植耐碳青霉烯革兰阴性菌筛查的老年重症患者,以分离出的68株产KPC-2肺炎克雷伯菌菌株作为研... 详细信息

目的探讨老年重症患者肠道定植产KPC-2肺炎克雷伯菌的分子流行病学特征。方法纳入2019年1月-2020年6月四川省中西医结合医院收治的进行直肠定植耐碳青霉烯革兰阴性菌筛查的老年重症患者,以分离出的68株产KPC-2肺炎克雷伯菌菌株作为研究样本。对菌株进行药敏性分析,采用聚合酶链式反应检测CTX-M、SHV、TEM-1β、RmtB、Arm、oqxAB、oqxA、oqxB、qnrB等耐药基因及allS、rmpA、mrkD、kfuBC、cf29a、fimH、ureA、uge等毒力基因情况。结果 68株产KPC-2肺炎克雷伯菌对所有β内酰胺类抗菌药物耐药,对喹诺酮类、氨基糖苷类、磺胺类等药物表现出较高程度的耐药。68株产KPC-2肺炎克雷伯菌检出CTX-M、SHV、TEM-1β、RmtB、Arm、oqxAB、oqxA、oqxB、qnrB基因,其中TEM-1β、oqxAB、oqxA、oqxB等基因检出率高于50%。入组68株产KPC-2肺炎克雷伯菌中,以毒力基因fimH、ureA、uge分布较为广泛,其次为rmpA、mrkD。结论产KPC-2肺炎克雷伯菌临床菌株有其独特的分子生物学特征,这些特征决定其生物学功能及耐药性情况,对这些临床特征进行定期监测可对临床提供一定参考。

关键词：肺炎克雷伯菌分子流行病学耐药基因毒力基因老年重症患者肠道定植

高毒力肺炎克雷伯菌在2型糖尿病和体检人群的肠道定植研究

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高毒力肺炎克雷伯菌在2型糖尿病和体检人群的肠道定植研究

作者：孙菲南方医科大学

学位级别：硕士

研究目的:1.收集2型糖尿病人群的粪便标本进行肺炎克雷伯菌的分离、培养与鉴定,明确定植于2型糖尿病人群肠道的肺炎克雷伯菌(Klebsziella pneumoniae,Kp)和高毒力肺炎克雷伯菌(hypervirulent Klebsiella pneumoniae,hvKp)的特征和定植... 详细信息

研究目的:1.收集2型糖尿病人群的粪便标本进行肺炎克雷伯菌的分离、培养与鉴定,明确定植于2型糖尿病人群肠道的肺炎克雷伯菌(Klebsziella pneumoniae,Kp)和高毒力肺炎克雷伯菌(hypervirulent Klebsiella pneumoniae,hvKp)的特征和定植人群的特征。2.收集体检人群粪便标本进行肺炎克雷伯菌的分离、培养与鉴定,明确定植于体检人群肠道的肺炎克雷伯菌和高毒力肺炎克雷伯菌的特征和定植人群的特征。3.明确体检人群和2型糖尿病人群肺炎克雷伯菌和高毒力肺炎克雷伯菌发生肠道定植的危险因素。研究方法:1.收集2022年3月-2022年11月来自珠江医院住院人群中无感染症状的2型糖尿病人群粪便标本1267份,收集2022年5月-2022年11月体检人群的粪便标本658份进行肺炎克雷伯菌的分离、培养与鉴定,重复标本保留第一份。回顾性分析两组人群的临床资料。2.在麦康凯培养基上进行粪便中菌株的培养与分纯,菌株鉴定采用PCR扩增肺炎克雷伯菌的特征性基因khe的方法,后续进行琼脂糖凝胶电泳,用已知标准菌株ATCC 700603作为阳性对照,根据条带位置判定阳性结果,筛选肺炎克雷伯菌。3.记录收集标本的临床信息,包括性别、年龄、合并的基础疾病和暴露的危险因素等,分析肺炎克雷伯菌和高毒力肺炎克雷伯菌肠道定植人群的临床特征。4.采用拉丝实验(String Test)判断菌株的高黏液表型,PCR检测毒力质粒上的毒力基因(peg-344、iroB、iucA、rmpA和rmpA2),明确不同肺炎克雷伯菌菌株携带的毒力基因情况,并将毒力基因rmpA阳性和毒力基因iroB或iucA阳性的肺炎克雷伯菌定义为高毒力肺炎克雷伯菌。5.采取多位点序列分型(Multi-locus Sequence Typing,MLST)确定不同高毒力肺炎克雷伯菌菌株的序列分型,PCR扩增7个管家基因(gapA、infB、mdh、pgi、phoE、poB和tonB),将扩增产物的测序结果在肺炎克雷伯菌MLST数据库中进行比对得出序列型别,明确高毒力肺炎克雷伯菌的分子流行病学特征。6.采用SPSS25.0进行统计学数据分析,菌株肠道定植危险因素的单因素分析采用X2检验,多因素分析采用二元Logistic分析,P肠道定植的危险因素(P肠道定植高毒力肺炎克雷伯菌的独立危险因素,OR=9.208(3.636-23.321)。2.体检人群共收集到658份粪便标本,肺炎克雷伯菌检出率为34.80%(229/658),高黏液阳性率为25.33%(58/229),糖皮质激素的使用和合并消化系统疾病是肺炎克雷伯菌肠道定植的危险因素(P肠道定植的独立危险因素。3.2型糖尿病人群中肺炎克雷伯菌和高毒力肺炎克雷伯菌的肠道定植率有显著性差异(P肠道定植的共同危险因素糖皮质激素的使用未见显著性差异(P>0.05);体检人群中肺炎克雷伯菌和高毒力肺炎克雷伯菌的肠道定植率有显著性差异(P肠道定植率为25.71%,高毒力肺炎克雷伯菌的肠道定植率为10.58%;体检人群肺炎克雷伯菌的肠道定植率为34.80%,毒力肺炎克雷伯菌的肠道定植率为11.40%。2.糖皮质激素的使用是2型糖尿病人群发生高毒力肺炎克雷伯菌肠道定植的独立危险因素,合并消化系统疾病是体检人群肠道定植肺炎克雷伯菌的危险因素。3.肠道定植的高毒力肺炎克雷伯菌以ST275、ST273、ST443和ST335型为主要序列分型。

关键词：高毒力肺炎克雷伯菌 2型糖尿病肠道定植高危因素

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肠道定植CRE筛查技术方法学评价

检验医学 2022年第8期37卷 761-765页

作者：徐琪潘芬孙燕石迎迎于方圆张泓上海交通大学附属儿童医院上海市儿童医院检验科上海200062

目的评价含1μg/mL美罗培南麦康凯琼脂平板(药物筛选法)和粘贴10μg美罗培南纸片的麦康凯琼脂平板(纸片筛选法)在筛查临床粪便样本中肠道定植碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌(CRE)的性能。方法收集2019年7月—2020年3月上海交通大学附属... 详细信息

目的评价含1μg/mL美罗培南麦康凯琼脂平板(药物筛选法)和粘贴10μg美罗培南纸片的麦康凯琼脂平板(纸片筛选法)在筛查临床粪便样本中肠道定植碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌(CRE)的性能。方法收集2019年7月—2020年3月上海交通大学附属儿童医院临床送检主动筛查CRE的住院患儿粪便样本306例,分别采用药物筛选法和纸片筛选法检测。以聚合酶链反应(PCR)扩增碳青霉烯酶基因(PCR法)结果为标准,评价药物筛选法和纸片筛选法检测CRE的效能。结果 306例粪便样本中,PCR法CRE阳性检出率为12.1%(37/306),药物筛选法阳性检出率为17.3%(53/306),纸片筛选法阳性检出率为15.4%(47/306)。以PCR法为参考方法,药物筛选法的敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值和符合率分别为97.3%、93.7%、67.9%、99.6%和94.1%,2种方法一致性较好(Kappa值为0.77,P肠道定植CRE的筛查,各实验室可根据具体情况选择相应的方法。

关键词：碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌肠道定植药物筛选法纸片筛选法聚合酶链反应

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乳酸菌在肠道定植的影响因素及研究方法

食品科学 2021年第23期42卷 275-283页

作者：秦文飞宋馨夏永军艾连中王光强上海理工大学健康科学与工程学院上海食品微生物工程技术研究中心上海200093

乳酸菌是一类无芽孢的革兰氏阳性菌,能利用碳水化合物发酵产酸,其作为益生菌家族中重要的一员,具有调节肠道菌群平衡、参与免疫应答和抑制肠道病原菌的生长繁殖等多种益生功能。这些益生功能持续发挥作用的先决条件是乳酸菌能定植于肠道... 详细信息

乳酸菌是一类无芽孢的革兰氏阳性菌,能利用碳水化合物发酵产酸,其作为益生菌家族中重要的一员,具有调节肠道菌群平衡、参与免疫应答和抑制肠道病原菌的生长繁殖等多种益生功能。这些益生功能持续发挥作用的先决条件是乳酸菌能定植于肠道中,但到目前为止,乳酸菌在肠道定植的机制还并不清楚。本综述介绍了乳酸菌在肠道定植中的干扰因素(黏附能力、运动性、乳酸的分泌、与肠道菌群的作用、宿主基因与体征因素、胃酸与胆盐的耐受性以及饮食),概述了乳酸菌肠道定植的研究方法(平板计数法、荧光标记、聚合酶链式反应以及新型纳米材料),旨在加深对乳酸菌在肠道定植的认识,为进一步揭示乳酸菌定植肠道的机理提供参考。

关键词：乳酸菌肠道定植定植因素黏附模型量化方法体内示踪