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中卫山羊早期体型及羊毛性状的遗传参数估计

中国畜牧杂志 2024年第1期60卷 168-175页

作者：张楷仑常恒瑞朱梦笛赵占强罗锐贾弟林杨静华马彦龙郑惠玲西北农林科技大学动物科技学院陕西杨凌712100 宁夏回族自治区中卫山羊选育场宁夏中卫755006

本研究通过对国家级保护品种中卫山羊15个初生时期和35日龄的体型和羊毛性状的遗传力、遗传相关和表型相关进行估计,分析了性别和出生年份固定效应对这些性状的影响,旨在为中卫山羊的保种工作提供参考。运用DMU软件的DMUAI模块,用单性... 详细信息

本研究通过对国家级保护品种中卫山羊15个初生时期和35日龄的体型和羊毛性状的遗传力、遗传相关和表型相关进行估计,分析了性别和出生年份固定效应对这些性状的影响,旨在为中卫山羊的保种工作提供参考。运用DMU软件的DMUAI模块,用单性状动物模型估计遗传力,用多性状动物模型估计遗传相关与表型相关。结果发现,除了35日龄的肩部和臀部毛弯曲数的遗传力小于0.1外其他各性状遗传力的范围为0.10~0.62,均属于中等或偏高遗传力,各性状遗传相关的范围为-0.799~0.991,表型相关的范围为-0.407~0.904。出生年份对除35日龄管围外的其余性状均有极显著影响,性别效应对所有体型性状均有显著影响,但对于初生时期2个毛长性状和35日龄的2个羊毛弯曲数性状影响不显著。中卫山羊早期体型和羊毛性状具有选育提高潜力,可将初生体长和毛股长作为中卫山羊早期选择性状。

关键词：中卫山羊遗传参数体型性状羊毛性状

基于皮肤组织转录组学和蛋白质组学测序揭示影响羊毛性状的关键基因

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生物化学与生物物理进展 2023年第3期50卷 606-622页

作者：吴晋强郝晓静赵红霞董亚洁王荣张鹏翔王海东赫晓燕山西农业大学动物医学学院太谷030801

目的羊毛是高档纺织原料,羊毛的物理性质直接关系到羊毛品质。本研究旨在挖掘影响羊毛性状的基因,探索影响羊毛性状的复杂分子机制。方法本研究选取萨福克羊和小尾寒羊各3只作为试验样本,取背部皮肤组织,采用转录组学(RNA-seq)和蛋白质... 详细信息

目的羊毛是高档纺织原料,羊毛的物理性质直接关系到羊毛品质。本研究旨在挖掘影响羊毛性状的基因,探索影响羊毛性状的复杂分子机制。方法本研究选取萨福克羊和小尾寒羊各3只作为试验样本,取背部皮肤组织,采用转录组学(RNA-seq)和蛋白质组学测序分析造成羊毛性状差异的基因、蛋白质及相关信号通路。结果转录组测序表明:测序完成后,共得到230406674个原始数据和222049370个干净数据,其中Q20碱基百分比为99.9%以上,Q30碱基百分比为98%以上。以差异倍数FC≥1.4或FC≤0.714且P羊毛性状相关。KEGG富集发现,影响羊毛性状的信号通路可能是ECM-受体相互作用。蛋白质组测序表明:以差异倍数FC≥1.4或FC≤0.714且P羊毛性状相关。KEGG富集发现,影响羊毛性状的信号通路可能是过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路和ECM-受体相互作用。转录组与蛋白质组联合分析发现:转录组和蛋白质组均检测到的显著差异基因共有15个,其中13个为正相关,2个为负相关。中间丝显著富集,其中涉及的KRT35、KRT13、KAP13-1-like基因可能是影响羊毛性状的关键候选基因,PPAR信号通路显著富集,可能是影响羊毛性状的关键候选通路,FABP4基因可能是影响羊毛性状的关键候选基因。结论KRT35可能影响羊毛直径和弯曲;KRT13可能影响羊毛分化;KAP13-1-like可能影响羊毛硬度和韧性;FABP4可能影响羊毛直径。这些结果将扩展对影响绵羊羊毛性状的复杂分子机制的理解,并为后续的研究提供基础。

关键词：转录组测序蛋白质组测序萨福克羊小尾寒羊羊毛性状

鄂尔多斯细毛羊LMNB1基因和TXNIP基因多态性与羊毛性状关联分析

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家畜生态学报 2022年第10期43卷 23-29页

作者：付雪峰谷英吴翠玲德德玛孟根曹斯庆毕力格斯登丹巴田可川新疆畜牧科学院畜牧研究所新疆绒毛用羊遗传育种与繁殖实验室(XJYS1105)新疆乌鲁木齐830011 鄂尔多斯市农牧业科学研究院内蒙古鄂尔多斯017100 新疆师范大学生命科学学院中亚区域跨境有害生物联合控制国际研究中心/新疆特殊环境物种多样性应用与调控实验室新疆乌鲁木齐830017 内蒙古鄂尔多斯市乌审旗家畜改良工作站内蒙古鄂尔多斯017300 山东省农业科学院畜牧兽医研究所山东济南250100

该研究旨在寻找细毛羊主要经济性状的分子标记。以462只周岁鄂尔多斯细毛羊母羊为试验动物,联合DNA混池和Snapshot技术,检测LMNB1基因和TXNIP基因多态性,采用SAS9.2对LMNB1基因和TXNIP基因突变位点与羊毛性状进行关联分析。结果表明:鄂... 详细信息

该研究旨在寻找细毛羊主要经济性状的分子标记。以462只周岁鄂尔多斯细毛羊母羊为试验动物,联合DNA混池和Snapshot技术,检测LMNB1基因和TXNIP基因多态性,采用SAS9.2对LMNB1基因和TXNIP基因突变位点与羊毛性状进行关联分析。结果表明:鄂尔多斯细毛羊的LMNB1基因有1个Indel(Indel1)、4个SNP同义突变(SNP1、SNP2、SNP3、SNP4);TXNIP基因在3'UTR区有1个突变(SNP5)。LMNB1基因Indel1-SNP1突变位点ATCT基因型和TTTT基因型群体纤维直径变异系数显著高于AACC基因型(P0.05);TXNIP基因SNP5突变位点TT基因型平均纤维直径显著高于CT基因型(P0.05)。结果提示,TXNIP基因SNP5可作为影响鄂尔多斯细毛羊绒毛纤维直径的分子标记,为鄂尔多斯细毛羊超细型群体的选育提供试验依据。

关键词：鄂尔多斯细毛羊羊毛性状 LMNB1 TXNIP 多态性

凉山半细毛羊微卫星标记与羊毛性状的相关分析

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遗传 2006年第12期28卷 1505-1512页

作者：王高富吴登俊四川农业大学动物科技学院雅安625014

利用微卫星技术对凉山半细毛羊核心育种群206个个体第1、2、3、9号染色体上的18个微卫星位点进行研究,检测其基因型,利用SAS程序下的GLM对18个微卫星位点与羊毛性状的关系进行方差分析和多重比较,结果发现7个微卫星位点对部分羊毛性状... 详细信息

利用微卫星技术对凉山半细毛羊核心育种群206个个体第1、2、3、9号染色体上的18个微卫星位点进行研究,检测其基因型,利用SAS程序下的GLM对18个微卫星位点与羊毛性状的关系进行方差分析和多重比较,结果发现7个微卫星位点对部分羊毛性状存在显著或极显著影响,同时,在这些位点上找到对羊毛性状有利的基因型。

关键词：凉山半细毛羊微卫星标记羊毛性状相关分析

IGFBP-3基因多态性及其与中国美利奴羊部分羊毛性状的关联性分析

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遗传 2008年第9期30卷 1182-1186页

作者：沈敏王文君杨永林甘尚权何其宏张永胜王建华马春萍刘正山刘守仁李宁石河子大学动物科技学院石河子832000 江西农业大学食品科学与工程学院南昌330045 新疆兵团绵羊繁育生物技术重点实验室石河子832000 新疆紫泥泉绵羊育种中心石河子832025 中国农业大学农业生物技术国家重点实验室北京100193

采用PCR-SSCP方法对中国美利奴羊和哈萨克羊中IGFBP-3基因的多态性进行了检测,并对不同基因型与中国美利奴羊部分羊毛性状间的关联性进行了分析。结果在位于内含子1区的一段178bp的扩增产物经SSCP分析后出现了3种基因型,基因型AA、AB和B... 详细信息

采用PCR-SSCP方法对中国美利奴羊和哈萨克羊中IGFBP-3基因的多态性进行了检测,并对不同基因型与中国美利奴羊部分羊毛性状间的关联性进行了分析。结果在位于内含子1区的一段178bp的扩增产物经SSCP分析后出现了3种基因型,基因型AA、AB和BB及等位基因A、B在中国美利奴羊中的频率分别为0.70、0.24、0.06和0.82、0.18;在哈萨克羊中的频率分别为0.87、0.13、0.00和0.93、0.07。序列分析发现:在该序列的122位碱基表现多态性(g.122G>T)。所研究的两个群体在该位点上均处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P羊毛性状有一定的影响:不同基因型个体在剪毛后体重和净毛率上没有明显差异。AA、AB及BB基因型个体的羊毛伸直长度逐渐变短,其中AA与AB基因型之间差异极显著(P羊毛密度要明显低于AB型(P羊毛纤维直径则明显高于AB型(P<0.01)和BB型(P<0.05)个体。

关键词：中国美利奴羊 IGFBP-3基因多态性羊毛性状

绵羊皮肤源EST-SSR标记与羊毛性状的关联性分析

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农业生物技术学报 2011年第6期19卷 1056-1062页

作者：王遵宝赵宗胜吴洪宾余鹏张文祥曾献存石河子大学动物科技学院

为了筛选与绵羊(Ovis aries)毛性状基因座连锁更强的分子标记,本研究选择9个多态性丰富的绵羊皮肤源EST-SSR位点,检测了德国美利奴羊与中国美利奴羊级进杂交F2代群体的遗传多态性,并分析了标记与毛性状间的关联性。分析结果显示,所选的9... 详细信息

为了筛选与绵羊(Ovis aries)毛性状基因座连锁更强的分子标记,本研究选择9个多态性丰富的绵羊皮肤源EST-SSR位点,检测了德国美利奴羊与中国美利奴羊级进杂交F2代群体的遗传多态性,并分析了标记与毛性状间的关联性。分析结果显示,所选的9个EST-SSR位点在供试群体中共检测到39个等位基因,多态性丰富,其中的6个位点基因型间存在显著差异;其中,与自然长度关联的位点有5个,与伸直长度关联的位点有4个,与纤维直径关联的位点有3个。6个EST-SSR位点基因型间存在显著差异;关联性标记对羊毛性状相关效应的F检验结果表明:33176918位点和33176988位点分别对羊毛自然长度、纤维平均直径具有显著的遗传效应(P羊毛性状相关的6个位点中,33176918号位点对羊毛的自然长度有较大的标记效应,该位点的CD基因型是羊毛自然长度的有利基因型;33176988号位点对羊毛的纤维直径有显著地标记效应,该位点的BC基因型是纤维直径的有利基因型。这两个位点可能与控制毛形状的基因座紧密连锁。

关键词：绵羊简单重复序列表达序列标签羊毛性状

DSG4基因的SNPs筛查及其与裘用绵羊羊毛性状关系的研究

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畜牧兽医学报 2011年第5期42卷 641-649页

作者：张戈张元跃韩建林关伟军李颖康许斌张秀陶马月辉中国农业科学院北京畜牧兽医研究所农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室北京100193 湖南农业大学动物科技学院长沙410128 国际家畜研究所肯尼亚内罗毕001003 宁夏农业科学院畜牧兽医研究所银川750002

应用PCR-SSCP方法检测118只滩羊和82只小尾寒羊与滩羊杂交羊DSG4基因的多态性,用最小二乘法分析该基因多态性与毛股长度和弯曲数的关系。结果发现16个SNPs和1个TTG插入/缺失,其中在5′调控区和3′调控区各有1个SNP;11个SNPs位于外显子区... 详细信息

应用PCR-SSCP方法检测118只滩羊和82只小尾寒羊与滩羊杂交羊DSG4基因的多态性,用最小二乘法分析该基因多态性与毛股长度和弯曲数的关系。结果发现16个SNPs和1个TTG插入/缺失,其中在5′调控区和3′调控区各有1个SNP;11个SNPs位于外显子区域,其中4个为错义突变,TTG插入/缺失使丝氨酸替换为异亮氨酸并引起甘氨酸的插入/缺失;其余3个SNPs位于内含子区域。DSG4基因编码区的6处碱基变异与3′调控区的1个SNP处于完全连锁不平衡,组合基因型命名为PPRR、PQRS和QQSS。杂交羊QQSS基因型的初生肩部毛股长度、初生肩部毛股弯曲数以及二毛(1月龄左右)肩部毛股弯曲数的最小二乘均值极显著大于PPRR和PQRS基因型所对应的值(P0.05)。滩羊QQSS基因型上述性状的最小二乘均值也大于PPRR和PQRS基因型,但差异不显著(P>0.05)。本研究初步表明,QQSS基因型可能是裘用型绵羊毛股长度和弯曲数的有利基因型,本研究的结果为阐明DSG4基因对绵羊羊毛性状的影响提供了较丰富的分子素材。

关键词：滩羊 DSG4基因 SNP 羊毛性状

Ⅰ型IF、KAP1.3和KAP8.1基因多态性及合并基因型与中国美利奴羊羊毛性状的关联分析

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畜牧与兽医 2016年第3期48卷 68-73页

作者：雷小萍赵宗胜曹少奇袁聪张虎军石河子大学动物科技学院新疆石河子832003

采用PCR-RFLP和PCR-SSCP方法对中国美利奴羊和德国美利奴羊Ⅰ型IF、KAP1.3和KAP8.1基因的多态性进行了检测,并分析了多态位点不同基因型及合并基因型与中国美利奴羊羊毛性状的关联性。结果表明:KAP8.1基因CDS区存在g.1026T>C和g.1130C>... 详细信息

采用PCR-RFLP和PCR-SSCP方法对中国美利奴羊和德国美利奴羊Ⅰ型IF、KAP1.3和KAP8.1基因的多态性进行了检测,并分析了多态位点不同基因型及合并基因型与中国美利奴羊羊毛性状的关联性。结果表明:KAP8.1基因CDS区存在g.1026T>C和g.1130C>T突变。关联分析表明,在中国美利奴羊群体中,Ⅰ型IF基因BB基因型个体羊毛细度和羊毛伸直长度均明显低于AA和AB基因型个体,但3者之间差异不显著(P>0.05);KAP1.3不同基因型个体羊毛细度、自然长度和伸直长度差异显著(P羊毛细度最细,为(22.72±0.30)μm;KAP8.1基因不同基因型个体羊毛细度差异显著(P羊毛细度最细,为(21.64±0.43)μm;而羊毛自然长度和伸直长度差异不显著(P>0.05);KAP1.3-KAP8.1有利基因型聚合体BC-AA个体羊毛细度显著低于其它合并基因型个体(P羊毛性状有一定的影响,可以作为进行绵羊羊毛性状分子标记辅助选择的候选基因。

关键词：绵羊 Ⅰ型IF基因 KAP1.3基因 KAP8.1基因合并基因型羊毛性状

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滩羊二毛期羊毛性状分析及其相关性研究

中国畜牧兽医 2019年第2期46卷 442-448页

作者：李向龙陶金忠丁伟郭延生刘国林陈永宏刘欢欢宁夏大学农学院银川750021 宁夏农林科学院动物科学研究所银川750002

本试验旨在探究滩羊二毛期羊毛性状及其相关性,采集出生当天(初生期)及30～40日龄(二毛期)的滩羊样本各511个,其中公羊260只,母羊251只,分别测定初生期和二毛期羊毛的侧部毛长和侧部弯曲数;并分析了二毛期两型毛和绒毛的平均纤维直径(M... 详细信息

本试验旨在探究滩羊二毛期羊毛性状及其相关性,采集出生当天(初生期)及30～40日龄(二毛期)的滩羊样本各511个,其中公羊260只,母羊251只,分别测定初生期和二毛期羊毛的侧部毛长和侧部弯曲数;并分析了二毛期两型毛和绒毛的平均纤维直径(MFD)、平均纤维曲率(MFC)、毛纤维直径变异系数(CVFD)和毛纤维直径标准差(FDSD),对羊毛性状进行描述性统计及相关性分析。结果显示:初生期滩羊羊毛侧部弯曲数和初生期侧部毛长呈极显著中等正相关(r=0.410,P0.05)。本试验首次大规模检测了滩羊二毛期羊毛的性状指标,确定了各指标间的相关关系,为滩羊裘皮性状的选育提供数据支撑。

关键词：滩羊二毛期两型毛绒毛羊毛性状相关性