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基于EST数据开发柞蚕的SSR标记

基于EST数据开发柞蚕的SSR标记

中国蚕学会第十届青年学术研讨会

作者：郑茜茜马红方谌苗苗钟亮李群王欢夏润玺李喜升王凤成刘彦群沈阳农业大学生物科学技术学院辽宁省蚕业科学研究所

柞蚕SSR标记的开发对研究柞蚕的遗传与进化、分子遗传图谱构建、功能基因定位和克隆等有重要意义。本研究从1 500条柞蚕表达序列标签（EST）中鉴定了71个SSR位点,平均5.2 kb出现一个SSR位点。在1～6个碱基的重复基元中,以3和4个核苷酸... 详细信息

柞蚕SSR标记的开发对研究柞蚕的遗传与进化、分子遗传图谱构建、功能基因定位和克隆等有重要意义。本研究从1 500条柞蚕表达序列标签（EST）中鉴定了71个SSR位点,平均5.2 kb出现一个SSR位点。在1～6个碱基的重复基元中,以3和4个核苷酸重复为主导类型。设计合成了29对EST-SSR引物,通过PCR扩增和电泳检测鉴定了7对具有多态性的引物,测序验证结果表明其中的4对为真正的有应用价值的EST-SSR标记。建立的利用EST数据开发柞蚕SSR标记的方法,有助于进一步大量开发柞蚕SSR分子标记。

关键词：柞蚕表达序列标签简单重复序列

来源： cnki会议评论

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cnki会议

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豁眼鹅微卫星标记的筛选

畜牧与兽医 2012年第S1期44卷 329-329页

作者：苏丹胡建民高明栾新红沈阳农业大学畜牧兽医学院辽宁沈阳110866

微卫星DNA又称简单顺序重复(SSR),由串联排列的1~5 bp的简单重复序列组成,具有含量丰富、多态性高、共线性遗传、引物通用性强和重复性好等特点。在真核生物中,微卫星含量十分丰富,其中二核苷酸微卫星最多。微卫星可以存在于内含子、编... 详细信息

微卫星DNA又称简单顺序重复(SSR),由串联排列的1~5 bp的简单重复序列组成,具有含量丰富、多态性高、共线性遗传、引物通用性强和重复性好等特点。在真核生物中,微卫星含量十分丰富,其中二核苷酸微卫星最多。微卫星可以存在于内含子、编码区、启动子或其他任何位置,但是主要分布于非编码区,这是由大多数微卫星以二核苷酸形式存在决定的。

关键词：豁眼鹅微卫星标记编码区串联排列简单重复序列共线性真核生物启动子二核苷酸内含子

Genetic Diversity of Tea Plant(Camellia Sinensis(L.) ***)in Wuling Mountainous Area Revealed by ISSR Marker

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茶叶 2013年第4期39卷 205-211页

作者： Yue Zhang Li Lu Saiyan Yuan Xin Pang Wei-Dong Wang Lin Zhou John K Tanui Xing-Hui Li Tea Research Institute Nanjing Agricultural University department of tea science and biology Wuyi College

Genetic diversity and relationship of 183 tea germplasms were assessed by inter-simple sequence repeat(ISSR) *** study optimized the ISSR-PCR system for tea *** show that genetic similarity among 183 tea ascensions was between 0.52-0.93,indicating a wide gene pool and a broad genetic variation of Wuling tea *** highest similarity of all materials between No1 and No2 was *** of the183 tea germplasms were protracted by UPGMA clustering analysis also revealed the genetic diversity and relationship of the tea germplasms of Wuling mountainous ***,fingerprint of the 183 tea germplasms were constructed.

关键词： ISSR标记遗传多样性茶树资源武陵山区 UPGMA聚类分析 ISSR-PCR 简单重复序列指纹图谱构建

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中国毛竹基因组学研究取得重大进展

世界竹藤通讯 2009年第2期7卷 31-31页

据2009年1月报道中国科学家日前完成了包括毛竹叶片、笋和萌发种子等在内的毛竹全长cDNA文库构建，并精确测定了1万余条基因序列。毛竹全长cDNA文库构建和基因序列精确测定，是“毛竹基因组测序研究”重大科研项目的第一部分。科学家们... 详细信息

据2009年1月报道中国科学家日前完成了包括毛竹叶片、笋和萌发种子等在内的毛竹全长cDNA文库构建，并精确测定了1万余条基因序列。毛竹全长cDNA文库构建和基因序列精确测定，是“毛竹基因组测序研究”重大科研项目的第一部分。科学家们在完成毛竹基因序列的同时．还首次根据毛竹大规模的基因序列统计了毛竹基因的一些基本信息，包括Gc含量、密码子使用偏好性、简单重复序列、

关键词：中国科学家基因组学毛竹全长cDNA 基因序列简单重复序列文库构建精确测定

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贝母属植物叶绿体基因组研究进展

农业与技术 2024年第24期44卷 10-14页

作者：田童心卢梦月王冬梅程海涛杨学文杨东红李丽丽杨洪升佳木斯大学生物与农业学院黑龙江佳木斯154007 佳木斯大学口腔医学院黑龙江佳木斯154002

贝母属为百合科多年生草本植物,有止咳祛痰、清肺的药用价值。随着现代生物技术的发展,对叶绿体基因组的研究及在系统发育分析中的应用对物种间亲缘性的研究尤为重要。通过综述贝母属植物叶绿体基因组研究的最新进展,总结该属植物叶绿... 详细信息

贝母属为百合科多年生草本植物,有止咳祛痰、清肺的药用价值。随着现代生物技术的发展,对叶绿体基因组的研究及在系统发育分析中的应用对物种间亲缘性的研究尤为重要。通过综述贝母属植物叶绿体基因组研究的最新进展,总结该属植物叶绿体基因组的特征、DNA条形码、简单重复序列及系统发育分析的现状。并通过对贝母属植物的叶绿体基因组的多样性分析,为理解其进化历史和应用于物种鉴定、资源保护及遗传育种奠定理论基础,从而对贝母属植物有着更深的认识。

关键词：贝母属叶绿体基因组系统发育简单重复序列

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菜薹抽薹性状的ISSR和SRAP分析

中国园艺文摘 2010年第6期26卷 179-179页

以早抽薹品种CT07和晚抽薹品种T0601为亲本构建F2分离群体，采用分离集团混合分析法（Bulked segregant analysis，BSA）筛选与菜薹抽薹基因连锁的分子标记。用45条ISSR（Inter—simple sequence repeat，简单重复序列间扩增）引物和20... 详细信息

以早抽薹品种CT07和晚抽薹品种T0601为亲本构建F2分离群体，采用分离集团混合分析法（Bulked segregant analysis，BSA）筛选与菜薹抽薹基因连锁的分子标记。用45条ISSR（Inter—simple sequence repeat，简单重复序列间扩增）引物和20对SRAP（Sequence related amplified polymorphism，序列相关扩增多态性）引物组合进行PCR扩增筛选，

关键词： SRAP分析抽薹 ISSR 菜薹简单重复序列性状 simple 混合分析法