检索结果-南通市图书馆

亚洲栽培稻程氏指数与SSR标记分类的比较分析

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中国水稻科学 2012年第2期26卷 165-172页

作者：王彩红徐群于萍袁筱萍余汉勇王一平汤圣祥魏兴华中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室浙江杭州310006

选取具有代表性的100份亚洲栽培稻品种,应用程氏指数和109个SSR分子标记对它们进行分类。结果表明,等位酶Ⅰ群(典型籼稻)和Ⅵ-A群(温带粳稻)程氏指数和SSR标记亚结构特征均十分明显,拟合度较高(73.3%～100%)。Mantel检测揭示,程氏指数与... 详细信息

选取具有代表性的100份亚洲栽培稻品种,应用程氏指数和109个SSR分子标记对它们进行分类。结果表明,等位酶Ⅰ群(典型籼稻)和Ⅵ-A群(温带粳稻)程氏指数和SSR标记亚结构特征均十分明显,拟合度较高(73.3%～100%)。Mantel检测揭示,程氏指数与SSR分子标记进行栽培稻分类存在明显的正相关,两种方法各个材料间遗传距离的相关达极显著水平(r=0.466,P<0.01)。遗传结构和聚类分析表明,在籼粳亚种水平上,程氏指数和SSR标记分类结果趋于一致,但在亚种内亚结构分析中,程氏指数偏差较大,SSR标记具有更高的准确性。同时,SSR分析表明混合型材料多存在于Ⅱ群和Ⅵ群内部。

关键词：亚洲栽培稻分类程氏指数简单重复序列

基于RNA-seq的崇左金花茶EST-SSR标记开发

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复旦学报（自然科学版） 2015年第6期54卷 761-767页

作者：邵阳范文黄连冬高继银李昕骥张文驹复旦大学生命科学学院生物多样性科学研究所生物多样性与生态工程教育部重点实验室上海200438 广西南宁市金花茶公园南宁530022 广东棕榈风景园林科学研究院中山528416 中国林业科学研究院亚热带林业研究所富阳311400

本研究分析了崇左金花茶（Camellia chuongtsoensis）转录组水平的EST-SSR特征.从崇左金花茶转录组数据组装获得的35 410个Unigene中,共鉴定出2-7不同核苷酸重复类型的SSR位点7 754个,分别分布于6 394条序列中,其中1 121个Unigene具有... 详细信息

本研究分析了崇左金花茶（Camellia chuongtsoensis）转录组水平的EST-SSR特征.从崇左金花茶转录组数据组装获得的35 410个Unigene中,共鉴定出2-7不同核苷酸重复类型的SSR位点7 754个,分别分布于6 394条序列中,其中1 121个Unigene具有两个以上的位点.在转录组中SSR位点出现频率为21.90%,分布密度为1/3.6kb;在所有重复单元中,二碱基微卫星占主要优势,占SSR位点总数的61.3%.利用Primer 3.0设计引物,共计3 303条Unigene成功设计出引物.随机选择10对SSR引物,对一个崇左金花茶群体进行扩增多态性分析,8对引物能够扩增出符合预期大小的PCR片段,其中4对引物成功检测出多态.以上结果表明,转录组数据能够提供丰富的SSR位点,用于快速高效地开发SSR引物,所开发的引物可为崇左金花茶遗传多样性的研究以及种质资源的鉴定与保护等方面提供分子基础.

关键词：崇左金花茶简单重复序列转录组 RNA-seq

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分子标记技术在黑麦研究中的应用

中国生态农业学报 2011年第2期19卷 477-483页

作者：尹冬冬安调过李立会许红星中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心石家庄050022 中国科学院研究生院北京100049 中国农业科学院作物科学研究所北京100081

黑麦(Secale cereal L.)作为小麦的近缘植物,是改良小麦抗病性、产量和品质等性状的重要基因源。分子标记技术作为分子生物学研究中极具价值的一种研究工具已被广泛用于黑麦研究。本文论述了目前分子标记技术在黑麦遗传连锁图谱构建、... 详细信息

黑麦(Secale cereal L.)作为小麦的近缘植物,是改良小麦抗病性、产量和品质等性状的重要基因源。分子标记技术作为分子生物学研究中极具价值的一种研究工具已被广泛用于黑麦研究。本文论述了目前分子标记技术在黑麦遗传连锁图谱构建、有益基因定位和黑麦特异性分子标记开发应用等方面的研究进展,并分析了该技术在黑麦研究中的应用前景。

关键词：黑麦分子标记技术简单重复序列分子标记辅助选择

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籼稻脂肪酶基因的遗传分析及定位

中国水稻科学 2008年第2期22卷 125-130页

作者：龚继平吴方喜吴跃进郑家团黄庭旭王乌齐张建福谢华安福州国家水稻改良分中心／福建省杂交水稻工程技术研究中心／福建省农业科学院水稻研究所福建福州350018 中国科学院合肥物质科学研究院离子束生物工程学重点实验室安徽合肥230031

对籼稻材料PT46(高脂肪酶活性)和WP20(低脂肪酶活性)及其F2群体进行了脂肪酶活性的定量测定和遗传分析。χ2测验结果表明,F2群体表现型分布符合1∶2∶1的孟德尔分离比,表明脂肪酶活性高低由1对单基因控制,低脂肪酶活性为隐性性状。结合... 详细信息

对籼稻材料PT46(高脂肪酶活性)和WP20(低脂肪酶活性)及其F2群体进行了脂肪酶活性的定量测定和遗传分析。χ2测验结果表明,F2群体表现型分布符合1∶2∶1的孟德尔分离比,表明脂肪酶活性高低由1对单基因控制,低脂肪酶活性为隐性性状。结合SSR分子标记,以F2群体为定位群体,将脂肪酶活性基因定位在水稻第3染色体上,与SSR标记RM7和RM232之间的遗传距离分别为14.8cM和4.1cM,暂命名为la(lipase activity)。采用人工老化的方法,以种子发芽率和老化指数评价两亲本及其F2群体的耐储藏特性,结合所测定的脂肪酶活性数据进行相关性分析。结果表明,随着老化时间的延长,脂肪酶活性高的材料,发芽率降低迅速,老化指数增加很快,而脂肪酶活性较低的材料,老化指数变化相对较慢,即脂肪酶活性低的材料较耐储藏。经10、20d人工加速老化处理后的种子老化指数与种胚脂肪酶活性的相关系数分别为0.6165**和0.4703**,表明老化指数与脂肪酶活性呈显著正相关。

关键词：水稻脂肪酶活性定量分析遗传分析简单重复序列基因定位耐储性

绵羊脑、卵巢源EST-SSR标记与产羔数、初生重的关联性分析

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畜牧兽医学报 2014年第7期45卷 1084-1090页

作者：张文祥王遵宝赵宗胜李大全贾斌努尔力.阿不力孜石河子大学动物科技学院石河子832003

为了筛选与绵羊产羔数和初生重基因座紧密连锁的分子标记。本研究选择6个多态性丰富的绵羊脑、卵巢源EST-SSR位点,检测了德国美利奴与中国美利奴杂交F2代196只母羊的遗传多态性,分析了分子标记与产羔数、初生重的关联性。结果表明:6对... 详细信息

为了筛选与绵羊产羔数和初生重基因座紧密连锁的分子标记。本研究选择6个多态性丰富的绵羊脑、卵巢源EST-SSR位点,检测了德国美利奴与中国美利奴杂交F2代196只母羊的遗传多态性,分析了分子标记与产羔数、初生重的关联性。结果表明:6对绵羊脑、卵巢源EST-SSR多态位点在该群体中共检测到23个等位基因,群体杂合度在0.585 1~0.776 6,PIC值均大于0.5,属于高度多态位点,其中114719622、114720463和114722561位点的基因型分布处于哈代温伯格平衡状态。与产羔数、初生重关联分析表明:6个EST-SSR标记位点不同基因型间达到了显著(P<0.05)或极显著水平(P<0.01),114719418位点与羔羊平均初生重和总初生重关联;114720463和114758122位点分别与羔羊总初生重、产羔数关联;114719622和114722561位点与总初生重关联;47952182位点与产羔数关联。综上表明:6个EST-SSR标记位点可能与控制绵羊初生重、产羔数的基因座紧密连锁。

关键词：绵羊简单重复序列表达标签繁殖性状

玉米Opaque-2基因内3个SSR位点的显性等位变异及其对赖氨酸含量的影响

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作物学报 2006年第9期32卷 1265-1271页

作者：胡洁云杨文鹏张祖新郑用琏华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室湖北武汉430070 贵州省玉米工程技术研究中心/贵州省农业科学院旱粮研究所贵州贵阳550006

以10个O2O2基因型的普通玉米自交系和3个o2 o2基因型的高赖氨酸玉米自交系为材料,用3对O2基因内SSR引物phi112、umc1066和phi057进行PCR扩增产物电泳图谱分析和特异片段序列比较分析,以期了解O2位点显性等位变异对赖氨酸含量的影响。结... 详细信息

以10个O2O2基因型的普通玉米自交系和3个o2 o2基因型的高赖氨酸玉米自交系为材料,用3对O2基因内SSR引物phi112、umc1066和phi057进行PCR扩增产物电泳图谱分析和特异片段序列比较分析,以期了解O2位点显性等位变异对赖氨酸含量的影响。结果表明,玉米phi112、umc1066和phi057三个SSR位点均有丰富的显性等位变异,phi112位点的变异主要发生在其SSR序列的两侧,umc1066和phi057两位点的变异主要表现为SSR序列内部重复数目的变化和点突变。这些变异均对玉米籽粒的赖氨酸含量有影响。还讨论了这些显性等位变异影响O2基因的转录效率及其翻译产物对激活玉米醇溶蛋白合成能力改变的可能机制。

关键词：玉米简单重复序列显性等位赖氨酸含量

大豆细胞质雄性不育育性恢复基因Rf3的定位

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植物遗传资源学报 2021年第5期22卷 1411-1417页

作者：贾顺耕郭凤兰林春晶孙妍妍张颖雷蕾彭宝赵丽梅张春宝吉林省农业科学院大豆研究所/大豆国家工程研究中心长春130033 吉林农业大学农学院长春130118

在植物细胞质雄性不育/恢复系统中,一个不育基因能够被不同的恢复基因所恢复。在利用"三系"法进行杂交大豆选育过程中同样发现,作为父本的恢复系恢复能力不尽相同,可能存在不同的育性恢复基因。本研究以大豆细胞质雄性不育系JLCMS84A为... 详细信息

在植物细胞质雄性不育/恢复系统中,一个不育基因能够被不同的恢复基因所恢复。在利用"三系"法进行杂交大豆选育过程中同样发现,作为父本的恢复系恢复能力不尽相同,可能存在不同的育性恢复基因。本研究以大豆细胞质雄性不育系JLCMS84A为母本,以恢复系JLR1为父本配制杂交组合,以所获得的F2分离群体为试验材料,在大豆盛花期(R2期)根据花粉育性鉴定及显著性分析结果,明确JLR1所含恢复基因为显性单基因配子体遗传模式;结合集群分离分析法(BSA,bulked segregant analysis)和高通量测序技术,将其定位在第9号染色体上;进一步利用简单重复序列(SSR,simple sequence repeat)分子标记将该基因定位在分子标记BARCSOYSSR_09_1151和BARCSOYSSR_09_1183之间,遗传距离分别为0.6cM和0.5 cM,研究结果表明该基因是一个不同于已有研究的新恢复基因位点,将其命名为Rf3。本研究为进一步进行Rf3基因的克隆及鉴定提供了研究基础,同时也为开发与该基因紧密连锁的分子标记,并利用分子标记辅助选择(MAS,markerassisted selection)含有此恢复基因的新恢复系提供了理论依据。

关键词：细胞质雄性不育恢复基因集群分离分析法简单重复序列大豆

黄颡鱼遗传图谱构建及生长相关性状的QTL定位

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水产学报 2010年第2期34卷 185-193页

作者：葛学亮尹洪滨毕冰孙中武东北林业大学生命科学学院中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

以野生(♂)和人工养殖(♀)黄颡鱼杂交的100个F1个体为作图群体,用SSR、SRAP和TRAP3种DNA分子标记技术构建黄颡鱼的遗传连锁图谱。图谱整合了13个SSR标记,89个SRAP标记,26个TRAP标记。其中雌性框架图谱包括16个连锁群,图谱的长度为585.5... 详细信息

以野生(♂)和人工养殖(♀)黄颡鱼杂交的100个F1个体为作图群体,用SSR、SRAP和TRAP3种DNA分子标记技术构建黄颡鱼的遗传连锁图谱。图谱整合了13个SSR标记,89个SRAP标记,26个TRAP标记。其中雌性框架图谱包括16个连锁群,图谱的长度为585.5cM;雄性框架图谱包括15个连锁群,图谱的长度为752.3cM;共享框架图谱包括5个连锁群,图谱的长度为231.3cM。用该连锁图谱对黄颡鱼的5个生长相关性状进行QTL扫描,在雌性图谱上检测到1个头宽的QTL,定位于第七连锁群上,LOD值为3.2,可解释的表型变异为13%。在雄性图谱上分别检测到1个体高和体长的QTL,均定位于第一连锁群上。体高QTL的LOD值为2.4,可解释的表型变异为12%。全长QTL的LOD值为2.1,可解释的表型变异为11%。3个QTL均可用于黄颡鱼的生长性状的标记辅助育种。

关键词：黄颡鱼遗传图谱简单重复序列序列相关扩增多态性目标区域扩增多态性数量性状遗传位点

苦瓜性别相关SSR和SRAP分子标记的筛选及分析

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分子植物育种 2016年第7期14卷 1764-1771页

作者：王国莉陈勇智冉梦莲何凤芳佘美纯陈丽珊龚冠平冯荣华刘晓诗惠州学院生命科学系惠州516007

为揭示苦瓜雌雄花芽基因组间的分子差异,参照BSA法原理,构建了普通苦瓜雌雄花芽的DNA池和不同性型苦瓜雌雄花芽的DNA池,从26对SSR引物和30对SRAP引物中筛选特异引物对这些基因池进行差异性扩增。分析结果发现,两种标记分别筛选得到9对S... 详细信息

为揭示苦瓜雌雄花芽基因组间的分子差异,参照BSA法原理,构建了普通苦瓜雌雄花芽的DNA池和不同性型苦瓜雌雄花芽的DNA池,从26对SSR引物和30对SRAP引物中筛选特异引物对这些基因池进行差异性扩增。分析结果发现,两种标记分别筛选得到9对SRAP特异引物和8对SSR特异引物,引物有效率为30%和30.8%。苦瓜雌花芽和雄花芽DNA序列存在差异,SSR标记在分析普通苦瓜花芽DNA池和不同性型苦瓜花芽的DNA池时,多态性比率分别是10.7%和22.5%,SRAP的多态性比率则是7.4%和24.7%。SRAP扩增的雌性花芽的特异条带数较多,SSR分析雌雄花芽却只扩增出雄花芽的特异条带。但这些条带是否与性别表达基因紧密连锁,还需利用不同苦瓜的雌雄花芽DNA进行验证。这一研究结果为揭示苦瓜性别表达的分子机理奠定了基础。

关键词：苦瓜性别表达性型相关序列扩增多态性简单重复序列