检索结果-南通市图书馆

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

皮肤微生物对小鼠特应性皮炎的改善作用研究

皮肤微生物对小鼠特应性皮炎的改善作用研究

作者：谢坚南昌大学

学位级别：硕士

特应性皮炎(Atopic Dermatitis,AD)是一种以瘙痒为特征且反复发作的炎症性皮肤病,与金黄色葡萄球菌的定殖及皮肤微生物多样性下降高度相关。金黄色葡萄球菌具有加重AD的作用,因此被认为是一个合理的治疗靶点。鉴于目前广谱抗生素疗法效... 详细信息

特应性皮炎(Atopic Dermatitis,AD)是一种以瘙痒为特征且反复发作的炎症性皮肤病,与金黄色葡萄球菌的定殖及皮肤微生物多样性下降高度相关。金黄色葡萄球菌具有加重AD的作用,因此被认为是一个合理的治疗靶点。鉴于目前广谱抗生素疗法效果不佳,且产生细菌耐药性等问题,利用微生物种间竞争抑制金黄色葡萄球菌将成为一种有效的微生物疗法。本研究对人体皮肤微生物进行了分离、培养与鉴定;研究了不同的皮肤微生物对金黄色葡萄球菌的拮抗效果,筛选出拮抗作用强的代表性菌株;对代表性菌株全基因组进行测序;应用代表性菌株于小鼠皮肤改善了AD小鼠皮肤炎症。通过上述研究获得了如下结果:1.皮肤微生物的培养组。使用一次性拭子在人体的不同皮肤部位进行取样。经过简单培养,单菌落的分离,划线纯化与形态学和16s r RNA分子生物学鉴定,共获到了上万个单菌落,挑选了具有代表性的86个菌株,菌株提取DNA后扩增直接测序和BLAST。经比对鉴定,分别隶属6个细菌属,20个种。6个属分别为葡萄球菌属、假单胞菌属、芽孢杆菌属、克雷伯氏菌属、短杆菌属和微球菌属。2.皮肤微生物对金黄色葡萄球菌的抑菌作用。利用皮肤微生物无细胞上清液与Staphylococcus aureus USA300共培养,在21%与1%两个氧气水平下研究皮肤微生物对金黄色葡萄球菌细胞生长和生物膜形成的抑制作用。结果发现21%氧水平下生长抑菌率大于30%的菌株共有11株,主要是Bacillus subtilis和Staphylococcus epidermidis。Bacillus subtilis TOS-89对金黄色葡萄球菌细胞生长抑制率最高,达到75%;1%氧水平下生长抑菌率大于30%的菌株共有9株,主要是Bacillus subtilis、Staphylococcus epidermidis和Staphylococcus aureus。Bacillus subtilis TOS-89对金黄色葡萄球菌细胞生长抑制率最高,达到39%。皮肤微生物无细胞上清液对Staphylococcus aureus USA300生物膜形成的抑制作用中,芽孢杆菌和葡萄球菌菌株抑制效果相对较好,最高抑菌率分别达到64%和53%。采用抑菌圈法探究皮肤微生物与金黄色葡萄球菌的直接互作,结果发现共有12株菌株对Staphylococcus aureus USA300具有显著的抑制作用,其中Bacillus subtilis TOS-90的抑菌圈最大,为1.22±0.08cm;Brevibacterium sp.37 TOS-91的R值(抑菌圈直径/菌落直径)最大,达到3.22±0.69。根据上述实验结果与相关研究文献,选取了三株代表性拮抗菌株用于后续的Staphylococcus aureus USA300拮抗研究,其分别为Staphylococcus warneri TOS-23、Staphylococcus epidermidis GS-68与Bacillus subtilis TOS-90。3.皮肤微生物对小鼠特应性皮炎的改善作用。利用DNFB溶液与Staphylococcus aureus USA300构建AD小鼠模型,在小鼠皮肤上涂抹拮抗菌菌悬液进行干预治疗。治疗组共设有四组,分别为正常组(CT)、模型组(AD)、Bacillus subtilis TOS-90治疗组(BS)、Staphylococcus epidermidis GS-68治疗组(SE)、Staphylococcus warneri TOS-23治疗组(SW)与混合菌治疗组(M)。结果显示,BS组的治疗效果相对较好,其小鼠皮炎评分SCORAD、耳厚与Staphylococcus aureus USA300定殖均显著下降(P皮肤微生物组测序表明,BS组较AD组的皮肤菌群多样性与丰富度均有提高(P皮肤微生物多样性改善了小鼠特应性皮炎皮肤炎症。*** subtilis TOS-90的全基因组测序。测序结果显示Bacillus subtilis TOS-90的基因组总长度为4.69Mb,GC含量为45.94%,预测到5870个编码基因。根据COG功能注释结果,3502个基因具有明确的蛋白功能分类。根据KEGG功能注释结果

关键词：皮肤微生物特应性皮炎金黄色葡萄球菌抑菌作用枯草芽孢杆菌

皮肤微生物与寻常型中重度银屑病的相关性研究

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

皮肤微生物与寻常型中重度银屑病的相关性研究

作者：边慧莹哈尔滨医科大学

学位级别：硕士

背景及目的银屑病是由免疫介导的慢性炎症性疾病,可累及全身多个系统,严重影响患者的生活质量。其特征是角质形成细胞的过度增殖和炎细胞的浸润。银屑病发病的确切机制尚不清楚,T细胞的活化被认为在银屑病的发病中起到重要作用。近年来... 详细信息

背景及目的银屑病是由免疫介导的慢性炎症性疾病,可累及全身多个系统,严重影响患者的生活质量。其特征是角质形成细胞的过度增殖和炎细胞的浸润。银屑病发病的确切机制尚不清楚,T细胞的活化被认为在银屑病的发病中起到重要作用。近年来皮肤微生物在银屑病发病中的作用受到广泛关注,研究发现银屑病患者皮损处微生物群与健康皮肤存在差异。同时皮肤微生物还与几种免疫介导的疾病有关,如特应性皮炎、白癜风和化脓性汗腺炎等。但这些研究尚缺乏标准化的实验方法,使得结果存在差异甚至相互矛盾。为此,本研究将进一步明确皮肤微生物在银屑病皮损、非皮损和健康皮肤中的组成和分布特征,寻找皮肤微生物多样性与银屑病皮损面积与严重程度指数(PASI评分)之间的关系和具有显著差异性的物种,以探求皮肤微生物在银屑病发病中的作用,为临床治疗提供新的思路。方法采用皮肤拭子法和分区(油腻区、干燥区)取样收集临床样本。经微生物组总DNA提取和PCR扩增后,使用16S rDNA V3-V4可变区进行测序。测序数据以ASVs(Amplicon Sequence Variants)的概念构建类OTU(Operational Taxonomic Units),相当于以100%相似度聚类。获得ASV特征序列以及ASV丰度表格,进行物种注释和物种组成分析。对皮肤微生物群进行多样性分析,寻找组内及组间皮肤微生物群多样性的差异,包括物种多样性曲线、Alpha多样性分析和Beta多样性分析。Spearman分析银屑病皮损组多样性指数与PASI评分之间的关系。LEf Se(LDA Effect Size)分析寻找组间在丰度上具有显著性差异的物种,即biomarker。最后使用PICRUSt2(Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States)对菌群的功能进行预测。结果(1)在不同分类水平上各组的优势物种的组成具有相似性,但部分优势物种的相对丰度如放线菌门、拟杆菌门、葡萄球菌属、丙酸杆菌属等,从健康皮肤到银屑病非皮损皮肤再到皮损皮肤逐渐发生改变。(2)不同疾病状态(银屑病皮损、非皮损及健康皮肤)下,干燥区的皮肤微生物的丰富度和均匀度均要高于油腻区。银屑病患者皮肤微生物的多样性降低,银屑病非皮损皮肤微生物群处于二者之间的过渡状态。Spearman分析显示银屑病皮损组多样性指数与PASI评分无关,P值均大于0.05。(3)银屑病皮损组与健康对照组的菌群组成具有明显差异,Pr=0.00(P皮肤微生物群的差异性物种在属水平为Chryseobacterium(金黄杆菌属)和Enhydrobacter(水栖菌属),种水平为Chryseobacterium＿unclassified(未分类金黄杆菌)和Enhydrobacter＿unclassified(未分类肠杆菌);健康对照组皮肤微生物群的差异性物种在属水平为Cutibacterium(丙酸杆菌属)、Serratia(沙雷氏菌属)及Paraburkholderia(副伯克氏菌属),在种水平为Cutibacterium＿unclassified(未分类丙酸杆菌)、uncultured＿Serratia＿sp＿(未培养沙雷氏菌)及Paraburkholderia＿unclassified(未分类副伯克霍尔德菌)。(5)PICRUSt2功能预测显示,银屑病皮损区与健康对照相比L-色氨酸及L-蛋氨酸生物合成增加,L-异亮氨酸生物合成减少。结论(1)银屑病患者皮损、非皮损及健康对照组的皮肤微生物群的优势物种的组成具有相似性,但各优势物种的相对丰度不同。(2)银屑病患者皮肤微生物群多样性降低且与PASI评分无关,银屑病非皮损皮肤微生物群处于二者之间的过渡状态。(3)银屑病皮损组与健康对照组的菌群组成存在明显差异。(4)银屑病患者皮损皮肤微生物群的差异性物种与健康对照组相比存在明显不同,银屑病患者皮损皮肤微生物群的差异性物种为Chryseobacterium(金黄杆菌属)和Enhydrobacter(水栖菌属);健康对照组皮肤微生物群的差异性物种为Cutibacterium(丙酸杆菌属)、Serratia(沙雷氏菌属)和Paraburkholderia(副伯克氏菌属)。

关键词：银屑病皮肤微生物 16S rDNA测序

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

化妆品防腐剂使用与皮肤微生物的关系

卫生研究 2022年第1期51卷 153-156页

作者：崔生辉陈怡文(综述) 路勇(审校) 中国食品药品检定研究院北京100050

防腐剂是化妆品应对微生物污染的主要手段,添加益生菌相关物质是近期化妆品的重要发展方向。本文对化妆品中微生物污染及现阶段的防控措施进行了分析,总结了化妆品中防腐剂使用、皮肤微生物和益生菌相关化妆品的发展现状,并结合现阶段... 详细信息

防腐剂是化妆品应对微生物污染的主要手段,添加益生菌相关物质是近期化妆品的重要发展方向。本文对化妆品中微生物污染及现阶段的防控措施进行了分析,总结了化妆品中防腐剂使用、皮肤微生物和益生菌相关化妆品的发展现状,并结合现阶段皮肤微生物组学发展现状,对化妆品中防腐剂的使用对皮肤微生物的影响进行了分析,探讨我国化妆品安全监管微生物技术需求与检定溯源网络建设的必要性。

关键词：化妆品皮肤微生物微生物鉴定

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

皮肤微生物与银屑病发病相关性的研究进展

临床医学进展 2022年第2期12卷 1248-1254页

作者：边慧莹周婧哈尔滨医科大学附属第二医院皮肤科黑龙江哈尔滨

银屑病的病因极其复杂,涉及遗传、免疫与环境等多种因素。近年来越来越多的研究发现,银屑病患者存在皮肤微生物群失调,发病机制可能涉及对皮肤微生物免疫耐受的崩溃。但这些研究在取样方法、部位和微生物分析方法上各持己见,尚无统一标... 详细信息

银屑病的病因极其复杂,涉及遗传、免疫与环境等多种因素。近年来越来越多的研究发现,银屑病患者存在皮肤微生物群失调,发病机制可能涉及对皮肤微生物免疫耐受的崩溃。但这些研究在取样方法、部位和微生物分析方法上各持己见,尚无统一标准。迄今为止尚未发现皮肤微生物和银屑病之间的相关性,即微生物的组成变化是否与银屑病的发病具有因果关系。本文对国内外利用现代测序技术鉴定银屑病皮肤微生物多样性的研究进行梳理和分析,旨在了解银屑病发病机制,明确当前的研究进展和存在的问题,为进一步的研究提出建议。

关键词：银屑病皮肤微生物发病机制 Toll样受体抗菌肽

中国女性皮肤衰老与生理参数及皮肤微生物的关系研究

维普期刊数据库评论

在线全文

维普期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

中国女性皮肤衰老与生理参数及皮肤微生物的关系研究

作者：王彩霞上海应用技术大学

学位级别：硕士

背景:微生物菌群的变化与基础疾病之间的关系研究已经成为焦点,皮肤健康与微生态菌群的关系研究在学术界受到广泛关注。目的:探索中国女性在不同皮肤衰老程度下,面部皮肤生理状态和微生物菌群的变化,以及分析皮肤生理状态与微生物菌群... 详细信息

背景:微生物菌群的变化与基础疾病之间的关系研究已经成为焦点,皮肤健康与微生态菌群的关系研究在学术界受到广泛关注。目的:探索中国女性在不同皮肤衰老程度下,面部皮肤生理状态和微生物菌群的变化,以及分析皮肤生理状态与微生物菌群之间的相互关系,以期为后续的皮肤微生态的调节、皮肤生理状态的改善护肤品产品开发,提供有力的数据支撑。方法:通过招募上海地区,年龄在18～60岁的494名健康志愿者,采用非创伤性生物物理过程技术方法和16S rRNA高通量及ITS测序技术方法,对受试者面部皮肤生理参数测试,面部微生物菌群采集、测序。参考面部皱纹量表(Ficial Wrinkle Scale,FWS)及《皮肤老化图谱第二册亚洲人》,以鱼尾纹数量多少和深浅程度为指标的分级方法,进行衰老分级,共分为三级,分别命名为W0、W1、W2三组。对其中262名健康女性的皮肤生理参数、微生物菌群分布与衰老之间的关系进行研究。根据研究结果,开发一款具有调节微生态的抗衰老化妆品进行验证。结果:研究结果表明,不同皮肤衰老程度之间,皮肤生理参数发生明显变化,皮肤角质层水分含量和p H值呈上升趋势、皮脂含量呈下降趋势(P>0.05),TEWL、弹性显著降低(P皮肤衰老程度增大,细菌和真菌的物种多样性增大。分类学成分分析显示,门水平上衰老程度大的皮肤变形菌门、子囊菌门相对丰度增加,放线菌门相对丰度减少。属水平上,衰老程度大的丙酸杆菌相对丰度显著下降,棒状杆菌、枝孢菌、假丝酵母菌的相对丰度显著增加。皮肤生理参数与菌群相关性分析可知,两者之间密切程度较高,呈正相关者:如皮肤角质层水分含量与链球菌属、黑孢属、青霉菌属、红酵母属,皮脂含量与丙酸杆菌属、粪壳菌纲下某属,TEWL与粪壳菌纲下某属,皮肤弹性与毛孢子菌属;呈负相关者,如血红素与青枯菌属,TEWL与奈瑟氏菌属,皮脂含量与放线菌属、罗氏菌属、不动杆菌属,皮肤弹性与不动杆菌属、链球菌属、金黄杆菌属,黑色素含量与假单胞菌属、青枯菌属、毛孢子菌属和镰刀菌属。使用本课题开发的微生态抗衰老化妆品28天后的结果表明,面部皮肤衰老与皮肤生理参数和菌群确有关系。结论:中国女性在皮肤衰老过程中,皮肤生理状态和皮肤微生物菌群均会发生变化,且显示出明显的相关关系。设计的一款能调节皮肤菌群、具备祛皱抗衰的精华液,得到预期效果,验证了皮肤衰老与皮肤菌群之间的关系,本课题为抗衰化妆品研发提供了新思路。

关键词：皮肤衰老中国女性生理参数皮肤微生物 16S rRNA

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

乳腺癌对人体皮肤微生物影响的研究

乳腺癌对人体皮肤微生物影响的研究

作者：曹玉雪吉林大学

学位级别：硕士

研究背景乳房组分包括皮肤,纤维组织,乳腺和脂肪。正常生理机能下,乳房中细胞有序地进行新陈代谢,而有时这种正常的代谢和生长过程可能会发生错误:新的细胞不需要时也会形成,衰老细胞凋亡行程阻碍,从而使得多余的细胞堆积形成肿块。乳... 详细信息

研究背景乳房组分包括皮肤,纤维组织,乳腺和脂肪。正常生理机能下,乳房中细胞有序地进行新陈代谢,而有时这种正常的代谢和生长过程可能会发生错误:新的细胞不需要时也会形成,衰老细胞凋亡行程阻碍,从而使得多余的细胞堆积形成肿块。乳腺上皮组织中形成的恶性肿块即乳腺癌。在世界范围内,乳腺癌是女性中的头号杀手,且由于其异质性、高侵袭性和生理特征复杂性,导致多年来乳腺癌研究进展缓慢。研究显示,乳腺癌的发生发展和临床病理特征与人体微生物组的改变息息相关。乳房组织自身菌群、肠道菌群以及部分身体远端部位的微生物群均已经过研究检验,会因乳腺肿瘤病变状态而有所改变。而皮肤作为人体表面最大的器官,其菌群平衡对许多疾病都存在显著影响。这提示了乳腺癌和皮肤菌群之间可能具有某种未知的相关性。与肠道中的微生物相似,皮肤微生物在抵御入侵病原体、免疫系统的形成以及天然产物的分解等方面都有着重要的作用。当皮肤处于健康状态时,皮肤微生物与人体皮肤和外部环境一起构成了平衡和稳定的皮肤微生态,若一旦遭受环境改变或病原菌侵袭等使平衡被打破,引发微生态失衡,将会对宿主产生一系列屏障受损、引发或加速病变的连锁效应。近期有研究显示,皮肤微生物对宿主的保护性作用不仅限于皮肤表面一些诸如痤疮和特异性皮炎等常见疾病,还具备通过阻碍DNA合成而抑制肿瘤的潜能。这为日后皮肤微生物的研究指点了新的方向。本实验通过分析乳腺癌患者的皮肤菌群,探讨乳腺癌患者与健康人之间可能存在的菌群特征差异。研究目的乳腺癌作为全球范围内女性的头号杀手,因其复杂性一直没有合适的筛选方式,大部分患者确诊时已经是中晚期。本研究应用高通量测序技术,选择皮肤微生物群最多样和稳定的干燥部位,分析乳腺癌患者治疗前后与健康人群皮肤微生物群的异同,初步探索皮肤微生物与乳腺癌的关联,对日后找出可能存在的乳腺癌微生物风险标志和潜在的基于微生物的防治提供了初步参考。研究内容及方法为了探究乳腺癌患者与健康人群皮肤菌群的差异特征,选取未经过治疗的乳腺癌患者、经过1-3月治疗的乳腺癌患者和健康受试者各5名,受试者年龄均在50-60岁之间。在无菌环境下运用无菌拭子擦拭法采集受试者左前臂处皮肤样品。对样品进行DNA提取、PCR扩增、文库构建、Illumina测序、生物信息学分析等一系列操作。研究结果患者组OTU数量较之健康组和治疗组呈显著降低,α多样性和β多样性低于健康组。三组之间在优势菌群上差异不显著,主要差异集中在丰度较低的菌种上。患者组整体细菌丰度和多样性降低,科、属水平上组内差异性更为剧烈,菌群组分更为复杂。其中梭杆菌门,放线菌科,微球菌科,梭杆菌科,韦荣球菌科,肠杆菌科,不动杆菌属和假单胞菌属丰度降低显著,与健康组差异显著。治疗组整体差异不显著,部分菌种相较于患者组丰度有所回升。

关键词：皮肤微生物乳腺癌高通量测序 Illumina测序

基于皮肤微生物组的抗光老化发酵乳杆菌作用机制研究

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

基于皮肤微生物组的抗光老化发酵乳杆菌作用机制研究

作者：陈慧贞华南理工大学

学位级别：硕士

随着人们对皮肤健康的需求日渐增长,皮肤光老化问题越来越受到关注。自人类微生物组计划开展以来,皮肤微生物在皮肤健康中的重要作用被深入解析。目前益生菌改善皮肤健康尤其是缓解光老化问题已成为科学研究和市场应用的新热点,但益生... 详细信息

随着人们对皮肤健康的需求日渐增长,皮肤光老化问题越来越受到关注。自人类微生物组计划开展以来,皮肤微生物在皮肤健康中的重要作用被深入解析。目前益生菌改善皮肤健康尤其是缓解光老化问题已成为科学研究和市场应用的新热点,但益生菌改善皮肤光老化的具体机制和活性成分仍不清楚。本论文采用多组学手段联合解析乳杆菌的抗光老化作用机制:研究首先通过建立单侧日晒人群观察队列和建立光老化动物模型分析皮肤光老化过程中的微生态特征及潜在调控机制;研究继而根据光老化进程中皮肤受损的关键微生物,从我国来源的健康功能微生物菌种资源库中靶向筛选具有防控光老化作用的菌株;在此基础上,研究结合比较基因组学和靶向代谢组学探索发酵乳杆菌户外紫外线(Ultraviolet Radiation B,UVB)所致表皮光老化的活性代谢物,同时联合转录组学及非靶向代谢组学解析发酵乳杆菌由抗长波黑斑效应紫外线(Ultraviolet Radiation A,UVA)所致真皮光老化的活性代谢产物及作用的分子通路。本研究得到的主要结果如下:(1)建立长期单侧日晒人群的观察队列及实验动物模型,研究通过16S r RNA扩增子测序分析得出长期光照使表皮和真皮层中的乳杆菌相对丰度显著降低。通过微生物功能预测及环境因子关联分析发现,长期光照后皮肤微生物的变化会引起微生物源的抗老化物质如依可多因Ecotin、烟酰胺单核苷酸转运蛋白减少,进而导致皮肤修复光损伤能力下降、皮肤细胞中金属蛋白酶和炎症因子升高;这系列结果提示维持光照后皮肤微生态平衡有利于防止皮肤皱纹等老化症状产生;(2)根据光老化进程中受损的关键皮肤微生态特征,研究在我国来源的健康功能微生物菌种资源库中靶向筛选获得具有修复UVB损伤表皮作用的高效抗氧化菌株——发酵乳杆菌XJC60;联合比较基因组和靶向代谢组解析发酵乳杆菌XJC60的抗光老化活性物质为烟酰胺,XJC60通过产生高含量烟酰胺、稳定光损伤后皮肤的NAD/NADH水平、恢复线粒体膜电位水平并减少皮肤细胞内的活性氧(reactive oxygen species,ROS)水平;研究继而在细胞及动物水平上均验证XJC60的发酵上清通过其抗氧化作用,有效抑制UVB损伤后皮肤胶原蛋白降解和炎症发生,发挥抗光老化功效;(3)根据光老化进程中受损的关键皮肤微生态特征,研究在我国来源的健康功能微生物菌种资源库靶向筛选出具有修复UVA损伤真皮细胞作用的益生乳酸菌——发酵乳杆菌XJC48;采用非靶向代谢组分析推测XJC48代谢物中特异的单峰多糖是其发挥抗光老化作用的关键代谢产物;研究通过转录组分析发现XJC48来源的单峰多糖可通过调节IGF-1/Akt/Fox O细胞老化相关通路,从而发挥抗UVA损伤作用。综上所述,本论文通过探索光老化的皮肤微生态机制发现乳杆菌是其中的关键菌属,并在我国来源的健康功能微生物菌种资源库中筛选并在体内外验证了两株发酵乳杆菌XJC60和XJC48的抗光老化作用。本研究为创制系列高效安全的抗光老化新方法提供了理论基础。

关键词：光老化皮肤微生物发酵乳杆菌多组学代谢产物

应用高通量测序分析健康中国人群的皮肤微生物

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

应用高通量测序分析健康中国人群的皮肤微生物

作者：翟婉芳安徽医科大学

学位级别：硕士

研究背景皮肤暴露于外界环境中,形成机体抵御物理、生物化学等外来侵袭的第一道防线,同时其表面居住着各种各样的微生物,包括细菌、真菌、病毒、螨虫,形成一个复杂而充满活力的生态系统。皮肤微生物群参与并调节皮肤先天性免疫和适应性... 详细信息

研究背景皮肤暴露于外界环境中,形成机体抵御物理、生物化学等外来侵袭的第一道防线,同时其表面居住着各种各样的微生物,包括细菌、真菌、病毒、螨虫,形成一个复杂而充满活力的生态系统。皮肤微生物群参与并调节皮肤先天性免疫和适应性免疫,在皮肤健康和疾病发生发展中具有重要作用。研究目的通过高通量测序表征健康中国人群皮肤表面的细菌和真菌群落,了解其与部位、年龄、性别的关系。研究方法将50名健康受试者划分为五个年龄层,即儿童(4～6岁)、青少年(11～13岁)、年轻人(25～34岁)、中年人(37～53岁)和老年人(62～74岁)。运用拭子法采集其面颊、后背和掌前臂的皮肤样品,对皮肤拭子进行微生物基因组DNA提取—目的片段PCR扩增(细菌目的片段为16Sr DNA的V3-V4区,真菌目的片段为ITS2区)—PCR产物纯化—文库构建—上机测序—质量过滤—生物信息分析。研究结果共产生9,574,365条高质量的16S r DNA V3-V4区序列和10,382,475条高质量的ITS2区序列,物种注释为两个古生菌门,即Thaumarchaeota(奇古菌门)和Euryarchaeota(广古菌门),四个优势细菌门,即Actinobacteria(放线菌门)、Proteobacteria(变形菌门)、Firmicutes(厚壁菌门)和Bacteroidetes(拟杆菌门),两个优势真菌门,即Ascomycota(子囊菌门)和Basidiomycota(担子菌门)。后背以Propionibacterium(丙酸杆菌属)、Staphylococcus(葡萄球菌属)、Basidiomycota(担子菌门)、Malassezia(马拉色菌属)、Malassezia globosa(球形马拉色菌)为主,面颊和掌前臂有相似的细菌和真菌群落组成,但掌前臂有更高的细菌和真菌物种多样性,以Alphaproteobacteria(α-变形杆菌纲)为主,而面颊以Betaproteobacteria(β-变形杆菌纲)为主。老年人有更高的细菌物种丰富度和多样性,儿童有更高的真菌物种丰富度和多样性,宜于丝状真菌Cladosporium(枝孢菌)、Aspergillus(曲霉属)、Alternaria(链格孢属)、Penicillium(青霉属)和非马拉色酵母真菌Debaryomyces(德巴利酵母属)、Saccharomycopsis(覆膜孢酵母属)、Candida(假丝酵母属)的定殖,而不宜于亲脂性的Propionibacterium(丙酸杆菌属)、Malassezia(马拉色菌属)生长。丙酸杆菌属、马拉色菌属受皮脂水平影响,其丰度在青春期急剧增加,青壮年达到高峰,此后随年龄增长丰度逐渐降低。男性比女性有更高的细菌物种丰富度,女性有更丰富的Ascomycota(子囊菌门),男性有更丰富的Malassezia restricta(限制性马拉色菌)。此外皮肤表面高比例的气运真菌表明皮肤除了是常驻菌生长的栖息地,也作为沉积表面被动地从环境或衣物中收集更多的暂驻菌。研究结论鉴定了健康中国人皮肤表面的细菌和真菌群落,其群落组成和丰度受皮肤部位、年龄和性别影响,为皮肤疾病或屏障结构受损下的微生物群落鉴定以及正常微生物群的功能学研究奠定了基础。

关键词：皮肤微生物 16SrDNA ITS2 部位年龄性别

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

普氏蹄蝠的皮肤微生物组研究

普氏蹄蝠的皮肤微生物组研究

作者：赵敖华东师范大学

学位级别：硕士

动物的雌性个体常常倾向于选择特定的雄性作为配偶,雄性个体间也会通过性别内的直接竞争决定交配机会。无论哪种方式的性选择,获得更高生殖成功率的雄性通常在体格、健康程度、免疫力等方面有更高的优势,最终提高了后代的适合度。相关... 详细信息

动物的雌性个体常常倾向于选择特定的雄性作为配偶,雄性个体间也会通过性别内的直接竞争决定交配机会。无论哪种方式的性选择,获得更高生殖成功率的雄性通常在体格、健康程度、免疫力等方面有更高的优势,最终提高了后代的适合度。相关研究发现,动物的皮肤微生物组的特征与宿主的免疫力、健康状况等有密切关系;与此同时,宿主的遗传背景也常常对其皮肤微生物组的组成与结构有着重要影响。普氏蹄蝠存在典型的性别二态性,雄性个体头部的顶叶器官存在明显的大小差异,具有更大顶叶的雄性蝙蝠被认为在性选择中处于更高的优势地位。本文以普氏蹄蝠（Hipposideros pratti）为研究对象,通过对不同顶叶大小的雄性普氏蹄蝠皮肤微生物组的比较分析,揭示其顶叶形态特征与皮肤微生物组特征之间的关系。本研究通过拭子法采集雄性普氏蹄蝠的皮肤微生物,并进行16S rRNA高通量测序。在对测序结果进行质控、拼接、分类注释、多样性分析、网络结构构建、差异分析和功能注释等相关分析后,我们发现雄性普氏蹄蝠皮肤微生物群落主要有4个优势菌门,分别为拟杆菌门（Bacteroidetes）、变形菌门（Proteobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）和绿菌门（Chlorobi）,占皮肤微生物总量的93%。不同顶叶大小的雄性普氏蹄蝠皮肤微生物群落的物种多样性无明显差异,但是在群落结构上呈现出明显差异,并且大顶叶组具有更加复杂而稳定的微生物群落,而小顶叶组个体之间微生物结构差异较大。通过随机森林和LEfSe分析,发现4种菌属对普氏蹄蝠皮肤微生物差异产生影响,分别是不动杆菌属（Acinetobacter）、密螺旋体属（Treponema）、乳杆菌属（Lactobacillus）、Gemmiger,其中不动杆菌属在小顶叶组中多度明显增加。通过功能注释发现在小顶叶组中高表达的通路有原发性免疫缺陷、金黄色葡萄球菌感染、致病性大肠杆菌感染等,其中原发性免疫缺陷与不动杆菌属相关。本研究发现普氏蹄蝠的皮肤微生物组成及群落结构存在差异,进一步丰富了对蝙蝠皮肤微生物的研究。鉴于已有研究和上述实验,推测雄性普氏蹄蝠中大顶叶个体比小顶叶个体具有更良好的健康状况,暗示了顶叶形态特征在普氏蹄蝠性选择机制中的作用,这为今后开展普氏蹄蝠性选择的遗传学研究提供了新的参考。

关键词：普氏蹄蝠性选择 16S rRNA测序皮肤微生物