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2014-2020年河南省EV71疫苗上市前后对重症手足口病流行特征及病原谱影响

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中国公共卫生 2024年第3期40卷 342-346页

作者：王若琳李亚飞王文华卫海燕卢世栋王海峰叶莹黄学勇河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所郑州450016

目的探索肠道病毒71型(EV71)疫苗上市前后河南省重症手足口病流行特征和病原谱的变化情况,为制定重症手足口病防控策略提供相关依据。方法通过中国疾病预防控制中心传染病报告信息管理系统选取河南省2014-2020年所有手足口病报告信息... 详细信息

目的探索肠道病毒71型(EV71)疫苗上市前后河南省重症手足口病流行特征和病原谱的变化情况,为制定重症手足口病防控策略提供相关依据。方法通过中国疾病预防控制中心传染病报告信息管理系统选取河南省2014-2020年所有手足口病报告信息,分析EV71疫苗上市后河南省重症手足口病流行特征及病原谱变化。结果 2014-2020年,河南省共报告重症手足口病病例13 535例。EV71疫苗于2017年广泛使用,与上市前(2014-2016年)比较,上市后(2017-2020年)手足口病重症病例所占比率从3.19%(10 948/343 585)降为0.93%(2 587/278 075),差异有统计学意义(χ^(2)=3 672.874,P 病原由EV71转为其他肠道病毒,应进一步加强重点人群、高发季节、重点场所的EV71疫苗推广应用工作,开展综合防控工作预防重症手足口病的发生。

关键词：手足口病 EV71疫苗重症流行特征病原谱

新型冠状病毒感染疫情前后成人社区获得性肺炎病原谱变化及分析

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中国临床药理学杂志 2024年第4期40卷 607-610页

作者：程然李璐李晓光路明林菲北京大学第三医院感染疾病科北京100191 北京大学第三医院呼吸与危重症医学科北京100191

目的探讨新型冠状病毒感染疫情前后成人社区获得性肺炎(CAP)患者的病原体分布特点,为CAP诊疗及防控提供理论依据。方法纳入2017年6月至2022年7月就诊于北京大学第三医院发热门诊的CAP患者,按照时间节点(2020-01-24北京进入新型冠状病... 详细信息

目的探讨新型冠状病毒感染疫情前后成人社区获得性肺炎(CAP)患者的病原体分布特点,为CAP诊疗及防控提供理论依据。方法纳入2017年6月至2022年7月就诊于北京大学第三医院发热门诊的CAP患者,按照时间节点(2020-01-24北京进入新型冠状病毒一级防控)分为疫情前组和疫情后组。用实时荧光定量聚合酶链反应检测方法对采集的呼吸道样本进行病原体核酸检测,对病原体的检出情况及分布情况进行分析。结果纳入415例CAP患者,分为疫情前组(312例)和疫情后组(103例)。肺炎支原体、肺炎链球菌、甲型流感病毒是疫情前CAP组患者最常见的3种病原体。而乙型流感病毒、肺炎克雷伯菌、肺炎链球菌是疫情后社区获得性肺炎中最常见的3种病原体。甲型流感病毒、副流感病毒、肺炎支原体在疫情前的发生率均显著高于疫情后,2组间差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论疫情前后,流感病毒均为CAP患者主要致病菌,对今后经验性的治疗,保护易感人群和防控传染病具有重要意义。

关键词：新型冠状病毒感染发热门诊社区获得性肺炎病原谱

上海市普陀区儿童感染性腹泻病例病原谱及分子特征

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上海预防医学 2024年第6期36卷 543-550页

作者：顾文超张焕生唐海丰闫浩吴婷婷桂依琳李强李勇上海市普陀区疾病预防控制中心上海200333

【目的】了解2018—2023年上海市普陀区儿童感染性腹泻病的病原谱和分子特征,为儿童感染性腹泻防控提供科学依据。【方法】收集2018年1月—2023年12月上海市普陀区儿童腹泻病监测哨点医院就诊病例的粪便标本,通过分离培养11种细菌和实... 详细信息

【目的】了解2018—2023年上海市普陀区儿童感染性腹泻病的病原谱和分子特征,为儿童感染性腹泻防控提供科学依据。【方法】收集2018年1月—2023年12月上海市普陀区儿童腹泻病监测哨点医院就诊病例的粪便标本,通过分离培养11种细菌和实时荧光聚合酶链反应(PCR)检测5种病毒。使用脉冲场凝胶电泳(PFGE)标准分型法分析部分阳性菌株的分子分型;采用逆转录PCR方法扩增部分诺如病毒阳性标本的聚合酶-衣壳蛋白连接区,基因测序后使用生物信息软件进行分析。采用χ^(2)检验或Fisher精确概率法比较2018—2019年和2020—2023年病原体阳性率。【结果】707例病例中,总阳性率为47.67%,单一细菌阳性率为16.27%,单一病毒阳性率为22.63%,混合阳性率为8.77%。优势病原体为轮状病毒(10.75%)、诺如病毒(10.33%)、肠致病性大肠杆菌(8.06%)、沙门菌(6.36%)、肠集聚性黏附大肠杆菌(5.52%)、弯曲菌(5.23%)。夏秋季以细菌感染为主,冬春季以病毒感染为主。2020—2023年的总阳性率较2018—2019年下降(χ^(2)=5.753,P病原体,病原谱呈现季节性流行特征,部分病原体的分子特征存在多样性。应在不同季节加强儿童感染性腹泻病原体的分子特征监测,为防控提供实验室依据。

关键词：儿童感染性腹泻病原谱脉冲场凝胶电泳基因型

2020—2021年武汉市596例急性呼吸道感染患者病原谱研究

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实用预防医学 2024年第7期31卷 805-810页

作者：吴奕璇李瑶孔雯骅张祎婕刘满清武汉市疾病预防控制中心湖北武汉430021

目的在新冠感染疫情暴发一年后,明确非药物干预措施下武汉冬季呼吸道感染患者病原谱的构成,为呼吸道感染性疾病的防治提供病原学依据。方法收集2020年12月28日—2021年2月14日武汉8家大型医院发热门诊急性呼吸道感染(acute respiratory ... 详细信息

目的在新冠感染疫情暴发一年后,明确非药物干预措施下武汉冬季呼吸道感染患者病原谱的构成,为呼吸道感染性疾病的防治提供病原学依据。方法收集2020年12月28日—2021年2月14日武汉8家大型医院发热门诊急性呼吸道感染(acute respiratory tract infection,ARTI)病例咽拭子样本,经全自动核酸提取仪提取核酸后,采用实时荧光定量PCR技术进行23种常见呼吸道病原体检测。采用Excel 2016软件对数据进行录入、整理,建立数据库,用SPSS 20.0软件进行统计学分析。结果共收集596例ARTI病例,其中男性335例,女性261例,男女比例1.28∶1。年龄最小患者为5月龄,最大为91岁。23种呼吸道病原体中共13种病原体检出阳性,总阳性率86.24%(514/596),排在前3位的病原体分别为肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae,SPN)占比30.47%(323/1060)、肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KPN)占比24.25%(257/1060)和流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae,HIN)占比19.43%(206/1060)。514例检测阳性的病例中混合感染共331例,占比64.40%(331/514),其中细菌之间的混合感染占比54.68%(181/331)高于细菌和病毒的混合感染45.01%(149/331)。331例混合感染病例中,仅检出1例病毒之间的混合感染,占比0.30%(1/331),为人偏肺病毒(human metapneumovirus,HMPV)和呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)共感染。HIN、KPN、SPN、HMPV、RSV、呼吸道腺病毒(respiratory adenovirus,RA)、人博卡病毒(human bocavirus,HBoV)和肠道病毒(human enterovirus,HEV)在不同年龄段的患者中检出率差异有统计学意义,HIN、KPN、SPN、HMPV和RSV在不同体温患者中的检出率差异有统计学意义,不同性别患者之间所有病原体的检出率差异无统计学意义。国家级和非国家级流感监测哨点医院之间A族链球菌(group A streptococcus,GAS)和RSV的检出率差异有统计学意义。结论非药物干预措施下武汉冬季呼吸道病原以SPN、KPN、HIN、HMPV和金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)为主。加强对这些病原体的监测和预防是武汉市冬季呼吸道传染病防控的重点。

关键词：急性呼吸道感染非药物干预措施呼吸道病原体病原谱监测与预防

2021—2022年温州市住院儿童急性呼吸道感染病原谱变化分析:一项单中心研究

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温州医科大学学报 2024年第4期54卷 279-286页

作者：黄伊凡祁心怡刘秀静谢振迪余坚陈占国温州医科大学附属第二医院育英儿童医院临床检验中心浙江温州325027 杭州医学院检验医学院浙江杭州310059

目的:对比分析2021年和2022年温州市住院儿童急性呼吸道感染(ARIs)病原谱变化特点,为温州市儿童ARIs的精准诊治及防控提供科学依据。方法:回顾性分析2021年1月至2022年12月收治于温州医科大学附属第二医院育英儿童医院的ARIs住院患儿的1... 详细信息

目的:对比分析2021年和2022年温州市住院儿童急性呼吸道感染(ARIs)病原谱变化特点,为温州市儿童ARIs的精准诊治及防控提供科学依据。方法:回顾性分析2021年1月至2022年12月收治于温州医科大学附属第二医院育英儿童医院的ARIs住院患儿的13种呼吸道病原体检测结果,对比分析2021年和2022年ARIs住院患儿的病原谱特征,以及在不同性别、不同年龄、不同季节和病原体感染模式等方面的差异及变化趋势。结果:2021年和2022年病原体总阳性率分别为70.74%(3 477/4 915)和70.74%(6 099/8 622)。2022年检出率排名前五位的主要病原体,从2021年依次为鼻病毒(HRV)、呼吸道合胞病毒(HRSV)、副流感病毒(HPIV)、腺病毒(HADV)和偏肺病毒(HMPV),转变为HRV、肺炎支原体(Mp)、HRSV、HADV和HMPV。2022年Mp、HADV和HMPV检出率较2021年明显升高(均P病原体总体检出率男童略高于女童,以2~病原体好发年龄段有低龄化或高龄化趋势,感染高发季节存在不同程度的提前、延长或季节互换。2022年单一感染明显升高,多重感染明显下降,多重感染以HRV+Mp为主。结论:2022年温州市住院儿童ARIs病原谱与2021年相比有较大变化。低段幼儿仍是重点防治对象,Mp、HADV和HMPV感染率上升以及H3N2大暴发等问题需引起高度重视。建议持续加强ARIs的病原学监测。

关键词：急性呼吸道感染病原谱变化趋势住院患儿

儿童急性脑炎脑膜炎症候群病原谱流行病学特征分析

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实用预防医学 2024年第7期31卷 879-882页

作者：王迪凌慧周进芳南京医科大学附属儿童医院江苏南京210000

目的探讨儿童急性脑炎脑膜炎症候群流行特征,为该病的预防控制提供参考依据。方法收集2018年1月—2022年12月南京医科大学附属儿童医院上报的儿童急性脑炎脑膜炎症候群病例6328例,分析病例的时间分布、人群分布及病原谱构成,比较细菌和... 详细信息

目的探讨儿童急性脑炎脑膜炎症候群流行特征,为该病的预防控制提供参考依据。方法收集2018年1月—2022年12月南京医科大学附属儿童医院上报的儿童急性脑炎脑膜炎症候群病例6328例,分析病例的时间分布、人群分布及病原谱构成,比较细菌和病毒感染患儿临床症状差异。结果2018—2022年,年平均报告儿童急性脑炎脑膜炎症候群病例1265.60例;月份分布中,5—9月报告数较多。儿童急性脑炎脑膜炎症候群病例年龄主要以0~3岁、4~6岁和7~8岁为主,分别占35.19%、28.98%和23.94%;男女患儿年龄构成比较差异无统计学意义(χ^(2)=6.605,P=0.158)。共有2267例采集了血清/脑脊液样本,检出病原体311例,阳性率为13.72%,其中病毒感染178例,占57.23%,细菌感染133例,占42.77%。病毒感染以肠道病毒和疱疹病毒为主,细菌感染以肺炎链球菌和流感嗜血杆菌为主。细菌感染患儿中恶心、精神萎靡、嗜睡、颈项强直、角弓反张比例分别为56.39%、66.17%、53.38%、48.87%和11.28%,明显高于病毒感染患儿(P病原谱中病毒感染以肠道病毒和疱疹病毒为主,细菌感染以肺炎链球菌和流感嗜血杆菌为主,患儿年龄以0~8岁为主,5—9月份高发,且病毒感染和细菌感染患儿临床症状有所差异,临床可据此针对性地做好防控干预工作。

关键词：儿童急性脑炎脑膜炎症候群病原谱病毒感染细菌感染

济南市2017-2021年急性脑炎脑膜炎症候群监测病例病原谱分析

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中国疫苗和免疫 2024年第2期30卷 169-173页

作者：武晶晶刘子薇谭丽杨风华孙红云济南市疾病预防控制中心山东济南250021 平阴县疾病预防控制中心山东济南250400

目的了解济南市急性脑炎脑膜炎症候群(Acute meningitis and encephalitis syndrome,AMES)监测病例病原谱构成。方法2017-2021年在济南市7家医院开展AMES病例监测,采集血清和/或脑脊液标本,检测乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis viru... 详细信息

目的了解济南市急性脑炎脑膜炎症候群(Acute meningitis and encephalitis syndrome,AMES)监测病例病原谱构成。方法2017-2021年在济南市7家医院开展AMES病例监测,采集血清和/或脑脊液标本,检测乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)、肠道病毒(Enterovirus,EV)、流行性腮腺炎病毒(Mumps virus,MuV)和单纯疱疹病毒(Herpes simplex virus,HSV)IgM抗体以及脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitides,Nm)、肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae,Spn)和b型流感嗜血杆菌(Haemophilus influenza type b,Hib)抗原,分析IgM抗体和抗原阳性率。结果AMES病例JEV、EV、MuV、HSV IgM抗体阳性率分别为3.15%(82/2604)、13.62%(298/2188)、10.92%(239/2188)、4.94%(108/2188),其中最高年龄别阳性率分别为7.61%(≥40岁)、30.09%(5-9岁)、16.52%(5-9岁)、7.16%(≥40岁);Nm、Spn、Hib抗原阳性率分别为2.07%(50/2420)、1.03%(25/2420)、0.08%(2/2420),其中最高年龄别阳性率分别为4.65%(25-29岁)、2.56%(20-24岁)、0.17%(≥40岁)。在Nm抗原阳性病例中B群病例占44%(22/50)。结论济南市2017-2021年AMES病例优势病原为EV、MuV、HSV和JEV。建议加强儿童EV和MuV免疫预防,开展≥40岁人群乙脑疫苗接种,加快B群Nm疫苗研发和应用。

关键词：急性脑炎脑膜炎症候群病毒细菌病原谱

2022-2023年常熟市急性呼吸道感染病例常见病毒病原谱系分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2024年第3期38卷 252-257页

作者：关亚柯周正元梅国勇高晋懿杜海军韩俊徐翠玲中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室北京102206 常熟市疾病预防控制中心常熟215500

目的了解江苏省常熟市急性呼吸道感染(acute respiratory infection,ARI)病例的常见病毒病原谱构成。方法收集2022年1月至2023年10月常熟市5家哨点医院门诊和住院患者的鼻咽拭子样本,采用实时荧光定量聚合酶链式反应的方法检测流感病毒(... 详细信息

目的了解江苏省常熟市急性呼吸道感染(acute respiratory infection,ARI)病例的常见病毒病原谱构成。方法收集2022年1月至2023年10月常熟市5家哨点医院门诊和住院患者的鼻咽拭子样本,采用实时荧光定量聚合酶链式反应的方法检测流感病毒(influenza virus,Flu)、呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)、腺病毒(adenovirus,AdV)、人鼻病毒(human rhinovirus,HRV)、人副流感病毒(human parainfluenza virus,HPIV)、肠道病毒(enterovirus,EV)、人冠状病毒(human coronavirus,HCoV)、人偏肺病毒(human metapneumovirus,HMPV)和人博卡病毒(human bocavirus,HBoV)的核酸。结果1936份ARI病例中,350份(18.1%)病毒核酸检测为阳性。Flu检出率最高,占7.1%,其次为HBoV(3.7%)、AdV(1.9%)和RSV(1.6%)等。病毒检出率在不同年龄组和季节间具有明显差异,2023年3月总病毒检出率最高(47.6%),以Flu为主;Flu呈现春季和冬季单峰流行;HBoV和HCoV流行趋势一致,且前者检出率(5.43%)高于后者(2.45%),均在夏季出现高峰;RSV在秋季出现流行高峰(4.5%)。0~5岁儿童组检出率最高,可达33.3%。结论常熟市2022—2023年ARI病例感染的病毒以Flu、HBoV、AdV、RSV等病毒为主。

关键词：急性呼吸道感染病毒病原谱流行病学

2020—2021年咸阳市手足口病病原构成及柯萨奇病毒A6型序列分析

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中国预防医学杂志 2024年第6期 763-769页

作者：王士峰李珍妮秦龙张俊君咸阳市疾病预防控制中心西安市雁塔区疾病预防控制中心

目的了解咸阳市手足口病（hand,foot and mouth disease,HFMD）病原谱构成情况，分析柯萨奇病毒A6型（coxsackievirus A6,CVA6） VP1基因序列特征。方法对2020—2021年收集的HFMD病例样本进行反转录实时荧光定量聚合酶链式反应（rever... 详细信息

目的了解咸阳市手足口病（hand,foot and mouth disease,HFMD）病原谱构成情况，分析柯萨奇病毒A6型（coxsackievirus A6,CVA6） VP1基因序列特征。方法对2020—2021年收集的HFMD病例样本进行反转录实时荧光定量聚合酶链式反应（reverse transcription real time PCR,RT-qPCR）检测分型，分析病原学监测结果；选取部分CVA6阳性样本，采用半巢式RT-PCR法扩增病毒VP1片段全长，扩增产物经测序后进行序列相似性和基因进化分析。结果 2020—2021年共收集咸阳所辖县（区） HFMD样本615例，经RT-qPCR检测肠道病毒（enterovirus,EV）阳性率为72.20%(444/615)。其中CVA6样本占阳性样本总数的61.94%(275/444)，其次是其他EV型22.07%(98/444)、CVA16型13.51%(60/444)、CVA10型2.48%(11/444)。2020年CVA6为主要流行毒株，2021年其他EV、CVA6与CVA16共同流行。EV阳性病例的发病时间在2021年呈双峰分布（5—7月为主高峰和9—11月为次高峰），2020年发病高峰为9—11月。秦都区、旬邑县和三原县EV阳性样本最多，总占比超过50%。与2008年芬兰株（KM114057）相比，本研究中的35条VP1序列核苷酸相似性为92.0%～94.4%，氨基酸序列相似性97.4%～98.7%，存在7个主要突变位点，其中A5T、S27N、V30A、S137N突变率接近100.00%。VP1基因进化分析显示，咸阳市2020—2021年CVA6型均属于D3a分支。结论 2020—2021年咸阳市HFMD病原谱变化显著，CVA6为优势毒株，属于D3a基因亚型，需加强CVA6及其他EV分子病原学监测。

关键词：手足口病病原谱柯萨奇病毒A6型 VP1基因