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基于高通量测序技术解析中高温制曲细菌群落的演替规律

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酿酒科技 2022年第8期 34-41页

作者：杨勇葛向阳张龙云李燕荣贾亚伟江苏洋河酒厂股份有限公司江苏宿迁223800 宿迁学院江苏宿迁223800

为全面准确剖析中高温大曲发酵期的细菌群落更迭过程,本文采用高通量测序技术,对制曲各主要阶段不同分类水平的微生物信息进行了研究,结果表明:大曲刚入房时以乳杆菌属、肠杆菌科、魏斯氏菌属为主,并房后以魏斯氏菌属、乳杆菌属、明串... 详细信息

为全面准确剖析中高温大曲发酵期的细菌群落更迭过程,本文采用高通量测序技术,对制曲各主要阶段不同分类水平的微生物信息进行了研究,结果表明:大曲刚入房时以乳杆菌属、肠杆菌科、魏斯氏菌属为主,并房后以魏斯氏菌属、乳杆菌属、明串珠菌属为主,上架时以乳杆菌属、魏斯氏菌属为主,大火中期以魏斯氏菌属为主,下架时芽孢杆菌属占据绝对优势,兼有一定占比的魏斯氏菌属,出房时则以魏斯氏菌属、乳杆菌属、葡萄球菌属、肠杆菌科为主,还有占比5%以上的高温放线菌属、片球菌属、芽孢杆菌属、明串珠菌属、克罗彭斯特菌属,物种最趋丰富,占比更趋均衡。此外,本文还首次通过Venn图、聚类热图、OTU进化图进行生物信息的可视化,结合Alpha多样性与PCoA分析细菌群落在中高温制曲过程中的分布特征,RDA分析显示酸度、水分与细菌群落的关联性最大。研究结果揭示了中高温大曲发酵过程中细菌群落结构及差异,有助于中高温大曲微生物多样性形成机制的解析,进而解析绵柔形成机理。

关键词：高通量测序中高温大曲细菌演替

2011年春季东海赤潮演替过程中海水中的游离态多胺

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中国环境科学 2015年第11期35卷 3452-3461页

作者：刘艳赵卫红苗辉中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室山东青岛266071 中国科学院大学北京100049 临沂大学资源环境学院山东临沂276005

利用高效液相色谱法测定了2011年东海赤潮演替过程中海水中的主要的游离态多胺腐胺、亚精胺和精胺的浓度.调查海区腐胺、亚精胺和精胺的浓度范围分别为0~48nmol/L,3~11nmol/L和2~17nmol/L,其中腐胺的平均浓度最高,亚精胺次之,精胺的浓... 详细信息

利用高效液相色谱法测定了2011年东海赤潮演替过程中海水中的主要的游离态多胺腐胺、亚精胺和精胺的浓度.调查海区腐胺、亚精胺和精胺的浓度范围分别为0~48nmol/L,3~11nmol/L和2~17nmol/L,其中腐胺的平均浓度最高,亚精胺次之,精胺的浓度最低.从平面分布看,在4月份以中肋骨条藻为主的硅藻赤潮爆发期,和5月份以东海原甲藻为主的甲藻赤潮爆发期,赤潮爆发的区域多胺浓度相对较高;各个断面的多胺浓度随着赤潮爆发的过程发生变化,并且与DOC、POC、DON以及C/N等呈较明显的相关性.

关键词：多胺赤潮演替腐胺亚精胺精胺

混合高温菌浸出黄铜矿及浸出过程中微生物群落的演替

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中国有色金属学报 2010年第2期20卷 346-353页

作者：刘凯刁梦雪杨宇覃文庆吴学玲中南大学资源加工与生物工程学院长沙410083 中南大学生物冶金教育部重点实验室长沙410083

研究3株极端嗜热古菌(金属硫叶菌,Sulfolobus metallicus JCM9184;瑟杜生金属球菌,Metallosphaera sedula JCM9185和万座酸菌,Acidianus manzaensis YN25)在不同起始pH值和不同温度条件下对黄铜矿的混合浸出,并对浸矿过程中混合菌群落... 详细信息

研究3株极端嗜热古菌(金属硫叶菌,Sulfolobus metallicus JCM9184;瑟杜生金属球菌,Metallosphaera sedula JCM9185和万座酸菌,Acidianus manzaensis YN25)在不同起始pH值和不同温度条件下对黄铜矿的混合浸出,并对浸矿过程中混合菌群落的动态演替进行分析。结果表明:在起始pH1.5时的铜浸出率明显高于在起始pH2.5时的铜浸出率,而65℃条件下的铜浸出率高于75℃时的铜浸出率。利用限制性长度多态性(RFLP)分析65℃、起始pH1.5条件下的微生物群落演替,结果显示:在黄铜矿的浸出前期Sulfolobus metallicus是占据优势的菌种,而到后期Acidianus manzaensis的比例则会上升,并最后取代Sulfolobus metallicus成为优势种。

关键词：生物浸出黄铜矿精矿极端嗜热微生物微生物群落演替

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海水附着细菌多样性和群落演替的研究

高技术通讯 2008年第9期18卷 971-978页

作者：黄进强党宏月李铁刚黄桂桥潘鲁青中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室青岛266003 中国石油大学(华东)生物工程与技术中心青岛266555 中国科学院海洋研究所海洋地质与环境重点实验室青岛266071 钢铁研究总院青岛海洋腐蚀研究所青岛266071

通过细菌16S rRNA 基因(16s rDNA)文库方法研究了1至7天近海浸海玻片附着细菌的多样性和群落演替特征。从1至7天3个基因文库中共筛选了269个克隆、144个有效分类操作单元(OTU)并对其全部测序。16S rDNA 序列系统进化分析发现,这些细菌... 详细信息

通过细菌16S rRNA 基因(16s rDNA)文库方法研究了1至7天近海浸海玻片附着细菌的多样性和群落演替特征。从1至7天3个基因文库中共筛选了269个克隆、144个有效分类操作单元(OTU)并对其全部测序。16S rDNA 序列系统进化分析发现,这些细菌主要归属于8个细菌门类:变形菌门(Proteobacteria)(α-、γ-和δ-亚群)、拟杆菌门(Bac-teroidetes)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、浮霉菌门(Plancto-mvcetes)、光合细菌门(Cyanobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteria)。由此可知1周内变形菌门的α-亚群、γ-亚群和拟杆菌门的细菌是常见的附着类群;α-变形菌亚群中的玫瑰杆菌族(Roseobacter clade)是海洋环境中比较常见的早期附着种类;由聚类分析显示3天和7天细菌的群落结构相似。这些实验结果为了解海水附着细菌生物膜形成的演替过程提供了理论基础,并为海水微生物腐蚀控制提供了生物学线索。

关键词：海洋细菌附着表面细菌多样性演替

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华北典型地表水藻类群落演替特征

土木建筑与环境工程 2010年第2期32卷 114-121页

作者：范振强崔福义马华何文杰阴沛军哈尔滨工业大学城市水资源与水环境国家重点实验室哈尔滨150090 天津自来水集团有限公司天津300040

2006年2月-10月,对引滦原水藻类的群落结构及影响因素进行了调查研究。期间引滦原水中共检出藻类7门43属68种,藻类群落结构呈明显的季节性变化。春季和秋季的引滦原水中以绿藻为优势类群,藻类含量较低;夏季水温升高,水华微囊藻大量增殖... 详细信息

2006年2月-10月,对引滦原水藻类的群落结构及影响因素进行了调查研究。期间引滦原水中共检出藻类7门43属68种,藻类群落结构呈明显的季节性变化。春季和秋季的引滦原水中以绿藻为优势类群,藻类含量较低;夏季水温升高,水华微囊藻大量增殖并成为绝对优势种,藻类含量因而大幅上升,同时导致了原水藻类多样性指数的大幅降低。相关性分析表明,在目前的水质条件下,水温是影响引滦原水藻类群落结构变化的关键因素。

关键词：引滦水藻藻类群落结构演替水华微囊藻生物多样性

基于高通量测序技术解析中高温制曲真菌群落的演替规律研究

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酿酒科技 2023年第10期 33-38页

作者：杨勇葛向阳张聪芝李燕荣贾亚伟江苏洋河酒厂股份有限公司江苏宿迁223800 宿迁学院江苏宿迁223800

以洋河中高温大曲为研究对象,通过高通量测序技术分析不同培养阶段真菌微生物群落结构及其演替规律,并探索了大曲发酵、生香等功能与真菌种类之间的潜在关系。研究结果表明,子囊菌门和毛霉门占据绝对优势,子囊菌门包括半子囊菌纲的酵母... 详细信息

以洋河中高温大曲为研究对象,通过高通量测序技术分析不同培养阶段真菌微生物群落结构及其演替规律,并探索了大曲发酵、生香等功能与真菌种类之间的潜在关系。研究结果表明,子囊菌门和毛霉门占据绝对优势,子囊菌门包括半子囊菌纲的酵母目和散囊菌纲的散囊菌目,毛霉门即毛霉纲的毛霉目;属水平下,嗜热真菌属、根毛霉属、根霉属、曲霉属、生丝毕赤酵母属、横梗霉属、威克汉姆酵母属等真菌分别在不同培养阶段占据主导地位,前期主要是酵母属,后期主要是耐高温霉菌。其中,大曲发酵力与生丝毕赤酵母属相关性较高,酯化力与嗜热真菌属、红曲霉、威克汉姆酵母属相关性较高,水分则与孢圆酵母属的相关性较高。研究结果揭示了中高温大曲发酵过程中真菌群落的演替规律,解释了大曲发酵、生香等功能与真菌种类之间的潜在关系,有助于大曲微生物多样性形成机制的进一步解析,为优质大曲生产提供了理论依据。

关键词：中高温大曲高通量测序真菌演替相关性

放牧管理模式对高寒草甸鼢鼠鼠丘群落演替的影响

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生态学报 2020年第8期40卷 285-294页

作者：张倩杨晶姚宝辉蔡志远孙小妹王缠郭怀亮谭宇尘苏军虎甘肃农业大学草业学院/草业生态系统教育部重点实验室/甘肃省草业工程实验室/中美草地畜牧业可持续发展研究中心兰州730070 甘肃农业大学—新西兰梅西大学草地生物多样性研究中心兰州730070 甘肃农业大学资源与环境学院兰州730070

高寒草甸放牧利用下高原鼢鼠(Eospalax baileyi)等危害的发生是草地管理的关键难题,分析放牧管理模式对鼢鼠鼠丘植被群落演替的影响能为草地管理提供重要依据。研究选择划区轮牧(RG)、生长季休牧(GSG)、连续放牧(CG)和禁牧(PG)4种放牧... 详细信息

高寒草甸放牧利用下高原鼢鼠(Eospalax baileyi)等危害的发生是草地管理的关键难题,分析放牧管理模式对鼢鼠鼠丘植被群落演替的影响能为草地管理提供重要依据。研究选择划区轮牧(RG)、生长季休牧(GSG)、连续放牧(CG)和禁牧(PG)4种放牧管理模式,以及各模式下不同年限鼠丘(一年(ZM1)、两年(ZM2)、三年(ZM3)和多年鼠丘(ZMM))与对照(CM)草地。分析不同放牧管理模式对鼠丘植被群落特征和生物量等的影响,结果发现:PG和GSG下所有年限鼠丘的植被高度、地上生物量均高于RG和CG;RG和GSG下ZM1和ZM2物种Shannon-wiener指数均高于对照样地物种Shannon-wiener指数。主成分分析表明:RG下地上生物量和物种丰富度指数是影响鼠丘植被群落演替的重要因子,PG下地上生物量、盖度、Shannon-wiener指数和均匀度指数是鼠丘植被群落演替的重要因子,CG下物种丰富度和重要值是影响鼠丘植被群落演替的重要指标,GSG下Shannon-wiener指数、盖度和高度是影响鼠丘植被群落演替的重要指标。可见,不同放牧制度对鼠丘植被群落演替的影响不同,禁牧和生长季休牧管理模式能够较好地恢复鼠丘植被群落演替。

关键词：放牧管理高原鼢鼠鼠丘群落特征演替

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新疆喀纳斯湖北端河漫滩湿地植物群落演替

生态学杂志 2010年第8期29卷 1519-1525页

作者：李永亮岳明杨永林薄乖民西部资源与现代生物技术教育部重点实验室西北大学西安710069 国家林业局西北林业规划设计院西安710048

对喀纳斯湖北端河漫滩湿地植物群落进行了调查取样,通过除趋势对应分析(detrended correspondence analysis,DCA)排序研究了群落演替的动态,同时采用Shannon多样性指数、Margalef丰富度指数、Simpson多样性指数和Pielou均匀度指数,分析... 详细信息

对喀纳斯湖北端河漫滩湿地植物群落进行了调查取样,通过除趋势对应分析(detrended correspondence analysis,DCA)排序研究了群落演替的动态,同时采用Shannon多样性指数、Margalef丰富度指数、Simpson多样性指数和Pielou均匀度指数,分析了物种多样性在群落演替过程中的动态变化,并运用去势典范对应分析(detrended canonical correspondence analysis,DCCA)方法,分析了不同样方中土壤因子与群落多样性指数之间的关系。结果表明:1)该区域植物群落演替序列为泽生苔草群落→西伯利亚早熟禾群落→金露梅群落→沼桦群落→西伯利亚云杉群落;2)随着演替的进行,群落物种优势度显著增加,而物种多样性呈先增加后降低的趋势,金露梅群落最高;3)土壤含水量和群落物种优势度之间存在显著负相关。

关键词：演替物种多样性除趋势对应分析去势典范对应分析

赣江流域浮游硅藻功能群多样性及其水期演替的驱动特征

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环境科学研究 2016年第5期29卷 680-691页

作者：张萌邓道贵黄丹周慜吴俊伟徐军刘足根江西省环境保护科学研究院江西省环境保护工程技术中心江西南昌330029 淮北师范大学生命科学学院安徽淮北235000 南昌大学资源环境与化工学院江西南昌330031 中国科学院水生生物研究所湖北武汉430071

为了摸清我国南方丰水型河流流域重要的环境指示类群——浮游硅藻的功能多样性及其环境驱动要素,以赣江流域为例,采用国际上普遍认可的雷氏(Reynolds)、博氏(Borics)和帕氏(Padisák)分类体系进行浮游硅藻类群的系统研究.结果表明:赣江... 详细信息

为了摸清我国南方丰水型河流流域重要的环境指示类群——浮游硅藻的功能多样性及其环境驱动要素,以赣江流域为例,采用国际上普遍认可的雷氏(Reynolds)、博氏(Borics)和帕氏(Padisák)分类体系进行浮游硅藻类群的系统研究.结果表明:赣江流域共发现11个浮游硅藻功能类群(包含122种硅藻),并以MP、P、D和LO类群物种最丰富,全年以MP、P、C和D类群占优势,不同水文期浮游硅藻优势功能类群存在明显分异,表现为丰水期以MP类群占绝对优势,枯水期以C和MP类群占共优势,平水期以则以C类群占绝对优势.多元逐步回归分析发现,与丰水期占优势的MP、P、C和D类群密度呈显著相关的主要环境因子为纬度、ρ(Hg)、ρ(Zn)、p H和ρ(S^(2-)),与枯水期占优势的C、MP、P和D类群密度呈显著相关的主要环境因子为ρ(Pb)、ρ(Cr^(6+))、纬度、ρ(BOD5)、ρ(N)、ρ(P)和ρ(CN-),与平水期占优势的C、P和MP类群密度呈显著相关的主要环境因子为ρ(BOD5)、ρ(Pb)、ρ(Hg)、ρ(Cd)和ρ(NH_4^+-N)等.除趋势对应分析(DCA)和冗余分析结果显示,影响赣江流域浮游硅藻功能多样性的主要环境因子包括流域的经纬度、ρ(FC)(FC为粪大肠杆菌)、重金属含量〔ρ(Cu)、ρ(Pb)和ρ(Cr6+)〕、水位等(解释度达77.0%~90.4%).研究显示,赣江流域浮游硅藻功能类群多样性及结构呈明显的季节性演替特征,南-中亚热带流域的纬度差异、气温的时空差异以及水位的水期波动、污染物年内排放节律等的共同作用会引起河流流域水体物理和化学生境的改变,这是促使浮游硅藻功能类群不同水期演替的重要原因.

关键词：浮游硅藻功能类群环境因子排序分析演替赣江流域