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游程检验与K-S检验在基因选择中的应用研究

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游程检验与K-S检验在基因选择中的应用研究

作者：胡秋锋陕西师范大学

学位级别：硕士

基因芯片技术可以一次性对大量DNA序列进行检测,从而获得基因表达谱数据。从包含成千上万基因的表达谱数据中挖掘出能够辨别肿瘤样本和正常样本的关键基因已成为21世纪医疗、生物信息学以及人工智能等领域的研究焦点之一。基因数据属于... 详细信息

基因芯片技术可以一次性对大量DNA序列进行检测,从而获得基因表达谱数据。从包含成千上万基因的表达谱数据中挖掘出能够辨别肿瘤样本和正常样本的关键基因已成为21世纪医疗、生物信息学以及人工智能等领域的研究焦点之一。基因数据属于典型的高维小样本数据,常含有大量噪声和冗余基因,而真正导致肿瘤病发的关键基因所占比例非常小,从而给基因选择技术带来巨大挑战。一个具有显著区分能力的基因,其表达水平在不同类别中一定存在着显著差异,基于该思想,许多学者提出了一系列基于非参数统计和参数统计的Filter型基因选择方法,并取得了良好的效果。本文针对已有的基于统计检验的基因选择方法中存在的不足,提出了游程检验方法实现特征基因选择。然而,独立的非参数检验方法在选择具有区分能力的基因时,没有考虑到基因之间的冗余,因此,进一步提出K-S检验与mRMR相结合的基因选择算法。本文主要创新工作如下：(1)针对已有的秩和检验以及T检验等统计检验方法存在的不足,提出游程检验实现基因选择。3个经典基因数据集上的实验表明,与秩和检验、T检验相比,在给定显著性水平下,游程检验选择到的基因子集规模较小,且分类性能优于秩和检验与T检验,说明游程检验算法是一个有效的基因选择算法。(2)针对独立的非参数检验方法在选择具有区分能力的基因时,没有考虑到基因之间的冗余,提出一种基于K-S检验与最小冗余最大相关(Minimum Redundancy-Maximum Relevance,mRMR)原则的基因选择算法。算法分两步进行,先采用K-S检验选出具有一定区分能力的基因,然后对选择到的基因进行mRMR判断,选择与类别高度相关而其间相关性较小的基因构成基因子集。以SVM为分类器,以F1easure、准确率和AUC值为评价指标对选择到的基因子集进行评估。将本文算法与K-S检验、mRMR,以及经典的RELIEF和FAST算法进行对比,分别在5个经典基因数据集上的10次重复实验的平均实验结果表明,本文算法的运行时间远低于mRMR,其F1easure、准确率和AUC3种评价指标值优于其他比较算法。

关键词：基因选择游程检验 K-S检验 mRMR 支持向量机

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应用游程检验分析图

临床检验杂志 1993年第3期11卷 158-159页

作者：周筱云湖北省罗田县医院 436600

均数控制图是很多室内质量控制方法之一.已成为国内外目前采用最广泛的一种常规室内质量控制方法.正确分析X 图有利于改进科室管理,提高检验质量.目前用直观目测法对X 图作定性分析,

关键词：游程检验均速控制图实验室诊断

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异方差的游程检验

中山大学学报（自然科学版） 2004年第S1期43卷 9-11页

作者：兰嘉庆余宛泠西南财经大学四川成都610074

异方差现有常规检验方法的大多是参数检验的方法,需要参数服从一定的分布。但实际研究中往往有很多参数不服从假设的分布,针对这一以往方法的缺陷,提出了异方差的游程检验方法。该方法能克服参数检验需要参数分布的缺陷,而且也能用于小... 详细信息

异方差现有常规检验方法的大多是参数检验的方法,需要参数服从一定的分布。但实际研究中往往有很多参数不服从假设的分布,针对这一以往方法的缺陷,提出了异方差的游程检验方法。该方法能克服参数检验需要参数分布的缺陷,而且也能用于小样本。先对游程检验做了简单的概述,介绍了游程检验的基本原理,然后就叙述了游程检验对异方差检验的应用。

关键词：异方差游程检验游程

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中国证券市场有效性的游程检验

统计研究 2001年第12期18卷 43-46页

作者：李学刘建民靳云汇北京大学光华管理学院

Run test is a method to test the Weak Form Efficiency of Capital *** paper compares two methodologies introducing separately by Fama(1965) and Mood (1940).Then we test the efficiency of Chinese Stock *** should be poi... 详细信息

关键词：游程检验价格变化市场有效性中国证券市场

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基于游程检验的多元非参控制图

工业工程 2020年第2期23卷 124-132,149页

作者：裴德昭李艳婷上海交通大学机械与动力工程学院上海200240

本文提出了一个新的基于游程检验的多元非参控制图。首先,运用Kruskal算法的思想,将观测值排列成最短汉密尔顿路径;其次,基于最短汉密尔顿路径中的游程数设计带有滑动窗口的EWMA结构控制图,记为HAMEWMA控制图。通过蒙特卡洛随机方法对HA... 详细信息

本文提出了一个新的基于游程检验的多元非参控制图。首先,运用Kruskal算法的思想,将观测值排列成最短汉密尔顿路径;其次,基于最短汉密尔顿路径中的游程数设计带有滑动窗口的EWMA结构控制图,记为HAMEWMA控制图。通过蒙特卡洛随机方法对HAMEWMA控制图在不同条件(维度的高低,均值漂移的程度,受控数据量大小以及观测数据遵循的分布)下的控制效果进行研究,并与其他多元非参控制图(DFEWMA、SREWMA、SSEWMA、RTC)进行比较。结果表明:当均值漂移较大时,HAMEWMA控制图有更优秀的监控性能;当数据分布为非正态时,HAMEWMA控制图同样表现良好甚至优于数据分布为正态时;HAMEWMA控制图更适用于高维度的监控环境。

关键词：分布未知多元非参数游程检验汉密尔顿路径

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RPT方法在多元游程检验中的应用

中国卫生统计 2016年第2期33卷 362-363页

作者：朱凯李悦江西师范大学科学技术学院 330027 南昌大学公共卫生学院

游程检验是根据样本标志表现排列所形成的游程的多少进行判断的检验方法,在检验样本的随机性及判断数据的规律性等方面有着重要的作用。本文针对多元小样本随机游程检验问题,介绍可以有效解决这一问题的方法——randomized permutation ... 详细信息

游程检验是根据样本标志表现排列所形成的游程的多少进行判断的检验方法,在检验样本的随机性及判断数据的规律性等方面有着重要的作用。本文针对多元小样本随机游程检验问题,介绍可以有效解决这一问题的方法——randomized permutation test（简称RPT）,并运用Matlab软件编写程序实现该方法。

关键词：游程检验 Matlab软件应用小样本程序实现随机性

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游程检验在流行病学上的应用

浙江大学学报(医学版) 1980年第1期9卷 41-46页

作者：吴本璞浙江医科大学流行病学教研室

问题的提出无论临床或是流行病学资料,一般均以样本数据来推测总体趋势.防疫机构在分析流行过程周期性及其发病趋势时,通常均以疫情(数量)的动态变化来判断其特点,但这种分析判断常带有很大的盲目性,在于未曾考虑到抽样误差对资料(样本... 详细信息

问题的提出无论临床或是流行病学资料,一般均以样本数据来推测总体趋势.防疫机构在分析流行过程周期性及其发病趋势时,通常均以疫情(数量)的动态变化来判断其特点,但这种分析判断常带有很大的盲目性,在于未曾考虑到抽样误差对资料(样本)的影响.为此,应用游程检验??有助于判明资料是否具有随机性,从而为制

关键词：游程检验阿的平巴比妥钠发病率病毒性肝炎个数假设检验奎钠克林抗癌药佛罗那钠病毒传染性肝炎病毒病游程长度指数符号界限值流行病学

游程检验的结构分析及其在金融时间序列中的运用

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产业经济研究 2006年第4期 77-78页

作者：庄正欣朱琴华南京财经大学统计学系南京财经大学经济学院

国内的专家学者通过对股票价格指数进行游程检验，普遍认为我国的股票市场是一个弱有效市场。我们通过对股票市场的回报序列的游程进一步进行了游程检验，获得了不相一致的结论。

关键词：金融时间序列游程检验结构分析股票价格指数股票市场专家学者有效市场国内回报

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游程检验及其在流行病学中的应用与探讨

预防医学论坛 2017年第2期23卷 100-103,106页

作者：孙建伟许汴利苏佳黄学勇河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所河南郑州450016

目的通过实例分析探讨游程检验在流行病学中的应用,为流行病学资料分析提供新的方法和途径。方法从游程检验基本原理和应用条件出发,以SPSS 17.0为分析工具,以实例介绍游程检验在流行病学调查与分析中的实际应用。结果在调查抽样随机性... 详细信息

目的通过实例分析探讨游程检验在流行病学中的应用,为流行病学资料分析提供新的方法和途径。方法从游程检验基本原理和应用条件出发,以SPSS 17.0为分析工具,以实例介绍游程检验在流行病学调查与分析中的实际应用。结果在调查抽样随机性判定、疫情动态变化分析、干预效果评价、疾病时空聚集性判定、成组资料差异显著性检验5个实例分析中,游程检验均能得出确切的、符合实际的判定。游程个数检验和游程长度检验相结合,可以从问题整体和局部得出更为全面具体的判定。结论游程检验在流行病学分析中具有广泛适用性,是流行病学资料分析新的方法和途径。

关键词：游程检验流行病学随机性