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抗癌性喹唑啉类二氢叶酸还原酶抑制剂三维定量构效关系

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Chinese Journal of Chemical Physics 2009年第3期22卷 285-289,340页

作者：陈锦灿陈兰美廖思燕钱力郑康成广东医学院分析中心湛江524023 生物无机与合成化学教育部重点实验室中山大学化学与化学工程学院广州510275 广东医学院药学院湛江524023

在对一系列抗癌性7，8-二烃基-1，3-二氨基吡咯-[3，2-f]喹唑啉类二氢叶酸还原酶抑制剂的二维定量构效关系（2D—QSAa）研究基础上，应用比较分子场分析法对该类配合物进行了三维定量构效关系（3D—QSAR）研究．建立了具有良好的统计学... 详细信息

在对一系列抗癌性7，8-二烃基-1，3-二氨基吡咯-[3，2-f]喹唑啉类二氢叶酸还原酶抑制剂的二维定量构效关系（2D—QSAa）研究基础上，应用比较分子场分析法对该类配合物进行了三维定量构效关系（3D—QSAR）研究．建立了具有良好的统计学性能及预报能力的***模型，非交叉验证相关系数为0．993，交叉验证相关系数为0．619，估算的标准误差0．208，统计方差比193．4．该模型表明立体场因素的影响比静电场因素大很多，此结果与我们已经报道的2D—QSAR模型结果相一致．然而，3D—QSAR模型提供了可视化的立体场、静电场因素对活性的影响．3D—QSAR研究对实验上提出的二氢叶酸还原酶与药物分子的疏水键合作用机理得到了进一步的理论解释．

关键词：二氢叶酸还原酶喹唑啉 3D—QSAR 比较分子力场分析

青蒿素类衍生物的抗疟作用机理及多维构效关系研究

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青蒿素类衍生物的抗疟作用机理及多维构效关系研究

作者：梁瑞玲郑州大学

学位级别：硕士

青蒿素是1972年我国科学工作者从菊科植物黄花蒿中提取的新型抗疟药，经化学反应、光谱数据和X射线单晶衍射方法证明其为一种含有过氧桥键的新型倍半萜内酯。由于具有高效、速效、低毒的优点，青蒿素类衍生物在疟疾治疗中得到广泛应用... 详细信息

青蒿素是1972年我国科学工作者从菊科植物黄花蒿中提取的新型抗疟药，经化学反应、光谱数据和X射线单晶衍射方法证明其为一种含有过氧桥键的新型倍半萜内酯。由于具有高效、速效、低毒的优点，青蒿素类衍生物在疟疾治疗中得到广泛应用。对青蒿素抗疟机理的研究已经取得了许多成就，主要观点认为青蒿素类化合物抗疟作用属于氧化性机制，与血红素反应导致自由基的产生是这类药物的抗疟机理。分子中必须有过氧基团，无过氧基团将失去活性。作者在HF／STO-3G水平研究了青蒿素过氧桥键的裂解。过氧桥键在Fe作用下断裂并与Fe形成环状加成产物，加成产物不稳定，裂解产生自由基。以此来模拟青蒿素的抗疟机理，并给出合理解释。为了系统的研究该类化合物的构效关系，作者利用质子探针、sp杂化的CH探针、Fe探针进行比较分子力场分析，得到了稳定有效的模型。通过多种途径获得青蒿素类药物的结构参数，其中电子结构参数采用高斯软件在B3LYP／6-31G水平获得，立体参数和拓扑指数采用Cerius2在SGI工作站获得。建立多位信息的构效关系，进行系列青蒿素类衍生物的构效关系研究，引入遗传算法回归分析寻找其结构与抗疟活性间的关系，建立了较为显著的QSAR方程。

关键词：青蒿素抗疟机理 B3LYP/6-31G* 比较分子力场分析构效关系

噻唑类葡萄糖激酶激动药的三维定量构效关系与理性设计

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中国药师 2019年第9期22卷 1711-1716页

作者：梁佳龙张悦弘吴永新张鑫磊张东旭刘雪英中国人民解放军陆军第946医院新疆伊宁835000 空军军医大学

目的:构建噻唑类葡萄糖激酶(GK)激动药的三维定量构效关系(3D-QSAR),并进行理性设计。方法:运用比较分子力场分析(Co MFA)的方法,构建噻唑类GK激动药的3D-QSAR模型,通过晶体复合物结构对模型进行验证。对复合物中配体激动剂进行基于片... 详细信息

目的:构建噻唑类葡萄糖激酶(GK)激动药的三维定量构效关系(3D-QSAR),并进行理性设计。方法:运用比较分子力场分析(Co MFA)的方法,构建噻唑类GK激动药的3D-QSAR模型,通过晶体复合物结构对模型进行验证。对复合物中配体激动剂进行基于片段生长的理性设计,预测所设计分子的活性、药代动力学性质及毒性。结果:高精度的GK激动剂的3DQSAR模型为Co MFA:q^2=0.673,r^2=0.908;其中q^2为交叉验证系数,r^2为非交叉验证系数,激动药与受体蛋白之间的作用模式结果与构建的模型表现一致,18号化合物为全新化合物。结论:GK激动药的3D-QSAR模型可为GK激动药提供理性设计的理论基础,设计得到的分子口服吸收良好、生物预测活性较高,有望成为新的抗2型糖尿病药物分子。

关键词：葡萄糖激酶 2型糖尿病三维定量构效关系比较分子力场分析基于片段生长的理性分子设计

非核苷类HIV-1逆转录酶抑制剂Ⅱ6-(1-萘甲基)胸腺嘧啶类化合物三维定量构效关系

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中国药物化学杂志 2003年第5期13卷 254-259页

作者：孟歌陈芬儿复旦大学化学系上海200433

目的进一步研究6-(1-萘甲基)取代胸腺嘧啶类(HEPT)HIV-1逆转录酶抑制剂的构效关系。方法利用比较分子力场分析方法(CoMFA)对14个新合成的6-(1-萘甲基)取代HEPT类似物进行三维定量构效关系研究;对化合物与HIV-1逆转录酶的非底物结合部分(... 详细信息

目的进一步研究6-(1-萘甲基)取代胸腺嘧啶类(HEPT)HIV-1逆转录酶抑制剂的构效关系。方法利用比较分子力场分析方法(CoMFA)对14个新合成的6-(1-萘甲基)取代HEPT类似物进行三维定量构效关系研究;对化合物与HIV-1逆转录酶的非底物结合部分(NNBP)作用情况进行了对接(Dock)研究;并建立了回归方程。结果用模型预测了2个6-(1-萘甲基)取代HEPT类化合物的-logEC50值,结果得以验证。空间立体效应占85.7％,静电立场效应占14.3％。结论对接结果显示:在NNBP中,化合物以蝴蝶双翅形的构象伸展开来,并以芳环与结合腔表面的芳香性氨基酸残基产生疏水性相互作用。6-位引入(1-萘甲基)可显著提高化合物的生物活性,空间效应是影响活性的主要因素,此模型可为进一步的结构优化提供理论指导。

关键词：药物化学构效关系比较分子力场分析 Dock分析 6-(1-萘甲基)取代HEPT类似物 HIV-1逆转录酶抑制剂

取代苯基亚甲基环戊酮衍生物的设计、合成与抗肿瘤活性

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中国药物化学杂志 2010年第1期20卷 11-18,24页

作者：刘鹰翔闫星孙平华马玉卓广州中医药大学药物化学研究室广东广州510006 广东药学院药物化学系广东广州510006 暨南大学药物化学教研室广东广州510632

目的设计并合成一系列取代苯基亚甲基环戊酮衍生物,对它们的体外抗肿瘤活性进行初步筛选并探讨其构效关系。方法使用化学方法对目标化合物进行合成,采用MTT法测定目标化合物的体外抗肿瘤活性,利用CoMFA法讨论构效关系。结果与结论合成... 详细信息

目的设计并合成一系列取代苯基亚甲基环戊酮衍生物,对它们的体外抗肿瘤活性进行初步筛选并探讨其构效关系。方法使用化学方法对目标化合物进行合成,采用MTT法测定目标化合物的体外抗肿瘤活性,利用CoMFA法讨论构效关系。结果与结论合成了23个目标化合物,其中22个未见文献报道,目标化合物的结构经元素分析、1H-NMR和MS谱确认。体外抗肿瘤活性初筛结果显示,化合物Ⅰa和Ⅰb对Bel-7402、HCT-8、A-549肿瘤细胞均表现出较高的细胞毒性,化合物Ⅱg对Bel-7402和HCT-8呈现选择性抑制,但对A-549无抑制作用,化合物Ⅲa～Ⅲf对3种肿瘤细胞均无明显抑制作用。CoMFA结果显示,5位芳基胺甲基结构中,胺基的对位含有空间位阻较小和吸电子基团时将有助于提高化合物的活性,而胺基的邻位和间位连有空间位阻较大和供电子基团将会增强化合物的活性。

关键词：化学合成苯基亚甲基环戊酮抗肿瘤活性比较分子力场分析四氮唑盐法

噻唑类衍生物二氢乳清酸脱氢酶抑制剂的三维定量构效关系研究

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药物评价研究 2017年第1期40卷 20-27页

作者：陈诚唐光辉张贝娜林治华重庆理工大学药学与生物工程学院重庆400054

目的应用三维定量构效关系(3D-QSAR)研究噻唑类衍生物结构的二氢乳清酸脱氢酶抑制活性,为该类药物的设计和筛选提供可靠的理论依据。方法针对38个以噻唑为基本骨架的二氢乳清酸脱氢酶抑制剂,分别应用分子力场分析(Co MFA)和比较分子相... 详细信息

目的应用三维定量构效关系(3D-QSAR)研究噻唑类衍生物结构的二氢乳清酸脱氢酶抑制活性,为该类药物的设计和筛选提供可靠的理论依据。方法针对38个以噻唑为基本骨架的二氢乳清酸脱氢酶抑制剂,分别应用分子力场分析(Co MFA)和比较分子相似性指数分析(Co MSIA)2种经典的方法进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,建立相关模型,验证模型的预测能力,三维等势图分析噻唑类衍生物结构与活性的关系。结果 Co MFA模型的交叉验证系数q2为0.796,相关系数r2为0.978;Co MSIA模型的q2以及r2分别为0.721和0.976;2种模型对化合物的活性预测与实际值接近;三维等势图可以全面直观的分析化合物结构对其活性的影响。结论该3D-QSAR模型三维等势图揭示了结构特征与抑制活性的关系,模型具有较好的预测能力和较强的稳定性,为进一步开发研究打下了较好的基础。

关键词：二氢乳清酸脱氢酶抑制剂比较分子力场分析比较分子相似性指数分析三维定量构效关系

取代三唑-噻二唑类化合物抑菌活性的CoMFA模型

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徐州工程学院学报（自然科学版） 2021年第3期36卷 13-17页

作者：陈艳徐州工程学院材料与化学工程学院江苏徐州221018

基于比较分子力场(CoMFA)方法建立了21个取代三唑-噻二唑类化合物对大肠杆菌抑菌活性(E_(c))三维定量构效关系(3D-QSAR)模型,训练集中16个化合物用于建立预测模型,测试集中6个化合物(含模板分子)作为模型验证.已建立的CoMFA模型的非交... 详细信息

基于比较分子力场(CoMFA)方法建立了21个取代三唑-噻二唑类化合物对大肠杆菌抑菌活性(E_(c))三维定量构效关系(3D-QSAR)模型,训练集中16个化合物用于建立预测模型,测试集中6个化合物(含模板分子)作为模型验证.已建立的CoMFA模型的非交叉验证系数(R 2)、交叉验证系数(R^(2) _(cv))分别为0.938、0.504,说明所建模型具有较强的稳定性和良好的预测能力.该模型中立体场、静电场贡献率依次为90.7%和9.3%,显示以立体场作用为主,对应于位阻与疏水作用.由此推断,影响取代三唑-噻二唑类化合物对大肠杆菌抑菌活性的主要因素是疏水性,电荷分布仅占很次要因素.

关键词：取代三唑-噻二唑衍生物抑菌活性比较分子力场分析三维定量构效关系

硝基苯衍生物对发光菌抑制毒性的CoMFA模型

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徐州工程学院学报（自然科学版） 2020年第1期35卷 28-31页

作者：冯长君徐州工程学院材料与化学工程学院江苏徐州221018

文中研究了19种硝基苯衍生物对发光菌抑制活性(pB)的三维-定量构效关系(3D-QSAR).基于比较分子力场分析(CoMFA)建立训练集的3D-QSAR模型,具有高相关系数值(R2=0.911)和交叉验证系数值(Q2=0.382),不仅表现出显著的统计质量,还表现出令人... 详细信息

文中研究了19种硝基苯衍生物对发光菌抑制活性(pB)的三维-定量构效关系(3D-QSAR).基于比较分子力场分析(CoMFA)建立训练集的3D-QSAR模型,具有高相关系数值(R2=0.911)和交叉验证系数值(Q2=0.382),不仅表现出显著的统计质量,还表现出令人满意的预测能力.该模型中立体场、静电场贡献率依次为32.2%、67.8%.基于CoMFA等高线图,可以看出影响硝基苯衍生物抑制活性的一些关键结构因素.这些结果为理解硝基苯衍生物对发光菌的作用机理提供了有用的理论参考.

关键词：硝基苯衍生物发光菌抑制活性比较分子力场分析三维定量构效关系

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联苯双酯衍生物的定量构效关系研究

中国药物化学杂志 2002年第3期12卷 143-145页

作者：曾昭钧岳洪义闫冬彭胜国沈阳药科大学制药工程学院辽宁沈阳110016 上海宝龙药业有限公司上海201702

目的研究联苯双酯衍生物的降酶活性。方法用CoMFA对联苯双酯的单酯衍生物进行定量构效关系研究。

关键词：联苯双酯衍生物定量构效关系比较分子力场分析