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DNA生物传感器在环境污染监测中的应用

生物化学与生物物理进展 2001年第1期28卷 125-128页

作者：王建龙清华大学环境科学与工程系

基于生物催化和免疫原理的生物传感器在环境领域中获得了广泛应用 .近年来 ,随着分子生物学和生物技术的发展 ,人们开发了以核酸探针为识别元件 ,基于核酸相互作用原理的DNA生物传感器 .该传感器可用于受感染微生物的核酸序列分析、优... 详细信息

基于生物催化和免疫原理的生物传感器在环境领域中获得了广泛应用 .近年来 ,随着分子生物学和生物技术的发展 ,人们开发了以核酸探针为识别元件 ,基于核酸相互作用原理的DNA生物传感器 .该传感器可用于受感染微生物的核酸序列分析、优先控制污染物的检测以及污染物与DNA之间相互作用的研究 ,在环境污染监测中具有潜在的巨大应用前景 .简要介绍了核酸杂交生物传感器的基本原理及其在环境微生物和优先控制污染物 (prioritypollutant)检测中的应用研究进展 .

关键词： DNA生物传感器核酸杂交环境监测优先污染物

玻璃微流控通道中水凝胶固定寡核苷酸探针的方法及应用

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高等学校化学学报 2009年第6期30卷 1128-1130页

作者：张宇于浩董秀玲秦建华林炳承中国科学院大连化学物理研究所大连116023 中国科学院研究生院北京100049 大连市第三人民医院大连116033

A method of DNA probes immobilization and specific target sequences capture in a microfluidic chip was ***-modified DNA probes are immobilized in silanized glass microfluidic channels ]via] photopolymerization in a polyacrylamide *** resulting polymeric,hydrogel plugs are porous under electrophoretic conditions,and the immobilized DNA probes can be hybridized with fluorescence labeled complementary *** total analysis process can be completed within 5 min,and the limit of detection is 0.1 μmol/*** method is simple,rapid and *** double-stranded DNA can be chemically denatured,and the chip is *** conditions for photopolymerization,hybridization,and denaturation were discussed as well.

关键词：微流控芯片丙烯酰胺水凝胶 DNA探针固定核酸杂交

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核酸探针传感器的构建

生物化学与生物物理进展 1996年第6期23卷 527-531页

作者：陈誉华宋今丹李大为中国医科大学细胞生物学卫生部重点实验室沈阳东宁电子所

依据石英振子的晶体谐振频率是其表面沉积物的函数，建立了简便、特异、敏感性达１００ｐｇ，并能对受检样品相对定量的核酸杂交检测新方法，即压电晶体式核酸探针传感器，该方法的主要特点是以快速。

关键词：核酸杂交生物传感器核酸探针

云南曲靖地区α和β地中海贫血血液学和分子流行病学特征分析

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山西医药杂志 2022年第20期51卷 2296-2301页

作者：马蓉王俊玲李秀萍熊倩方哲伟刘红霞杨锦四李梦仙李宏伟云南省曲靖市第一人民医院检验中心 655000

目的本研究通过分析血常规、血红蛋白电泳及基因检测,旨在调查云南省曲靖地区地中海贫血(TM)的基因突变情况,系统分析TM的流行病学数据,为设计适当的预防策略提供参考,降低TM缺陷儿出生,提高居民生活质量。方法选取2017年7月至2021年8... 详细信息

目的本研究通过分析血常规、血红蛋白电泳及基因检测,旨在调查云南省曲靖地区地中海贫血(TM)的基因突变情况,系统分析TM的流行病学数据,为设计适当的预防策略提供参考,降低TM缺陷儿出生,提高居民生活质量。方法选取2017年7月至2021年8月在云南省曲靖市第一人民医院就诊的门诊、住院贫血患者共20952例患者进行血液学筛查,包括血常规指标,如平均红细胞体积(MCV),平均血红蛋白含量(MCH),血红蛋白(Hb),高效液相色谱(HPLC)对Hb进行电泳,对表型阳性者用聚合酶链反应(PCR)流变杂交技术检测中国人群常见的α和β地贫-TM突变类型,进一步调查1821例疑似的TM携带者。结果共诊断出地中海贫血携带者464例(25.48%),其中α-TM 164例(9.01%),β-TM 284例(15.60%),α合并β-TM 16例(0.88%),携带率分别为2.21%,0.78%,1.36%,0.08%。本次研究共检测出13种等位基因共21种基因型。包括静止型α-TM(-α^(3.7)/αα、-α^(4.2)/αα、α^(QS)α/αα、α^(CS)α/αα)49.39%,轻型(东南亚型)α-TM(-SEA/αα)47.56%、中间型(HbH病)α-TM(--SEA/-α^(4.2)、--SEA/-α^(3.7))3.05%;β-TM基因型有CD17/β^(N)(34.86%)、CD41-42/β^(N)(23.94%)、βE/β^(N)突变(22.18%)、IVS-Ⅱ-654/β^(N)(15.85%)、-29/β^(N)(1.06%)、CD71-72/β^(N)(1.41%)、Cap/β^(N)(0.70%);α合并β复合型TM基因型有α^(3.7)/αα联合CD41-42/β^(N)突变(25.00%)、--SEA/αα联合IVS-Ⅱ-654/β^(N)突变(25.00%)、α^(3.7)/αα联合βe/β^(N)突变(12.50%)、--SEA/-α^(4.2)联合CD41-42/β^(N)突变(12.50%)、αWSα/αα联合βe/β^(N)突变(12.50%)、αWSα/αα联合CD41-42/β^(N)突变(12.50%)。结论曲靖地区TM基因携带率相对较高,常见的突变类型均在该地出现,这些发现将有助于临床遗传咨询,对曲靖地区TM防控有重要意义。

关键词：地中海贫血核酸杂交血蛋白电泳分子流行病学曲靖地区血常规

微阵列芯片比较基因组杂交技术在染色体易位携带者胚胎植入前遗传学诊断中的应用

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中华妇产科杂志 2014年第3期49卷 193-198页

作者：谢言信徐艳文苗本郁曾艳红王静周灿权中山大学孙逸仙纪念医院生殖医学中心 510120 中山大学附属第一医院生殖医学中心广东省生殖医学重点实验室广州510080

目的探讨微阵列芯片比较基因组杂交（aCGH）技术用于染色体易位携带者胚胎植入前遗传学诊断（PGD）的效果.方法 2012年1月至2013年6月在中山大学附属第一医院生殖中心共对151对染色体相互易位和62对罗氏易位携带者夫妇进行220个周期的P... 详细信息

目的探讨微阵列芯片比较基因组杂交（aCGH）技术用于染色体易位携带者胚胎植入前遗传学诊断（PGD）的效果.方法 2012年1月至2013年6月在中山大学附属第一医院生殖中心共对151对染色体相互易位和62对罗氏易位携带者夫妇进行220个周期的PGD,其中应用aCGH技术对染色体相互易位和罗氏易位携带者行PGD的周期数分别为33和22个周期,应用荧光原位杂交（FISH）技术对染色体相互易位和罗氏易位携带者行PGD的周期数分别为119和46个周期.比较两种检测方法的诊断率.结果应用aCGH技术对染色体相互易位和罗氏易位携带者易位染色体正常或平衡胚胎检出率分别为38.20％（123/322）及67.20％（127/189）,FISH技术分别为15.39％（195/1 267）及30.75％（202/657）,aCGH技术的检出率均显著高于FISH技术（P均＜0.05）.应用aCGH技术对染色体相互易位和罗氏易位携带者易位染色体的异常胚胎检出率分别为59.32％（191/322）及30.69％（58/189）,FISH技术分别为83.03％（1 052/1 267）及67.43％（443/657）,aCGH技术均显著低于FISH技术（P均＜0.05）.aCGH技术检测的染色体相互易位携带者胚胎中,易位染色体正常或平衡、而非易位染色体发生非整倍体改变的异常胚胎检出率为20.19％（65/322）,明显低于罗氏易位携带者的38.62％（73/189）,两者比较,差异有统计学意义（P＜0.01）.结论 aCGH技术进行染色体易位携带者PGD的易位染色体正常或平衡检出率较FISH技术更高,而相互易位携带者的胚胎中非易位染色体发生非整倍体改变的异常胚胎检出率较罗氏易位携带者低.

关键词：易位,遗传植入前诊断微阵列分析核酸杂交原位杂交,荧光

染色体与微卫星稳定型结直肠癌患者的染色体变异特征及其意义

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中华医学杂志 2007年第1期87卷 11-15页

作者：谢丹吴惠茜刘泳冬曾穗德林锋中山大学肿瘤防治中心实验研究部-华南肿瘤国家重点实验室广州510060 中山大学附属第一医院病理科广东省人民医院胃肠外科

目的探讨染色体与微卫星稳定型(MACS 型)结直肠癌(CRC)的染色体变异特征及其临床病理学意义。方法分别应用流式细胞学、微卫星不稳定性分析和免疫组织化学方法对156例 CRC 患者组织的 DNA 倍性、微卫星不稳定性和 DNA 错配修复蛋白(hMS... 详细信息

目的探讨染色体与微卫星稳定型(MACS 型)结直肠癌(CRC)的染色体变异特征及其临床病理学意义。方法分别应用流式细胞学、微卫星不稳定性分析和免疫组织化学方法对156例 CRC 患者组织的 DNA 倍性、微卫星不稳定性和 DNA 错配修复蛋白(hMSH_2和 hMLH_1)表达进行了检测,筛选并确证 MACS 型 CRC;进一步应用比较基因组杂交(CGH)方法,检测 MACS 型 CRC 的染色体变异情况,结合患者的临床病理学资料,分析其相关性。结果在156例 CRC 患者中,有41例(26%)既是二倍体/近二倍体 DNA 含量的肿瘤,又呈现稳定的 DNA 微卫星序列,且均呈 hMSH_1和bMSH_2蛋白正常表达,确证为 MACS 型 CRC。CGH 检测结果显示,41例 MACS 型 CRC 患者染色体的总体平均变异(扩增和缺失)数目为9.6;染色体 DNA 扩增频率≥10%的位点依次出现于:20 q(68%)、13 q(56%)、7 q(49%)、13 p(39%)、20 p(37%)、8 q(30%)、1 q(22%)、11 q(15%)、16 q(12%)、2 p,4 q 和10 q(10%);染色体 DNA 缺失频率≥10%的位点依次为:18 q(63%)、8 p(51%)、17 p(37%)、1 p(30%)、3 p(26%)、4 p、13 q 和14(15%)、21 q 和 Xp(10%);在 Dukes’C/D 期的CRC 中,分别有79%和82%的肿瘤出现染色体20 q 扩增和18 q 缺失,变异率明显高于 Dukes'A/B 期的 CRC(46%,P=0.038;21%,P=0.0009)。结论 MACS 型 CRC 的染色体变异频数接近于染色体不稳定(C1)型 CRC,但高于微卫星不稳定(MSI)型 CRC;染色体8 p 的高频缺失可能是 MACS 型CRC 不同于 CI 型和 MSI 型 CRC 相对独特的分子事件;染色体20 q 扩增和18 q 缺失是 MACS 型 CRC中最为频发的染色体变异,并与该型 CRC 的恶性临床表型密切相关,可能在其恶性进展中担当十分重要的作用。

关键词：结肠直肠肿瘤流式细胞术基因核酸杂交

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差异杂交筛选人肝癌组织内高表达的新基因

中华肿瘤杂志 1997年第6期19卷 417-419页

作者：李宝安万大方刘彦仿顾健人第四军医大学病理教研室上海第二军医大学东方肝胆外科研究所上海市肿瘤研究所癌基因与相关基因国家重点实验室

目的寻找与肝癌相关的新基因。方法应用Ｎｏｒｔｈｅｒｎ杂交技术对１２个表达序列标记（ｅｘｐｒｅｓｓｅｄｓｅｑｕｅｎｃｅｔａｇ，ＥＳＴ）克隆进行筛选，找到在肝癌及癌旁肝组织内有表达差异的基因，然后与基因数据库进行比较。结... 详细信息

目的寻找与肝癌相关的新基因。方法应用Ｎｏｒｔｈｅｒｎ杂交技术对１２个表达序列标记（ｅｘｐｒｅｓｓｅｄｓｅｑｕｅｎｃｅｔａｇ，ＥＳＴ）克隆进行筛选，找到在肝癌及癌旁肝组织内有表达差异的基因，然后与基因数据库进行比较。结果Ｎｏｒｔｈｅｒｎ杂交结果显示，ＥＳＴ克隆Ｆ９３９１在所有６例肝细胞肝癌标本中呈高表达，而在相应的癌旁肝及２例正常组织内低表达。ＤＮＡ序列测定并检索基因数据库ＧｅｎｅＤａｔａｂａｓｅｓ（ＥＭＢＬ９６．６），表明该基因属于一未知新基因。结论Ｆ９３９１基因为一在肝癌组织内高表达的新基因，它与细胞的增殖相关，可能在肿瘤的发生中起重要作用，并且有可能成为肝癌诊治的一个新标志。

关键词：肝肿瘤基因表达 RNA 核酸杂交

动脉粥样硬化斑块形成时血管平滑肌细胞增生相关基因的cDNA全长克隆及其功能的初步探讨

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中华病理学杂志 1999年第5期28卷 352-355页

作者：赵高峰高鹏张华娄黎明乔绘红佘铭鹏河南医科大学第一附属医院胸外科 450052 中国医学科学院

目的　克隆动脉粥样硬化斑块形成时血管平滑肌细胞（ＳＭＣ）增生相关基因的ｃＤＮＡ全长，并对其功能进行初步探讨。方法　选用氧化低密度脂蛋白（ｏｘＬＤＬ）作为刺激物作用于培养的人主动脉ＳＭＣ，利用减除杂交技术构建减除... 详细信息

目的　克隆动脉粥样硬化斑块形成时血管平滑肌细胞（ＳＭＣ）增生相关基因的ｃＤＮＡ全长，并对其功能进行初步探讨。方法　选用氧化低密度脂蛋白（ｏｘＬＤＬ）作为刺激物作用于培养的人主动脉ＳＭＣ，利用减除杂交技术构建减除文库，克隆相关基因片段，在全长文库构建的基础上筛选相关基因的ｃＤＮＡ全长。并进行原核系统内蛋白表达及量效关系检测。结果　发现了４个新基因片段，克隆了一个新基因ｃＤＮＡ全长，该基因在原核系统内有大约相对分子质量为４４０００的蛋白表达，其高表达可能与ＳＭＣ增生有关。结论　筛选克隆的新基因ＰＳＭＣＨ１在动脉粥样硬化斑块形成时可能有较重要的生物学作用。

关键词：动脉粥样硬化核酸杂交血管平滑肌

分别携带β珠蛋白基因CD41—42（-TCTT）和CD43（G→T）突变夫妇的产前诊断结果分析

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中华医学遗传学杂志 2017年第5期34卷 684-687页

作者：郝颖吴维青蒋妮萍徐晓昕尹珊珊姜楠徐志勇蔡筠谢建生广东省深圳市妇幼保健院出生缺陷和预防控制重点实验室 518048

目的为两对双方分别携带β珠蛋白基因CD41-42（-TCTT）和CD43（G→T）杂合突变的夫妇提供产前诊断，明确其胎儿的基因型。方法应用反向斑点杂交法（两种试剂盒）、多色探针熔解曲线法和DNA序列分析法同时检测β珠蛋白基因的突变。结果家... 详细信息

目的为两对双方分别携带β珠蛋白基因CD41-42（-TCTT）和CD43（G→T）杂合突变的夫妇提供产前诊断，明确其胎儿的基因型。方法应用反向斑点杂交法（两种试剂盒）、多色探针熔解曲线法和DNA序列分析法同时检测β珠蛋白基因的突变。结果家系1胎儿3种方法的检测结果均显示其为CD43（G→T）突变杂合子；家系2胎儿多色探针熔解曲线结果和DNA序列分析结果均提示为CD41—42（-TCTT）和CD43（G→T）突变双重杂合子，而反向斑点杂交法两种试剂盒产生了不一致的结果，一种为CD4142（-TcTT）和CD43（G→T）突变双重杂合子，而另一种为CD41—42（-TCTT）突变纯合子。结论对携带β珠蛋白基因CD41—42（-TCTT）和CD43（G→T）突变的夫妇进行产前诊断应采用其他可避免误诊的手段，如直接测序等。

关键词： β地中海贫血产前诊断核酸杂交