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中国莱姆病螺旋体的核糖体基因分型研究

中华微生物学和免疫学杂志 2001年第3期21卷 298-301页

作者：史翠霞万康林马凤琴张哲夫中国预防医学科学院流行病学与微生物学研究所北京102206

目的　莱姆病螺旋体的基因型和临床表现、疫苗菌株和抗原菌株的选择存在密切的关系 ,所以对中国菌株进行分子流行病学研究 ,可为莱姆病的防治提供科学依据。方法　 5S～ 2 3SrRNA基因间隔区RFLP分析和 16 +2 3SrRNA基因RFLP分析。结果... 详细信息

目的　莱姆病螺旋体的基因型和临床表现、疫苗菌株和抗原菌株的选择存在密切的关系 ,所以对中国菌株进行分子流行病学研究 ,可为莱姆病的防治提供科学依据。方法　 5S～ 2 3SrRNA基因间隔区RFLP分析和 16 +2 3SrRNA基因RFLP分析。结果　中国菌株至少被分为 3个基因型 (B .burgdorferisensustricto、B .garinii和B .afzelii) ,B .garinii和B .afzelii占优势 ,B .burgdorferisensustricto少见。少数菌株用上述方法尚不能明确其分类地位 ,需进一步研究 ,中国很可能存在世界上独特的新基因型。结论　中国菌株的基因型明显不同于北美菌株 ,而同欧洲菌株比较接近。 5S～ 2 3SrRNA基因间隔区RFLP分析方法简便、快速、准确 ,是理想的基因型分类方法 ,可作为国内菌株基因型鉴定的常规方法。

关键词：莱姆病螺旋体核糖体基因分型分子流行病学莱姆病

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贵州省莱姆病螺旋体的核糖体基因分型研究

中华流行病学杂志 2003年第12期24卷 1129-1131页

作者：王定明郝琴蔡星和万康林王昭孝陈建贵州省疾病预防控制中心贵阳550004 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所

目的　对从贵州省农耕区的鼠类动物分离到的 2 1株莱姆病螺旋体菌株进行分子流行病学研究。方法　应用聚合酶链反应 (PCR)从 2 1株莱姆病螺旋体分离株的全基因组DNA扩出 5S～2 3SrRNA基因间隔区 ,扩增产物用限制性片段长度多态性分析 (R... 详细信息

目的　对从贵州省农耕区的鼠类动物分离到的 2 1株莱姆病螺旋体菌株进行分子流行病学研究。方法　应用聚合酶链反应 (PCR)从 2 1株莱姆病螺旋体分离株的全基因组DNA扩出 5S～2 3SrRNA基因间隔区 ,扩增产物用限制性片段长度多态性分析 (RFLP)和核酸序列分析。结果　贵州省 2 1株莱姆病螺旋体菌株可分为两个基因型 :Borreliavalaisiana(B .valaisiana) 2 0株 ,Borreliasp1株。结论　贵州省农耕区以B .valaisiana基因型为主 ,目前B .valaisiana对人的致病性已经得到证实。

关键词：贵州省莱姆病螺旋体核糖体基因分型流行病学

PCR及核糖体基因分型法检测和鉴定脂环酸芽孢杆菌

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食品科学 2013年第16期34卷 200-205页

作者：张宇霞文朝慧李儒甘肃出入境检验检疫局综合技术中心甘肃兰州730020

为实现对果汁生产中脂环酸芽孢杆菌从原料到成品的快速检测和鉴定,采用聚合酶链式反应(PCR)以及自动化核糖体基因分型RiboPrinter,对经过分离、筛选和纯化后的59株分离菌株进行鉴定。结果表明:自动化核糖体基因分型使得鉴定结果更加快... 详细信息

为实现对果汁生产中脂环酸芽孢杆菌从原料到成品的快速检测和鉴定,采用聚合酶链式反应(PCR)以及自动化核糖体基因分型RiboPrinter,对经过分离、筛选和纯化后的59株分离菌株进行鉴定。结果表明:自动化核糖体基因分型使得鉴定结果更加快速、准确和可靠,最大化避免了其他因素对实验的影响,且在鉴定到种的基础上可以进一步分类,进行溯源分析。RiboPrinter分型结果为建立我国脂环酸芽孢杆菌分子分型数据库积累了一定的数据和经验,但由于菌株的来源地及数量有限,因此尚不能看出核糖体基因型是否有明显的地域分布特征。

关键词：脂环酸芽孢杆菌聚合酶链式反应 RiboPrinter 核糖体基因分型

食源性单核细胞增生李斯特菌的自动化核糖体基因分型

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现代预防医学 2009年第21期36卷 4162-4166页

作者：李迎慧刘衡川姚景会付萍王竹天冉陆深圳市疾病预防控制中心四川大学华西公共卫生学院中国疾病预防控制中心

[目的]为了解我国食品来源的单核细胞增生李斯特菌(Listeria Monocytogene,LM)的遗传物质多态性特征,探索LM鉴定及溯源新方法。[方法]运用自动化的核糖体基因分型系统(RiboPrinter),用EcoRI酶,对我国食品污染物监测网来源的67株LM进行... 详细信息

[目的]为了解我国食品来源的单核细胞增生李斯特菌(Listeria Monocytogene,LM)的遗传物质多态性特征,探索LM鉴定及溯源新方法。[方法]运用自动化的核糖体基因分型系统(RiboPrinter),用EcoRI酶,对我国食品污染物监测网来源的67株LM进行了分子分型研究。[结果]67株菌均被鉴定为LM;并获得了13种RiboPrinter核糖体基因条带型,除2种被系统判定为新条带型,另外11种分别与杜邦数据库中的DUP-1038、DUP-1039、DUP-1042、DUP-1044、DUP-1045、DUP-1052相似。[结论]RiboPrinter分型结果为建立我国LM分子分型数据库积累了一定的数据和经验,但由于菌株的来源地及数量都有限,因此尚不能看出核糖体基因型是否有明显的地域分布特征。

关键词：单核细胞增生李斯特菌 RiboPrinter 核糖体基因分型

O139群霍乱弧菌的核糖体基因分型及其与药物抗性相关性研究

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国外医学（流行病学．传染病学分册） 2005年第4期32卷 196-200,225页

作者：潘劲草叶榕王满琴张文元孟冬梅濮小英张蔚汪皓秋黄志成施世锋项海青何浙生杭州市疾病预防控制中心 310006 浙江省医学科学院杭州310013

目的了解杭州市及浙江省部分地区O139群霍乱弧菌分离株的核糖体基因分型特征及其与抗生素抗性关系.方法对1994～2004年杭州市分离的105株及2000年浙江省部分地区分离的5株O139群菌株,PCR法检测ctxA和tcpA基因,纸片扩散法测定抗生素抗性... 详细信息

目的了解杭州市及浙江省部分地区O139群霍乱弧菌分离株的核糖体基因分型特征及其与抗生素抗性关系.方法对1994～2004年杭州市分离的105株及2000年浙江省部分地区分离的5株O139群菌株,PCR法检测ctxA和tcpA基因,纸片扩散法测定抗生素抗性,应用核糖体基因分型技术进行分子分型;并与1997～2001年分离的20株O1群霍乱弧菌流行株代表菌株的分子分型结果进行比较.结果杭州市105株O139群菌株中,95株ctxA阳性菌株分为8个型(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ、Ⅶ和Ⅷ型),其中Ⅱ型菌株为2000年后的优势克隆群(占73.7%,70/95),并于2004年引起一起较大规模的爆发;10株ctxA阴性菌株被分为3个型(α、β和γ型).2000年浙江绍兴市4株ctx4阳性O139群分离株属Ⅱ型,浙江湖州市1株ctxA阴性分离株属γ型.20株O1群流行代表菌株被分为5个型(A、B、C、D和E型),其中A型和B型分别与O139群中的Ⅵ型和Ⅶ型的带谱相同.ctxA阳性和ctxA阴性O139群菌株间的耐药谱显著不同.67株Ⅱ型O139群菌株中共有28种耐药谱,最少的仅对2种抗生素同时耐药,最多对¨种抗生素同时耐药;分别有对11种和10种抗生素耐药的菌株在2002～2004年间成为优势菌(81.5%,22/27).结论1994～2004年间多种核糖体基因型O139群霍乱弧菌在杭州同时或替换流行,多重耐药的核糖体基因型Ⅱ型O139群菌株于2002～2004年间成了杭州优势流行菌株.

关键词：霍乱弧菌核糖体基因分型耐药性 O139群霍乱弧菌药物抗性相关性研究 1997~2001年 O1群霍乱弧菌 2004年抗生素耐药

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猪链球菌核糖体基因分型研究

中国猪业 2010年第6期5卷 28-30页

作者：王凯山东省东营市河口区动物疫病防治监控中心

从青岛农业大学动物科技学院实验室分离培养的15株猪链球菌中提取基因组DNA,利用PstⅠ消化并进行电泳分析,将电泳分离的DNA片段转移至尼龙膜上并固定;以大肠杆菌C83907 16srDNA两侧保守区域设计引物,利用PCR扩增出16srRNA基因片段,用地... 详细信息

从青岛农业大学动物科技学院实验室分离培养的15株猪链球菌中提取基因组DNA,利用PstⅠ消化并进行电泳分析,将电泳分离的DNA片段转移至尼龙膜上并固定;以大肠杆菌C83907 16srDNA两侧保守区域设计引物,利用PCR扩增出16srRNA基因片段,用地高辛标记制成探针;该探针与基因组DNA酶切片段进行杂交,通过对杂交带型分析,进而对猪链球菌进行核糖体基因分型。

关键词：猪链球菌 16srRNA 核糖体基因分型

O139群霍乱弧菌的核糖体基因分型及其与药物抗性相关性研究

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O139群霍乱弧菌的核糖体基因分型及其与药物抗性相关性研究

O139群霍乱弧菌16S rRNA基因分型分析

应对突发公共卫生事件论坛

作者：潘劲草叶榕王满琴张文元孟冬梅濮小英张蔚汪皓秋黄志成施世锋项海青何浙生

目的了解杭州市及浙江省部分地区0139群霍乱弧菌分离株的核糖体基因分型特征及其与抗生素抗性关系。方法对1994年至2004年杭州市分离的105株及2000年浙江省部分地区分离的5株0139群菌株,PCR法检测ctxA和tcpA基因,纸片扩散法测定抗生素抗... 详细信息

目的了解杭州市及浙江省部分地区0139群霍乱弧菌分离株的核糖体基因分型特征及其与抗生素抗性关系。方法对1994年至2004年杭州市分离的105株及2000年浙江省部分地区分离的5株0139群菌株,PCR法检测ctxA和tcpA基因,纸片扩散法测定抗生素抗性,应用核糖体基因分型技术进行分子分型;并与1997年至2001 年分离的20株01群霍乱弧菌流行株代表菌株的分子分型结果进行比较。结果杭州市105株0139群霍乱菌株中, 95株ctxA阳性菌株分为8个型(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ、Ⅶ和Ⅷ型),其中Ⅱ型菌株为2000年后的优势克隆群(占 73．7％(70／95)),并于2004年引起一起较大规模的暴发;10株ctxA阴性菌株被分为3个型(α、β和γ型)。2000 年绍兴市4株ctxA阳性0139群分离株属Ⅱ型,湖州市1株ctxA阴性分离株属γ型。20株01群霍乱流行株代表菌株被分为5个型(A、B、C、D和E型),其中A型和B型分别与0139群中的Ⅵ型和Ⅶ型的带谱相同。ctxA阳性和 ctxA阴性0139群菌株间的耐药谱显著不同。67株Ⅱ型0139群菌株中共有28种耐药谱,最少的仅对2种抗生素同时耐药,最多对11种抗生素同时耐药;分别对11种和10种抗生素耐药菌株在2002年至2004年间成为优势菌 (81．5%(22／27))。结论 1994年至2004年间多种核糖体基因型0139群霍乱弧菌在杭州同时或替换流行,多重耐药的核糖体基因型Ⅱ型0139群菌株于2002年至2004年间成了杭州优势流行菌株。

关键词：霍乱弧菌核糖体基因分型耐药性

来源： cnki会议评论

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现代预防医学 2007年第18期34卷 3455-3456+3459页

作者：严寒秋马小燕李峰黎新宇刘桂荣唐耀武北京市疾病预防控制中心北京北京市疾病预防控制中心 100013

[目的]研究北京市O139群霍乱弧菌的分子生物学特征。[方法]对北京市1998￣2000年的30株O139群霍乱弧菌进行PCR霍乱肠毒素(CT)基因检测,以16SrRNA为探针对菌株DNA进行Southern杂交后对图谱进行核糖体基因(RT)分型分析。[结果]对30株霍乱... 详细信息

[目的]研究北京市O139群霍乱弧菌的分子生物学特征。[方法]对北京市1998￣2000年的30株O139群霍乱弧菌进行PCR霍乱肠毒素(CT)基因检测,以16SrRNA为探针对菌株DNA进行Southern杂交后对图谱进行核糖体基因(RT)分型分析。[结果]对30株霍乱弧菌RT图谱进行分析,共存在5种16SrRNA核糖体基因型,其中CT阳性的O139群霍乱弧菌为RT1型,CT阴性的O139群霍乱弧菌为RT2-RT5型。[结论]北京市不同年份的O139群霍乱弧菌CT阳性菌株核糖体基因型较为单一,CT阴性菌株基因型具有明显的多样性。提示北京市O139群霍乱弧菌CT阳性菌株和CT阴性菌株遗传发生上相距较远。

关键词：霍乱弧菌霍乱肠毒素核糖体基因分型

中国O139群霍乱弧菌核糖体基因多态性的研究

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中华流行病学杂志 2002年第3期23卷 203-205页

作者：曲梅阚飙祁国明刘延清高守一中国疾病预防控制中心传染病预防控制所卫生部医学分子细菌学重点实验室

目的　分析国内O139群霍乱弧菌分离株的遗传多态性。方法　以 16srRNA和 2 3srRNA核糖体基因作探针 ,对内切酶消化的菌株染色体DNA进行Bouthern杂交 ,分析杂交图谱。结果　选择的 12 2株O139群霍乱弧菌得到 10种核糖体基因型。 9株ctxAB... 详细信息

目的　分析国内O139群霍乱弧菌分离株的遗传多态性。方法　以 16srRNA和 2 3srRNA核糖体基因作探针 ,对内切酶消化的菌株染色体DNA进行Bouthern杂交 ,分析杂交图谱。结果　选择的 12 2株O139群霍乱弧菌得到 10种核糖体基因型。 9株ctxAB、zot和RS均为阴性的无毒菌株 ,分属于 4种独特的核糖体基因型。结论　O139群霍乱弧菌在遗传分化及克隆群的地区分布上存在多态性 ,提示国内O139霍乱流行的复杂性。

关键词： O139群霍乱弧菌核糖体基因分型中国遗传多态性