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分子植物育种 2015年第12期13卷 2811-2817页

作者：倪州献白天道蔡恒陈淑芬徐立安南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京210037 广西大学林学院南宁530004

SSR标记是林木种内遗传多样性及种质鉴别的重要分子工具,而通用性SSR标记可有效解决近缘物种标记不足、开发成本高等问题。本研究检测并分析了基于马尾松基因组测序结果开发的22个SSR多态性标记,在湿地松、白皮松及黄山松等7个松属树种... 详细信息

SSR标记是林木种内遗传多样性及种质鉴别的重要分子工具,而通用性SSR标记可有效解决近缘物种标记不足、开发成本高等问题。本研究检测并分析了基于马尾松基因组测序结果开发的22个SSR多态性标记,在湿地松、白皮松及黄山松等7个松属树种中的通用性(可扩增性及多态性)。结果显示:参试标记在湿地松、白皮松、华山松、加勒比松、油松、黄山松及细叶云南松中的有效扩增率分别为68.18%、31.82%、36.63%、63.64%、100%、100%及100%;对以上7个树种各随机抽样6个植株(实生苗)进行扩增多态性初步检测,多态性标记占有效扩增标记的比例分别为86.67%、71.43%、25.00%、78.57%、90.91%、95.45%及100%。研究结果表明该22个标记绝大部分可应用于参试树种(尤其是油松,黄山松及细叶云南松)的遗传多样性及分子标记辅助育种研究中。

关键词：马尾松松属植物 SSR 标记通用性

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大豆基因组SSR和EST-SSR在黄芪中的通用性分析

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分子植物育种 2015年第5期13卷 994-998页

作者：贺润丽樊杰平莉莉温旭东狄金雷山西中医学院太原030024

分子标记的种间通用性可降低其开发成本,提高利用效率,促进遗传研究较薄弱物种的分子遗传学研究。为开发黄芪SSR分子标记,本研究利用大豆的66对基因组SSR(G-SSR)和43对EST-SSR引物在黄芪基因组中进行通用性分析,并选出其中条带清晰易辨... 详细信息

分子标记的种间通用性可降低其开发成本,提高利用效率,促进遗传研究较薄弱物种的分子遗传学研究。为开发黄芪SSR分子标记,本研究利用大豆的66对基因组SSR(G-SSR)和43对EST-SSR引物在黄芪基因组中进行通用性分析,并选出其中条带清晰易辨的23对引物对6种不同来源的黄芪进行遗传分析。结果表明:大豆G-SSR、EST-SSR引物在黄芪中的通用性比例分别为31.82%、76.74%,多态性引物分别占18.18%、53.49%,大豆EST-SSR在黄芪的通用性高于基因组SSR,且通用的大豆SSR标记可以用于不同来源黄芪的遗传多样性分析。本研究发掘的多态性SSR引物可以有效用于黄芪的分子遗传多样性研究。

关键词：黄芪大豆 SSR EST-SSR 标记通用性

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蚕豆SSR标记的开发及遗传连锁图谱的构建

蚕豆SSR标记的开发及遗传连锁图谱的构建

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作者：马钰中国农业科学院

学位级别：硕士

蚕豆（Vicia faba L.）是世界上重要的食用豆类作物之一，也是人类栽培的最古老的作物之一。我国是世界上蚕豆栽培面积最大，产量最多的国家。蚕豆具有固氮、耐瘠等特性，目前已成为种植业结构调整中重要的间套作物和养地作物。同时，... 详细信息

蚕豆（Vicia faba L.）是世界上重要的食用豆类作物之一，也是人类栽培的最古老的作物之一。我国是世界上蚕豆栽培面积最大，产量最多的国家。蚕豆具有固氮、耐瘠等特性，目前已成为种植业结构调整中重要的间套作物和养地作物。同时，蛋白和淀粉含量高、脂肪含量低，易消化吸收，为人类饮食和动物饲料提供了重要的蛋白和淀粉来源，在农业耕作体系和产业结构中有着不可忽视的地位。然而，目前国内外对蚕豆的遗传研究远远落后于其他作物，可应用于蚕豆的分子标记十分有限。本研究利用磁珠富集法和数据库搜索法开发蚕豆基因组SSR和EST-SSR引物，并筛选近缘种豌豆、山黧豆EST-SSR引物用于蚕豆研究。以F2分离群体为作图群体，利用SSR标记构建蚕豆遗传连锁图谱。主要研究结果如下： 1.利用数据库搜索法检索出5029条蚕豆EST序列，在所检出的SSR位点中，三核苷酸重复类型最多，占总数的44.1%，共搜索到63种EST-SSR重复基元，其中AG、TC、AAG基序最多，占16.1%。利用Primer3.0成功设计66对蚕豆EST-SSR引物，在32份国内外蚕豆资源DNA中扩增，45对（68.2%）引物有扩增产物，21对（31.8%）引物扩增出多态性。 2.利用磁珠富集法开发的10662对蚕豆基因组SSR引物在8份蚕豆资源DNA中进行扩增，4297对能成功扩增，有效扩增率为40.3%;1140对扩增出多态，多态性比率为26.5%。其中以单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复类型为主，单核苷酸和三核苷酸重复类型的有效扩增率高于二核苷酸重复类型的有效扩增率，四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复类型有效扩增数偏少。 3.通过399对豌豆EST-SSR引物和300对山黧豆EST-SSR引物在蚕豆中的通用性分析，豌豆EST-SSR引物的通用性比率（56.9%）显著高于山黧豆EST-SSR引物的通用性比率（22.3%）。对比发现，三核苷酸和四核苷酸重复类型引物的通用性比率最高，六核苷酸重复类型引物的通用性比率次之，二核苷酸和五核苷酸的通用性比率最低。 4.以大粒蚕豆91825和小粒蚕豆K1563杂交获得的129株F2分离群体为作图群体，采用11517对SSR引物对亲本进行多态性检测，从中筛选出148对多态性引物。利用作图群体对多态性SSR引物进行连锁遗传分析，构建了一张包含127个SSR标记的蚕豆分子遗传连锁图谱。该图谱覆盖长度为1588.3cM，共包含14个连锁群，平均图距为12.5cM。其中27%（P≤0.05）的标记出现偏分离现象，研究发现了6个偏分离区域。

关键词：蚕豆 SSR标记开发引物筛选标记通用性遗传连锁图谱

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