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农业生物技术学报 2019年第12期27卷 2140-2149页

作者：张学英李振侠尹宝颖李中勇张媛徐继忠李琦玮邵建柱河北农业大学园艺学院河北科技大学生物科学与工程学院

’斗南’大果芽变是由’斗南’苹果(Malus domestica’Tonami’)的一主枝自然变异产生的。为明确’斗南’苹果大果芽变的机理,本研究以’斗南’苹果及其大果芽变’大果斗南’苹果为材料,对果实大小、细胞倍性、细胞组织结构及果实发育... 详细信息

’斗南’大果芽变是由’斗南’苹果(Malus domestica’Tonami’)的一主枝自然变异产生的。为明确’斗南’苹果大果芽变的机理,本研究以’斗南’苹果及其大果芽变’大果斗南’苹果为材料,对果实大小、细胞倍性、细胞组织结构及果实发育早期的转录组进行比较分析。结果表明,’大果斗南’平均单果重是’斗南’的1.5倍,二者差异显著(P果实细胞大小无显著差异,但在盛花后28 d和成熟期’大果斗南’的细胞数量显著多于’斗南’(P果实转录组数据,获得51个差异表达基因,KEGG通路主要富集在植物激素信号转导途径中,从中筛选出5个可能与大果芽变相关的基因,这些基因主要参与细胞分裂素信号转导及乙烯信号转导途径,表明’斗南’大果芽变可能与发育过程中植物激素变化有关。本研究结果为苹果大果型芽变的细胞学和分子基础研究提供了基础资料。

关键词：苹果大果芽变果实发育早期转录组分析差异表达基因

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基于蓝莓果实发育早期转录组数据的差异基因筛选与表达分析

基于蓝莓果实发育早期转录组数据的差异基因筛选与表达分析

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作者：蔡凯玲浙江师范大学

学位级别：硕士

果实大小是决定蓝莓（Vaccinium spp.）经济价值重要的农艺性状,主要由果实中细胞数目及细胞体积决定。其中,果实发育早期阶段是决定蓝莓果实大小的关键时期。本研究以蓝莓中果型品种?奥尼尔?和小果型品种?蓝雨?为实验材料,对发育早期... 详细信息

果实大小是决定蓝莓（Vaccinium spp.）经济价值重要的农艺性状,主要由果实中细胞数目及细胞体积决定。其中,果实发育早期阶段是决定蓝莓果实大小的关键时期。本研究以蓝莓中果型品种?奥尼尔?和小果型品种?蓝雨?为实验材料,对发育早期的果实（S0-S2期）进行转录组测序,以及差异表达基因筛选、克隆、表达、病毒介导的基因沉默（VIGS）处理,以期了解蓝莓调控果实大小的内在机制,为靶向选择大果形蓝莓栽培品种奠定理论基础。具体研究结果如下:（1）转录组数据分析:（1）主成分（PCA）分析发现3个生物学重复间的数据基本聚类在一起,表明转录组数据可靠,且2个品种S1期与S2期数据相似。（2）‘奥尼尔’和‘蓝雨’S0期果实中的差异表达基因共有45,474个,其中上调基因20,827个,下调基因共有24,647个;2个品种S1期的差异表达基因共有69,294个,其中上调基因35,074个,下调基因34,220个;2个品种S2期的差异表达基因共有69,816个,其中上调基因有34,027个,下调基因有35,789个。上述结果表明2个品种在S1期和S2期的差异表达基因数目多于S0期,推测S0期与S1-S2期的差异表达基因对蓝莓果实大小有较大影响。（3）GO富集分析发现差异表达基因主要富集在“分子功能”模块;KEGG分析表明差异表达基因富集于多个不同的代谢通路。在此基础上,我们通过韦恩结果筛选出31个候选基因,进行下一步分析。（2）实时荧光定量PCR验证:qPCR分析发现31个候选基因在2个蓝莓品种果实发育早期的表达差异明显,结果表明基本与转录组数据相符。（3）5个关键基因分离:采用同源克隆的方法,从‘蓝雨’果实S1期中分离出3个细胞色素P450相关基因和2个生长素相关基因的全长cDNA,即Cluster-24679.305304（CYP749A22）、Cluster-24679.356572（CYP81E8）、Cluster-24679.62988（CYP76A2）、Cluster-24679.344142（ILR1）、Cluster-24679.308496（YUCCA10）,序列分析发现这些基因结构较为保守。（4）基因功能鉴定:成功分离出7个差异表达细胞色素P450基因的非保守片段,并构建病毒诱导的基因沉默（VIGS）载体,将这些载体转化至根癌农杆菌GV3101以及侵染绿熟期番茄果实。在侵染后10天,发现VcCYP81E8基因（Cluster-24679.383750）沉默后的番茄果实颜色较阴性对照偏黄,推测VcCYP81E8基因可能参与了类胡萝卜素的生物合成和代谢调控,其相关生物学功能仍有待于进一步研究。

关键词：蓝莓果实发育早期转录组果实大小

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花生黄曲霉抗性与SR和α-微管蛋白相关性

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中国生物工程杂志 2012年第3期32卷 32-38页

作者：严海燕宗成志翟刚马生财单世华中南民族大学生命科学学院武汉430074 山东省花生研究所青岛266100

信号识别颗粒受体在分泌性蛋白合成和分泌过程中起重要作用。微管蛋白对细胞内各种生命活动都是必需的。将数据库中花生抗黄曲霉和敏感品种的两类α-微管蛋白α和α7和SR蛋白进行序列比较分析发现,在种子发育早期5,α-微管蛋白在敏感品... 详细信息

信号识别颗粒受体在分泌性蛋白合成和分泌过程中起重要作用。微管蛋白对细胞内各种生命活动都是必需的。将数据库中花生抗黄曲霉和敏感品种的两类α-微管蛋白α和α7和SR蛋白进行序列比较分析发现,在种子发育早期5,α-微管蛋白在敏感品种各有三条EST,抗性品种各有一条EST,晚期7只有抗性品种各有一条EST。SR只在抗性品种的6、7时期各有一条EST,敏感品种中没有。用荧光定量PCR方法对抗性品种KB153与敏感品种JH1012发育中不同时期的果实和部位进行差异表达分析,结果表明在果实发育早期的小果期,SR、α-微管蛋白α和α7在抗性品种中都显著上调表达,说明SR介导的内质网蛋白质运输途径与黄曲霉抗性有关。SR基因在抗性品种的子叶中的表达也上调,这与抗性品种中一些贮藏蛋白含量尤其是蛋白酶抑制剂高于敏感品种的现象一致。

关键词：黄曲霉花生 α-微管蛋白果实发育早期 SR

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