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基于系统药理学的茵陈作用机制研究

中国药房 2018年第10期29卷 1312-1319页

作者：陈国铭汤顺莉邝梓君黄雁赵金龙於菁雯陈子茵林洪荣黄楚瑶许华广州中医药大学第一临床医学院广州510405 广州中医药大学第三临床医学院广州510405 广州中医药大学针灸康复临床医学院广州510405 广州中医药大学第一附属医院儿科广州510405

目的:探讨茵陈可能的药理作用机制,为其进一步开发利用提供参考。方法:利用中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP)筛选茵陈的有效成分和相关靶标蛋白;运用Cytoscape 3.5.1软件构建茵陈有效化合物-靶标蛋白可视化网络,并进行拓扑学分析;借... 详细信息

目的:探讨茵陈可能的药理作用机制,为其进一步开发利用提供参考。方法:利用中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP)筛选茵陈的有效成分和相关靶标蛋白;运用Cytoscape 3.5.1软件构建茵陈有效化合物-靶标蛋白可视化网络,并进行拓扑学分析;借助STRING数据库进行蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络的构建与分析;通过DAVID生物信息学资源数据库对靶标蛋白编码基因进行KEGG通路富集分析。结果:共筛选出茵陈有效化合物13个,靶标蛋白189个,KEGG富集通路34条。槲皮素、β-谷甾醇、异鼠李素、Artepillin C等是主要有效化合物,前列腺素G/H合成酶2(PTGS2)、热休克蛋白90(HSP90)、二肽基肽酶Ⅳ、蛋白激酶A催化亚基Cα等是主要靶标蛋白;转录因子AP-1(JUN)、细胞肿瘤抗原p53在PPI网络中发挥了关键作用;靶标蛋白编码基因主要富集在肿瘤坏死因子α(TNF-α)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路、Toll样受体信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶/丝苏氨酸蛋白激酶(P13K/Akt)信号通路、T细胞受体信号通路、甲状腺激素信号通路、凋亡信号通路等通路上。结论:茵陈中的槲皮素、β-谷甾醇、异鼠李素等化合物可能通过TNF-α信号通路、HIF-1信号通路、PI3K/Akt信号通路等作用于PTGS2、HSP90、JUN等靶标蛋白,进而发挥其抗炎、抗肿瘤等药理作用。

关键词：系统药理学茵陈有效化合物靶标蛋白信号通路药理作用

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基于网络药理学的葶苈子潜在作用机制研究

中国药房 2019年第20期30卷 2823-2828页

作者：史佩玉林樫陈国铭方彩珊綦向军侯颖跃罗冬强邢万里黄睿澜罗文婷广州中医药大学第一临床医学院广州510405 广州医科大学附属第一医院国家呼吸系统疾病临床医学研究中心广州510120

目的:探讨葶苈子潜在的药理作用机制,为其进一步开发利用和临床应用提供参考。方法:利用中药系统药理学分析平台数据库和STRING数据库筛选并确认葶苈子的有效成分和相关靶标蛋白;运用Cytoscape3.7.0软件构建葶苈子有效化合物-靶标蛋白... 详细信息

目的:探讨葶苈子潜在的药理作用机制,为其进一步开发利用和临床应用提供参考。方法:利用中药系统药理学分析平台数据库和STRING数据库筛选并确认葶苈子的有效成分和相关靶标蛋白;运用Cytoscape3.7.0软件构建葶苈子有效化合物-靶标蛋白可视化网络,并进行网络拓扑学分析;借助STRING数据库和Cytoscape3.7.0软件构建并分析葶苈子靶标蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络;通过DAVID生物信息学资源数据库对靶标蛋白进行KEGG通路富集分析。结果:共筛选获得葶苈子有效化合物9个,包括槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等;获得靶标蛋白174个,主要包括人前列腺素内源性过氧化物合酶2(PTGS2)、核受体共激活因子2、孕酮受体等,其中转录因子AP-1(JUN)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)是PPI网络中的核心蛋白。KEGG富集通路包括磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路、肿瘤坏死因子α(TNF-α)信号通路、缺氧诱导因子1信号通路、Toll样受体信号通路、甲状腺激素信号通路等。结论:葶苈子中的槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等有效化合物可能通过PI3K/Akt信号通路、TNF-α信号通路等作用于PTGS2、JUN、MAPK1等靶标蛋白,进而发挥泻肺平喘、利水消肿的功效。

关键词：葶苈子网络药理学药理作用机制有效化合物靶标蛋白信号通路

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基于网络药理学的川芎作用机制研究

医药论坛杂志 2021年第7期42卷 1-6,11页

作者：邱建利张慧娟赵倩义孙晓旭袁业红郑海涛河南中医药大学第一附属医院儿科郑州450000

目的探讨中药川芎的可能药理作用机制,为进一步开发作用靶点明确的药物提供依据。方法利用中药系统药理学分析平台、Cytoscape 3.5.1软件、STRING数据库以及DAVID生物信息学资源数据库分别对川芎的有效化学成分以及靶标蛋白进行分析,并... 详细信息

目的探讨中药川芎的可能药理作用机制,为进一步开发作用靶点明确的药物提供依据。方法利用中药系统药理学分析平台、Cytoscape 3.5.1软件、STRING数据库以及DAVID生物信息学资源数据库分别对川芎的有效化学成分以及靶标蛋白进行分析,并通过化合物及其靶标蛋白的关系构建可视化的网络进行拓扑学分析,进一步分析蛋白质与蛋白质之间相互关系网络,最后将编码重要靶标蛋白的基因进行KEGG生物信息学富集分析。结果本研究共筛选到7个有效化合物,49个主要靶标蛋白以及20条KEGG信号富集通络。亚麻油酸乙酯、杨梅酮、川芎哚等是主要化合物;PTGS1、PTGS2、凝血酶、RXRA、是主要靶标蛋白;PTGS1、NCOA2、PTGS2、F2在网络中发挥了关键作用;主要化合物靶标蛋白的主要编码基因主要集中在TNF-α、HIF-1等信号通路。结论中药川芎中亚麻油酸乙酯、杨梅酮、川芎哚等可能通过TNF-α、HIF-1等信号通路作用于PTGS1、PTGS2、凝血酶、RXRA等起到活血化瘀、抗炎、抗菌的作用。

关键词：川芎网络药理学有效化合物靶标蛋白信号通路

以LLC细胞毒活性筛选指导下的色谱分离技术策略对土贝母有效成分进行分离、纯化与鉴定的研究

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以LLC细胞毒活性筛选指导下的色谱分离技术策略对土贝母有效成分...