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基于结直肠癌高表达抗原PSG9的HLA-A2/A3限制性CTL表位预测

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肿瘤防治研究 2010年第1期37卷 104-105页

作者：赵俊伟高艳锋祁元明祁峰李永欣安秀丽郑州大学生物工程系 450001

0 引言研究发现,寻找更多的具有强的HLA-Ⅰ限制性的免疫原性的表位肽,发展以表位肽为基础的疫苗成为肿瘤免疫疗法中的一个有潜力的治疗策略.

关键词： PSG9 抗原肽 HLA—A2/A3 表位

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H-Y抗原候选基因的研究进展

中国畜牧兽医 2011年第10期38卷 68-73页

作者：谭庆辉王乃东薛立群湖南农业大学动物医学院湖南长沙410128

雄性特异性组织相容性抗原(male specific minor histompatibility antigens,H-Y抗原)是由Y染色体上的基因编码,在雄性动物细胞中普遍表达(包括胚胎和滋养层细胞)。H-Y抗原不仅能引起基因型相同的雌性动物排斥雄性组织,也能导致人白细... 详细信息

雄性特异性组织相容性抗原(male specific minor histompatibility antigens,H-Y抗原)是由Y染色体上的基因编码,在雄性动物细胞中普遍表达(包括胚胎和滋养层细胞)。H-Y抗原不仅能引起基因型相同的雌性动物排斥雄性组织,也能导致人白细胞抗原匹配干细胞移植术后出现移植抗宿主性疾病(GVH)。细胞毒性T淋巴细胞检测到几个不同的H-Y抗原表位,这些肽是从胞内蛋白分离出来,由主要组织相容性复合分子结合呈递在细胞表面。H-Y抗原肽与人白细胞抗原Ⅰ类和Ⅱ类分子特异结合参与免疫反应,从而影响移植结果。近年来越来越多的文献报道了H-Y抗原的相关研究,作者主要综述编码H-Y抗原的相关候选基因,并对它在疾病等方面的前景作出了一些展望。

关键词： H-Y抗原候选基因抗原肽

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SBEM蛋白在不同乳腺癌细胞中的表达及抗原表位的预测

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SBEM蛋白在不同乳腺癌细胞中的表达及抗原表位的预测

作者：郝辉大连医科大学

学位级别：硕士

目的：乳腺癌病人发生远处转移是导致死亡的主要原因，无论肿瘤细胞是被机械性捕获至毛细血管还是通过与内皮细胞发生黏附，其在转移灶的停留和生长都是引起继发性远处转移的必要步骤。在临床研究中将这些常规检查方法不能发现的肿瘤播... 详细信息

目的：乳腺癌病人发生远处转移是导致死亡的主要原因，无论肿瘤细胞是被机械性捕获至毛细血管还是通过与内皮细胞发生黏附，其在转移灶的停留和生长都是引起继发性远处转移的必要步骤。在临床研究中将这些常规检查方法不能发现的肿瘤播散细胞定义为微转移，早期检测出微转移的存在并进行临床干预是改善病人预后的重要因素。乳腺上皮粘蛋白（Small breast epithelial mucin,SBEM）是一种膜结合粘液素（MUC）家族成员，仅有90个氨基酸序列，在乳腺癌组织的细胞膜上呈特异性表达。已有研究表明，SBEM有望成为一种分子标记物用来检测乳腺癌患者是否发生了微转移。对SBEM蛋白功能和作用机制进行深入研究，有助于早期发现和防治乳腺癌微转移;进一步筛选出SBEM蛋白的保护性抗原表位，可为乳腺癌免疫治疗提供理想的干预靶点，为基因疫苗及药物治疗的研制与开发提供了重要的实验基础。方法：1、应用免疫细胞化学的方法检查SBEM蛋白在MCF-7、MDA-MB-231和SK-BR-3三组细胞中的表达情况，对比分析该蛋白在三种不同病例类型的乳腺癌细胞中的表达水平。2、应用流式细胞仪对比分析SBEM蛋白在MCF-7、MDA-MB-231和SK-BR-3三组细胞中的表达水平。3、采用半定量PCR对比分析SBEM mRNA在MCF-7、MDA-MB-231和SK-BR-3三组细胞中mRNA的表达水平。4、运用生物信息学的方法，通过SYFPEITHI和ProPred-I预测法进行SBEM抗原表位的初步预测，并结合NETCHOP3.0蛋白酶切分析法，进行SBEM抗原表位的多重筛选及综合分析，并预测出乳腺癌中乳腺上皮粘蛋白的HLA-A*0201限制性CTL表位。结果：1、免疫细胞化学结果显示，SBEM蛋白在MDA-MB-231细胞膜上呈高表达，且表达水平高于MCF-7细胞及SKBR-3细胞。2、流式细胞术检测结果显示，SBEM蛋白在MDA-MB-231细胞上呈高表达，且表达水平高于MCF-7细胞和SK-BR-3细胞。3、半定量PCR检测结果显示，SBEM mRNA在MDA-MB-231细胞中呈高表达，且表达水平明显高于MCF-7细胞和SK-BR-3细胞。4、运用生物信息学的方法，通过SYFPEITHI和ProPred-I预测法进行SBEM抗原表位的初步预测，并结合NETCHOP3.0蛋白酶切分析法，进行候选抗原表位的多重筛选及综合分析，得到两条亲和性相对较高的九肽作为乳腺癌相关抗原SBEM的候选HLA-A*0201限制性CTL抗原肽，即LLGVSIFLV（9-17）和VLLGVSIFL（8-16）。结论：1、SBEM蛋白及mRNA在MDA-MB-231细胞中呈高表达，明显高于其他两种乳腺癌细胞系。说明SBEM蛋白及mRNA在不同病理类型的乳腺癌细胞中的表达水平不同。病理类型越恶劣，其表达水平越高。进一步应用免疫细胞化学染色方法对其表达部位进行验证，结果显示SBEM蛋白主要表达在细胞膜上。肿瘤相关抗原SBEM作为一种膜蛋白，且在恶性程度较高的乳腺癌中呈高表达，这为研究SBEM蛋白的候选HLA-A*0201限制性CTL表位提供了重要的理论及实验基础。2、通过生物信息学方法筛选出的保护性HLA-A*0201限制性CTL候选抗原表位LLGVSIFLV（9-17）和VLLGVSIFL（8-16）最有亲和力，为乳腺癌免疫治疗奠定重要的实验基础，为个体化治疗乳腺癌转移提供理想的干预靶点。应用生物信息学方法预测抗原表位，不仅有助于免疫学技术的发展，而且有助于基因疫苗的研制及抗体药物的研制和开发，为疾病的生物免疫治疗提供了新的靶点及新的思路。

关键词： SBEM 抗原表位抗原肽 HLA-A*0201 限制性

PLS方法应用于T细胞表位定量构效关系研究

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PLS方法应用于T细胞表位定量构效关系研究

作者：宋哲大连理工大学

学位级别：硕士

T细胞是最重要的免疫细胞,它的主要功能是介导细胞免疫和调节机体的免疫功能。细胞毒性T细胞能够直接对肿瘤细胞进行特异性杀伤。要使T细胞发挥它的免疫功能,需要激活T细胞的免疫应答,使T细胞活化、增殖、分化。可是T细胞不能直接识别... 详细信息

T细胞是最重要的免疫细胞,它的主要功能是介导细胞免疫和调节机体的免疫功能。细胞毒性T细胞能够直接对肿瘤细胞进行特异性杀伤。要使T细胞发挥它的免疫功能,需要激活T细胞的免疫应答,使T细胞活化、增殖、分化。可是T细胞不能直接识别天然抗原,它只能识别与主要组织相容性复合体MHC分子结合、并被主要组织相容性复合体MHC分子提呈的抗原肽。本文主要研究的是能够激活细胞毒性T细胞的、在内源性抗原加工提呈途径中产生的、与主要组织相容性复合体MHCⅠ类分子结合的抗原肽。内源性抗原肽产生过程为:在抗原提呈细胞APC内部,内源性抗原与泛素结合,并被泛素带到蛋白酶体中。在蛋白酶体中,内源性抗原被加工处理、降解为抗原肽;抗原肽经过抗原相关转运蛋白TAP转运至内质网中;在内质网中,抗原肽与新生成的MHCⅠ类分子结合为抗原肽-MHC分子复合物;复合物经过高尔基体被转移至抗原提呈细胞表面,并与T细胞表面的T细胞抗原受体TCR结合,成为TCR-抗原肽-MHC分子三元体,激活T淋巴细胞免疫应答的全过程。由内源性抗原肽产生过程可知,抗原肽-MHCⅠ类分子复合体对T细胞的激活起到直接作用。因此,研究什么样的抗原肽与MHCⅠ类分子结合是十分重要的。MHCⅠ类分子是由α链(含α1、α2和α3三个结构域)和β链(β2m)组成,其中α1和α2构成Ⅰ类分子抗原结合槽。结合槽的两端是封闭的,因此能够与MHCⅠ类分子结合的抗原肽的长度受到限制,一般为8～11。在α1和α2构成的结合槽中,有6个由氨基酸残基构成的口袋(pocket A～F)。与MHCⅠ类分子结合的抗原肽相应位置的侧链会进入到这6个pocket中。而MHCⅠ类分子的这种结构就决定了什么样的抗原肽能够与之结合。不同的抗原肽与MHCⅠ类分子的结合力是不同的,在免疫学实验上用IC值(InhibitConcentration to achieve 50%bioeffectivity)来表示这种结合亲和力的大小。 MHCⅠ类分子的结合槽的氨基酸序列是不变的,因此抗原肽的氨基酸序列将决定它能否与MHCⅠ类分子结合。也就是说,抗原肽是激活T细胞免疫应答的关键,这些能够激活T细胞免疫应答的抗原肽又称为T细胞表位。因此T细胞表位的鉴定在免疫学中有十分重要的意义。实验上鉴定T细胞表位的方法是采用先合成大量的交叠肽,再通过多肽结合实验或T杀伤效应检测进行选取。这种实验方法费时费力效率低,因而有必要采用理论方法预测T细胞表位。本文基于长度为9(含有9个氨基酸)的抗原肽的模型,建立了抗原肽的二维定量构效关系模型,并用偏最小二乘法PLS对该模型求解,得到了抗原肽与MHCⅠ类分子结合亲和力预测模型。该模型的预测准确率为66.8%。通过对本模型的研究将有助于人们对MHCⅠ类分子结合抗原肽加工提呈过程的深入了解,对人们进行肿瘤疫苗设计和开发都是具有一定指导意义的。

关键词：主要组织相容性复合体抗原肽定量构效关系偏最小二乘法

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肿瘤疫苗潜在的靶抗原——癌基因蛋白

国外医学（肿瘤学分册） 1999年第1期26卷 4-7页

作者：张克强毛宁唐佩弦军事医学科学院基础医学研究所

近年来随着ＭＨＣ分子对抗原识别理论的阐明以及癌基因结构和功能的深入研究，以ＭＨＣ癌基因抗原肽为基础旨在诱导ＣＤ８＋ＣＴＬ介导的细胞免疫反应为主的肿瘤疫苗研究进展迅速，提示癌基因抗原肽疫苗有望应用于肿瘤特异性免疫治疗。

关键词：抗原肽肿瘤疫苗靶抗原癌基因蛋白

HLA-A2限制性人食管癌相关抗原COX-2表位的鉴定和改造

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肿瘤防治研究 2008年第7期35卷 460-463页

作者：祁峰高艳锋孙战强胡红敏陈鲤翔祁元明郑州大学生物工程系 450001

目的筛选和鉴定食管癌广泛高表达蛋白COX-2的HLA-A2限制性CTL表位。方法运用生物信息学的方法,以SYFPEITHI法初步预测,结合MHCPred 2.0和NetChop3.0 Server在线分析,设计出五条新的抗原肽。通过标准Fmoc固相合成法合成抗原肽,以流式细... 详细信息

目的筛选和鉴定食管癌广泛高表达蛋白COX-2的HLA-A2限制性CTL表位。方法运用生物信息学的方法,以SYFPEITHI法初步预测,结合MHCPred 2.0和NetChop3.0 Server在线分析,设计出五条新的抗原肽。通过标准Fmoc固相合成法合成抗原肽,以流式细胞仪对其与HLA-A2分子的结合力和稳定性进行分析,并对结合力较低的P66(FI抗原肽诱导的特异性CTL对肿瘤细胞的杀伤作用。结果P321对HLA-A2分子有较高的结合力(FI=1.93),同时P66Y1与HLA-A2分子的结合力显著增强(FI=1.48),并且它们与HLA-A2分子的稳定性较好(DC50>2h)。P321和P66Y1对表达COX-2的EC-9706、EC-1的杀伤率分别明显高于P66。结论源于食管癌广泛高表达抗原COX-2的抗原肽P321和P66Y1能分别有效激发HLA-A2限制性CTL的免疫应答并杀伤肿瘤细胞。

关键词： COX-2 抗原肽 HLA-A2 表位

田鼠巴贝虫抗原分析与重组BmSA1优化表达及其抗原表位合成鉴定

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田鼠巴贝虫抗原分析与重组BmSA1优化表达及其抗原表位合成鉴定

作者：张加中国疾病预防控制中心

学位级别：硕士

人田鼠巴贝虫病是一种重要的人兽共患血液原虫病,其病原体为田鼠巴贝虫,该病主要通过蜱叮咬及输血传播。人体感染田鼠巴贝虫后的临床症状表现不一,轻者可为无症状感染者,重者可出现类似于疟疾发作症状,甚至危及生命,尤其是当病人为免疫... 详细信息

人田鼠巴贝虫病是一种重要的人兽共患血液原虫病,其病原体为田鼠巴贝虫,该病主要通过蜱叮咬及输血传播。人体感染田鼠巴贝虫后的临床症状表现不一,轻者可为无症状感染者,重者可出现类似于疟疾发作症状,甚至危及生命,尤其是当病人为免疫缺陷者或年老者。目前,田鼠巴贝虫病的诊断依然是以显微镜检查作为金标准。然而显微镜检查的敏感性低,且田鼠巴贝虫与疟原虫形态相似,难以分辨,容易造成误诊和漏诊,延误治疗。因此,急需研发快速有效的田鼠巴贝虫病诊断方法,而诊断抗原的选择是制备免疫诊断试剂的关键,天然粗抗原或重组抗原是诊断抗原的主要来源。目的本研究旨在通过制备田鼠巴贝虫粗抗原并分析其抗原组分,筛选有效的抗原组分,并初步建立间接ELISA技术用于田鼠巴贝虫病诊断;通过截短表达国内外文献报道的田鼠巴贝虫分泌性抗原1(Babesia microti secreted antigen 1,BmSA1),降低重组BmSA1抗原与疟原虫感染血清的交叉反应,提高用于诊断田鼠巴贝虫病的特异性;通过预测并合成BmSA1的抗原表位肽,筛选有望用于田鼠巴贝虫病免疫诊断的抗原肽;通过用BmSA1免疫小鼠制备单克隆抗体,为后续建立以抗体检测循环抗原的免疫诊断技术奠定基础。方法1)用田鼠巴贝虫标准株(Babesia microti ATCC(?)PRA-99TM)感染BALB/c小鼠,待虫血症达高峰时,提取田鼠巴贝虫虫体并制备可溶性粗抗原,SDS-PAGE和Western Blot进一步分析有效抗原组分,初步建立以粗抗原为基础的间接ELISA技术。2)通过用DNA2.0软件对BmSA1基因进行密码子优化,原核表达BmSA1蛋白,并评价其与疟疾病人血清交叉反应率。3)截短表达N-末端及C-末端BmSA1,并比较其与疟原虫感染病人血清的交叉反应率。4)用DNASTAR、ABCPred、LEPS、VSMTrip四种软件预测BmSA1抗原表位,并合成抗原表位肽,用间接ELISA法鉴定其诊断效果。5)用全长BmSA1免疫小鼠,分离脾B细胞与骨髓瘤细胞融合,制备特异性单克隆抗体。结果1)建立了可溶性粗抗原-ELISA法,可检测感染早期(7d)小鼠血清,且与恶性疟、间日疟病人及弓形虫抗体阳性者血清无交叉反应,显示出其较好的诊断敏感性和较高的特异性。通过SDS-PAGE分析,获得5条分子质量约为72、66、60、53、43 kDa的主蛋白带和介于14.4～116kDa的7条次带。经Western Blot分析,SBA有15个抗原组分能被田鼠巴贝虫阳性小鼠血清识别,以分子量约为72、53、43、39、30 kDa蛋白组分反应较强。2)通过密码子优化,BmSA1蛋白获得了高效、可溶性表达,其与恶性疟原虫感染者血清的交叉反应为13.3%,与间日疟原虫感染者血清的交叉反应为26.7%。3) N-末端截短型BmS A1 (N-BmSA1)和C-末端截短型BmSA1 (C-BmSA1)均能与田鼠巴贝虫阳性血清反应,其中N-BmSA1与疟原虫阳性血清交叉反应率基本与全长BmSA1相同,而C-BmSA1与疟原虫阳性血清未检测出交叉反应。4)鉴定出氨基酸26-59、氨基酸239-256、氨基酸252-271、氨基酸272-287、氨基酸281-300为BmSA1的抗原表位,ELISA检测阳性小鼠血清和阴性小鼠血清的OD值比值均大于2.1,有较好的诊断应用价值。5)获得3株识别重组BmSA1和可溶性粗抗原的单克隆抗体细胞株。结论应用可溶性粗抗原建立的间接ELISA可作为田鼠巴贝虫感染的有效筛查工具;田鼠巴贝虫可溶性抗原组分中分子量约为72、53、43、39、30KDa的抗原组分有望成为诊断候选抗原,其特性和诊断效果有待进一步探讨。C-端截短型BmSA1相比全长BmSA1具有更高的诊断特异性,有望用于田鼠巴贝虫病的诊断。鉴定出的5个BmSA1抗原表位肽为后续建立抗原肽-ELISA试剂盒奠定了基础。

关键词：田鼠巴贝虫可溶性粗抗原 BmSA1 截短表达抗原肽 ELISA 单克隆抗体

结直肠癌抗原特异性T细胞扩增与制备的关键技术研究

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结直肠癌抗原特异性T细胞扩增与制备的关键技术研究

作者：刘洋中国人民解放军医学院

学位级别：硕士

目的：结直肠癌(CRC)在我国的发病率和致死率呈不断上升趋势。包括免疫治疗在内的综合治疗在结直肠癌治疗中起到越来越重要的作用。通过多种方式用肿瘤抗原刺激自体淋巴细胞获得抗原特异性杀伤细胞的研究众多,肿瘤细胞表面的抗原被抗原... 详细信息

目的：结直肠癌(CRC)在我国的发病率和致死率呈不断上升趋势。包括免疫治疗在内的综合治疗在结直肠癌治疗中起到越来越重要的作用。通过多种方式用肿瘤抗原刺激自体淋巴细胞获得抗原特异性杀伤细胞的研究众多,肿瘤细胞表面的抗原被抗原提呈细胞(APC)加工成抗原肽与主要组织相容复合物(MHC)分子形成复合物提呈给T细胞并诱导其活化,形成肿瘤抗原特异性的细胞毒性T淋巴细胞(CTL)。转化生长因子βII型受体(TGFβRⅡ)和O位N-乙酰葡萄糖胺糖基转移酶(OGT)基因的框移突变产生的两种新生抗原具有HLA-A2限制性,存在于20-40%的HLA-A2限制性结直肠癌患者且不存在于正常人和其他肿瘤患者,提呈后的抗原肽分别为TGFβRⅡ (RLSSCVPVA,131-139)和OGT (SLYKFSPFPL,28-37).肿瘤为了逃避识别,下调甚至不表达MHC分子,部分肿瘤患者免疫细胞数下降功能低下都会造成肿瘤抗原无法提呈,导致T细胞无法活化。针对上述T细胞无法活化的现状,我们人工合成抗原肽并与患者的外周血T细胞共培养,以提高结肠癌特异性T细胞的活化效率。接下来,用树突状细胞(DC)结合抗原肽诱导活化杀伤性T细胞与抗原肽直接刺激活化细胞比较杀伤效能,以期获得同等或者更好的杀伤效果且减少体外对细胞操作,降低副反应发生率。综上所述,本课题旨在构建简便有效的肿瘤特异性T细胞的制备方法,以达到增强特异性同时降低更加安全的目的。方法：合成TGFβRⅡ (RLSSCVPVA,131-139)和OGT (SLYKFSPFPL,28-37)两段抗原肽,质谱分析进行纯度鉴定;筛选获得表达TGFβRⅡ (RLSSCVPVA,131-139)和OGT(SLYKFSPFPL,28-37)且具有HLA-A2限制性的结肠癌细胞系一株：DLD-1。选择具有HLA-A2限制性的结直肠癌患者,应用密度梯度离心法和细胞因子刺激方式分离外周血培养获得结直肠癌患者CD8+T细胞为主的外周血单个核细胞(PBMC)昆悬液,流式细胞分析鉴定刺激培养前后细胞表型及比例;使用抗原肽与CD8+T细胞共培养刺激活化产生抗原特异性CTL, MTS实验测定针对DLD-1结肠癌细胞系不同效靶比的杀伤效应,ELISA方法评估了各组IFN-□分泌情况以进一步评估CTL活化和杀伤能力。其次,表达HLA-A2分子健康人的PBMC诱导获到成熟DC附载抗原肽刺激相应个体T细胞活化形成抗原特异性CTL,比较DC疫苗诱导的CTL与直接使用抗原肽刺激的CTL杀伤活性。结果：我们获得的TGFβRⅡ (RLSSCVPVA,131-139)和OGT (SLYKFSPFPL,28-37)抗原肽,纯度≥99%,分别加入到表达HLAA2分子的结直肠癌患者和健康人PBMC,DC进而诱导形成的抗原肽特异性CTL,经MTS试验证实经抗原肽刺激2的结直肠癌患者T细胞混悬液在第杀伤实验3天效靶比为5/1,10/1,20/1分别获得对DLD-1的48.54%,63.62%和70.23%杀伤率,低于健康对照组的杀伤率为66.32%,74.82%和81.61%,仅在10/1条件下无抗原肽处理患者组的杀伤能力优于健康对照,说明抗原肽刺激无法提高结肠癌患者自体免疫细胞杀伤DLD-1的能力。另外,与DC细胞负载抗原肽诱导形成的肿瘤抗原肽特异性CTL相比,直接使用抗原肽刺激正常人的T细胞为主的PBMC诱导得到的特异性CTL能够对DLD-1获得更好的杀伤效果：与DC负载抗原肽诱导形成的肿瘤抗原肽特异性CTL相比,直接刺激获得的特异性CTL第14天在效靶比为5/1时,DC负载抗原肽1(OGT)与抗原肽1直接刺激获得的CTL对DLD-1的杀伤率分别为26.71%和65.84%(P=0.054),DC负载与抗原肽2(TGFβRⅡ)直接刺激的CTL对DLD-1的杀伤率分别为20.69%和81.32%(P=0.039),DC负载与抗原肽1+2直接刺激的CTL对DLD-1的杀伤率分别为39.91%和69.24%(P=0.048)。在效靶比为10/1时,DC负载与抗原肽1直接刺激的CTL对DLD-1的杀伤率分别为36.33%和88.82%(P=0.038),DC负载与抗原肽2直接刺激的CTL对DLD-1的杀伤率分别为37.51%和89.74%(P=0.022),DC负载与抗原肽1+2直接刺激的CTL对DLD-1的杀伤率分别为45.58%和86.61%(P=0.043)。结论：本研究合成的两种结直肠癌新生抗原肽直接负载在健康人细胞中能获得对DLD-1较高的杀伤效果。两种抗原肽可能成为未来作为结肠癌免疫治疗的新靶点。

关键词：结直肠癌转化生长因子βⅡ型受体 O位N-乙酰葡萄糖胺糖基转移酶抗原肽肿瘤标志物细胞毒T淋细胞

基于深度集成架构的MHC-Ⅰ类分子结合肽预测研究

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基于深度集成架构的MHC-Ⅰ类分子结合肽预测研究

作者：全振东北师范大学

学位级别：硕士

主要组织相容性复合体（MHC）是由高度多态性基因组成的染色体区域,它通过与抗原蛋白相结合形成MHC-多肽的复合物,可以被运送至抗原提呈细胞表面,通过T细胞受体被T细胞识别,在机体的免疫反应中扮演着重要的作用。MHC分子主要分为两类:M... 详细信息

主要组织相容性复合体（MHC）是由高度多态性基因组成的染色体区域,它通过与抗原蛋白相结合形成MHC-多肽的复合物,可以被运送至抗原提呈细胞表面,通过T细胞受体被T细胞识别,在机体的免疫反应中扮演着重要的作用。MHC分子主要分为两类:MHC-Ⅰ类和MHC-Ⅱ类。MHC-Ⅰ类分子结合肽是指由MHC-Ⅰ类分子和内源性抗原降解后的短肽结合的复合物,是细胞毒性T细胞表位预测的重要研究内容之一。预测MHC-Ⅰ类分子结合肽对于抗原性分析、疫苗的研发、免疫疾病的研究以及抗体的制备均有重要的指导价值和研究意义。相较于生物实验,使用计算方法预测MHC-I类分子结合肽更为高效且节约成本。目前,基于计算方法的此类研究已取得了一定进展,但在计算模型的预测效果及模型的可解释性方面仍有提高空间。本文构建了一个基于集成架构和深度学习算法的MHC-I类分子结合肽预测模型。我们选用Onehot、氨基酸组成、保守性等8类特征为肽段进行编码,在此基础上构建8个独立的深度学习子网络,并使用加权平均方法实现了集成架构,通过和独立子网的对比实验验证了集成架构在本问题研究中的优越性。本研究在去冗余的独立测试集上AUC为0.953,准确率（Precision）为0.736,与其他同类研究对比后,本模型在该独立测试集上表现最佳。实验结果表明:本研究能有效预测MHC-I类分子结合肽且具有创新性,可为其他研究提供有效的理论参考。

关键词： MHC-Ⅰ类分子结合肽抗原肽抗原序列深度学习卷积神经网络集成学习