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基因芯片在抗肿瘤血管生成中草药相关基因筛选中的研究

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第二军医大学学报 2002年第3期23卷 273-275页

作者：托娅苏秀兰路桂荣辛学东王文礼柯杨包文宇北京大学医学部临床肿瘤学院上海联合基因科技集团有限公司

目的 :利用基因芯片技术 ,从基因水平解释抗肿瘤血管生成中草药的有效组分 T3的分子机制。方法 :( 1)采用两种细胞系 :人胃癌 BGC82 3细胞和血管内皮细胞 ( EC) ,每种细胞分两组 ,一组为对照 ,另一组为 T3药物刺激组 ;( 2 )抽提细胞总R... 详细信息

目的 :利用基因芯片技术 ,从基因水平解释抗肿瘤血管生成中草药的有效组分 T3的分子机制。方法 :( 1)采用两种细胞系 :人胃癌 BGC82 3细胞和血管内皮细胞 ( EC) ,每种细胞分两组 ,一组为对照 ,另一组为 T3药物刺激组 ;( 2 )抽提细胞总RNA ,经反转录制备 c DNA,对照组用 Cy3、药物刺激组用 Cy5荧光标记 ,获得 c DNA探针 ;( 3 ) c DNA探针与 Bio Door基因表达谱芯片杂交 ,结果由扫描仪扫描并用 Im a Gene3 .0软件进行分析统计。结果 :( 1) BGC82 3细胞组有 2 .5 3 %基因表达谱发生明显的变化 ,其中 15 8条基因在经 T3刺激后表达量明显上升 ,4 4条明显下降 ;( 2 ) EC组有 0 .4 6%的基因表达谱发生明显的变化 ,其中 3 0条基因在经 T3刺激后表达量明显上升 ,7条基因表达量明显下降。结论 :利用基因芯片技术可从基因水平解释中药的作用机制。

关键词：微矩阵基因芯片基因表达谱中草药药物筛选抗肿瘤血管生成

基因表达谱芯片在胰腺癌相关基因筛选中的应用研究

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第二军医大学学报 2000年第9期21卷 819-822页

作者：金钢胡先贵应康李瑶唐榕唐岩景在平谢毅毛裕民第二军医大学长海医院普外科上海200433 复旦大学遗传学研究所

目的 :探讨基因表达谱芯片技术在高通量筛查肿瘤相关基因群及研究胰腺癌分子病理学变化中的应用价值。方法 :应用含有 40 96条人类全长基因的 c DNA表达谱芯片 ,对 3例临床切除的胰腺癌及正常胰腺标本的基因表达谱进行分析。结果 :在 ... 详细信息

目的 :探讨基因表达谱芯片技术在高通量筛查肿瘤相关基因群及研究胰腺癌分子病理学变化中的应用价值。方法 :应用含有 40 96条人类全长基因的 c DNA表达谱芯片 ,对 3例临床切除的胰腺癌及正常胰腺标本的基因表达谱进行分析。结果 :在 3例胰腺癌和正常胰腺组织中均有差异表达的基因 398条 ,其中新基因 2 89条 ,老基因 10 9条。从老基因中筛选出有显著表达差异基因 37条 ,其中在胰腺癌组织中上调基因 2 0条 ,下调基因 17条。结论 :运用本基因表达谱芯片对基因表达谱进行分析 ,能够有效筛查出新的胰腺癌相关基因。

关键词：微矩阵基因芯片基因表达谱胰腺肿瘤基因筛选

基因芯片对PMA激活的血管内皮细胞早期反应基因的研究

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第二军医大学学报 2000年第9期21卷 815-818,I002页

作者：吴超群应康戴建凉李瑶陈菊祥和桂芬金刚倪小龙谢毅毛裕民复旦大学遗传学研究所上海200433 第二军医大学长征医院上海200003 联合基因科技(集团)有限公司

目的 :用基因芯片研究 PMA激活的血管内皮细胞的早期反应基因 (imm ediate early response gene,ERG)。方法 :以包含 40 96条人类基因的 DNA芯片检测血管内皮细胞受代谢增强剂 PMA(phorbol myristate acetate)激活后早期的基因表达谱 ,... 详细信息

目的 :用基因芯片研究 PMA激活的血管内皮细胞的早期反应基因 (imm ediate early response gene,ERG)。方法 :以包含 40 96条人类基因的 DNA芯片检测血管内皮细胞受代谢增强剂 PMA(phorbol myristate acetate)激活后早期的基因表达谱 ,并从中筛查出 ERG。结果 :血管内皮细胞受 PMA作用 6 h后 ,17条基因上调 ,11条下调。数据处理聚类分析表明 17条上调基因中多数 (13/ 17)属蛋白质磷酸酶和转录调控因子基因 ,而下调基因中多数 (9/ 11)为细胞分裂相关基因。结论 :证明PMA激活的人血管内皮细胞早期反应基因主要是转录调控因子和蛋白质磷酸酶基因。

关键词：微矩阵基因芯片血管内皮细胞早期反应基因 PMA

ARP-SRP基因表达谱芯片对脑损伤的初步研究

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法医学杂志 2002年第3期18卷 146-149页

作者：周亦武张益鹄邓伟年刘艳胡志红华中科技大学同济医学院法医学系湖北武汉430030 中国科学院武汉病毒研究所湖北武汉430071

目的研究脑挫伤后ARP-SRP基因表达谱差异及其法医学意义。方法从脑组织提取mRNA,应用ARP-SRP-1.0S基因芯片,研究脑挫伤组织与对照脑组织细胞凋亡蛋白和应激反应蛋白相关基因特异性表达差异。结果基因芯片杂交结果中,发现人类溶酶体的胃... 详细信息

目的研究脑挫伤后ARP-SRP基因表达谱差异及其法医学意义。方法从脑组织提取mRNA,应用ARP-SRP-1.0S基因芯片,研究脑挫伤组织与对照脑组织细胞凋亡蛋白和应激反应蛋白相关基因特异性表达差异。结果基因芯片杂交结果中,发现人类溶酶体的胃蛋白酶抑制剂不敏感蛋白酶基因(CLN2)表达水平显著下降。结论CLN2基因与一种婴儿致死性神经变性疾病LINCL有关,但CLN2基因在脑损伤中的作用尚有待进一步研究;基因芯片在研究脑损伤后相关基因的改变具有快速、高通量、高敏度等特点。

关键词：基因芯片微矩阵基因芯片基因表达谱差异表达脑损伤法医鉴定学

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基因芯片在胰腺癌相关基因筛选中的初步研究

肿瘤防治研究 2006年第2期33卷 86-89,136页

作者：张弘周国雄黄介飞徐岷魏群江枫南通大学附属医院消化内科江苏226001

目的探讨基因表达谱芯片技术在筛查胰腺癌相关基因群表达中的作用。方法按微矩阵排列的4096种全长基因PCR产物制成Biostar H-40s型微矩阵表达谱芯片;采用一步法抽提胰腺癌及正常胰腺组织总RNA,用Oligotex mRNA离心柱分离纯化两种组织的m... 详细信息

目的探讨基因表达谱芯片技术在筛查胰腺癌相关基因群表达中的作用。方法按微矩阵排列的4096种全长基因PCR产物制成Biostar H-40s型微矩阵表达谱芯片;采用一步法抽提胰腺癌及正常胰腺组织总RNA,用Oligotex mRNA离心柱分离纯化两种组织的mRNA;经逆转录合成荧光分子(Cy3/Cy5)掺入的cDNA一链制备表达谱探针,芯片杂交和洗片后,用荧光扫描仪扫描芯片荧光信号图像,分析胰腺癌及正常胰腺组织中差异表达的基因。结果在4096种基因中,胰腺癌组织与正常胰腺组织间有949条(23.2%)存在差异表达的基因,其中我们确定了9条上调和8条下调的癌基因和抑癌基因可能与胰腺癌的发病机制存在相关性。结论基因表达谱芯片技术可以筛选出胰腺癌表达异常的相关基因群,对其进一步研究有助于认识胰腺癌的发病机制。

关键词：微矩阵基因芯片胰腺癌癌基因抑癌基因

基因表达谱芯片筛选成釉细胞瘤相关基因的研究

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口腔医学纵横 2002年第2期18卷 86-88,I002-1页

作者：刘进忠汪说之武汉大学口腔医学院湖北武汉430079

目的 :研究成釉细胞瘤和正常口腔粘膜组织中差异表达的基因。方法 :分别从成釉细胞瘤及正常口腔粘膜组织中提取总RNA并纯化为mRNA ,两种不同组织的mRNA分别逆转录合成有荧光分子标记的探针 ,然后与含有 70 0种人类基因的芯片进行杂交 ,... 详细信息

目的 :研究成釉细胞瘤和正常口腔粘膜组织中差异表达的基因。方法 :分别从成釉细胞瘤及正常口腔粘膜组织中提取总RNA并纯化为mRNA ,两种不同组织的mRNA分别逆转录合成有荧光分子标记的探针 ,然后与含有 70 0种人类基因的芯片进行杂交 ,杂交信号用ScanArray30 0 0扫描 ,结果用ImgGene3.0软件分析。结果 :成釉细胞瘤和正常口腔粘膜有差异表达的基因 32个 ,其中表达上调基因 5个、下调 2 7个。结论

关键词：成釉细胞瘤微矩阵基因芯片基因表达肿瘤相关基因口腔粘膜

应用BiostarH-Ⅰ型基因芯片筛选肺鳞癌中细胞信号传导及免疫相关基因

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首都医科大学学报 2005年第6期26卷 729-732页

作者：白澎张沪生王毓洲首都医科大学附属北京同仁医院呼吸内科

目的利用基因芯片技术,寻找人类肺鳞癌组织和正常肺组织中与生物信号传导或免疫反应有关的差异表达基因。方法提取肺鳞癌和正常肺组织总RNA,反转录合成cDNA探针,混合后与BiostarH-Ⅰ型基因芯片杂交,ScanArray 4000扫描仪扫描杂交信号,... 详细信息

目的利用基因芯片技术,寻找人类肺鳞癌组织和正常肺组织中与生物信号传导或免疫反应有关的差异表达基因。方法提取肺鳞癌和正常肺组织总RNA,反转录合成cDNA探针,混合后与BiostarH-Ⅰ型基因芯片杂交,ScanArray 4000扫描仪扫描杂交信号,计算机分析差异表达基因。结果筛选出差异表达的已知基因8条,其中5条表达上调(r>2.0),分别为METAP2、LIV-1、CUL2、CSE1L、RBBP2H1A;3条表达下调(r基因芯片技术实现高通量筛选肺癌发病相关基因,发现8条在肺鳞癌中与细胞信号传导或免疫反应有关的差异表达基因,为今后更深入的研究指明了方向。

关键词：微矩阵基因芯片肺肿瘤免疫生物信号传导

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应用基因芯片分析妇科恶性肿瘤的基因表达

中国优生与遗传杂志 2004年第6期12卷 3-7页

作者：易广才单祥年邵振堂南京市妇幼保健院南京210004 南京师范大学生命科学学院 210097

目的　应用基因微矩阵芯片研究妇科恶性肿瘤相关基因表达。方法　分别提取癌组织和正常对照组织mR NA ,经反转录分别用Cy3-dCTP和Cy5 -dCTP荧光标记cDNA ,获得两组探针 ,混合后与基因芯片H4 0s(基因点数为 4 0 96点 )杂交 ,经严格洗片后... 详细信息

目的　应用基因微矩阵芯片研究妇科恶性肿瘤相关基因表达。方法　分别提取癌组织和正常对照组织mR NA ,经反转录分别用Cy3-dCTP和Cy5 -dCTP荧光标记cDNA ,获得两组探针 ,混合后与基因芯片H4 0s(基因点数为 4 0 96点 )杂交 ,经严格洗片后用GenePix4 0 0 0B扫描仪进行扫描 ,获得荧光信号图像 ,用图像处理软件 :GenePixPro3.0对图像进行处理 ,获得两种组织中差异表达的基因信息。结果　在 4种癌组织中同时出现表达差异的基因有 35条 ,占 0 .85 %。其中 4种癌组织中都下调表达的基因 6条 ,没有均上调表达的基因 ,在前 3种癌组织中都上调表达而在乳腺癌中却下调表达的基因12条 ,在前 3种癌组织中都下调表达而在乳腺癌中却上调表达的基因 12条 ,其它 5条。结论　 1 肿瘤的发生过程比我们已了解的要复杂的多 ,它是多种基因表达失衡的结果。每种肿瘤的每个患病个体其肿瘤的发生和发展都具有自己一系列独特的基因表达谱 ,即使是同一肿瘤的不同个体之间 ,基因表达谱可能差异也很大。 2 子宫颈癌、乳腺癌、卵巢癌和子宫内膜癌这四种癌组织中具有相同表达行为的基因只有 6个 ,它们是 :AB0 2 3136 (编码人类蛋白KIAA0 919)、AF0 80 15 8(丝氨酸、苏氨酸K激酶基因 )、S795 2 2 (蛋白质合成延长因子EF - 1基因 )。

关键词：宫颈鳞癌卵巢恶性透明细胞癌乳腺导管浸润癌子宫颈癌腺癌基因表达谱微矩阵基因芯片

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应用基因芯片研究妇科恶性肿瘤相关基因表达

应用基因芯片研究妇科恶性肿瘤相关基因表达