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尿嘧啶激发态动力学溶剂效应的飞秒瞬态吸收光谱研究

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物理学报 2022年第18期71卷 203-208页

作者：沈环华林强魏政荣华中农业大学理学院武汉430070 中国科学院精密测量科学与技术创新研究院波谱与原子分子物理国家重点实验室武汉430071 湖北大学物理与电子科学学院武汉430062

尿嘧啶是构成RNA链最基本的结构单元之一,其光辐射下的光物理和光化学过程与光致癌变等过程紧密关联,因而受到广泛的关注.本文采用飞秒瞬态吸收光谱技术,研究了在紫外光辐射下,溶剂效应对尿嘧啶激发态超快动力学的影响.实验利用一束264... 详细信息

尿嘧啶是构成RNA链最基本的结构单元之一,其光辐射下的光物理和光化学过程与光致癌变等过程紧密关联,因而受到广泛的关注.本文采用飞秒瞬态吸收光谱技术,研究了在紫外光辐射下,溶剂效应对尿嘧啶激发态超快动力学的影响.实验利用一束264 nm的激发光将尿嘧啶激发到(1)^(π,π^(*))态(即S_(2)态).然后,利用覆盖范围为280—360 nm的紫外超连续谱作为探测光,实现对尿嘧啶激发态和基态动力学的同步探测.测量发现,尿嘧啶在乙腈溶剂中显现了两个动力学衰减过程,即9.8 ps(在300 nm处)和>1000 ps,分别对应于振动冷却过程和三重态的衰减过程.这一观察与水溶液中的结果差异很大,因为在水溶液中基本没有测量到三重态的布居.通过对一系列溶液展开测量,发现尿嘧啶的超快动力学过程依赖于溶剂形成氢健能力的大小.越容易形成氢键的溶剂,尿嘧啶越不容易布居到三重态.

关键词：飞秒瞬态吸收光谱尿嘧啶激发态动力学溶剂效应

尿嘧啶对植物乳植杆菌LIP-1冻干存活率的影响及其作用机制

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农业工程学报 2022年第7期38卷 308-316页

作者：马蓉泽王俊国鄂晶晶陈子超张敬雅内蒙古农业大学食品科学与工程学院乳品生物技术与工程教育部重点试验室农业农村部奶制品加工重点试验室呼和浩特010018

为了研究在培养基中添加微量生长因子对菌株冷冻干燥存活率的影响,该研究以植物乳植杆菌LIP-1(Lactiplantibacillus plantarum LIP-1)为研究对象,探究培养基中添加尿嘧啶对菌株冷冻干燥存活率的影响及其作用机制。结果表明与未添加尿嘧... 详细信息

为了研究在培养基中添加微量生长因子对菌株冷冻干燥存活率的影响,该研究以植物乳植杆菌LIP-1(Lactiplantibacillus plantarum LIP-1)为研究对象,探究培养基中添加尿嘧啶对菌株冷冻干燥存活率的影响及其作用机制。结果表明与未添加尿嘧啶的空白对照组相比,在培养基中添加0.05 g/L尿嘧啶能够显著提高植物乳植杆菌LIP-1的活菌数与冻干存活率(P尿嘧啶的加入能够促使菌株合成更多的尿苷二磷酸(P尿嘧啶的加入抑制了乳清酸向尿苷二磷酸的转化,使胞内的乳清酸含量显著升高(P尿嘧啶减轻了细胞壁与细胞膜受到的冻干损伤,提高了菌株的冻干存活率。研究结果为提高菌株冷冻干燥存活率提供了新的方法和思路。

关键词：菌冷冻干燥植物乳植杆菌LIP-1 尿嘧啶细胞壁细胞膜

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含酰胺和尿嘧啶的氢键复合物的三体效应

高等学校化学学报 2014年第11期35卷 2403-2409页

作者：李书实姜笑楠王长生辽宁师范大学化学化工学院大连116029

采用包含BSSE校正的MP2／aug—cc—pVTZ方法对酰胺、二肽、尿嘧啶和水分子形成的氢键复合物的三体效应进行了研究，分析了三体作用能对体系总作用能的贡献．结果表明，在这些氢键复合物中，三体作用能占体系总作用能的10％～20％，三体... 详细信息

采用包含BSSE校正的MP2／aug—cc—pVTZ方法对酰胺、二肽、尿嘧啶和水分子形成的氢键复合物的三体效应进行了研究，分析了三体作用能对体系总作用能的贡献．结果表明，在这些氢键复合物中，三体作用能占体系总作用能的10％～20％，三体作用属于近程作用，因此在分子模拟中至少应考虑近处的三体效应．

关键词：三体效应氢键复合物作用能酰胺尿嘧啶团簇体系凝聚相体系

尿嘧啶和5-氯尿嘧啶^1S0→^1S2跃迁动态结构的共振拉曼光谱

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物理化学学报 2009年第9期25卷 1799-1805页

作者：翁克凤王惠钢祝新明郑旭明浙江理工大学化学系先进纺织材料与加工技术教育部重点实验室杭州310018

采用含时量子波包理论的简单模型对5-氯尿嘧啶和尿嘧啶的共振拉曼光谱开展了强度分析拟合,获得了1(π,π*)激发态的几何结构变化动态特征.结果表明,尿嘧啶1S0→1S2跃迁的动态结构特征因5-位氯原子取代而改变.5-氯尿嘧啶的动态结构特征... 详细信息

采用含时量子波包理论的简单模型对5-氯尿嘧啶和尿嘧啶的共振拉曼光谱开展了强度分析拟合,获得了1(π,π*)激发态的几何结构变化动态特征.结果表明,尿嘧啶1S0→1S2跃迁的动态结构特征因5-位氯原子取代而改变.5-氯尿嘧啶的动态结构特征主要沿C5襒C6伸缩振动+C6H12弯曲振动和N3H9/N1H7弯曲振动+N1C6伸缩振动反应坐标展开,而尿嘧啶的动态结构特征主要沿嘧啶环的伸缩振动+C5H11/C6H12/N1H7弯曲振动和C4襒O10伸缩振动反应坐标展开.π和π*轨道中氯原子的pz电子参与嘧啶环的p-π共轭作用导致了在1(π,π*)激发态上5-氯尿嘧啶的振动重组能更多地配分给嘧啶环的弯曲振动模式和C5襒C6伸缩振动模式.尿嘧啶在甲醇中的激发态动态结构特征与在水中的基本一致,但波包沿C5H11/C6H12/N1H7弯曲振动+N1C6伸缩振动(ν12)和环呼吸振动(ν17)反应坐标的运动明显增强.

关键词：共振拉曼光谱尿嘧啶动态结构 5-氯尿嘧啶

含尿嘧啶结构单元二肽衍生物的设计、合成及生物活性研究

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有机化学 2019年第5期39卷 1460-1468页

作者：唐雪梅范莉张泽朝杨大成西南大学化学化工学院重庆400715 西南大学生命科学学院重庆400715

为探索新型抗糖尿病分子,设计了含有尿嘧啶结构单元的二肽衍生物.以尿嘧啶、多聚甲醛和半胱氨酸为原料,经过两步反应获得关键中间体S-胸腺嘧啶-L-半胱氨酸(IM-2),再经氨基保护、羧基酯化和氨基酸偶联,顺利合成了16个二肽衍生物.所得目... 详细信息

为探索新型抗糖尿病分子,设计了含有尿嘧啶结构单元的二肽衍生物.以尿嘧啶、多聚甲醛和半胱氨酸为原料,经过两步反应获得关键中间体S-胸腺嘧啶-L-半胱氨酸(IM-2),再经氨基保护、羧基酯化和氨基酸偶联,顺利合成了16个二肽衍生物.所得目标化合物均经1H NMR、13C NMR和HRMS进行结构确认,并开展了过氧化物酶体增殖物受体反应元件(PPRE)激动活性、α-葡萄糖苷酶-rat抑制活性、二肽基肽酶-4(DPP-4)抑制活性筛选.生物活性结果显示,这些二肽衍生物的PPRE相对激动活性、α-葡萄糖苷酶和DPP-4抑制活性都很弱;同时发现,该类分子的α-葡萄糖苷酶抑制活性变化趋势与PPRE激动活性、DPP-4抑制活性变化趋势相反,这为新型多肽多靶点药物的设计提供了新思路.

关键词：糖尿病尿嘧啶二肽衍生物过氧化物酶体增殖物激活受体反应元件(PPRE) α-葡萄糖苷酶抑制活性二肽基肽酶-4抑制活性

氧气作为唯一氧化剂的钯催化咖啡因或尿嘧啶C—H键直接芳基化反应

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有机化学 2018年第8期38卷 2076-2084页

作者：潘帼帅吴孔川邓泽颖张馨予张晓凤林深黄秋锋福建师范大学化学与材料学院福州350007 福建省高分子材料重点实验室福州350007

报道了钯催化咖啡因或尿嘧啶C—H与芳烃C—H的脱氢偶联反应.反应最大特点是采用常压氧气作为唯一氧化剂.反应对很多官能团,比如卤素、酯基、硝基、腈基、醚等,都有很好的容忍度.本方法为制备C6-芳基尿嘧啶或C8-芳基咖啡因衍生物提供了... 详细信息

报道了钯催化咖啡因或尿嘧啶C—H与芳烃C—H的脱氢偶联反应.反应最大特点是采用常压氧气作为唯一氧化剂.反应对很多官能团,比如卤素、酯基、硝基、腈基、醚等,都有很好的容忍度.本方法为制备C6-芳基尿嘧啶或C8-芳基咖啡因衍生物提供了简便、直接和绿色经济路线.

关键词：钯咖啡因尿嘧啶 C—H键芳基化氧气

槲皮素与尿嘧啶和胸腺嘧啶氢键的结合位点(英文)

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物理化学学报 2013年第6期29卷 1173-1182页

作者：王长生刘朋于楠辽宁师范大学化学化工学院辽宁大连116029

深入理解药物分子和核酸碱基间的相互作用机制对合理设计研发新型高效药物有重要意义.本文运用密度泛函理论B3LYP方法对核酸碱基尿嘧啶和胸腺嘧啶与药物分子槲皮素间的氢键相互作用位点进行了研究.使用B3LYP/6-31G(d)方法优化得到了30... 详细信息

深入理解药物分子和核酸碱基间的相互作用机制对合理设计研发新型高效药物有重要意义.本文运用密度泛函理论B3LYP方法对核酸碱基尿嘧啶和胸腺嘧啶与药物分子槲皮素间的氢键相互作用位点进行了研究.使用B3LYP/6-31G(d)方法优化得到了30个稳定的氢键复合物结构,使用B3LYP/6-311++G(3df,2p)方法计算了这些复合物的结合能.研究结果表明,槲皮素可以使用5个不同的结合位点与尿嘧啶或胸腺嘧啶形成氢键复合物,尿嘧啶或胸腺嘧啶可以使用3个不同的结合位点与槲皮素形成氢键复合物.当槲皮素的结合位点固定时,槲皮素与尿嘧啶的位点u1或胸腺嘧啶的位点t1形成的氢键作用最强,与位点u2或位点t2形成的氢键强度最弱;当尿嘧啶或胸腺嘧啶的作用位点固定时,二者与槲皮素的位点qu1形成的氢键作用最强,与位点qu5作用强度次之,与位点qu3的作用强度最弱.分子中原子(AIM)和自然键轨道(NBO)分析计算结果表明,轨道作用在氢键中起重要作用.

关键词：槲皮素尿嘧啶胸腺嘧啶氢键结合能自然键轨道分析分子中原子分析

1,3-二(乙氧基甲基)-5-N,N-二甲氨基-6-甲基尿嘧啶的合成

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有机化学 2008年第2期28卷 301-303页

作者：马小艳王瑞平李阿敏陈艳丽王孝伟张志丽刘俊义北京大学药学院化学生物学系北京100083 首都医科大学化学生物学与药学学院北京100069

报道了1,3-二(乙氧基甲基)-5-N,N-二甲氨基-6-甲基尿嘧啶方便、高产率的合成方法.以6-甲基尿嘧啶(1)为起始物,经硝化、嘧啶N1,N3-烷基化、还原及氨基甲基化,首次高产率合成了1,3-二(乙氧基甲基)-5-N,N-二甲氨基-6-甲基尿嘧啶(5),并对其... 详细信息

报道了1,3-二(乙氧基甲基)-5-N,N-二甲氨基-6-甲基尿嘧啶方便、高产率的合成方法.以6-甲基尿嘧啶(1)为起始物,经硝化、嘧啶N1,N3-烷基化、还原及氨基甲基化,首次高产率合成了1,3-二(乙氧基甲基)-5-N,N-二甲氨基-6-甲基尿嘧啶(5),并对其化学结构进行了表征.

关键词： 1,3-二(乙氧基甲基)-5-N,N-二甲氨基-6-甲基尿嘧啶 1,3-二(乙氧基甲基)-5-氨基-6-甲基尿嘧啶 5-硝基-6-甲基尿嘧啶

毛细管区带电泳法测定冬虫夏草中的腺苷、腺嘌呤和尿嘧啶

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分析化学 2002年第9期30卷 1081-1084页

作者：杨更亮李海鹰刘海燕王德先李保会陈义中国科学院化学研究所分子科学中心保定071002 保定071002 北京100080 河北大学化学与环境科学学院

建立了毛细管区带电泳法测定天然和人工冬虫夏草中腺苷、腺嘌呤和尿嘧啶含量的分析方法。采用15mmol L硼砂 +14mmol L磷酸二氢钠 +5 %(V V)甲醇 (pH =9.5 )作为缓冲体系 ,在电压为 18kV和检测波长为 2 5 4nm的条件下 ,冬虫夏草提取液中... 详细信息

建立了毛细管区带电泳法测定天然和人工冬虫夏草中腺苷、腺嘌呤和尿嘧啶含量的分析方法。采用15mmol L硼砂 +14mmol L磷酸二氢钠 +5 %(V V)甲醇 (pH =9.5 )作为缓冲体系 ,在电压为 18kV和检测波长为 2 5 4nm的条件下 ,冬虫夏草提取液中的腺苷、腺嘌呤和尿嘧啶实现了基线分离。定量分析表明 ,3种成分的校正峰面积与质量浓度呈较好的线性关系 (r≥ 0 .9991)。考察了缓冲溶液的pH值、浓度及有机改性剂对腺苷、腺嘌呤和尿嘧啶迁移行为的影响。

关键词：毛细管区带电泳冬虫夏草腺苷腺嘌呤尿嘧啶