检索结果-南通市图书馆

参与氮素调控的小rna sNRT2.3-1、sNRT2.3-2及chr4-27017的功能初探

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

参与氮素调控的小RNA sNRT2.3-1、sNRT2.3-2及chr4-27017的功能初...

作者：徐曼南京农业大学

学位级别：硕士

水稻是重要的粮食作物,同时也是研究单子叶作物生长发育重要的模式植物。氮素是植物生长所必须的,提高作物的氮素利用效率对于改良品种、提高产量、减轻环境污染等都具有重要的理论及生产意义。在过去的几十年里,越来越多的基因被发现... 详细信息

水稻是重要的粮食作物,同时也是研究单子叶作物生长发育重要的模式植物。氮素是植物生长所必须的,提高作物的氮素利用效率对于改良品种、提高产量、减轻环境污染等都具有重要的理论及生产意义。在过去的几十年里,越来越多的基因被发现参与提高植物的氮素利用效率,其中小rna(small rna)家族成员也发挥着重要作用。小rna是一类长度大约在20～24bp的内源非编码rna,能够调控动植物生长发育的全过程,其大致可以分为三类:micro rna(mi rna)、small interfering rna(si rna)及其他小rna。本研究主要是对实验室前期将日本晴野生型(WT)、Os NAR2.1沉默材料(Os NAR2.1-rnai)和Os NAR2.1超表达材料(OE-Os NAR2.1)小rna测序的结果进行进一步深入分析,以期找到与氮素调控相关的小rna,并对其可能的靶基因进行预测分析,同时围绕其表达模式和提高氮素利用方面的生理功能展开研究,所获得的主要结果如下:1.通过对小rna测序结果的分析和验证找到了一个可能响应氮素营养新的小rna chr4-27017,并通过stem-loop(茎环)法及Dicer～like1(DCL1,是mi rna生物合成过程中的核心成分,其缺失能影响小rna的形成)突变体验证证明了小rna chr4-27017是mi rna。通过“Target mimicry”方法创制了mi rna chr4-27017的突变体材料,田间表型显示,其抽穗期相较于野生型晚了近一周的时间,单株产量有增加的趋势。通过靶基因预测网站的预测和mi rna chr4-20107突变体的rna-seq分析找到了该小rna下游5个可能的靶基因:LOC＿Os08g09080、LOC＿Os05g14220、LO C＿Os02g41954、LOC＿Os01g34920和LOC＿Os09g39430,并做了表达模式分析,发现在mi rna chr4-20107突变体的仅LOC＿Os08g09080、LOC＿Os01g34920和LOC＿Os05g14220基因的表达量,与野生型相比显著增加,推测它们是mi rna chr4-27017的候选靶基因。这都将会在一定程度上阐释mi rna chr4-20107在水稻生长发育及氮素吸收利用过程中的功能。2.通过Dicer～like3(DCL3,是si rna生物合成过程中的核心成分,其缺失能影响小rna的形成)突变体验证证明了测序结果中发现的位于基因Os NRT2.3附近的两个小rna s NRT2.3-1和s NRT2.3-2是si rna。同样也通过“Target mimicry”方法构建了小rna s NRT2.3-1和s NRT2.3-2的mimic突变体材料,不同氮处理田间表型表明小rna s NRT2.3-1的突变株系sm NRT2.3-1-m ATG抽穗期的抽穗时间要比野生型晚两周左右的时间,成熟期高氮地株高要比野生型高约6 cm,产量约增加35%,这与过表达基因Os NRT2.3b的表型一致(抽穗延迟,产量增加)。通过RT-PCR反应检测了基因Os NRT2.3b的表达情况,发现仅在s NRT2.3-1突变株系sm NRT2.3-1-m ATG中基因Os NRT2.3b的表达量与野生型相比,要显著增高,说明si rna s NRT2.3-1可能通过影响基因Os NRT2.3b的表达从而影响植株表型和功能发挥。

关键词：水稻氮素利用效率小rna 小rna mimic突变体

番茄正反交性状差异及小rna对其调控机制的初步研究

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

番茄正反交性状差异及小RNA对其调控机制的初步研究

作者：孙倩浙江大学

学位级别：硕士

本实验进行了普通栽培番茄(Solanum lycopersicum cv. Micro-Tom)和醋栗番茄(S. pimpinellifolium line WVa700)的种间远缘正反交,观察了正反交杂种的植物学差异性状,运用了AFLP (Amplified fragment length polymorphism)和MSAP (Methylation-sensitive amplification polymorphism)分子标记手段,探究了正反交杂种在基因上和DNA甲基化模式和水平上的差异;通过小rna测序,系统地分析了正反交杂种间的小rna差异,探索异源细胞质中小rna对正反交杂种差异性状的影响。本研究揭示了异源细胞质中小rna对远缘正反交杂种差异性状的调控作用,为阐明远缘正反交杂种性状差异的分子机制提供一种思路。主要结果如下：1.在普通栽培番茄和醋栗番茄的正反交杂种Micro-Tom×WVa700和WVa700xMicro-Tom之间,果形指数、单果重和株高3个植物学性状存在显著性差异。与两亲本相比,Micro-Tom×WVa700具有较大的叶面积、较大的冠幅和较小的果形指数,WVa700xMicro-Tom具有较大的叶长和较小的果形指数。2.采用AFLP分子标记技术分析正反交杂种在遗传上差异,结果显示,68个条带(4.3%)仅在Micro-Tom×WVa700显示变异,16个(1.01%)条带仅在WVa700xMicro-Tom中显示变异,两者存在显著性差异(P小rna的高通量测序技术分析正反交杂种间小rna的表达差异以及其靶基因的表达差异, 结果显示, 在Micro-Tom×WVa700和WVa700×Micro-Tom中,已知的76个mirnas的表达水平呈现很大的不同,3个mirna (miR172e-3p、miR482a、miR5081)在Fl杂种和亲本间有显著的差异表达。对这76个差异表达的mirnas进行靶基因预测,有410个靶基因出现。对靶基因的基因功能进行分析,结果显示这些靶基因参与了许多代谢过程,并且和蛋白相关。在远缘杂交过程中,不同表达的mirnas通过负调控其靶基因对正反交杂种差异表型和超亲表型起重要作用。此外,比较了远缘杂交过程中小rna的种类变化,结果显示在正反交后代中,小rna的种类减少了,甚至部分消失了。与WVa700相比,Micro-Tom的细胞质中小rna具有更强的缓冲能力。

关键词：番茄正反交表型差异 DNA甲基化细胞质效应小rna 缓冲能力

鼠伤寒沙门菌小rna GcvB靶基因筛选和验证分析

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

中国预防兽医学报 2020年第8期42卷 753-759页

作者：潘永段世宇杨阳杨琦贵州大学动物科学学院贵州贵阳550025 贵州大学动物疫病研究所贵州贵阳550025 贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室贵州贵阳550025

为筛选鼠伤寒沙门菌小rna GcvB的靶基因,本研究利用Targetrna2程序分别预测鼠伤寒沙门菌中能与GcvB R1、R2和R3功能基序完全或部分碱基互补的靶基因,结果显示,分别预测到与GcvB R1、R2和R3功能基序具有强相互作用的靶基因共16个,所有基... 详细信息

为筛选鼠伤寒沙门菌小rna GcvB的靶基因,本研究利用Targetrna2程序分别预测鼠伤寒沙门菌中能与GcvB R1、R2和R3功能基序完全或部分碱基互补的靶基因,结果显示,分别预测到与GcvB R1、R2和R3功能基序具有强相互作用的靶基因共16个,所有基因均能产生与匹配功能基序至少7个连续碱基互补配对(p小rna GcvB的正调控,其对STM1856、metF、mltC和sbp基因的调控与GcvB R1功能基序存在显著关联(p小rna GcvB在鼠伤寒沙门菌中的调控机制提供了参考依据。

关键词：鼠伤寒沙门菌小rna 同源重组荧光定量PCR

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

志贺菌调控小rna研究进展

动物医学进展 2014年第7期35卷 86-89页

作者：刘翠翠魏小娟张继瑜王婧周绪正李冰李金善牛建荣中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所兽药重点开放实验室甘肃兰州730050

志贺菌(Shigella)是一类具有严重危害性和高度传染性的革兰阴性肠道杆菌,能够通过侵袭肠上皮细胞引起人和其他哺乳类动物发热、腹痛、腹泻等菌痢症状,也称作痢疾杆菌。我国每年约有2 000万人次感染志贺菌,且近年来有愈演愈烈的趋势,对... 详细信息

志贺菌(Shigella)是一类具有严重危害性和高度传染性的革兰阴性肠道杆菌,能够通过侵袭肠上皮细胞引起人和其他哺乳类动物发热、腹痛、腹泻等菌痢症状,也称作痢疾杆菌。我国每年约有2 000万人次感染志贺菌,且近年来有愈演愈烈的趋势,对公共卫生和人类健康造成了巨大威胁。随着抗生素的广泛使用甚至滥用,使菌株产生了不同程度的耐药性,导致治疗难度增大、治疗不彻底而转为慢性菌痢。细菌小rna作为一类新发现的基因表达调控子通过与靶mrna配对,导致mrna翻译和稳定性的变化,从而影响细胞的各种生理功能,如个体发育、翻译激活与抑制、细菌毒性、耐药性等。论文将对志贺菌的调控小rna进行综述,为临床治疗志贺菌病及新药研发提供新的思路和方向。

关键词：志贺菌痢疾耐药性小rna

中科院上海分院科学家发现一种非编码小rna具有调控多发性硬化症的作用

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

生物学教学 2010年第4期35卷 74-75页

据2009年10月21日《新民晚报》消息，国际著名学术期刊《自然·免疫》（Nature Immunology）昨天在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学和细胞生物学研究所裴钢院士研究组的这一最新研究成果。

关键词：多发性硬化小rna 上海非编码科学家中科院调控细胞生物学

维普期刊数据库评论

在线全文

维普期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

细菌小rna的研究

生命的化学 2010年第6期30卷 815-820页

作者：生秀梅徐顺高张海方黄新祥许化溪江苏大学基础医学与医学技术学院镇江212013

小rna(smallrna,srna)在基因表达调控和生长发育等方面发挥着重要作用。细菌srna多通过与靶mrna配对,转录后水平影响目的mrna翻译或(和)稳定性,对基因的表达进行调节,以影响细胞的多种生理功能。本文从细菌srna与真核生物微rna(microrna... 详细信息

小rna(smallrna,srna)在基因表达调控和生长发育等方面发挥着重要作用。细菌srna多通过与靶mrna配对,转录后水平影响目的mrna翻译或(和)稳定性,对基因的表达进行调节,以影响细胞的多种生理功能。本文从细菌srna与真核生物微rna(microrna,mirna)的比较,srna的分类,srna分子伴侣Hfq及srna鉴别方法等方面综述了srna的研究进展,指出目前srna研究仍然存在的问题。原核生物中srna的大量发现和深入研究,有可能使人们对生物进化和生命的发展过程有更为深入的认识与了解。

关键词：细菌小rna 基因表达调控

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

植物非细胞自主性小rna分子研究进展

生物技术通报 2015年第10期31卷 16-23页

作者：邓帅张婷婷王茹茹刘宇张元湖山东农业大学生命科学学院作物生物学国家重点实验室泰安271018

非细胞自主性是rna干扰的主要特点之一,表现为沉默效应可以在细胞、组织和生物个体间传递和扩散,可移动的小rna分子在这种非细胞自主性的沉默扩散中发挥了核心作用。近年来的研究表明小rna分子可以与转录因子、多肽和植物激素一样传递... 详细信息

非细胞自主性是rna干扰的主要特点之一,表现为沉默效应可以在细胞、组织和生物个体间传递和扩散,可移动的小rna分子在这种非细胞自主性的沉默扩散中发挥了核心作用。近年来的研究表明小rna分子可以与转录因子、多肽和植物激素一样传递胞间信息,并以其特有的方式调控发育模式、响应环境胁迫、增强病毒抗性和维持转座子的沉默。综述了近年来在植物非细胞自主性rnai研究中取得的主要进展,主要介绍了通过韧皮部和胞间连丝途径传递沉默信号的各种小rna分子及其生物学作用、非细胞自主性小rna的分子特征和运输效率的调控,并对存在的问题及其研究前景进行了展望。

关键词： rna干扰沉默效应非细胞自主性小rna 分子特征运输调控

鼠疫耶尔森菌中长度在100 nt以内的小rna缺失株及过表达菌株的构建

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

军事医学 2017年第10期41卷 800-804页

作者：高肖芳刘子中李文亮王红朵杨瑞馥韩延平安徽医科大学合肥230032 军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的构建鼠疫耶尔森菌中长度在100 nt以内的小rna缺失株及过表达菌株的方法。方法在高拷贝质粒pBAD/HisA的基础上利用定点突变试剂盒制备一个可诱导的转录融合载体作为小rna的过表达质粒。通过转录组测序、引物延伸并参考已有文献,预测... 详细信息

目的构建鼠疫耶尔森菌中长度在100 nt以内的小rna缺失株及过表达菌株的方法。方法在高拷贝质粒pBAD/HisA的基础上利用定点突变试剂盒制备一个可诱导的转录融合载体作为小rna的过表达质粒。通过转录组测序、引物延伸并参考已有文献,预测了目的小rna的存在、大小以及转录起始位点等,将目的小rna的全长导入到改造后的质粒中并构建小rna的过表达菌株。结果与结论成功构建了小rna sR01、sR02、sR03、HmsA 4株缺失株以及小rna MicF、HmsA、CpxQ 3株过表达菌株。建立了基于λ-Red同源重组、100 nt以内短片段小rna敲除方法和基于定点突变试剂盒改造质粒的小rna过表达菌株构建方法。

关键词：鼠疫菌小rna λ-Red同源重组过表达

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

基于集成学习的神经网络对小rna的预测

济南大学学报（自然科学版） 2013年第1期27卷 6-10页

作者：林云光陈月辉济南大学信息科学与工程学院山东济南250022

通过计算智能的方法,即粒子群算法优化的前向人工神经网络和集成神经网络来预测小rna。从小rna前体序列中提取36维特征用于训练神经网络模型,利用训练好的模型分别对阳性和阴性小rna数据集进行测试,预测平均精度达到90%以上,并且通过集... 详细信息

通过计算智能的方法,即粒子群算法优化的前向人工神经网络和集成神经网络来预测小rna。从小rna前体序列中提取36维特征用于训练神经网络模型,利用训练好的模型分别对阳性和阴性小rna数据集进行测试,预测平均精度达到90%以上,并且通过集成神经网络的方法取得了更高的精度。实验结果表明,利用集成神经网络建模进行小rna的预测是一条行之有效的途径。

关键词：小rna 人工神经网络集成学习粒子群优化算法