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pirna:一类新的非编码小rna

中国生物工程杂志 2008年第8期28卷 130-135页

作者：黄雪梅张守涛王芳刘伟张一折郑州大学生物工程系郑州450001

pirna(Piwi-interacting rna)是从哺乳动物生殖细胞中分离得到的一类长度约为30nt的小rna,并且这种小rna与PIWI蛋白家族成员相结合才能发挥它的调控作用。目前,越来越多的文献表明pirna在生殖细胞的生长发育中的调控是由于Piwi-pirna复... 详细信息

pirna(Piwi-interacting rna)是从哺乳动物生殖细胞中分离得到的一类长度约为30nt的小rna,并且这种小rna与PIWI蛋白家族成员相结合才能发挥它的调控作用。目前,越来越多的文献表明pirna在生殖细胞的生长发育中的调控是由于Piwi-pirna复合物引起的基因沉默导致的,但由于对pirna的研究尚处于初级阶段,它的一些具体的功能和生源论尚在研究当中。综述了pirna的最新研究进展。

关键词： pirna 非编码小rna 生殖细胞发育

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铜绿假单胞菌毒力相关小rna的筛选与鉴定

南开大学学报（自然科学版） 2016年第2期49卷 52-59页

作者：陈谷奎陈荣伟程志晖金守光吴卫辉靳永新南开大学生命科学学院天津300071

小rna在细菌的基因调控过程中具有重要的作用,然而目前在铜绿假单胞菌中仅发现了几种有功能的小rna.铜绿假单胞菌中存在着许多短片段rna(100-250 bp),然而这些短片段rna的功能尚不清楚.为了筛选与铜绿假单胞菌毒力相关的小rna,结合生物... 详细信息

小rna在细菌的基因调控过程中具有重要的作用,然而目前在铜绿假单胞菌中仅发现了几种有功能的小rna.铜绿假单胞菌中存在着许多短片段rna(100-250 bp),然而这些短片段rna的功能尚不清楚.为了筛选与铜绿假单胞菌毒力相关的小rna,结合生物信息学手段和实验检测技术对这些短片段rna进行了靶点基因预测及相关表型研究.结果显示:利用小rna靶点预测软件,筛选到23个毒力相关小rna;通过构建小rna过表达质粒,对这些小rna进行了高表达及相关的表型检测,发现Pant116对铜绿假单胞菌的3型分泌系统具有负调控作用.

关键词：铜绿假单胞菌小rna 靶点预测软件 3型分泌系统

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真菌小rna的发生及其作用机制

微生物学通报 2018年第7期45卷 1563-1573页

作者：梁丽琴杜海燕段江燕谢丙炎山西师范大学生命科学学院山西临汾041004 中国农业科学院蔬菜花卉研究所农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室北京100081

小rna是真核生物体内一种含量丰富的内源性非编码rna,通过与其靶m rna完全或非完全互补结合调控真核生物的基因表达。本文全面综述了真菌中已发现的小rna种类、小rna发生相关蛋白因子以及小rna的具体作用机制,为进一步研究小rna对真菌... 详细信息

小rna是真核生物体内一种含量丰富的内源性非编码rna,通过与其靶m rna完全或非完全互补结合调控真核生物的基因表达。本文全面综述了真菌中已发现的小rna种类、小rna发生相关蛋白因子以及小rna的具体作用机制,为进一步研究小rna对真菌生长发育的调控机制提供重要参考。

关键词：真菌小rna 发生蛋白作用机制

溶藻弧菌ZJ-T小rna srvg23535基因突变株的构建及其功能初探

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微生物学通报 2019年第4期46卷 829-841页

作者：邓益琴陈偿苏友禄程长洪马红玲刘松林冯娟中国水产科学研究院南海水产研究所农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室广东广州510300 中国科学院南海海洋研究所西沙南沙深海海洋环境观测研究站广东广州510301 中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室广东广州510301

【背景】小rna被证实对细菌遗传变异、生长繁殖、致病性等具有重要的调控作用,但是在机会致病菌——溶藻弧菌(Vibrioalginolyticus)中研究较少。本实验室前期通过转录组测序和Northern Blot鉴定得到溶藻弧菌ZJ-T中小rna srvg23535。【... 详细信息

【背景】小rna被证实对细菌遗传变异、生长繁殖、致病性等具有重要的调控作用,但是在机会致病菌——溶藻弧菌(Vibrioalginolyticus)中研究较少。本实验室前期通过转录组测序和Northern Blot鉴定得到溶藻弧菌ZJ-T中小rna srvg23535。【目的】初探小rna srvg23535对溶藻弧菌生物学特性的影响。【方法】利用同源重组技术构建小rna srvg23535的缺失突变株,并对野生株和srvg23535突变株的菌落形态、运动性、胞外蛋白酶分泌、H_2O_2和Cu^(2+)的压力感应、铁吸收利用、抗生素抗性以及生长代谢等生物学特性进行比较研究。【结果】通过对溶藻弧菌小rna srvg23535基因缺失突变株的生物学特性分析表明,小rna srvg23535缺失后,对溶藻弧菌菌落形态、运动性、胞外蛋白酶分泌、H_2O_2和Cu^(2+)的压力感应、铁吸收利用、抗生素抗性以及多数测定的碳源、氮源代谢的影响不显著;但突变株对D-海藻糖(D-trehalose)的代谢减弱,对果胶(Pectin)、丙氨酸-谷氨酰胺(Ala-Gln)的代谢增强,并可利用丙氨酸-天冬氨酸(Ala-Asp)为氮源。【结论】小rna srvg23535参与调控溶藻弧菌对D-海藻糖(D-trehalose)、果胶(Pectin)、丙氨酸-谷氨酰胺(Ala-Gln)和丙氨酸-天冬氨酸(Ala-Asp)的代谢,这将为获取srvg23535调控靶标基因,进而阐明其与靶标基因的相互作用机制奠定基础。

关键词：溶藻弧菌小rna srvg23535 缺失突变株生物学特性

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病原菌非编码小rna的致病调控功能研究

中国预防兽医学报 2011年第9期33卷 749-752页

作者：孟霞王亨朱国强扬州大学兽医学院江苏扬州225009

细菌非编码小rna（Small non-coding rna）是一类长度为40个～500个核苷酸,在基因组中被转录但是不编码蛋白质的一类rna分子,简称srna。最新研究表明,srna作为新发现的基因调节子,可促进病原菌快速调整自身的基因表达和生理特征,

关键词：小rna 非编码病原菌调控功能致病编码蛋白质生理特征基因表达

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表观代际遗传与精子中非编码小rna

中国科学：生命科学 2022年第3期52卷 312-321页

作者：殷鑫王延博艾仔海尔•艾尼瓦尔陈熹南京大学生命科学高等研究院南京大学生命科学学院南京210023

近年研究表明,父亲肥胖、糖尿病和精神压力等后天环境暴露,不仅损害自身健康,也可能对其子代健康产生影响,此类特殊的遗传现象并不涉及DNA序列的改变,因此科学家使用表观代际遗传现象来解释这种非经典遗传学现象.已发现的代际遗传机制包... 详细信息

近年研究表明,父亲肥胖、糖尿病和精神压力等后天环境暴露,不仅损害自身健康,也可能对其子代健康产生影响,此类特殊的遗传现象并不涉及DNA序列的改变,因此科学家使用表观代际遗传现象来解释这种非经典遗传学现象.已发现的代际遗传机制包括DNA甲基化、组蛋白修饰和精子小rna调控等,其中父亲后天环境暴露导致精子小rna表达谱改变,潜在调控早期胚胎发育,从而介导异常表型代际遗传的过程是目前研究的重点方向.但仍然存在诸多科学问题亟待解决,包括环境暴露如何影响精子小rna表达谱,即小rna的来源;精子小rna传递到卵母细胞通过何种机制影响胚胎早期发育,从而传递父本环境暴露的信息给子代;受精卵中只携带了一个精子的小rna信息,如此低量的小rna是如何发挥足以决定子代某方面表型的强大生物学功能的.本综述将系统阐述父亲精子小rna在代际遗传方向的既有发现及其作为代际遗传现象的分子信息载体的研究价值,为代谢类疾病和精神类疾病的代际遗传现象未来的发展方向提供参考.

关键词：代际遗传精子小rna 细胞外囊泡

牦牛卵巢小rna高通量测序及生物信息学分析

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畜牧兽医学报 2016年第1期47卷 55-63页

作者：熊显荣兰道亮李键字向东林亚秋马力西南民族大学生命科学与技术学院成都610041 西南民族大学青藏高原研究院成都610041

本研究旨在利用高通量测序技术描绘牦牛卵巢srna图谱,为探析牦牛繁殖性能提供基础。以牦牛卵巢组织作为研究对象,构建牦牛srna文库,进行高通量测序和生物信息学分析,最后利用RT-qPCR技术验证mirna在牦牛卵巢组织中的表达。经测序后得到... 详细信息

本研究旨在利用高通量测序技术描绘牦牛卵巢srna图谱,为探析牦牛繁殖性能提供基础。以牦牛卵巢组织作为研究对象,构建牦牛srna文库,进行高通量测序和生物信息学分析,最后利用RT-qPCR技术验证mirna在牦牛卵巢组织中的表达。经测序后得到包含12 126 208条clean reads,其中特异序列为212 757条;比对分析显示,只有7 383 536(60.89%)条总序列及80 981(38.06%)条特异序列能与牦牛基因组匹配。与黄牛相比,牦牛srna中有56个表达量上调,其中miR-135a表达上调最显著;有33个表达下调,其中miR-2316表达下调最显著。RT-qPCR验证6个mirna在牦牛卵巢组织中的表达情况,定量结果和测序结果基本一致。与牦牛EST序列信息比对后共预测出5个新mirna。本研究成功绘制牦牛卵巢srna图谱,同时证实rna-Seq高通量测序技术在完善srna信息及挖掘新mirna方面的优势,对研究srna在牦牛遗传育种以及以牦牛为重要高原动物模型来进行高原适应性和抗逆性等相关领域的研究具有重要意义。

关键词：牦牛卵巢高通量测序小rna 生物信息学

利用小rna深度测序和组装技术鉴定紫藤花叶病病原

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植物病理学报 2015年第1期45卷 88-92页

作者：苏秀徐毅陈莎傅帅钱亚娟张立钦周雪平浙江大学生物技术研究所杭州310058 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地临安311300

rna沉默（rna silencing）是一种在真核生物体内普遍保守的基于核酸序列特异性抑制基因表达的调控机制。2009年Kreuze等发现病毒特异的小rna（small rna，srna）在序列上是重叠的，因此推测通过深度测序技术获得的大量srna序列能用来组... 详细信息

rna沉默（rna silencing）是一种在真核生物体内普遍保守的基于核酸序列特异性抑制基因表达的调控机制。2009年Kreuze等发现病毒特异的小rna（small rna，srna）在序列上是重叠的，因此推测通过深度测序技术获得的大量srna序列能用来组装病毒的基因组并用来鉴定和发现新病毒。利用srna深度测序技术已在作物和昆虫上鉴定发现多种病毒。但在木本植物上还未见报道。

关键词：技术鉴定测序技术小rna 组装利用花叶病序列特异性病原

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睾丸特异性小rna：pirna

中华男科学杂志 2008年第2期14卷 163-165页

作者：丁晓芳李红钢熊承良华中科技大学附属协和医院生殖医学中心华中科技大学同济医学院计划生育研究所湖北武汉430022

真核细胞能产生一类长度19～30个核苷酸(nt)的小rna,这些小rna能在降解mrna及翻译抑制等方面起靶向作用。与之相关的Argonaut家族蛋白分为2个亚家族:AGO亚家族,包括AGO1～44个成员,表达分布广泛,主要与mirnas和sirnas结合、通过与rna干... 详细信息

真核细胞能产生一类长度19～30个核苷酸(nt)的小rna,这些小rna能在降解mrna及翻译抑制等方面起靶向作用。与之相关的Argonaut家族蛋白分为2个亚家族:AGO亚家族,包括AGO1～44个成员,表达分布广泛,主要与mirnas和sirnas结合、通过与rna干扰类似的途径抑制目的基因表达;另一个是PIWI亚家族,包括PIWI、Aubgine(AUB)和AGO3,均局限表达于睾丸组织。最近4个研究小组在哺乳动物的睾丸内发现了一类新的小rna,因能与PIWI亚家族蛋白结合,故命名为piwi-interfering rnas(pirnas),可能在精子发生的基因表达调控中起重要作用。

关键词：小rna 干扰性小rnas 微rnas pirnas 睾丸精子发生