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宿主基因与结核病易感性研究概览

浙江大学学报(医学版) 2023年

作者：胡文娟徐凯进浙江大学医学院附属第一医院传染病诊治国家重点实验室国家感染性疾病临床医学研究中心国家传染病医学中心感染性疾病诊治协同创新中心

“吕贝克灾难”、双胞胎研究及收养研究等流行病学观察性研究结果都充分表明，宿主基因是决定机体对结核分枝杆菌是否易感和感染后是否发病的重要因素。从连锁分析到全基因组关联研究，已发现人白细胞抗原（HLA）类基因、非HLA类基因（S... 详细信息

“吕贝克灾难”、双胞胎研究及收养研究等流行病学观察性研究结果都充分表明，宿主基因是决定机体对结核分枝杆菌是否易感和感染后是否发病的重要因素。从连锁分析到全基因组关联研究，已发现人白细胞抗原（HLA）类基因、非HLA类基因（SLC11A1、VDR、ASAP1、细胞因子类基因及模式识别受体类基因）与结核病易感性相关。本文对近年涉及结核病易感性基因的研究进行回顾，重点叙述HLA类基因和非HLA类基因与结核病发病的关联，并对文中涉及的基因进行富集分析，结果提示大部分基因参与免疫炎症调控，并与自身免疫性疾病关系密切，可为后续结核感染风险预测和结核病诊治提供参考。

关键词：结核病宿主基因易感性富集分析风险预测综述

宿主基因miR-138对单纯疱疹病毒I型抑制作用的研究

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中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生 2022年第1期 0020-0023页

作者：于晓凤唐梅浙江中医药大学·中医药科学院浙江杭州310053

宿主基因micro RNA miR-138在神经系统中高效表达,它通过靶向病毒ICP0的信使RNA来抑制单纯疱疹病毒herpes simplex virus 1(HSV-1)裂解循环的各类基因,从而促进病毒在宿主体内潜伏。然而,我们发现过表达miR-138仍然可以抑制病毒的裂解,... 详细信息

宿主基因micro RNA miR-138在神经系统中高效表达,它通过靶向病毒ICP0的信使RNA来抑制单纯疱疹病毒herpes simplex virus 1(HSV-1)裂解循环的各类基因,从而促进病毒在宿主体内潜伏。然而,我们发现过表达miR-138仍然可以抑制病毒的裂解,因此我们怀疑miR-138是否还有其他靶点来抑制HSV-1的复制过程。方法:我们利用细菌人工染色体技术(BAC)将miR-138基因和ICP0上的3’UTR进行编辑,获得重组病毒WT-IE-138,WT-IE-138M,M138-IE-138和M138-IE-138M。在N2A细胞中进行培养,空斑试验观察独立于ICP0的情况下病毒的复制情况;进一步通过小鼠感染实验,qPCR技术检测小鼠三叉神经中病毒的复制基因。结果:结果显示,空斑试验发现独立于ICP0,miR-138仍能抑制病毒复制。通过RT-qPCR检测发现M138-IE-138M病毒基因的复制水平明显高于M138-IE-138,说明miR-138确实通过靶向病毒基因和未知宿主基因促进HSV潜伏,为后续研究提供有力证据。结论:miR-138还有其他靶点来抑制HSV-1的复制过程,从而造成病毒在宿主体内的长期潜伏。

关键词：宿主基因 miR-138 单纯疱疹病毒

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宿主基因与结核病遗传易感性研究进展

中国人兽共患病学报 2007年第5期23卷 518-520,458页

作者：高玉婧裴秀英宁夏医学院银川750004

自1993年起，结核病就被世界卫生组织宣布为主要的全球危害性疾病。据WHO的资料，全球大约已有32％的人口感染了结核分枝杆菌，但仅有10％的感染者会进一步发展为临床结核病，提示个体差异可能与结核病遗传易感性有关。遗传因素对结核... 详细信息

自1993年起，结核病就被世界卫生组织宣布为主要的全球危害性疾病。据WHO的资料，全球大约已有32％的人口感染了结核分枝杆菌，但仅有10％的感染者会进一步发展为临床结核病，提示个体差异可能与结核病遗传易感性有关。遗传因素对结核病易感性或抵抗性的重要性已被许多结核研究工作者所重视。随着人类基因组学和蛋白质组学的进展，大量疾病的相关基因不断被发现，遗传易感性机制亦被逐步阐明，国内外也不断报道了对结核病宿主遗传易感性的研究结果。本文对结核病宿主遗传易感性的研究现状和发展前景做一综述。

关键词：宿主遗传易感性结核病宿主基因世界卫生组织结核分枝杆菌人类基因组学蛋白质组学个体差异

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宿主基因与结核病易感性研究进展

中国公共卫生 2014年第11期30卷 1403-1408页

作者：后永春舒文朱士玉张国良陈伟聂绍发许奕华上海市普陀区疾病预防控制中心性艾科 200333 华中科技大学同济医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学系中国疾病预防控制中心结核病预防控制中心

结核病是全球范围内疾病负担最严重的疾病之一,结核病控制工作已成为重大的公共卫生问题与社会问题,尽管结核病的防治工作取得积极成效,但仍面临诸多挑战[1-2]。据报道,世界约有1/3的人口感染结核分枝杆菌,仅有不足1/10的结核病分枝杆... 详细信息

结核病是全球范围内疾病负担最严重的疾病之一,结核病控制工作已成为重大的公共卫生问题与社会问题,尽管结核病的防治工作取得积极成效,但仍面临诸多挑战[1-2]。据报道,世界约有1/3的人口感染结核分枝杆菌,仅有不足1/10的结核病分枝杆菌感染者继续发展成为临床结核病患者,其他大多数感染者均能控制或清除体内的结核分枝杆菌[3-4]。提示结核病的发病存在个体差异,

关键词：结核病宿主基因易感性

系统性红斑狼疮患者CD4^+T细胞miR-126及宿主基因EGFL7 DNA甲基化状态分析

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中南大学学报（医学版） 2013年第8期38卷 793-797页

作者：梁云生赵莎梁功平赵明陆前进医学表观基因组学湖南省重点实验室长沙410078 中南大学湘雅二医院皮肤科长沙410011 湖南省儿童医院儿童保健所长沙410007

目的:探讨系统性红斑狼疮(SLE)患者CD4+T细胞miR-126宿主基因EGFL7的甲基化水平对miR-126表达的调控。方法:采用实时qPCR检测SLE患者CD4+T细胞miR-126及EGFL7 mRNA表达水平;亚硫酸氢钠基因组测序法检测EGFL7基因启动子区甲基化状态。结... 详细信息

目的:探讨系统性红斑狼疮(SLE)患者CD4+T细胞miR-126宿主基因EGFL7的甲基化水平对miR-126表达的调控。方法:采用实时qPCR检测SLE患者CD4+T细胞miR-126及EGFL7 mRNA表达水平;亚硫酸氢钠基因组测序法检测EGFL7基因启动子区甲基化状态。结果:miR-126及其宿主基因EGFL7在SLE患者CD4+T细胞表达上调(P宿主基因EGFL7基因座第7个内含子中,其自身的基因序列中包含29个CpG位点。但该区域甲基化水平在SLE患者CD4+T细胞和正常对照组间差异无统计学意义(P=0.907)。而SLE患者CD4+T细胞中EGFL7基因启动子区甲基化水平显著降低(P宿主基因EGFL7启动子区甲基化状态调控宿主基因本身及其miR-126的表达。

关键词：系统性红斑狼疮 miR-126 EGFL7 宿主基因 DNA甲基化

核内小RNA宿主基因14在肿瘤中的表达及其调控作用

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中华病理学杂志 2020年第8期49卷 866-869页

作者：赵俞乔史文广何日升关沧海姜兴明哈尔滨医科大学附属第二医院胆胰外科 150086

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类转录本长度大于200个核苷酸的不具备蛋白质编码能力或仅具备有限的蛋白质编码能力的RNA分子,其广泛参与肿瘤的发生发展过程。核内小RNA宿主基因14(small nucleolar RNA host gene 14,SN... 详细信息

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类转录本长度大于200个核苷酸的不具备蛋白质编码能力或仅具备有限的蛋白质编码能力的RNA分子,其广泛参与肿瘤的发生发展过程。核内小RNA宿主基因14(small nucleolar RNA host gene 14,SNHG14)是一种新发现的lncRNA,在诸多人类肿瘤中呈现异常表达,对肿瘤的增殖、侵袭转移、耐药等恶性生物学行为起到调控作用,与患者的淋巴侵袭和肿瘤大小等密切相关,并可作为预后的独立危险因素。

关键词：宿主基因肿瘤大小恶性生物学行为异常表达小RNA 人类肿瘤侵袭转移广泛参与

水稻中Intronic MicroRNA与其宿主基因功能关系分析

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四川大学学报（自然科学版） 2012年第6期49卷 1342-1348页

作者：童永鳌王胜华四川大学生命科学学院成都610064

根据已有的水稻基因组注释,对水稻中已知的437个pre-miRNAs的基因组背景加以分析,有98个(～22%)与蛋白编码基因相重叠,其中69个(～16%)位于蛋白编码基因的内含子区域,即intronic microRNAs(in-miRNAs).对这些in-miRNAs的靶基因进行Gene ... 详细信息

根据已有的水稻基因组注释,对水稻中已知的437个pre-miRNAs的基因组背景加以分析,有98个(～22%)与蛋白编码基因相重叠,其中69个(～16%)位于蛋白编码基因的内含子区域,即intronic microRNAs(in-miRNAs).对这些in-miRNAs的靶基因进行Gene Ontology(GO)富集分析,结果显示in-miRNAs对蛋白质氨基酸磷酸化,DNA整合,蛋白质水解,恒温保持,防御响应等生物学过程中的基因有明显的调控作用.最后,对宿主基因及靶基因的功能进行整合分析发现有4个in-miRNAs所调控的靶基因与其宿主基因参与了相同的生物过程.我们推断,in-miRNAs可能会在这些生物过程中,通过下调靶基因的表达来协助或抑制其宿主基因的功能.

关键词： Intronic microRNA 宿主基因功能关系 GO富集分析水稻

内含子microRNA及其宿主基因的表达与功能

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中国生物化学与分子生物学报 2010年第12期26卷 1080-1084页

作者：马宁张艳芬高旭哈尔滨医科大学基础医学院哈尔滨150086 哈尔滨医科大学附属第一临床医学院哈尔滨150001

微小RNA(microRNAs,miRNAs)是一类具有转录后水平基因表达调控作用的非编码小分子***可参与机体发育、代谢及恶性肿瘤、心律失常等疾病的发生.近半数microRNA的编码基因位于已知编码蛋白基因的内含子中,称为"内含子microRNA",后者称为"... 详细信息

微小RNA(microRNAs,miRNAs)是一类具有转录后水平基因表达调控作用的非编码小分子***可参与机体发育、代谢及恶性肿瘤、心律失常等疾病的发生.近半数microRNA的编码基因位于已知编码蛋白基因的内含子中,称为"内含子microRNA",后者称为"宿主基因".由于内含子microRNA编码基因位置的特殊性,有研究者认为二者能够共同表达并发挥相似的生物学功能.它的发现不仅丰富了人们对内含子功能的认识,还有助于完善宿主基因功能的作用通路。

关键词：内含子microRNA 宿主基因作用通路

内含子miRNA反馈调节宿主基因的表达与功能研究进展

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军事医学科学院院刊 2009年第6期33卷 580-582,595页

作者：黄宝春曹国军邵宁生军事医学科学院基础医学研究所北京100850

miRNA是近年来发现的一类重要的基因表达调控因子。研究发现,许多miRNA位于编码蛋白基因(宿主基因)的内含子中,称为内含子miRNA。现有的证据表明,大多数内含子miRNA和它们的宿主基因表达一致,提示这些内含子miRNA参与宿主基因在功能和... 详细信息

miRNA是近年来发现的一类重要的基因表达调控因子。研究发现,许多miRNA位于编码蛋白基因(宿主基因)的内含子中,称为内含子miRNA。现有的证据表明,大多数内含子miRNA和它们的宿主基因表达一致,提示这些内含子miRNA参与宿主基因在功能和表达上的调控,本文就这方面的最新研究进展做一综述。

关键词： miRNA 内含子宿主基因反馈调节