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联合应用表型分析、热休克蛋白65限制性片段长度多态性分析和测序鉴定养鱼水中的非结核分枝杆菌

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中国防痨杂志 2007年第2期29卷 154-159页

作者：陈雪蔡林赵亭丁北川张建中北京大学人民医院皮肤科北京100044 北京结核病控制研究所北京100035

目的了解养鱼水中非结核分枝杆菌(NTM)的分布情况。方法采集30份市售养鱼水标本,通过分离培养和生化反应初步鉴定,然后从培养菌落中提取DNA,PCR扩增65kD分枝杆菌抗原,扩增产物:(1)分别应用两种限制性内切酶BstEⅡ和HaeⅢ酶切,然后进行... 详细信息

目的了解养鱼水中非结核分枝杆菌(NTM)的分布情况。方法采集30份市售养鱼水标本,通过分离培养和生化反应初步鉴定,然后从培养菌落中提取DNA,PCR扩增65kD分枝杆菌抗原,扩增产物:(1)分别应用两种限制性内切酶BstEⅡ和HaeⅢ酶切,然后进行琼脂糖凝胶电泳和限制性片段长度多态性分析(PRA);(2)直接测序。结果30份市售养鱼水中29份样本分枝杆菌培养阳性,其中6份样本分别生长出两种形态性状完全不同的菌落,共分离出35株分枝杆菌,表型特征均符合NTM。理化性质、PRA和测序鉴定发现,戈登分枝杆菌8株(23%)、龟-偶然分枝杆菌复合群8株(23%)、日内瓦分枝杆菌9株(26%)、不产色分枝杆菌1株,其余9株未鉴定到种。结论NTM广泛存在于市售养鱼水中,分子生物学方法与常规细菌学鉴定可互相补充,提高鉴定的正确性。

关键词：分枝杆菌,非结核聚合酶链反应多态性,限制性片段长度

限制性片段长度多态性聚合酶链反应法检测人细胞色素氧化酶2D6药物代谢相关基因位点多态性

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安徽医药 2019年第12期23卷 2347-2350页

作者：夏清荣单锋徐亚运梁俊曹银柳杨闫春宇合肥市第四人民医院药剂科安徽省精神卫生中心精神药理研究室

目的建立测定人细胞色素氧化酶2D6(CYP2D6)基因多态性的限制性片段长度多态性聚合酶链反应(polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism,PCR RFLP)检测方法。方法通过增加PCR扩增体系中DNA模板上样体积、降低... 详细信息

目的建立测定人细胞色素氧化酶2D6(CYP2D6)基因多态性的限制性片段长度多态性聚合酶链反应(polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism,PCR RFLP)检测方法。方法通过增加PCR扩增体系中DNA模板上样体积、降低引物浓度以及减少限制性内切酶的用量等方法改进、优化实验条件,建立以PCR RFLP法为基础的肝药酶CYP2D6基因型检测方法。结果采用PCR RFLP法能够检测CYP2D6?2、CYP2D6?10和CYP2D6?14基因型,且过程简便,经济实用。结论该方法检测CYP2D6药物代谢相关基因位点基因型具有简便、高效、准确和经济的特点,可在临床及实验室推广使用。

关键词：细胞色素P450 CYP2D6 多态性,限制性片段长度扩增片段长度多态性分析基因检测

IS6110-限制性片段长度多态性和间隔区寡核苷酸分型技术在结核分枝杆菌菌株鉴定中的应用

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结核病与胸部肿瘤 2005年第3期 202-206页

作者：郭艳玲王甦民李传友刘洋北京市结核病胸部肿瘤研究所

目的评价IS6110-限制性片段长度多态性（IS6110-RFLP）和间隔区寡核苷酸分型技术（spoligotyping）两种方法在结核病流行病学中的应用，探讨我国各地区的结核分枝杆菌菌株特点。方法收集158株结核分枝杆菌临床分离株，分别应用IS6110-R... 详细信息

目的评价IS6110-限制性片段长度多态性（IS6110-RFLP）和间隔区寡核苷酸分型技术（spoligotyping）两种方法在结核病流行病学中的应用，探讨我国各地区的结核分枝杆菌菌株特点。方法收集158株结核分枝杆菌临床分离株，分别应用IS6110-RFLP和Spoligotyping两种方法进行鉴定。结果①IS6110-RFLP的分辨力大于spoligotyping分型。②将本次实验结果与国际spoligotype数据库进行比较。结果有14个类型属于共有类型，其中类型1为流行的类型，分布广泛，即所说的北京基因型。③广东地区与其他地区成簇率和北京基因型所占比例差异有统计学意义（P〈0．05）。广东地区成簇率和北京基因型所占比例均显著低于其他地区。结论同时应用IS6110-RFLP分型和Spoligotyping两种方法进行结核病流行病学调查研究非常有效，在中国不同地区的菌株具有不同的特点。

关键词：多态性,限制性片段长度核苷酸类分枝杆菌,结核限制性片段长度多态性结核分枝杆菌分型技术菌株鉴定寡核苷酸 Spoligotyping 间隔区

ACE2 rs2074192位点多态性与非乙醇性脂肪性肝病易感性的相关性

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青岛大学学报（医学版） 2024年第1期60卷 39-42页

作者：赵守林张梅赵真真陈立震宣世英青岛大学附属青岛市市立医院感染性疾病科山东青岛266071 青岛大学附属青岛市市立医院临床研究中心山东青岛266071

目的探讨青岛地区人群血管紧张素转化酶2(ACE2)rs2074192位点多态性与非乙醇性脂肪性肝病(NAFLD)易感性的相关性。方法研究纳入NAFLD病人208例,健康查体者105例。收集受试者的血液标本,提取DNA,应用多聚酶链反应(PCR)检测ACE2基因rs2074... 详细信息

目的探讨青岛地区人群血管紧张素转化酶2(ACE2)rs2074192位点多态性与非乙醇性脂肪性肝病(NAFLD)易感性的相关性。方法研究纳入NAFLD病人208例,健康查体者105例。收集受试者的血液标本,提取DNA,应用多聚酶链反应(PCR)检测ACE2基因rs2074192位点的基因型,比较ACE2 rs2074192位点基因型及等位基因频率在NAFLD组及对照组的分布差异。同时收集受试者的临床资料及实验室生化检查结果,比较不同基因型病人临床资料及实验室生化结果的差异。结果NAFLD组和对照组ACE2 rs2074192位点的基因型与等位基因分布差异均无统计学意义(P>0.05)。ACE2 rs2074192位点T等位基因女性携带者体质量指数高于未携带者,T等位基因男性携带者血清葡萄糖水平低于未携带者(t=-2.613、-3.195,P多态性与NAFLD易感性无明显相关性。

关键词：非酒精性脂肪性肝病多态性,限制性片段长度血管紧张素转换酶2 疾病遗传易感性

TLR4基因多态性与小儿反复呼吸道感染的关系

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青岛大学学报(医学版) 2024年

作者：赵淑景马志平张金彪付峰冯娜娜河北省沧州中西医结合医院儿科一区河北省沧州中西医结合医院实验诊断科河北省沧州中西医结合医院科教科

目的探究Toll样受体4（TLR4）基因多态性与小儿反复呼吸道感染（RRTI）的关系。方法选择107例RRTI病儿作为观察组,另选103例体检健康儿童作为对照组（近1年未出现RRTI）,采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应（PCR-RFLP）技术分析两... 详细信息

目的探究Toll样受体4（TLR4）基因多态性与小儿反复呼吸道感染（RRTI）的关系。方法选择107例RRTI病儿作为观察组,另选103例体检健康儿童作为对照组（近1年未出现RRTI）,采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应（PCR-RFLP）技术分析两组TLR4基因rs2737190位点多态性,比较不同病情严重程度病儿TLR4基因多态性的差异,并分析不同TLR4基因多态性病儿临床特征的差异。结果观察组TLR4基因rs2737190位点AG基因型、G等位基因频率均明显高于对照组,AA基因型频率明显低于对照组（χ2=4.129～8.564,P性,并促进其炎症反应升高和病情进展。

关键词：呼吸道感染再感染儿童 Toll样受体4 多态性,限制性片段长度病人病情

扩增片段长度多态性技术应用于复杂样本的方法学探讨

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中国基层医药 2010年第13期17卷 1729-1731,1873页

作者：郑坚邹泽红傅意玲汕头大学医学院炎症与免疫性广东省汕头515031 广州医学院第二附属医院

目的探讨扩增片段长度多态性（AFLP）技术应用于变态反应疾病等复杂样本的遗传研究之可能性,探讨差异片段后续分析方法.方法利用公共数据库中获得的遗传背景差异较大的成对材料进行AFLP筛选所得的差异片段,采用不同的BLAST程序进行深... 详细信息

目的探讨扩增片段长度多态性（AFLP）技术应用于变态反应疾病等复杂样本的遗传研究之可能性,探讨差异片段后续分析方法.方法利用公共数据库中获得的遗传背景差异较大的成对材料进行AFLP筛选所得的差异片段,采用不同的BLAST程序进行深入的生物信息学分析.结果不同的BLAST程序获得的结果所包含的可用信息量不同.以BLASTX程式获得的结果显示,前述差异片段分别与洋葱伯克霍尔德菌噬菌体及结核分支杆菌末端酶的大亚基高度同源.在后二者基本信息缺失的情况下,利用关键词搜索获得了末端酶与肿瘤形成及转移的重要信息.结论通过采用AFLP方法对遗传背景差异较大的成对材料进行分子标记筛选,获得的差异片段进一步经生物信息学分析,对于后续的深入研究十分关键.

关键词：多态性,限制性片段长度序列分析,DNA 数据库,遗传学生物信息学

军团菌扩增片段长度多态性分析分子分型技术及其在流行病学研究中的应用

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国际检验医学杂志 2007年第1期28卷 32-34,37页

作者：屈平华（综述）朱庆义（审校）胡朝晖（审校）广州金域医学检验中心科研部 510330

扩增片段长度多态性分析（AFLP）作为一种理想、有效的基因组指纹分析技术，结合了限制片段长度多态性分析（RELP）与酶链聚合反应（PCR）的优点，具有高度的重复性和一致率，被认为是军团菌传播调查的国际性标准分型的“金标准”。现... 详细信息

扩增片段长度多态性分析（AFLP）作为一种理想、有效的基因组指纹分析技术，结合了限制片段长度多态性分析（RELP）与酶链聚合反应（PCR）的优点，具有高度的重复性和一致率，被认为是军团菌传播调查的国际性标准分型的“金标准”。现对嗜肺军团菌AFLP分子分型的方法原理和在流行病学调查中的应用研究现状作一综述。

关键词：多态性,限制性片段长度军团菌,嗜肺流行病学,分子

滇南地区心脑血管疾病患者细胞色素P_(450)2C19基因分析及临床意义

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中国基层医药 2022年第1期29卷 2-6页

作者：童燕翔林驰宗希涛李丰耿鑫滇南中心医院(红河哈尼族彝族自治州第一人民医院)神经外科蒙自661199 昆明医科大学第一附属医院神经外二科昆明650032

目的分析滇南地区心脑血管疾病患者细胞色素P_(450)2C19(CYP2C19)基因分布及临床意义。方法回顾性分析滇南中心医院2019年5月至2020年6月诊治的心脑血管疾病患者245例的资料,分析CYP2C19基因分布情况,分析其与民族、年龄、性别、血脂、... 详细信息

目的分析滇南地区心脑血管疾病患者细胞色素P_(450)2C19(CYP2C19)基因分布及临床意义。方法回顾性分析滇南中心医院2019年5月至2020年6月诊治的心脑血管疾病患者245例的资料,分析CYP2C19基因分布情况,分析其与民族、年龄、性别、血脂、高血压、糖尿病的关系,并与其他地区进行比较。结果245例患者CYP2C19基因的7种表型^(*)1/^(*)17、^(*)1/^(*)1、^(*)1/^(*)2、^(*)1/^(*)3、^(*)2/^(*)2、^(*)2/^(*)3、^(*)3/^(*)3所占比例分别为2.86%、38.37%、39.18%、5.31%、9.39%、4.08%、0.82%,超快代谢者占2.86%,快代谢者占38.37%,中间代谢者占44.49%,慢代谢者占14.29%。CYP2C19基因的多态性位点突变频率观察值符合Hardy-Weinberg遗传平衡(P>0.05),具有恒定性及群体代表性。使用Fisher检验发现滇南地区心脑血管疾病患者的CYP2C19基因分布与民族、年龄、性别、基础疾病、血脂及心脑血管疾病种类无明显关联,均差异无统计学意义(均P>0.05),滇南地区人群与东莞、江西、福建、川北、赤峰、厦门、陕西、昆明地区人群CYP2C19基因分布均差异有统计学意义(P性别、基础疾病、血脂及心脑血管疾病种类无明显关联。CYP2C19基因分布与地区分布相关,可以指导不同地区个性化用药。

关键词：细胞色素P_(450)酶系统基因表达基因频率多态性,限制性片段长度冠状动脉疾病脑缺血性别因素年龄因素滇南地区

云南省红河哈尼族彝族自治州心脑血管疾病患者血脂及载脂蛋白E基因情况分析

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中国基层医药 2023年第10期30卷 1467-1471页

作者：童燕翔林驰汤进伟陈晓鹏云南省滇南中心医院(红河哈尼族彝族自治州第一人民医院)神经外科蒙自661199

目的分析云南省红河哈尼族彝族自治州心脑血管疾病患者的血脂及载脂蛋白E(ApoE)基因分布情况,及其与民族、性别及年龄的关系。方法收集2019年5月至2020年6月云南省滇南中心医院(红河哈尼族彝族自治州第一人民医院)收治的心脑血管疾病患... 详细信息

目的分析云南省红河哈尼族彝族自治州心脑血管疾病患者的血脂及载脂蛋白E(ApoE)基因分布情况,及其与民族、性别及年龄的关系。方法收集2019年5月至2020年6月云南省滇南中心医院(红河哈尼族彝族自治州第一人民医院)收治的心脑血管疾病患者102例为研究对象,分析其血脂及ApoE基因分布情况,并观察其与民族、性别及年龄的相关性。结果该地区心脑血管疾病患者的总胆固醇(TC)男女差异有统计学意义[(4.10±1.27)mmol/L比(4.70±1.83)mmol/L,t=1.87,P=0.048],TC值在不同民族及不同年龄段的差异均无统计学意义(P=0.343、1.000),低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、三酰甘油(TG)在不同民族、不同性别及不同年龄的差异均无统计学意义(P=0.562、0.125、0.158;0.884、0.068、0.681;0.262、0.367、0.965)。血脂异常和血脂正常患者在不同民族、不同性别及不同年龄的差异均无统计学意义(P=0.890、0.336、0.142)。所有患者未检测到E2/E4基因,ApoE的E2/E2及E2/E3基因占16.67%,E3/E3占70.59%,E3/E4及E4/E4占12.74%,ApoE基因在不同民族、不同性别及不同年龄的差异均无统计学意义(χ^(2)=0.13、0.69、0.44,P=0.936、0.429、0.804)。结论云南省红河哈尼族彝族自治州心脑血管疾病女性患者TC水平高于男性患者,LDL-C、HDL-C及TG水平与民族、性别及年龄无明显关联,血脂异常以低HDL-C及高TG为主,E2/E4基因在该地区暂未发现。

关键词：少数民族血脂异常载脂蛋白E类基因表达多态性,限制性片段长度年龄因素性别因素