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丙型肝炎病毒基因亚型、机体免疫功能与抗病毒疗效研究

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丙型肝炎病毒基因亚型、机体免疫功能与抗病毒疗效研究

作者：苏峥河北医科大学

学位级别：硕士

目的: 探讨HCV 基因亚型、机体免疫功能对慢性丙型肝炎患者抗病毒疗效的影响,以及HCV 基因型与机体免疫功能的关系。方法: 治疗前,检测所有入选慢性丙型肝炎病例的血清HCV RNA 含量、血清ALT 水平。采用Simmonds 基因分型法于治疗前检... 详细信息

目的: 探讨HCV 基因亚型、机体免疫功能对慢性丙型肝炎患者抗病毒疗效的影响,以及HCV 基因型与机体免疫功能的关系。方法: 治疗前,检测所有入选慢性丙型肝炎病例的血清HCV RNA 含量、血清ALT 水平。采用Simmonds 基因分型法于治疗前检测病例组的HCV RNA 基因亚型。将丙型肝炎病毒基因组特异片段固定在尼龙膜每个预定的区域内制成芯片。从待检的血清中分离出HCV RNA,经PCR 扩增和DIG-11-dUTP 标记后,通过碱基互补配对的原理与芯片进行杂交,显色后通过计算机判读杂交信号或与模式图比较判定结果,进而对丙型肝炎患者进行基因型检测。同时于治疗前检测所有入选病例血清IL-4和IFN-γ水平,以及检测健康对照组血清IL-4和IFN-γ。取空腹静脉血2ml,室温静置6小时后离心,取血清-20℃储存,采用双抗体夹心酶联分析法同批测定全部血清标本。IFN-检测方法:从已平衡至室温的密封袋中取出所需反应板,分别将标本及不同浓度标准品(100μL/孔)加入相应反应板孔中, 轻轻混匀30秒后封住板孔,37℃20分钟之后洗板5次,每孔加入5ulAnti IFN-rBiotin 和50ul IFN-r HRP,轻轻混匀30秒,封住板孔,37℃15分钟后再洗板5次。每孔加入50ul底物A和50ul底物B,轻轻混匀10秒,室温避光温育3±2分钟,每孔加入100ul终止液,

关键词：慢性丙型肝炎基因亚型 IL-4 IFN-γ 抗病毒治疗

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河南省人免疫缺陷病毒流行株的基因亚型分析

中华传染病杂志 1999年第4期17卷 253-255页

作者：韩卫国苏玲王哲邵一鸣王春俭李宏河南省卫生防疫站郑州450003 卫生部艾滋病预防与控制中心

目的　研究流行于河南省献血员中的人免疫缺陷病毒（ＨＩＶ）外膜蛋白（ｅｎｖ）基因亚型。方法　提取ＨＩＶ感染者外周血单个核白细胞（ＰＢＭＣ）的ＤＮＡ，经套式聚合酶链反应（ＮｅｓｔｅｄＰＣＲ）扩增ｅｎｖ基因片断，... 详细信息

目的　研究流行于河南省献血员中的人免疫缺陷病毒（ＨＩＶ）外膜蛋白（ｅｎｖ）基因亚型。方法　提取ＨＩＶ感染者外周血单个核白细胞（ＰＢＭＣ）的ＤＮＡ，经套式聚合酶链反应（ＮｅｓｔｅｄＰＣＲ）扩增ｅｎｖ基因片断，对Ｃ２Ｖ３区３５０～４５０核苷酸顺序进行测定和分析。结果　２０份样品的ｅｎｖ基因序列与Ｂ亚型最为接近，基因离散率为８．３４％，与其它国际亚型的基因离散率在２０％以上；与流行于云南的Ｂ亚型毒株基因离散率为４．１８％；样品间的基因离散率为３．４％。结论　流行于河南省献血员中的ＨＩＶ属Ｂ亚型，并与云南的流行株密切相关；其在河南的流行时间在３～６年间。

关键词：基因亚型艾滋病毒基因变异

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女性宫颈人乳头状瘤病毒感染基因亚型分布

中华医院感染学杂志 2013年第16期23卷 3833-3834页

作者：李玲吴雪斌李凌柯桂珠福建医科大学附属漳州市医院妇产科福建漳州363000

目的了解女性人乳头状瘤病毒(HPV)感染基因亚型及年龄分布,并对HPV感染特征进行分析。方法对2009年6月-2011年9月医院妇产科门诊患者2312例进行HPV感染基因亚型筛查。结果 2312例患者HPV感染1093例,总感染率为47.3%,21种基因亚型均被检... 详细信息

目的了解女性人乳头状瘤病毒(HPV)感染基因亚型及年龄分布,并对HPV感染特征进行分析。方法对2009年6月-2011年9月医院妇产科门诊患者2312例进行HPV感染基因亚型筛查。结果 2312例患者HPV感染1093例,总感染率为47.3%,21种基因亚型均被检出,感染率最高的亚型16,其他常见亚型感染顺位为52、58、18、11、33、53、CP8304、68、6、31;高危亚型感染773例,感染率89.0%,低危亚型感染率19.8%,单一感染800例,感染率73.2%,多重感染293例,感染率26.8%,在多重感染中以二重感染为主202例占68.9%;HPV感染总感染率及高危亚型随年龄增长感染率升高,低危亚型随年龄增大感染率呈下降趋势;各年龄组HPV感染检出率比较差异有统计学意义(P基因亚型符合亚洲人群分布规律,但有一定区域性,HPV高危亚型感染年龄主要分布在>36岁。

关键词：人乳头状瘤病毒基因亚型感染

利用ClustalX2.0软件分析中国乙肝病毒基因型和基因亚型比例和重组

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中国现代医学杂志 2011年第25期21卷 3121-3124页

作者：陈俊意曾祥琼谭丽重庆医药高等专科学校临床医学系重庆400030

目的分析中国乙肝病毒基因型和基因亚型比例和重组。方法采用PubM ed工具,在NCBI中随机下载111条中国乙肝病毒(HBV)全序列核苷酸,利用ClustalX 2.0软件分析中国乙肝病毒基因型和基因亚型比例和重组。结果基因型A占总数的3.6%;基因型B占... 详细信息

目的分析中国乙肝病毒基因型和基因亚型比例和重组。方法采用PubM ed工具,在NCBI中随机下载111条中国乙肝病毒(HBV)全序列核苷酸,利用ClustalX 2.0软件分析中国乙肝病毒基因型和基因亚型比例和重组。结果基因型A占总数的3.6%;基因型B占总数的18.9%,其中B1占总数的3.6%,B2占总数的15.3%;基因型C占总数的58.6%,其中C1占总数的51.4%,C2占总数的5.4%,C 3占总数的1.8%;基因型D占总数的2.7%;基因型G占总数的6.3%;基因型E、F和H没有在随机样本中发现。结论发现A/B重组型1例,A/G重组型1例,C/G重组型1例,C/D基因型3例。人员交流扩大,其他乙肝病毒基因型也易于进入中国,与基因型B或者C发生共感染并重组。

关键词：乙肝病毒基因型基因亚型重组中国

未经抗病毒治疗的HIV感染孕产妇的毒株基因亚型和耐药分析

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中国预防医学杂志 2021年第1期22卷 23-27页

作者：邓煜川徐晴晴朱禹静李珍王爱玲姚均中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心北京102206 中国疾病预防控制中心妇幼保健中心

目的了解云南、四川、广东、广西壮族自治区和新疆维吾尔自治区等五个地区人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)感染孕产妇体内毒株基因亚型及耐药情况。方法选取2016年6月—2019年6月229例未接受抗逆转录病毒治疗(anti... 详细信息

目的了解云南、四川、广东、广西壮族自治区和新疆维吾尔自治区等五个地区人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)感染孕产妇体内毒株基因亚型及耐药情况。方法选取2016年6月—2019年6月229例未接受抗逆转录病毒治疗(antiretroviral therapy treatment, ART)的孕产妇HIV感染者产时外周血血浆,提取HIV-1核糖核酸(RNA),通过巢式聚合酶链式反应扩增HIV蛋白酶区(PR)、反转录酶区(RT)并测序。根据基因测序结果进行基因亚型和耐药突变位点以及抗病毒药物耐药情况的分析。结果 229例未经ART的HIV感染孕产妇血浆成功扩增197例,CRF07BC亚型87例(44.16%)、CRF08BC亚型56例(28.43%)、CRF01AE亚型44例(22.34%)、特殊重组亚型9例(4.57%)以及CRF85BC1例(0.51%)。其中16例发生耐药,耐药率为8.12%(16/197),22例含有耐药突变位点。发生核苷类反转录酶抑制剂(nucleotide reverse transcriptase inhibitor, NRTIs)、非核苷类反转录酶抑制剂(non-nucleoside reverse transcri ptase inhibitors, NNRTIs)、蛋白酶抑制剂(protease inhibitor, PIs)耐药突变频数分别为4例、18例和1例,其中有1例出现NRTIs和NNRTIs的双重耐药突变位点。耐药位点与HIV基因分型差异有统计学意义(P亚型特异性。结论我国HIV感染的孕产妇人群中HIV基因亚型呈多样性。该人群传播性耐药率已经高于WHO耐药监测阈值,其耐药传播情况属中度流行水平,不同基因型耐药情况存在差异性。应该加强对该重点人群的耐药监测,为母婴阻断提供更加科学有效的抗病毒治疗措施。

关键词：人类免疫缺陷病毒基因亚型耐药分析

安徽、河南、山西3省自愿咨询检测人群HIV/HCV共感染及HCV基因亚型初步分析

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中国输血杂志 2009年第5期22卷 377-380页

作者：赵晶潘品良王哲乔晓春苏斌肖瑶蒋岩中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心国家艾滋病参比实验室北京100050 河南省疾病预防控制中心山西省疾病预防控制中心安徽省疾病预防控制中心

目的了解目前我国安徽、河南、山西3省自愿咨询检测(VCT)人群HIV感染者中HIV/HCV共感染率及HCV亚型的分布情况。方法对来自安徽、河南、山西3省VCT人群中HIV阳性样本进行HCV抗体检测并对HCV阳性的样本进行HCVC/E1区RT-PCR扩增、基因测序... 详细信息

目的了解目前我国安徽、河南、山西3省自愿咨询检测(VCT)人群HIV感染者中HIV/HCV共感染率及HCV亚型的分布情况。方法对来自安徽、河南、山西3省VCT人群中HIV阳性样本进行HCV抗体检测并对HCV阳性的样本进行HCVC/E1区RT-PCR扩增、基因测序,分析HCV的亚型分布。结果在HIV阳性的382份样本中,检出HCV阳性215份,3省VCT人群HIV感染者中HIV/HCV共感染率平均为56.3%,安徽、河南、山西3省分别为50.0%、59.3%、42.9%。其中,经血传播人群的HIV/HCV共感染率为72.1%,经性传播人群为33.3%,其它途径人群为36.6%。HCV PCR扩增成功98份,1b亚型69份(70%),2a亚型28份(29%),3a亚型1份(1%)。结论安徽、河南、山西VCT人群具有较高的HIV/HCV共感染率;经性传播人群HIV/HCV共感染率高于国外水平;HIV/HCV共感染对HCV亚型分布无显著影响。

关键词： HIV HCV HIV/HCV共感染基因亚型

2008-2015年粤赣口岸出入境人员HIV感染者基因亚型分析研究

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中国艾滋病性病 2016年第4期22卷 228-231,236页

作者：吴健赵明惠刘开明吕志平张建明廖立新广东国际旅行卫生保健中心广州510635 江西国际旅行卫生保健中心南昌330002

目的监测近年来广东和江西口岸出入境人员中,艾滋病病毒1型(HIV-1)感染者感染毒株的亚型流行分布特征,为有效的开展口岸艾滋病监测和防控提供科学依据。方法从205份确证的HIV-1抗体阳性样本中提取病毒核酸,通过反转录和巢式PCR技术扩增H... 详细信息

目的监测近年来广东和江西口岸出入境人员中,艾滋病病毒1型(HIV-1)感染者感染毒株的亚型流行分布特征,为有效的开展口岸艾滋病监测和防控提供科学依据。方法从205份确证的HIV-1抗体阳性样本中提取病毒核酸,通过反转录和巢式PCR技术扩增HIV-1基因的env、p17、vif、vpr和pol区域,将PCR产物测序后进行分析对比,以确定其基因亚型。结果 205份样品中有93份样品扩增阳性,其中广东口岸88份,江西口岸5份。共发现17种HIV-1亚型和重组亚型。其中,A亚型6份(6.5%);B亚型6份(6.5%);C亚型10份(10.8%);D、F、G亚型各1份,分别占1.1%;CRF01_AE重组型33份(35.5%);CRF02_AG重组型12份(12.9%);CRF07_BC重组型13份(14.0%);CRF08_BC重组型3份(3.2%)。此外,研究还发现7个独特重组型(URFs),分别是A/H/J/U、CRF01_AE/A/C、CRF01_AE/B、CRF01_AE/C、CRF02_AG/A、CRF07_BC/A和CRF07_BC/B,这些新的独特重组型是在广东口岸首次发现。这些不同亚型的感染者来自包括中国在内的29个不同国家。结论近年来广东口岸和江西口岸出入境人员中HIV-1亚型和重组亚型种类呈明显的多样化和复杂化。监测出入境人员中HIV感染者基因型分布情况,对及时发现新型毒株,预防和控制艾滋病从国境口岸的传入十分重要。

关键词：艾滋病病毒基因亚型出入境人员

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辽宁省汉城型汉坦病毒基因亚型分析

中国公共卫生 2012年第12期28卷 1594-1596页

作者：耿英芝田疆刘芸王博孙英伟李鑫姚文清辽宁省疾病预防控制中心感传所沈阳110005

目的分析辽宁省汉城型汉坦病毒(HV)的基因亚型及其分布情况。方法收集辽宁省内主要肾综合征出血热(HFRS)流行地区的鼠肺和病人血清标本,采用间接免疫荧光法(IFA)检测鼠肺中HV抗原,应用HV特异性引物以RT-PCR方法扩增标本中M和S基因片段... 详细信息

目的分析辽宁省汉城型汉坦病毒(HV)的基因亚型及其分布情况。方法收集辽宁省内主要肾综合征出血热(HFRS)流行地区的鼠肺和病人血清标本,采用间接免疫荧光法(IFA)检测鼠肺中HV抗原,应用HV特异性引物以RT-PCR方法扩增标本中M和S基因片段的特异性核苷酸序列,测序后与已知病毒序列进行比较分析,构建系统发生树,以明确其型别和亚型及其地理分布情况。结果辽宁省HFRS疫区褐家鼠携带的病毒均为汉城型病毒(SEOV);对鼠肺及病人携带HV的部分M片段及部分S片段进行核苷酸序列分析表明,发现SEOV的同源性较高,变异较小,稳定性较高,而且地理位置相近地区基因组核苷酸序列的同源性很高(>98.8%),具有小范围的地理聚集现象。结论辽宁省流行的SEOV均为S3亚型,基因亚型分布比较单一。

关键词：汉坦病毒(HV) 汉城型病毒(SEOV) 基因亚型系统发生分析分布

云南红河和文山地区女性宫颈人乳头瘤病毒感染基因亚型分布状况研究

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中国全科医学 2012年第18期15卷 2036-2038页

作者：赵菊芬李茜张琴杨柳风霍竹蕙段丽娅中国人民解放军第59中心医院妇产科云南省开远市661600

目的探讨云南省红河和文山两个多民族地区女性人乳头瘤病毒(HPV)感染基因亚型分布及年龄特点。方法对2009年3—9月在我院就诊的来自云南省红河和文山两个多民族地区的2 887名女性进行生殖道21种HPV感染基因亚型筛查,分析常见感染亚型及... 详细信息

目的探讨云南省红河和文山两个多民族地区女性人乳头瘤病毒(HPV)感染基因亚型分布及年龄特点。方法对2009年3—9月在我院就诊的来自云南省红河和文山两个多民族地区的2 887名女性进行生殖道21种HPV感染基因亚型筛查,分析常见感染亚型及分布特点。结果 2 887名女性HPV总感染率为14.1%,21种基因亚型均被检出,常见的5种高危亚型依次为HPV 68、16、52、58、18型,常见的2种低危型为HPV 6、43。高危亚型感染率82.8%,单纯低危亚型感染率12.6%,单一感染率81.3%,多重感染率18.7%,其中以二重感染最多见。HPV感染集中于≤45岁,各年龄段HPV感染检出率及类型比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论云南省红河和文山地区女性HPV感染常见基因亚型总体符合亚洲人群分布规律,又有独特的区域性,HPV感染主要分布在≤45岁人群。

关键词：人乳头瘤病毒基因亚型宫颈肿瘤