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陕西延川枣区叶蝉种类鉴定及其种群消长动态与传播枣疯病潜在介体叶蝉筛查

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应用昆虫学报 2023年第3期60卷 980-989页

作者：陈玉鑫刘瑞昌刘锦春陈秀琳李伯辽李广伟陕西省红枣重点实验室(延安大学) 延安716000 延安大学生命科学学院延安716000 延安市枣业工程技术研发中心延安716000

【目的】明确陕西延川县枣区叶蝉种类及其种群消长动态,筛查携带枣疯植原体的潜在介体叶蝉,为预防和控制枣疯病在陕北枣区的蔓延流行提供科学依据。【方法】利用黄色粘虫板诱捕法调查枣园发生的叶蝉种类及主要种类的种群消长动态,以枣... 详细信息

【目的】明确陕西延川县枣区叶蝉种类及其种群消长动态,筛查携带枣疯植原体的潜在介体叶蝉,为预防和控制枣疯病在陕北枣区的蔓延流行提供科学依据。【方法】利用黄色粘虫板诱捕法调查枣园发生的叶蝉种类及主要种类的种群消长动态,以枣疯植原体16SrDNA为检测基因通过PCR技术筛查携带枣疯植原体的叶蝉种类及携带率。【结果】陕西延川枣区发生的叶蝉共11种,包括异色对纹叶蝉Zygina discolorHorváth、镇原树小叶蝉ArboridiazhenyuanaSong&Li、桃一点叶蝉Singaporashinshana Matsumura、蒙奥小叶蝉Austroasca mitjaevi Dworakowska、白边大叶蝉Kolla paulula Walker、截突长突叶蝉Batracomorphus allionii Turton、端钩菱纹叶蝉Hishimonus hamatus Kuoh、新东方叶蝉Orientus ishidae Matsumura、亨氏普叶蝉Platymetopius henribauti Dlabola、褐背普叶蝉Platymetopius obsoletus Signoret和茶网背叶蝉Reticuluma testacea Kuoh。异色对纹叶蝉、截突长突叶蝉和蒙奥小叶蝉的诱集量较大,分别占叶蝉总诱集量的49.64%、21.82%和11.76%%,属于优势种。延川县枣区叶蝉主要发生在4月下旬至11月上旬,异色对纹叶蝉成虫有3个发生高峰,截突长突叶蝉和茶网背叶蝉成虫有2个明显的发生高峰,其他叶蝉仅有1个或无明显的发生高峰期。PCR检测结果显示不同种类的叶蝉其枣疯植原体携带率显著不同,异色对纹叶蝉和端钩菱纹叶蝉携带枣疯植原体的比例最高,达80%以上;桃一点叶蝉、茶网背叶蝉和新东方叶蝉次之,携带率介于50%-68%之间,截突长突叶蝉的携带率相对较低(39%),白边大叶蝉成虫中未检测到枣疯植原体。【结论】延川枣园携带枣疯病植原体的叶蝉种类多、携带率高,应根据不同叶蝉的发生规律对潜在的枣疯植原体介体叶蝉进行高效治理,有助于阻断和延缓枣疯病在陕北枣区的流行蔓延。

关键词：枣疯病植原体叶蝉介体昆虫种群动态

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中国菱纹叶蝉族分类研究

中国菱纹叶蝉族分类研究

作者：曹文俊贵州大学

学位级别：硕士

菱纹叶蝉族Opsiini隶属于半翅目Hemiptera叶蝉科Cicadellidae角顶叶蝉亚科Deltocephalinae,本文详述了菱纹叶蝉族叶蝉分类研究概况,对中国菱纹叶蝉族进行了系统分类研究,并对该族现有属种进行了区系分析和基于形态特征对该族的属间系统... 详细信息

菱纹叶蝉族Opsiini隶属于半翅目Hemiptera叶蝉科Cicadellidae角顶叶蝉亚科Deltocephalinae,本文详述了菱纹叶蝉族叶蝉分类研究概况,对中国菱纹叶蝉族进行了系统分类研究,并对该族现有属种进行了区系分析和基于形态特征对该族的属间系统发育关系进行了探讨,结果如下:1.分类研究本文记述菱纹叶蝉族15属63种,包括3新属、5新种和3种级新异名(已发表1新属、1新种与1种级新异名)。编制了该族分属种检索表,并对该族具检视标本的雄虫进行了拍摄、解剖、绘制和描述。论文共拍摄了44种成虫整体彩色特征图片,绘制了相对应的雄虫外生殖器结构特征图。模式标本和研究标本保存于贵州大学昆虫研究所(GUGC),新分类单元及种分类地位变化如下:新属:拟锥顶叶蝉属Japananoides Cao&Xing,2022;齿茎叶蝉属Odontochilus ***.;拟碎斑叶蝉属Paralitura ***.。新种:点冠拟锥顶叶蝉Japananoides circularis Cao&Xing,2022;细尖齿茎叶蝉Odontochilus apiculatus ***.;阔尖齿茎叶蝉Odontochilus expansus ***.;离茎拟碎斑叶蝉Paralitura discedens ***.;阔茎拟碎斑叶蝉Paralitura platycaulis ***.。新异名:类叉突拟菱纹叶蝉Hishimonoides similis Dai,Viraktamath&Zhang,2010 ***.为细齿拟菱纹叶蝉Hishimonoides denticulateus Li&Xing,2010的异名;六盘山蠕纹叶蝉Phlepsopsius liupanshanensis Li,2011 ***.为双斑拟茎叶蝉Pseudophlepsius binotatus(Signoret,1880)的异名;三点碎斑叶蝉Litura tripunctaus(Li,2011)***.为齿突碎斑叶蝉Litura unda Knight,1970的异名。2.区系分析对中国菱纹叶蝉族15属63种昆虫在世界和中国动物地理区划中的分布情况进行了系统分析,结果如下:属级水平:在世界地理区划中分布型计11式,其中东洋界区系型计5属,占总属数的33.33%;其余均为跨界分布型,共计10属,占总属数的66.67%。其余10式跨界分布型均仅有1属,各占总属数的6.67%。如果将跨区属计算在内,该族在东洋界分布最广,总计有13属分布,占总属数的86.67%;其次古北界分布有9属,占总属数的60.00%;再之非洲界分布7属,占总属的46.67%;其它动物地理界相对较少。在中国动物地理区划中的分布型计10式。单式区系型4式,其中华南区区系型有6属,占中国已知属的40.00%。将跨区属计算在内,华南区分布最多,达10属,占中国已知菱纹叶蝉族总属数的66.67%;华北区次之,分布有6属,各占总属数的40.00%。结果表明:菱纹叶蝉族昆虫在世界分布广泛,属级阶元在世界动物地理区划各区系中均有分布,东洋界分布最广,其次为古北界,再之为非洲界,澳洲界、新北界分布较少,新热带界分布最少。在中国动物地理区划中属级水平上,以华南区为主,次之为华北区,青藏区、西南区最少。种级水平:在世界动物地理区划中分布型计9式,其中东洋界区系型,所含种类数量最多,共计37种,占总种数的58.73%;其次为古北界-东洋界区系型,共计14种,占总种数的22.22%。如果将跨区种计算在内,东洋界分布58种,占总种数的92.06%;其次为古北界,分布21种,占总种数的33.33%;再次为非洲界,分布9种,占总种数的14.29%。在中国动物地理区划中的分布型计17式。其中华南区区系型所占种数最多,分布16种,占总种数的25.40%;其次为华中区区系型,共计9种,占总种数的14.29%。将跨区种包括在内,华中区分布34种,占总种数的53.97%;其次,华南区分布31种,占总种数的49.21%;再次为西南区,分布20种,占总种数的31.75%。结果表明:中国菱纹叶蝉族昆虫种级水平在世界动物地理区划中以东洋界为主,非洲界、古北界分布为次,澳洲界分布较少,新北界目前仅分布1种。在中国动物地理区划中,以华中区为主,其次华北区、华南区和西南区,蒙新区、东北区分布最少。3.系统发育分析选取圆冠叶蝉族的双斑纹翅叶蝉Nakaharanus bimaculatus Li,1988作为外群,挑选54个关键的形态特征进行编码,采用最大简约法maximum parsimony,使用TNTver.1.1软件,对中国菱纹叶蝉族15属63种构建系统发育树,结果表明:(1)菱纹叶蝉族的单

关键词：半翅目叶蝉菱纹叶蝉族区系分析系统发育

陕北枣区传播枣疯病的叶蝉种类鉴定及虫媒传病的分子基础

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陕北枣区传播枣疯病的叶蝉种类鉴定及虫媒传病的分子基础

作者：陈玉鑫延安大学

学位级别：硕士

枣疯病(Jujube witches’-broom,JWB)是由枣疯病植原体Candidatus phytoplasma ziziphi引起的一种枣树致死性病害。枣疯病不仅限制了陕北枣区红枣产业的健康发展,并对当地脆弱的生境造成了严重威胁。摸清陕北枣区枣疯病的发病现状、鉴... 详细信息

枣疯病(Jujube witches’-broom,JWB)是由枣疯病植原体Candidatus phytoplasma ziziphi引起的一种枣树致死性病害。枣疯病不仅限制了陕北枣区红枣产业的健康发展,并对当地脆弱的生境造成了严重威胁。摸清陕北枣区枣疯病的发病现状、鉴定及监测枣园叶蝉种类及其消长动态规律、筛查携带枣疯病植原体的叶蝉种类及明确枣疯病传播的介体叶蝉是目前亟待解决的难题。本文调查了陕北4县、15个乡镇、60个行政村枣园枣疯病发病情况;调查了枣园主要叶蝉种类及在田间的种群消长动态;以枣疯病植原体16S rDNA为标记,检测了不同叶蝉携带枣疯病植原体的情况。采用原核表达系统异源表达了枣疯病优势膜蛋白(Imp),利用免疫荧光组化定位了枣疯病植原体在染病枣树和叶蝉体内的分布。通过传病试验验证端钩菱纹叶蝉能否传播枣疯病。具体研究结果如下:(1)枣疯病在调查的15个乡镇中均有不同程度的发生,平均发病率为0.17%～33.63%,地理位置上呈现陕北枣区偏南部枣疯病发病重、偏北部发生较轻的特点,陕北枣区枣疯病平均发病率与地理纬度成负相关关系。(2)延川县枣园共鉴定到13种叶蝉,分别为异色对纹叶蝉Zygina discolor Horváth、小绿叶蝉(待定种)Empoasca sp.、镇原树小叶蝉Arboridia zhenyuana Song&Li、斑小叶蝉(待定种)Erythroneura sp.、桃一点叶蝉Singapora shinshana Matsumura、蒙奥小叶蝉Austroasca mitjaevi Dworakowska、白边大叶蝉Kolla paulula Walker、截突长突叶蝉Batracomorphus allionii Turton、端钩菱纹叶蝉Hishimonus hamatus Kuoh、新东方叶蝉Orientus ishidae Matsumura、亨氏普叶蝉Platymetopius henribauti Dlabola、褐背普叶蝉Platymetopius obsoletus Signoret和茶网背叶蝉Reticuluma testacea Kuoh,其中异色对纹叶蝉、斑小叶蝉(待定种)和截突长突叶蝉是优势种类。异色对纹叶蝉有3个明显发生高峰期,世代重叠严重;斑小叶蝉(待定种)在整个监测期均能诱集到成虫,有4个明显的发生高峰期;截突长突叶蝉年发生2代,高峰期在6月下旬和8月下旬。(3)以枣疯病植原体16S rDNA为检测基因,PCR结果表明,异色对纹叶蝉、斑小叶蝉(待定种)、端钩菱纹叶蝉、桃一点叶蝉、茶网背叶蝉、小绿叶蝉(待定种)、新东方叶蝉的携病率较高,分别达86%、86%、82%、68%、56%、55%和50%,截突长突叶蝉和蒙奥小叶蝉携带枣疯病植原体的比例分别为39%和5%,在白边大叶蝉体内未检测到枣疯病植原体。对端钩菱纹叶蝉是否传播枣疯病的问题进行了接病试验验证,发现接入端钩菱纹叶蝉15 d后在4株枣苗叶片中均检测到枣疯病植原体,30 d和45 d时浓度最高,75 d时有2株枣树未检测到植原体。180d之后4株实生苗提前发出嫩枝和嫩芽,出现了花梗延长等枣疯病早期症状,证明了端钩菱纹叶蝉可以传播枣疯病。(4)构建了JWB-Imp/p ET28a(+)原核表达载体,并在220 rpm、37℃、IPTG浓度0.5 m M的培养条件下获得了在上清中表达的融合蛋白,利用Ni-NTA His·Bind Resin纯化树脂对重组JWB-Imp蛋白进行了纯化,采用BCA法对纯化蛋白进行定量,测得纯化蛋白JWB-Imp浓度为1.55 mg/m L。以纯化浓缩后的重组JWB-Imp蛋白为抗原,通过免疫注射成年雄性新西兰大白兔获得了多克隆抗体,抗体效价为1:256000。通过免疫定位试验检测了枣疯病植原体在染病枣树和端钩菱纹叶蝉中的组织分布,结果表明枣疯病植原体存在于端钩菱纹叶蝉唾液腺、肠道、性腺、卵和染病枣树的嫩茎、叶脉和根部。

关键词：枣疯病植原体叶蝉端钩菱纹叶蝉优势膜蛋白免疫荧光标记

轻-中度石漠化地区不同土地利用类型对叶蝉种群结构和动态的影响

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轻-中度石漠化地区不同土地利用类型对叶蝉种群结构和动态的影响

作者：杨霄贵州师范大学

学位级别：硕士

我国是喀斯特地貌分布最广的国家,而贵州省则是我国喀斯特地貌最典型、最集中的地区。喀斯特地貌的岩石以可溶性岩石为主,容易遭受侵蚀导致基岩大面积的出露,在这样的自然条件下,加之人类的不合理利用,导致石漠化不断加剧,生态环境不断... 详细信息

我国是喀斯特地貌分布最广的国家,而贵州省则是我国喀斯特地貌最典型、最集中的地区。喀斯特地貌的岩石以可溶性岩石为主,容易遭受侵蚀导致基岩大面积的出露,在这样的自然条件下,加之人类的不合理利用,导致石漠化不断加剧,生态环境不断恶化,对当地的社会经济发展与建设造成了巨大的阻碍,所以对于生态环境的保护和石漠化的治理刻不容缓。本研究选取轻-中度石漠化典型代表地区——贵州省毕节市七星关区撒拉溪镇冲锋村为研究区,并在区内设置6种不同土地利用类型的样地,包括刺梨林、玫瑰林、李树林、牧草地、桃树林和核桃林,并选取叶蝉作为环境指示生物,于2019年5-10月通过扫网法,进行叶蝉科昆虫标本的采集,利用显微镜、体视镜等对昆虫标本进行鉴定,并使用SPSS20.0和Canoco 5等相关软件对叶蝉科昆虫的物种组成、相似性、多样性和均匀度特征进行了分析。研究结论如下:1、对贵州省毕节市撒拉溪镇冲锋村轻-中度石漠化地区的叶蝉类昆虫进行了分类鉴定。一共采集到叶蝉标本11525头,分属于11亚科52属,其中顶斑叶蝉属Empoascanara Distant和小绿叶蝉属Empoasca Walsh为优势类群。2、对不同土地利用类型的叶蝉类昆虫进行了分类鉴定。其中刺梨林8亚科31属2072头,核桃林8亚科31属1300头,桃树林7亚科29属1543头,玫瑰林6亚科30属1902头,李树林10亚科33属2243头,草地7亚科25属2465头。其个体数量依次为:草地＞李树林＞刺梨林＞玫瑰林＞桃树林＞核桃林,类群数则相差不大,说明在轻-中度石漠化地区,种植草本植物对叶蝉类昆虫的保护和恢复相对木本植物来说更具效果。3、对不同月份内采集的叶蝉进行物种多样性分析,结果发现Shannon-Wiener多样性指数（H’）和Pieluo均匀性指数（J）趋于一致,而Simpson优势度指数（C）总体和Shannon-Wiener多样性指数（H’）、Pieluo均匀性指数（J）相反。具体如下:Shannon-Wiener多样性指数（H’）为10月＞6月＞5月＞7月＞9月＞8月,Pieluo均匀性指数（J）为10月＞5月＞6月＞7月＞9月＞8月,Simpson优势度指数（C）为8月＞9月＞5月＞7月＞6月＞10月。温度较高的6、7、8月份叶蝉的数量远大于温度较低的其他月份,冗余分析结果表明温度和叶蝉数量呈正相关关系,而气压和湿度对叶蝉数量的影响则不明显,说明温度在叶蝉的生长发育过程中起到关键作用。4、对不同样地内采集的叶蝉进行物种多样性分析,结果发现Shannon-Wiener多样性指数（H’）:刺梨林＞草地＞核桃林＞李树林＞桃树林＞玫瑰园,Pieluo均匀性指数（J）则是:草地＞刺梨林＞李树林＞桃树林＞核桃林＞玫瑰园,Simpson优势度指数（C）为:玫瑰园＞李树林＞草地＞刺梨林＞桃树林＞核桃林。5、对不同样地内采集的叶蝉进行相似性分析,结果发现土地利用类型的相似性是叶蝉群类结构相似的基础,核桃林与桃树林均为高大的乔木,与地表植被类型差别明显,因此这两种土地利用类型叶蝉群落结构较为相似。刺梨林和草地则均为较为低矮的草灌木植被类型,因此它们的群落结构较为相似。李树林和玫瑰园之间的植被类型较复杂,杂草相对较多,导致叶蝉类群相似性相对最低。6、结合研究区内轻-中度石漠化背景,为更好的保护生态环境以及叶蝉科昆虫的物种多样性,并且提高当地的经济发展水平,建议采取以下措施:（1）选择刺梨林和草地进行植被恢复,保护叶蝉科昆虫生物多样性;（2）增强居民生态保护意识。

关键词：土地利用类型叶蝉群落结构轻-中度石漠化物种多样性撒拉溪

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叶蝉线粒体基因组全序列结构研究进展

基因组学与应用生物学 2020年第6期39卷 2565-2577页

作者：陈晓晓袁周伟苑晓伟宋月华贵州师范大学喀斯特研究院/国家喀斯特石漠化防治工程技术研究中心贵阳550001

叶蝉种类多,数量大,并且广泛分布于全世界,主要生活在森林和草地上,均以植物为食,对蔬菜、禾谷类等经济植物产生危害。迄今,在NCBI中已收录27种叶蝉线粒体基因组全序列数据。本文概述了叶蝉线粒体基因组全序列的获取过程和分析方法,并... 详细信息

叶蝉种类多,数量大,并且广泛分布于全世界,主要生活在森林和草地上,均以植物为食,对蔬菜、禾谷类等经济植物产生危害。迄今,在NCBI中已收录27种叶蝉线粒体基因组全序列数据。本文概述了叶蝉线粒体基因组全序列的获取过程和分析方法,并且比较了PCR法和NGS在实际测序应用中的优缺点;从开展时间和研究空间两方面梳理了叶蝉线粒体基因组全序列研究现状;分析了27种叶蝉全序列结构的基因重叠、基因偏斜、PCGs基因、密码子使用、RNA基因和A+T富含区的基本特征;总结了叶蝉线粒体基因组在系统发育关系、分类鉴定以及不同地理种群之间的应用;同时基于以上研究,从研究数量、研究体系和研究应用三方面归纳了叶蝉线粒体基因组全序列现阶段研究中的不足,并对今后的研究工作予以展望。

关键词：叶蝉线粒体基因组全序列基因结构系统发育关系

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沼液对葡萄叶蝉及霜霉病的防治效果

农业工程 2022年第5期12卷 126-129页

作者：徐雯琦李文博郭清霖郑云霄陈晓峰中国农业大学烟台研究院山东烟台264670

研究了不同浓度沼液喷施对葡萄叶蝉及葡萄霜霉病的防治效果。田间和温室试验各设6个处理,从葡萄展叶期开始定期喷施不同浓度沼液,开展霜霉病病原菌接种试验和叶蝉危害观察试验。结果表明,不同浓度的沼液喷施对葡萄叶蝉危害防治具有一定... 详细信息

研究了不同浓度沼液喷施对葡萄叶蝉及葡萄霜霉病的防治效果。田间和温室试验各设6个处理,从葡萄展叶期开始定期喷施不同浓度沼液,开展霜霉病病原菌接种试验和叶蝉危害观察试验。结果表明,不同浓度的沼液喷施对葡萄叶蝉危害防治具有一定的效果,与未喷施沼液的T_(0)相比,露地栽培叶蝉危害显著降低,且随着喷施沼液浓度的提高而逐步下降,喷施沼液原液叶蝉危害率为17.40%,防治效果达49.12%;不同浓度的沼液喷施葡萄叶片对不同栽培环境下(露地和温室)葡萄霜霉病均具有防治效果,且喷施80%浓度沼液效果最显著,防治效果分别达58.54%和50.56%。研究结果揭示了沼液在葡萄病虫害防治中的作用,沼液可在葡萄栽培中得到综合利用。

关键词：沼液葡萄叶蝉霜霉病

Bt水稻对飞虱和叶蝉及其卵寄生蜂扩散规律的影响

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浙江大学学报（农业与生命科学版） 2003年第1期29卷 29-33页

作者：陈茂叶恭银胡萃 Tu J Datta S K 浙江大学应用昆虫学研究所浙江杭州310029 国际水稻研究所

研究了Bt水稻两个纯合品系TT9-3和TT9-4在田间对飞虱、叶蝉及其卵寄生蜂扩散规律的影响。结果表明:在Bt稻区与对照(IR72)区间相互扩散的飞虱有白背飞虱(Sogatellafurcifea)、褐飞虱(Nilaparvatalugens);叶蝉有黑尾叶蝉(Nephotetixcincti... 详细信息

研究了Bt水稻两个纯合品系TT9-3和TT9-4在田间对飞虱、叶蝉及其卵寄生蜂扩散规律的影响。结果表明:在Bt稻区与对照(IR72)区间相互扩散的飞虱有白背飞虱(Sogatellafurcifea)、褐飞虱(Nilaparvatalugens);叶蝉有黑尾叶蝉(Nephotetixcincticeps)、白翅叶蝉(Erythroneurasubrufa)和电光叶蝉(Deltpcephalusdorsalis);其中以白背飞虱和黑尾叶蝉为主。扩散数量叶蝉多于飞虱;扩散方向以Bt稻区向对照区扩散为主,其中TT9-3与IR72、TT9-4与IR72间白背飞虱与黑尾叶蝉的扩散量差异均达显著水平(P叶蝉的卵寄生蜂有稻虱缨小蜂(Anagrusspp.)和叶蝉柄翅小蜂(Lynaenonlongicrus),数量上后者多于前者,扩散方向也以Bt稻区向对照区扩散为主。

关键词：扩散规律 Bt水稻飞虱叶蝉卵寄生蜂转基因作物生态安全

黑肩绿盲蝽在寄生植物、飞虱和叶蝉卵上的生长和发育

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中国水稻科学 1996年第4期10卷 220-226页

作者：俞晓平胡萃浙江省农业科学院植物保护研究所浙江农业大学植物保护系国际水稻研究所昆虫植病系

系统地测定了不同寄主卵和寄主植物对稻飞虱重要天敌黑肩绿盲蝽ＣｙｒｔｏｒｈｉｎｕｓｌｉｖｉｄｉｐｅｎｎｉｓＲｅｕｔｅｒ生长和发育的影响。结果表明，在实验室条件下黑肩绿盲蝽能在水稻以及禾本科杂草如稗草Ｅｃｈｉｎｏｃｈｌｏ... 详细信息

系统地测定了不同寄主卵和寄主植物对稻飞虱重要天敌黑肩绿盲蝽ＣｙｒｔｏｒｈｉｎｕｓｌｉｖｉｄｉｐｅｎｎｉｓＲｅｕｔｅｒ生长和发育的影响。结果表明，在实验室条件下黑肩绿盲蝽能在水稻以及禾本科杂草如稗草Ｅｃｈｉｎｏｃｈｌｏａｇｌａｂｒｅｓｃｅｎｓ、千金子Ｌｅｐｔｏｃｈｌｏａｃｈｉｎｅｎｓｉｓ、马唐Ｄｉｇｉｔａｒｉａｃｉｌｉａｒｉｓ和狗牙根Ｃｙｎｏｄｏｎｄａｃｔｙｌｏｎ上生长和繁殖。大田连续采样证实该盲蝽在稻田周围杂草地只能作短暂停留。黑肩绿盲蝽的若虫龄数随寄主卵和寄主植物的变化而变化，表现为５龄、６龄和４龄。水稻和禾本科花穗与飞虱蜜露或蜂蜜的结合可为黑肩绿盲蝽的生长和发育提供重要的营养源。该研究将为黑肩绿盲蝽的自然保护利用提供重要的理论依据。

关键词：黑肩绿盲蝽食物条件生长发育寄主飞虱叶蝉

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叶蝉EST资源的微卫星信息分析

南方农业学报 2013年第4期44卷 558-561页

作者：胡德辉焦晓真桑洪玉邱永福李容柏广西民族大学海洋与生物技术学院南宁530006 广西大学农学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室南宁530005

【目的】分析叶蝉EST序列信息，为其分子标记体系建立、遗传图谱构建及相关致害基因挖掘奠定基础。【方法】利用生物信息学技术对NCBI数据库中的4种叶蝉亚种EST序列进行SSR基序分析与统计，并对筛选出的SSR基序区段进行引物设计，开发出... 详细信息

【目的】分析叶蝉EST序列信息，为其分子标记体系建立、遗传图谱构建及相关致害基因挖掘奠定基础。【方法】利用生物信息学技术对NCBI数据库中的4种叶蝉亚种EST序列进行SSR基序分析与统计，并对筛选出的SSR基序区段进行引物设计，开发出SSR标记。【结果】11044条叶蝉EST序列的总长为5866kb。按照引物筛选设定的参数，筛选获得1946条含有SSR基序的EST序列，占总EST序列的17．6％；其中包含2230个SSR基序并全部获得相应的SSR引物，平均间距为2．63kb。在2～5个核苷酸重复中，3个核苷酸重复为优势基序，占总基序的77．3％，尤以AAT类最丰富，占3个核苷酸重复总数的40．7％；双核苷酸重复中，AG类所占的比例最大，为39．1％。【结论】从叶蝉EST序列中筛选获得2230个SSR引物，以3个核苷酸重复基序所占比重最大。

关键词：叶蝉 EST SSR EST—SSR 引物筛选