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古代dna序列的分析与甄别──兼评恐龙dna研究

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古生物学报 1995年第6期34卷 657-673页

作者：杨洪美国密歇根大学人类遗传学系

从古代生物中获取的古代ＤＮＡ序列为进一步从分子水平上认识古代生命及其演化提供了新的证据。分析和甄别古代ＤＮＡ序列是古代ＤＮＡ研究的关键步骤之一。本文着重讨论甄别古代ＤＮＡ序列的主要标准如：野外取样与实验室控制、ＤＮＡ... 详细信息

从古代生物中获取的古代ＤＮＡ序列为进一步从分子水平上认识古代生命及其演化提供了新的证据。分析和甄别古代ＤＮＡ序列是古代ＤＮＡ研究的关键步骤之一。本文着重讨论甄别古代ＤＮＡ序列的主要标准如：野外取样与实验室控制、ＤＮＡ“行为”分析、系统发育验证和实验结果的可重复性，并在此基础上评述近期发表的有关恐龙ＤＮＡ的研究。安成才等（１９９５）发表了６条来自一枚恐龙蛋化石中的１８ＳｒＤＮＡ序列，但未做进一步的系统发育研究。本文按１８ＳＲＮＡ分子的二级结构模式对已发表的恐龙蛋ＤＮＡ序列与现生生物各类群代表的１８ＳｒＤＮＡ序列进行了重新对位排列并做了系统发育分析。所获结果表明原文中的两组１８ＳｒＤＮＡ序列分别来自于至少两种不同的生物，它们在系统树上的位置均不在脊椎动物分支之内，其中一组序列同现生的高等植物呈姊妹群关系。

关键词：古代dna 序列甄别恐龙蛋 dna

古代dna技术及其在家养动物驯化历史研究中的应用

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科学通报 2011年第7期56卷 511-516页

作者：刘冉冉李宁中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 中国农业大学农业生物技术国家重点实验室北京100193

家养动物始终伴随着人类文明的发生、发展,其起源和驯化历史一直备受关注.而在其近万年的演化历史中,家养和野生群体间可能发生基因互渗及替代,因此基于现代物种dna信息进行的历史推断可能存在偏差.近年来,古代生物遗骸中的dna(古代dna... 详细信息

家养动物始终伴随着人类文明的发生、发展,其起源和驯化历史一直备受关注.而在其近万年的演化历史中,家养和野生群体间可能发生基因互渗及替代,因此基于现代物种dna信息进行的历史推断可能存在偏差.近年来,古代生物遗骸中的dna(古代dna)获取技术日益成熟,为这类研究开辟了新的途径.本文总结了近年来古代dna技术研究进展,点评了古代生物遗骸dna的获取和鉴别方法、古代dna提取、扩增及测序技术的革新.最后,本文综述了古代dna技术在猪、马、羊、狗等主要家养动物驯化历史研究中的应用进展,为该技术的进一步发展及应用提供有益的参考.

关键词：古代dna 家养动物驯化历史

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古代dna研究中污染的控制和识别

人类学学报 2003年第2期22卷 163-173页

作者：杨东亚加拿大SimonFraserUniversity考古系

现代分子生物学中PCR技术的发展使得直接分析古代动植物和人类材料中的dna成为可能 ,这为考古学、人类学和古生物学提供了一种新的研究手段。但由于PCR技术的高度敏感性和古代dna含量的极其微量性 ,古代dna研究也极易受现代dna污染。如... 详细信息

现代分子生物学中PCR技术的发展使得直接分析古代动植物和人类材料中的dna成为可能 ,这为考古学、人类学和古生物学提供了一种新的研究手段。但由于PCR技术的高度敏感性和古代dna含量的极其微量性 ,古代dna研究也极易受现代dna污染。如何甄别所获得的dna是真实的古代dna而不是污染的现代dna是所有古代dna研究工作者都要面临的挑战 ,污染的控制和识别也因此成为古代dna研究中一个至关重要的问题。

关键词：古代dna PCR 考古学人类学污染dna 污染控制污染识别

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古代dna研究实验技术

遗传 2002年第5期24卷 551-554页

作者：杨淑娟赖旭龙唐先华盛桂莲中国地质大学地球科学学院武汉430074

现代分子生物技术的发展,使从古代样品中获取微量dna成为现实。在过去的十多年里,古dna研究取得了重大进展,但实验方案还需要加以改进,其结果的分析与推论也需要多方面的验证。本综述着重介绍了古dna研究的实验技术及可靠性分析。

关键词：古代dna 实验技术古代样品可靠性

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古代dna技术的历史与应用

吉林师范大学学报（自然科学版） 2007年第3期28卷 61-64页

作者：于长春吉林师范大学生命科学学院吉林四平136000

古代dna是指从考古学遗存或博物馆标本中得到的dna.古代dna技术则是以分子生物学的研究方法和技术为基础,由分子生物学、考古学、人类学及古生物学等交叉产生的一个新的研究领域.本文综述了古代dna技术的研究历史与应用现状.

关键词：古代dna PCR 系统发育树人类起源

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古代dna研究

三峡大学学报（人文社会科学版） 1998年第1期21卷 103-107页

作者：蔡胜和吴东颖国家遗传医学中心北京100005

古代dna的研究有助于了解生物的起源、进化和迁徒，可以为多学科提供可靠的。有价值的分子信息．本文就古代dna样品的种类来源、提取程序及PCR技术在古代dna研究中的应用作了详细的概述．同时还介绍了影响古代dna研究可靠性的一些因素... 详细信息

古代dna的研究有助于了解生物的起源、进化和迁徒，可以为多学科提供可靠的。有价值的分子信息．本文就古代dna样品的种类来源、提取程序及PCR技术在古代dna研究中的应用作了详细的概述．同时还介绍了影响古代dna研究可靠性的一些因素及预防措施．

关键词：古代dna 提取 PCR

新疆克里雅河下游圆沙古城古代居民线粒体dna多态性研究

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中国科学（C辑） 2008年第2期38卷 136-146页

作者：高诗珠崔银秋杨亦代段然慧伊弟利斯.阿不都热苏勒朱泓周慧吉林大学边疆考古研究中心考古dna实验室新疆文物考古研究所乌鲁木齐830011

圆沙古城位于新疆塔克拉玛干沙漠的中心地区,地处古丝绸之路的南线.本实验以距今2000～2500年前的圆沙古城15例古代居民的线粒体dna(mtdna)为研究对象.系统发育及多维度分析结果表明圆沙古城古代人群与现代中亚南部人群、印度河流域人... 详细信息

圆沙古城位于新疆塔克拉玛干沙漠的中心地区,地处古丝绸之路的南线.本实验以距今2000～2500年前的圆沙古城15例古代居民的线粒体dna(mtdna)为研究对象.系统发育及多维度分析结果表明圆沙古城古代人群与现代中亚南部人群、印度河流域人群以及新疆察吾呼古代人群间存在着相对较近的遗传距离.

关键词：圆沙古城古代dna mtdna 新疆中亚

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利用mtdna信息分析陶寺古牛的起源驯化

农业生物技术学报 2025年第1期 92-103页

作者：张兴杨柳侯凌云凌飞向海赵兴波华南理工大学生物科学与工程学院佛山大学动物科技学院/广东省动物分子设计与精准育种重点实验室中国农业大学动物科学技术学院/畜禽生物育种全国重点实验室

作为最重要的家畜之一，普通牛（Bos taurus）在中国的起源和传播模式受到广泛关注。本研究收集了来自黄河中游3个考古遗址的9个古代牛遗骸，提取古dna进行PCR测序和系统发生分析，以探索中国家养牛的起源和传播。经2轮PCR实验获得4个... 详细信息

作为最重要的家畜之一，普通牛（Bos taurus）在中国的起源和传播模式受到广泛关注。本研究收集了来自黄河中游3个考古遗址的9个古代牛遗骸，提取古dna进行PCR测序和系统发生分析，以探索中国家养牛的起源和传播。经2轮PCR实验获得4个陶寺（距今4100年前）古牛527 bp的线粒体dna（mitochondrial dna, mtdna）序列。单倍型划分结果显示，陶寺古牛存在4种单倍型，都属于家养普通牛T3和T4单倍群，证实中国普通牛起源于近东地区，4 100年前就已经被华北人群利用。此外，陶寺遗址丰富的单倍型数量提示陶寺遗址古代牛群体具有较高的母系遗传多样性。群体间遗传分化指数FST（Fstatistics）分析和Median-Joining网络图表明，中国古代牛与现代东亚(FST=0.0164)及中国普通牛(FST=0.0066)均有密切的遗传关系，提示陶寺遗址古代牛群体可能是现代东亚和中国普通牛的重要母系祖先群体之一。本研究为解析我国的家牛起源和传播提供了分子遗传证据。

关键词：古代dna 陶寺遗址普通牛起源

山羊P2RY12-P2RY13单倍型渗入鉴定及其功能分析

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家畜生态学报 2024年第1期45卷 9-15页

作者：刘晓懿蔡钰东郑惠玲姜雨西北农林科技大学动物科技学院陕西杨凌712100

基因渗入对动物的驯化以及适应性的提高起到了至关重要的作用。该研究收集了世界范围内共163只现代家山羊、81只古代家山羊以及69只山羊野生近缘种的基因组数据,进行全基因组遗传变异检测、构建Neighbor-joining树、单倍型网络图以及蛋... 详细信息

基因渗入对动物的驯化以及适应性的提高起到了至关重要的作用。该研究收集了世界范围内共163只现代家山羊、81只古代家山羊以及69只山羊野生近缘种的基因组数据,进行全基因组遗传变异检测、构建Neighbor-joining树、单倍型网络图以及蛋白质结构预测。我们发现家山羊基因组chr1:116312 kb~116397 kb区域内存在来自阿尔卑斯北山羊或伊比利亚北山羊的渗入。这段长达85 kb的渗入单倍型包含2个与乳腺炎相关的蛋白编码基因P2RY12和P2RY13,其中P2RY12基因上来自渗入单倍型的变异Pro317Ser导致了蛋白质末端α-螺旋的增长,该渗入单倍型主要存在于欧洲和非洲的现代家山羊群体中,频率分别为52.1%和32.1%。通过对古代样本进行分析,推测该单倍型的渗入最早发生于3000 a前的欧洲地区,可能由于对泌乳性状的选择而导致其频率升高并扩散至非洲地区。该研究为家山羊基因组中P2RY12-P2RY13单倍型的来源与功能提供了新的见解。

关键词：山羊渗入基因组古代dna