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酸奶发酵剂双组分信号转导系统研究进展

食品与发酵工业 2022年第17期48卷 298-303页

作者：芦隐月宋馨夏永军王光强艾连中熊智强上海理工大学健康科学与工程学院上海食品微生物工程研究中心上海200093

酸奶发酵剂是由多种乳酸菌复配用于酸奶发酵生产的微生物材料,主要菌种为保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌。双组分信号转导系统(two-component signal transduction system, TCS)是细菌中常见的信号机制,经典TCS由跨膜受体组氨酸蛋白激酶和... 详细信息

酸奶发酵剂是由多种乳酸菌复配用于酸奶发酵生产的微生物材料,主要菌种为保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌。双组分信号转导系统(two-component signal transduction system, TCS)是细菌中常见的信号机制,经典TCS由跨膜受体组氨酸蛋白激酶和同源胞质内应答调控蛋白组成,使得细菌能够感知和响应外界环境刺激并且调控自身生理生化过程。与大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和天蓝色链霉菌等模式细菌相比,乳酸菌TCS研究相对滞后,缺乏系统阐明其响应和调控机制。该文总结酸奶发酵剂中保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌TCS近年来研究进展,以期为乳酸菌TCS解析和酸奶工业化生产控制提供帮助。

关键词：酸奶发酵剂乳酸菌双组分信号转导系统保加利亚乳杆菌嗜热链球菌

假单胞菌属双组分信号转导系统调控吩嗪生物合成研究进展

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微生物学通报 2022年第1期49卷 352-362页

作者：邱薇刘磊康杰叶泽铭葛菁萍黑龙江大学农业微生物技术教育工程研究中心黑龙江哈尔滨150500 黑龙江大学生命科学学院微生物省高校重点实验室黑龙江哈尔滨150080

吩嗪是由假单胞菌或链霉菌产生的一类具有抗菌、抗肿瘤和抗寄生虫活性的含氮杂环代谢物,在农业和医疗领域具有广泛的应用。但吩嗪的合成受到复杂的级联网络调控。本文总结了假单胞菌属中双组分信号转导系统(two-component signal transd... 详细信息

吩嗪是由假单胞菌或链霉菌产生的一类具有抗菌、抗肿瘤和抗寄生虫活性的含氮杂环代谢物,在农业和医疗领域具有广泛的应用。但吩嗪的合成受到复杂的级联网络调控。本文总结了假单胞菌属中双组分信号转导系统(two-component signal transduction system,TCS)对吩嗪生物合成的调控机制,阐明在双组分信号转导系统的控制下小RNA(small RNA)和群体感应(quorum sensing)对吩嗪生物合成的影响,为假单胞菌属调控吩嗪合成级联网络的进一步研究提供参考。

关键词：假单胞菌属吩嗪双组分信号转导系统群体感应小RNA

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嗜酸乳杆菌群双组分信号转导系统

哈尔滨工业大学学报 2009年第4期41卷 104-110页

作者：崔艳华马莺哈尔滨工业大学食品科学与工程学院哈尔滨150090

为明确Lactobacillus acidophilus菌群中的双组分信号转导系统的分布及功能，采用HMMER、SMART、TMHMM、ClustalW等生物信息学手段对***菌群中全基因组进行扫描，对其中的双组分信号转导系统进行预测，并进行结构分析及功能预测.结果表... 详细信息

为明确Lactobacillus acidophilus菌群中的双组分信号转导系统的分布及功能，采用HMMER、SMART、TMHMM、ClustalW等生物信息学手段对***菌群中全基因组进行扫描，对其中的双组分信号转导系统进行预测，并进行结构分析及功能预测.结果表明，***菌群中具有5-9个双组分信号转导系统，其中部分TCS系统调控细菌的耐酸、耐胆汁能力及细菌素分泌等益生功能密切相关的性能.

关键词：嗜酸乳杆菌群双组分信号转导系统组氨酸蛋白激酶应答调节蛋白生物信息学分析

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嗜酸硫杆菌双组分信号转导系统多样性分析

中国环境科学 2015年第7期35卷 2146-2152页

作者：余水静彭涛周丹潘涛董伟陈江安邱廷省江西理工大学资源与环境工程学院江西赣州341000 江西理工大学江西省矿冶环境污染控制重点实验室江西赣州341000 江西理工大学江西省矿业工程重点实验室江西赣州341000

为探索嗜酸硫杆菌（Acidithiobacillus）对极端矿山环境条件感知和反应分子机制的差异,利用生物信息学方法鉴定和分析了两株嗜酸氧化亚铁硫杆菌、一株喜温嗜酸硫杆菌和一株耐冷嗜酸硫杆菌的双组分信号转导系统（TCS）结构多样性特征.结... 详细信息

为探索嗜酸硫杆菌（Acidithiobacillus）对极端矿山环境条件感知和反应分子机制的差异,利用生物信息学方法鉴定和分析了两株嗜酸氧化亚铁硫杆菌、一株喜温嗜酸硫杆菌和一株耐冷嗜酸硫杆菌的双组分信号转导系统（TCS）结构多样性特征.结果表明,4株嗜酸硫杆菌拥有27~38个TCS蛋白,聚类分析显示有16组配对的TCS族、4组孤儿组氨酸蛋白激酶（HK）和9组孤儿反应调节蛋白（RR）,与其进化分支有较好的相关性;其中9个配对和5个不配对的TCS蛋白族为嗜酸硫杆菌菌株所共有,其余特有TCS均在一个或几个菌株中缺失.嗜酸硫杆菌菌株共有的TCS功能涉及氮素固定及代谢调节、柠檬酸/苹果酸代谢调节等,特有TCS功能涉及如趋化性调控、重金属响应、铜抗性调控等,这可能有助于菌株在极端矿山环境中生存.

关键词：嗜酸硫杆菌双组分信号转导系统多样性分析

水产品荧光假单胞菌双组分信号转导系统的序列分析和功能预测

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食品科学 2021年第22期42卷 178-184页

作者：李秋莹徐瑾秀张婧阳孙彤励建荣渤海大学食品科学与工程学院生鲜农产品贮藏加工及安全控制技术国家地方联合工程研究中心辽宁锦州121013

为研究双组分信号转导系统(two-component signal transduction system,TCS)在水产品优势腐败菌荧光假单胞菌生长繁殖和环境适应过程中的作用,利用生物信息学方法对水产品荧光假单胞菌PF08的TCS进行序列分析和功能预测。结果表明:荧光... 详细信息

为研究双组分信号转导系统(two-component signal transduction system,TCS)在水产品优势腐败菌荧光假单胞菌生长繁殖和环境适应过程中的作用,利用生物信息学方法对水产品荧光假单胞菌PF08的TCS进行序列分析和功能预测。结果表明:荧光假单胞菌PF08中存在63个组氨酸激酶、84个应答调节蛋白、39个成对TCS、25个融合组氨酸激酶;该菌株中所有的组氨酸激酶均具有HATPase_c和HisKA结构域,所有应答调节蛋白均具有REC结构域;系统发生树结果表明具有相同结构域的TCS多聚于同一聚簇,其可能具有相近的功能;该菌株39对TCS有25对的生物学功能得到预测,其主要参与调控荧光假单胞菌PF08的营养元素代谢、生物体内物质运输、细胞形态分化、应对不利环境及细胞抗性和毒力等。该研究结果为进一步阐明TCS在水产品荧光假单胞菌PF08菌株环境适应过程中的功能提供一定参考。

关键词：水产品荧光假单胞菌双组分信号转导系统序列分析功能预测

表皮葡萄球菌双组分信号转导系统arlS基因生物学功能研究

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中华微生物学和免疫学杂志 2007年第10期27卷 946-953页

作者：王家学朱涛娄强吴旸韩聪瞿涤复旦大学上海医学院生物医学研究院病原生物学研究所教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室200032

目的探讨表皮葡萄球菌arlS/R双组分信号转导系统(two-component signal transduction system,TCS)的组氨酸激酶arlS基因删除对细菌生物学的影响。方法构建含有红霉素抗性基因(ermB)的pBT2-△arlS质粒,随后将电转入表皮葡萄球菌1457的重... 详细信息

目的探讨表皮葡萄球菌arlS/R双组分信号转导系统(two-component signal transduction system,TCS)的组氨酸激酶arlS基因删除对细菌生物学的影响。方法构建含有红霉素抗性基因(ermB)的pBT2-△arlS质粒,随后将电转入表皮葡萄球菌1457的重组质粒在43℃条件下振摇培养,筛选表皮葡萄球菌1457菌株的arlS缺失突变株(SE1457-△arlS);采用微量板半定量方法检测arlS删除突变对细菌生物被膜形成的影响,通过检测A595值观察其生长曲线,检测过夜培养上清液对菌细胞裂解的活性,并用0.1%TritonX-100诱导细菌自溶的方法检测SE1457-△arlS突变株的自溶情况。结果成功构建pBT2-△arlS质粒,利用同源重组基因删除的方法表皮葡萄球菌1457 arlS基因被删除。△arlS突变株与野生株的生长曲线基本相似,提示arlS基因删除对细菌的增殖无明显影响,但SE1457-△arlS突变株形成生物被膜的能力明显低于野生株,降低90.96%;在0.1%Triton X-100诱导下SE1457-△arlS基因删除突变株的裂解率为97.83%,野生株为55.38%;而△arlS突变株过夜培养上清液对靶细菌裂解的活性则低于野生株,其裂解率为20.50%,野生株为56.12%。结论表皮葡萄球菌arlS/R双组分信号转导系统arlS基因可调控细菌生物被膜形成、菌细胞自溶以及胞外细菌裂解酶的活性。

关键词：表皮葡萄球菌双组分信号转导系统 arLS基因

牙龈卟啉单胞菌双组分信号转导系统的研究进展

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华西口腔医学杂志 2021年第1期39卷 88-93页

作者：尧可蔡靖仪赵蕾吴亚菲赵志河申道南口腔疾病研究国家重点实验室国家口腔疾病临床医学研究中心四川大学华西口腔医院成都610041

牙龈卟啉单胞菌被认为是主要的牙周致病菌之一,与慢性牙周炎发生发展密切相关。面对复杂的口腔环境,牙龈卟啉单胞菌必须及时感知环境变化并作出反应,双组分信号转导系统在其中具有重要作用。双组分信号转导系统通常由组氨酸激酶和反应... 详细信息

牙龈卟啉单胞菌被认为是主要的牙周致病菌之一,与慢性牙周炎发生发展密切相关。面对复杂的口腔环境,牙龈卟啉单胞菌必须及时感知环境变化并作出反应,双组分信号转导系统在其中具有重要作用。双组分信号转导系统通常由组氨酸激酶和反应调节蛋白组成,通过控制蛋白的磷酸化状态调节信号传导。近年来,有关牙龈卟啉单胞菌的双组分信号转导系统陆续被报道。本文就牙龈卟啉单胞菌的双组分系统的组成和功能进行综述。

关键词：牙龈卟啉单胞菌双组分信号转导系统基因调控

野油菜黄单胞菌Xcc 8004双组分信号转导系统基因及其蛋白架构分析

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植物病理学报 2015年第2期45卷 139-150页

作者：潘俊霞付珊姚任之唐学慧何勇强姜伟广西大学生命科学与技术学院南宁530004 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室南宁530004

Xanthomonas campestris ***(Xcc 8004)是一个拥有复杂代谢循环的革兰氏阴性植物病原菌,它能侵染几乎所有的十字花科植物引起黑腐病。基因注释表明,该基因组存在大量编码双组分信号转导系统的基因,本研究利用生物信息学方法鉴定编码双... 详细信息

Xanthomonas campestris ***(Xcc 8004)是一个拥有复杂代谢循环的革兰氏阴性植物病原菌,它能侵染几乎所有的十字花科植物引起黑腐病。基因注释表明,该基因组存在大量编码双组分信号转导系统的基因,本研究利用生物信息学方法鉴定编码双组分信号转导系统感受蛋白和响应调控蛋白基因,结果表明,Xcc 8004共有111个双组分信号转导系统基因,55个感受基因中的30个与响应调控基因成对存在,很有可能组成一个双组分信号转导系统,25个感受基因和26个响应调控基因独立存在于基因组中。另外,还发现3个HKs和2个RRs未被注释。本文拟通过分析双组分信号转导系统基因及其编码蛋白的功能域架构,为Xcc 8004双组分调控系统的功能研究和防治病害提供参考。

关键词：十字花科黑腐病菌生物信息学双组分信号转导系统功能域架构

表皮葡萄球菌双组分信号转导系统saeRS对相关蛋白调控的研究

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西安交通大学学报（医学版） 2012年第6期33卷 680-684页

作者：娄强王艳歌瞿涤河南大学医学院细胞与分子免疫学实验室河南开封475004 河南大学医学院细胞生物学教研室河南开封475004 复旦大学上海医学院教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室上海200032

目的利用双向电泳技术对表皮葡萄球菌菌体蛋白进行蛋白质组学分析,寻找双组分信号转导系统saeRS的调控网络。方法对表皮葡萄球菌1457双组分信号转导系统saeRS删除株与野生株菌体蛋白进行双向电泳差异比较;电泳图谱采用Image Master 2DPl... 详细信息

目的利用双向电泳技术对表皮葡萄球菌菌体蛋白进行蛋白质组学分析,寻找双组分信号转导系统saeRS的调控网络。方法对表皮葡萄球菌1457双组分信号转导系统saeRS删除株与野生株菌体蛋白进行双向电泳差异比较;电泳图谱采用Image Master 2DPlatinum软件分析;免疫印迹法验证saeRS调控的差异蛋白。结果在表皮葡萄球菌1457双组分信号转导系统saeRS删除株与野生株蛋白质图谱中共发现23个差异表达的蛋白点(10个下调,13个上调)。结论蛋白质双向电泳技术可以成功应用于分析表皮葡萄球菌双组分信号转导系统saeRS的调控网络;此图谱为进一步研究saeRS在表皮葡萄球菌中的调控机制奠定了基础。

关键词：表皮葡萄球菌双组分信号转导系统 saeRS 蛋白质组双向电泳