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淹水时间对水稻土中厌氧粘细菌群落结构的影响

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农业生物技术学报 2011年第5期19卷 793-800页

作者：夏淑红由焦化王保莉曲东西北农林科技大学生命科学学院西北农林科技大学资源环境学院

通过模拟水稻土淹水过程,分析厌氧粘细菌(Anaeromyxobacter)群落结构随淹水时间的动态变化特征,揭示其群落结构变化与微生物Fe(Ⅲ)还原的内在联系。水稻土样品分别淹水处理1h、1d、5d、10d、20d和30d,采用PCR-RFLP方法分析厌氧粘细菌的... 详细信息

通过模拟水稻土淹水过程,分析厌氧粘细菌(Anaeromyxobacter)群落结构随淹水时间的动态变化特征,揭示其群落结构变化与微生物Fe(Ⅲ)还原的内在联系。水稻土样品分别淹水处理1h、1d、5d、10d、20d和30d,采用PCR-RFLP方法分析厌氧粘细菌的群落结构的动态变化特征。测序序列提交NCBI,获得序列登录号为JF430083JF4301440。应用厌氧泥浆培养方法,测定水稻土中Fe(Ⅲ)还原量变化。结果表明,在淹水不同时间处理中α多样性指数存在明显差异,淹水20d处理的多样性最高,而10d处理的最小。不同淹水时间处理共产生了11种优势类型(P1P11),基于16SrRNA基因的系统发育分析将其分为3组。Group1和Group2分别包括5种优势类型均隶属于具有异化铁还原功能的厌氧粘细菌,其中P1优势类型在这两组中均存在。Group3与其他两组关系较远。不同淹水时期的水稻土中,厌氧粘细菌的群落结构发生着动态演替变化,其中Group1不仅与淹水前期的水铁矿还原有关,而且在淹水后期也与土壤中针铁矿还原能力密切相关。为进一步阐明厌氧粘细菌在土壤中的环境功能提供理论依据。

关键词：水稻土厌氧培养厌氧粘细菌群落结构 PCR-RFLP

具有厌氧分解原油能力的一株Microbacterium 91A

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大庆石油学院学报 1993年第4期17卷 53-56页

作者：刘春德江伯英邱琴王德民王祖农大庆石油学院开发系山东大学大庆石油管理局

从大庆油田油井产出油水混合物中分离到一株Microbacterium 91A。该菌株为革兰氏阳性,不形成芽孢的好氧菌。它能在72℃牛奶中存活18min,并不能还原硝酸盐。在以刃天青作为氧化还原电位指示剂的严格厌氧条件下,菌株Microbacterium 91A生... 详细信息

从大庆油田油井产出油水混合物中分离到一株Microbacterium 91A。该菌株为革兰氏阳性,不形成芽孢的好氧菌。它能在72℃牛奶中存活18min,并不能还原硝酸盐。在以刃天青作为氧化还原电位指示剂的严格厌氧条件下,菌株Microbacterium 91A生长在含有0.04% Tween 80的无机盐培养基中,分别以大庆原油和正壬烷作为唯一碳源,40℃接床培养25天,用气相色谱和质谱检测到了代谢产物4-甲基-2.6-二特丁基苯酚的存在。

关键词：微生物培养基厌氧培养原油

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厌氧条件下水稻土中铁还原对砷形态的影响

厌氧条件下水稻土中铁还原对砷形态的影响

作者：李荣华西北农林科技大学

学位级别：硕士

水稻土中铁的微生物还原过程在土壤环境化学方面具有特殊的意义。氧化铁作为电子受体不仅可以促进水稻土中变价元素的形态转化,还影响其生物有效性。通过添加变价元素,一方面可以影响土壤的氧化还原电位,另一方面也改变土壤中电子供体/... 详细信息

水稻土中铁的微生物还原过程在土壤环境化学方面具有特殊的意义。氧化铁作为电子受体不仅可以促进水稻土中变价元素的形态转化,还影响其生物有效性。通过添加变价元素,一方面可以影响土壤的氧化还原电位,另一方面也改变土壤中电子供体/受体的比例,影响土壤中电子传递的流向。而且含铁氧化物具有较高的表面活性,可以通过吸附沉淀影响污染物在土壤中的存在形态和迁移能力。利用这种特征,可以作为消除或减少土壤污染物的有效途径。本研究以4 省份的典型水稻土为供试样品,通过室内恒温厌氧培养试验,研究了厌氧水稻土中有效As 的浸提和不同价态As 的测定方法;通过向水稻土中添加As(III)、As(V),研究了厌氧培养对水稻土中As 形态的影响;通过水稻土中添加SO42-、NO3-对Fe-As 体系的影响试验,研究了不同电子受体对土壤中铁还原和As(III)的影响。实验获得以下主要结果: 1.4 种供试的水稻土中水溶性砷含量极少,在供试的4 种水稻土中全砷转化成水溶性砷的百分率均低于4%,有效砷含量因土壤种类不同而异。以1.0 mol/L HCl作浸提剂能较好地表征土壤砷的有效性,是测定土壤有效态砷的一种良好的浸提剂。有效砷的浸提时间应该以60min 为宜。 2.选择蠕动注射方法添加还原剂KBH4—NaOH 溶液,通过控制样品溶液pH,对As(III)和As(V)进行了分步还原,用硝酸银-聚乙烯醇-乙醇溶液作吸收液来吸收还原生成的AsH3,用分光光度法在400nm 波长下测定吸收液的吸光度,求算出As (III)和As (V)的含量。在对模拟砷污染水样和厌氧水稻土中As (III)和As (V)的测中,砷质量浓度在0.5mg/L 时,吸光度和砷质量浓度之间符合朗伯-比尔定律,标准溶液的测定相对误差为-3.60%.20%,检测限为0.6μg;环境水样测定的As 回收率为97.14%03.4%,与Ag-DDC 标准方法比较无显著差异。水稻土中总砷和As(III)的回收率分别为98.36%02.8%及56.02%5.34%。 3.向水稻土中添加As(III)后,在厌氧培养10d 前As(III)可以促进铁还原。厌氧培养10d 左右的As(III)浓度为最低。由于氧化剂的耗竭,As(III)的氧化过程终结,随之而来的是As(V)的还原过程启动,引起As(III)浓度的逐渐增加。 4.　在水稻土中添加As(V),可导致Fe(II)生成量的“滞后”,产生滞后的原因是是由于As(V)对Fe(II)的氧化消耗所致,此过程将是As(V)还原的驱动力。同样,铁还原平衡与As(V)还原平衡的时间也有一致性。

关键词：水稻土厌氧培养铁还原 As(III,V) 形态

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双季稻区厌氧纤维分解菌的分离与筛选

江苏农业科学 2005年第5期33卷 112-114页

作者：刘金胜廖晓兰黄璜湖南农业大学生物安全科技学院湖南长沙410128 湖南农业大学农学院湖南长沙410128

在严格的厌氧条件下,从水牛粪便和胃残渣中共分离了230个标样,得到1150个菌株。通过对这些菌株降解滤纸速度的观察,筛选出了3株纤维素分解能力较强的细菌。其中以301菌株能力最强,将1ml1.7×103cfu/ml菌液加入到含有滤纸的9ml2号培养液... 详细信息

在严格的厌氧条件下,从水牛粪便和胃残渣中共分离了230个标样,得到1150个菌株。通过对这些菌株降解滤纸速度的观察,筛选出了3株纤维素分解能力较强的细菌。其中以301菌株能力最强,将1ml1.7×103cfu/ml菌液加入到含有滤纸的9ml2号培养液中培养,分解50%粗滤纸只需3d,全部分解只需7d。通过JSM-6360电镜4×104倍放大观察,此细菌为圆椭圆形,直径为225nm左右。此外,对301菌株在不同培养液、不同pH值等培养条件下分解纤维素的能力进行了初步研究。

关键词：厌氧培养纤维素分解菌分离

厌氧纤维分解菌的分离、筛选及与农药相关性研究

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厌氧纤维分解菌的分离、筛选及与农药相关性研究

作者：刘金胜湖南农业大学

学位级别：硕士

在严格的厌氧条件下,从双季稻区水牛的粪便和胃残渣中共分离了230个标样,得到1150个菌株。通过对这些菌株降解滤纸速度的观察,筛选出了3株纤维素分解能力较强的细菌。其中以301号菌株分解纤维素能力最强,将1.7×10～3cfu/mL的菌液1mL加... 详细信息

在严格的厌氧条件下,从双季稻区水牛的粪便和胃残渣中共分离了230个标样,得到1150个菌株。通过对这些菌株降解滤纸速度的观察,筛选出了3株纤维素分解能力较强的细菌。其中以301号菌株分解纤维素能力最强,将1.7×10～3cfu/mL的菌液1mL加入到含有滤纸的9mL的2号培养液中培养,分解粗滤纸50%只需3d,而使其全部分解也只需7d。通过JSM-6360电镜4×10～4倍放大观察此细菌为圆椭圆形,其直径为225nm左右。初步测定301号菌株的最佳培养条件和培养方法为:在37℃厌氧条件下,301号菌株最佳培养液为2号培养液,最佳培养时间是7d,最佳pH值是7.5。取301号菌株取1ml菌液(1.7×10～3cfu/mL)加入到含有滤纸条和不同浓度的9ml含农药培养液中培养,观察菌株降解滤纸速度,农药在低浓度(0.1mg/L、0.2mg/L)下对厌氧纤维分解菌降解纤维素的活力影响不大。除草剂(苄嘧磺隆和丁草胺)在低浓度下甚至对其活力有一定的促进作用。而在高浓度(0.4mg/L、0.8mg/L、1.6mg/L)下杀菌剂(井冈霉素和稻瘟清)几乎能完全抑制厌氧纤维分解菌的活性;杀虫剂(三唑磷和杀虫双)对其也有明显的抑制作用;而除草剂对厌氧纤维分解菌的活力几乎无影响。对301菌株酶活力进行测定,以微晶纤维素作底物酶活力最高,滤纸作底物酶活力次之,CMC(羧甲基纤维素钠)作底物酶活力相对较低。同时,其产酶高峰期在第4d至第7d,其中以第7d最高,在第8d开始下降。测定301菌株对稻草叶、稻草杆和滤纸降解活性,其降解稻草叶、稻草杆和滤纸活性较高,其中又以降解滤纸速度最快。放入试管中培养前后称其干重,3d降解了56.33%,7d降解了97.00%;稻草叶次之,3d降解了20.98%,7d降解了65.90%:相对而言,稻草杆较慢3d降解了6.99%,7d降解了26.19%。

关键词：厌氧培养纤维分解菌分离农药稻草酶活降解

亚热带土壤反硝化过程中NO_3^--N对CH_4排放的影响

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环境科学 2008年第12期29卷 3513-3519页

作者：续勇波蔡祖聪雷宝坤云南农业大学烟草学院昆明650201 中国科学院南京土壤研究所土壤与农业可持续发展国家重点实验室南京210008 云南大学生命科学学院昆明650091 云南省农业科学院农业环境资源研究所昆明650205

研究了发育于不同成土母质和不同土地利用方式下的45个亚热带土壤样本,在反硝化严格厌氧培养条件下(密闭、淹水、充N2),加入KNO3的处理(加入N量为200 ***-1)和不加KNO3的空白对照对CH4产生和排放的影响.结果表明,厌氧培养条件下无论加入... 详细信息

研究了发育于不同成土母质和不同土地利用方式下的45个亚热带土壤样本,在反硝化严格厌氧培养条件下(密闭、淹水、充N2),加入KNO3的处理(加入N量为200 ***-1)和不加KNO3的空白对照对CH4产生和排放的影响.结果表明,厌氧培养条件下无论加入KNO3与否,CH4的产生和排放首先取决于土壤有机碳总量水平及其有效性.对照土壤中花岗岩母质发育的土壤和KNO3处理土壤中稻田利用方式下的土壤CH4排放量最高.加入KNO3显著抑制了CH4的产生和排放,NO3--N对CH4产生的抑制效应可能较N2O对CH4产生的抑制效应更大.加入KNO3处理中厌氧培养第1周内的NO3--反硝化量和降低速率是决定CH4排放量的关键因素.不加KNO3的对照土壤中,73%的土样表现为Fe2+的产生和CH4的排放之间呈指数关系增长,表明Fe3+和CO2的还原可同步进行.NO3--N不仅显著抑制了CH4的产生和排放,也抑制了Fe3+的还原.

关键词：反硝化 CH4 NO3^--N 土壤性质厌氧培养 Fe^2+ 红壤

体外发酵条件下牛肉和鸡肉蛋白对人粪便微生物的影响

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食品科学 2020年第12期41卷 120-128页

作者：张广红周光宏徐幸莲李春保肉品加工与质量控制教育部重点实验室江苏省肉类加工与质量控制协同创新中心农业农村部肉品加工重点实验室南京农业大学江苏南京210095

为研究体外条件下牛肉和鸡肉蛋白对粪便肠道微生物组成的影响,将牛肉蛋白和鸡肉蛋白(0.01 g)与人粪便微生物37℃共同培养48 h,提取发酵液DNA,采用Illumina PE250测序平台对粪便微生物V4区进行富集测序,分析微生物的组成和结构。结果表明... 详细信息

为研究体外条件下牛肉和鸡肉蛋白对粪便肠道微生物组成的影响,将牛肉蛋白和鸡肉蛋白(0.01 g)与人粪便微生物37℃共同培养48 h,提取发酵液DNA,采用Illumina PE250测序平台对粪便微生物V4区进行富集测序,分析微生物的组成和结构。结果表明,在体外发酵条件下,牛肉蛋白和鸡肉蛋白都显著影响了微生物的组成和结构。在门水平上,与对照组相比,添加牛肉蛋白和鸡肉蛋白显著增加了变形菌门和放线菌门的相对丰度(P<0.05);而鸡肉蛋白组还显著降低了拟杆菌门的相对丰度(P<0.05)。在属水平上3组共有15种核心菌属:与对照组相比,牛肉蛋白和鸡肉蛋白组普氏菌属(Prevotella)、Parabacteroides、Faecalibacterium 3种菌属相对丰度显著降低(P<0.05);巨球型菌属(Megasphaera)、巨单胞菌属(Megamonas)和大肠杆菌-志贺菌属(Escherichia-Shigella)相对丰度显著增加(P<0.05),而鸡肉蛋白组还显著增加萨特氏菌属(Sutterella)和瘤胃菌属(Ruminococcus torques)的相对丰度(P<0.05);乳酸杆菌(Lactobacillus)和双歧杆菌(Bifidobacteria)相对丰度也有所增加。体外发酵条件下,牛肉和鸡肉蛋白显著影响人粪便微生物的组成和结构,并且2种肉蛋白产生的结果也有所差异。

关键词：牛肉蛋白鸡肉蛋白粪便微生物高通量测序技术厌氧培养

典型煤层水微生物产甲烷潜力及其群落结构研究

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微生物学报 2020年第4期60卷 727-738页

作者：来守超方晓瑜涂波陈浩邓泽李贵中陈振宏张辉承磊农业部沼气科学研究所四川成都610041 农业部农村可再生能源开发利用重点实验室四川成都610041 中国石油勘探开发研究院河北廊坊065007

内蒙古自治区二连盆地、海拉尔盆地是我国重要的煤层气产区,其中生物成因煤层气是煤层气的重要来源,但复杂物质转化产甲烷相关微生物群落结构及功能尚不清楚。【目的】研究煤层水中的微生物代谢挥发性脂肪酸产甲烷的生理特征及群落特征... 详细信息

内蒙古自治区二连盆地、海拉尔盆地是我国重要的煤层气产区,其中生物成因煤层气是煤层气的重要来源,但复杂物质转化产甲烷相关微生物群落结构及功能尚不清楚。【目的】研究煤层水中的微生物代谢挥发性脂肪酸产甲烷的生理特征及群落特征。【方法】以内蒙古自治区二连盆地和海拉尔盆地的四口煤层气井水作为接种物,分别添加乙酸钠、丙酸钠和丁酸钠厌氧培养;定期监测挥发性脂肪酸降解过程中甲烷和底物的变化趋势,应用高通量测序技术,分析原始煤层气井水及稳定期产甲烷菌液的微生物群落结构。【结果】除海拉尔盆地H303煤层气井微生物不能代谢丙酸外,其他样品均具备代谢乙酸、丙酸和丁酸产生甲烷的能力,其生理生态参数存在显著差异,产甲烷延滞期依次是乙酸培养后,古菌群落结构与煤层气井水的来源显著相关,二连盆地优势古菌为氢营养型产甲烷古菌Methanocalculus(相对丰度13.5%–63.4%)和复合营养型产甲烷古菌Methanosarcina(7.9%–51.3%),海拉尔盆地的优势古菌为氢营养型产甲烷古菌Methanobacterium(24.3%–57.4%)和复合营养型产甲烷古菌Methanosarcina(29.6%–66.5%);细菌群落则与底物类型显著相关,硫酸盐还原菌Desulfovibrio(12.0%–41.0%)、互营丙酸氧化菌Syntrophobacter(39.6%–75.5%)和互营丁酸菌Syntrophomonas(8.5%–21.9%)分别在乙酸钠、丙酸钠和丁酸钠处理组显著富集。【结论】煤层气井水微生物可降解挥发性脂肪酸(乙酸、丙酸和丁酸)并具有产甲烷潜力;乙酸可能被古菌直接代谢产甲烷,而丙酸和丁酸通过互营细菌和产甲烷古菌代谢产甲烷。Desulfovibrio、Syntrophobacter和Syntrophomonas分别在乙酸、丙酸和丁酸代谢过程中发挥了重要作用。这些结果为煤层气生物强化开采提供了一定的微生物资源基础。

关键词：生物成因煤层气挥发性脂肪酸产甲烷厌氧培养高通量测序互营代谢

艰难梭菌分离株快速鉴定和毒素检测的多重PCR方法的建立

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中华微生物学和免疫学杂志 2011年第8期31卷 755-759页

作者：贾红兵王靖杨辉程颖卢金星鄢盛恺中国医学科学院北京协和医学院研究生院北京100005 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室

目的建立可同时进行艰难梭菌分离株菌种鉴定和毒素检测的多重PCR方法。方法用于多重PCR中的3对引物分别为艰难梭菌的种特异性的磷酸丙糖异构酶（triose phosphateisomerase，tpi）基因、毒素A基因部分序列、毒素B基因部分序列。艰难梭菌... 详细信息

目的建立可同时进行艰难梭菌分离株菌种鉴定和毒素检测的多重PCR方法。方法用于多重PCR中的3对引物分别为艰难梭菌的种特异性的磷酸丙糖异构酶（triose phosphateisomerase，tpi）基因、毒素A基因部分序列、毒素B基因部分序列。艰难梭菌ATCC9689等21株标准菌株和47株临床分离艰难梭菌分别被应用于多重PCR最低检出限、特异性评估试验和验证试验。同时，应用ELISA对47株分离株进行毒素A／B检测。结果该多重PCR方法可检测到最低DNA浓度为0．5pg／μl，特异性为100％。47株艰难梭菌分离株中埘基因均为阳性，其中毒素基因A（＋）／B（＋）为37株，毒素基因A（-）／n（-）为10株，未检出毒素基因A（-）／B（＋）菌株。47株毒素A／B检测结果为20株阳性、27株阴性。毒素A／B阳性的20株菌均为多重PCR检测毒素基因A（＋）／B（＋）。结论成功建立用于艰难梭菌的菌种鉴定和毒素分析结合为一体的多重PCR方法，对临床诊断艰难梭菌感染有着重要应用价值。

关键词：艰难梭菌聚合酶链反应厌氧培养酶联免疫吸附试验