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分支系统学与中国北部寒武纪高肌虫分类探讨

古生物学报 1989年第4期28卷 463-473,570页

作者：赵靖舟西安石油学院

古生物学者在进行化石生物分类时,常以形态总体相似性或者某几个甚至某一个所谓的“主要性状”为分类依据。由此而产生的分类系统就常常不可避免地引起争议甚至产生错误。这是分类学者自觉或不自觉受到数值系统学(Numerical systematics... 详细信息

古生物学者在进行化石生物分类时,常以形态总体相似性或者某几个甚至某一个所谓的“主要性状”为分类依据。由此而产生的分类系统就常常不可避免地引起争议甚至产生错误。这是分类学者自觉或不自觉受到数值系统学(Numerical systematics)和进化系统学(Evolutionary systematics)影响的结果。究其原因,主要是由于不少分类学者对于生物分类的目的往往可能理解不全,或者即使完全了解也未予足够重视(当然,这与化石性状的局限性亦有一定关系)。许多分类学者可能以为,生物的分类就是同类相合,异类相分,如同图书馆的检索一样。其目的主要在于方便应用。

关键词：分支系统学寒武纪高肌虫分类

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分支系统学软件PHYLIP系统及其使用

安徽农业大学学报 2001年第4期28卷 438-444页

作者：肖中新潘孝铭安徽省环境监测中心站合肥230061

PHYLIP是一个系统发育推断软件。PHYLIP软件由 30个程序组成 ,针对不同的数据 ,采用不同的程序。本文对 PHYLIP软件的输入与输出文件的格式、输入文件的选项、应答选项、建树的策略都作了详细论述。为便于理解 ,文中给出了丰富的例子阐述

关键词： PHYLIP软件分支系统学系统发育系统学使用系统发育推断软件

分支系统学当前的理论和方法概述及华东地区山胡椒属十二个种的分支系统学研究

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植物分类学报 1996年第1期34卷 12-28页

作者：桑涛徐炳声美国俄亥俄州立大学植物生物学系哥伦布斯俄亥俄43210 中国科学院植物研究所系统与进化植物学开放研究实验室

本文概述了当前分支系统学研究中涉及的主要理论和方法,包括性状的选取、性状状态和极性的确定、数据矩阵的分析计算、结果分支图的处理、分支图可靠性的评价及分支图的应用。本文同时以华东地区樟科山胡椒属Lindera12个种的分支系统学... 详细信息

本文概述了当前分支系统学研究中涉及的主要理论和方法,包括性状的选取、性状状态和极性的确定、数据矩阵的分析计算、结果分支图的处理、分支图可靠性的评价及分支图的应用。本文同时以华东地区樟科山胡椒属Lindera12个种的分支系统学研究为例,讨论了用形态性状进行分支系统学研究中可能遇到的问题,也揭示了一些分支系统学与传统的系统学在应用性状推导进化关系上的不同点。对这12个种的分支系统学研究得出了一些不同于传统系统学方法所推测的山胡椒属内的系统发育关系,如分支系统学研究显示山胡椒组和球果组很近缘。在严格一致性分支图上,杯托组的黑壳楠和江浙山胡椒分别位于最原始和最进化的分支,表明这个组是复系类群。分支图也显示山胡椒组可能是复系类群。

关键词：生物分类学分支系统学山胡椒属樟科

分支系统学的外群分析方法中外群性状状态确定的探讨

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动物学报 1997年第1期43卷 108-109页

作者：何继满中国科学院动物研究所北京100080

分支系统学(cladistics)在生物系统学(“分类学”)中已得到广泛的应用,它引起了整个生物系统学理论和方法的巨大变革,且在不断的运用中,其理论和力法得到不断的发展和完善。 Hennig在1953年研究昆虫系统发育的文章中,仍没有讨论性状极性... 详细信息

分支系统学(cladistics)在生物系统学(“分类学”)中已得到广泛的应用,它引起了整个生物系统学理论和方法的巨大变革,且在不断的运用中,其理论和力法得到不断的发展和完善。 Hennig在1953年研究昆虫系统发育的文章中,仍没有讨论性状极性(character polarity)的确定方法,虽然他已明确地认识到单系(monophyly)的确定只能依据离征(apomorphy),只有基于离征建立的系统关系才是真正的系统发育关系(phylogeny)。那么正确地判定祖征(plesiomorphy)和离征就是一个至关重要的问题,也即关系到正确地判定性状极向的问题。极向判定错误,必然导致系统发育关系分析的错误。

关键词：生物分类学分支系统学外群内群外群分析

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泥盆纪枝蕨纲的分支系统学研究

北京大学学报（自然科学版） 2008年第2期44卷 299-307页

作者：薛进庄郝守刚北京大学地球与空间科学学院北京100871

枝蕨纲是中泥盆世至早石炭世的一个重要的植物类群。作者对枝蕨纲代表植物进行了尝试性的分支系统学研究。枝蕨纲中可识别出伊瑞蕨目、瘤指蕨目和其他一些过渡类型。伊瑞蕨目和瘤指蕨目演化关系密切,二者分别以营养性末级附枝的顶端回... 详细信息

枝蕨纲是中泥盆世至早石炭世的一个重要的植物类群。作者对枝蕨纲代表植物进行了尝试性的分支系统学研究。枝蕨纲中可识别出伊瑞蕨目、瘤指蕨目和其他一些过渡类型。伊瑞蕨目和瘤指蕨目演化关系密切,二者分别以营养性末级附枝的顶端回弯和具瘤指蕨型的植物体组构为近裔共性。中国中上泥盆统的Metacladophyton和Polypetalophyton比伊瑞蕨目和瘤指蕨目进化程度要高,可能代表枝蕨纲内的一个新的高级分类单元,以具片化的末级附枝及次生生长为特征。伊瑞蕨目和瘤指蕨目出现在中泥盆世,而以Metacladophyton和Polypetalophyton为代表的进化类型出现在中泥盆世晚期至晚泥盆世早期。从伊瑞蕨目、瘤指蕨目到Metacladophyton和Polypetalophyton,侧生分枝系统显示了从三维的枝系统向似羽片状系统逐渐演化的趋势。

关键词：泥盆纪枝蕨纲伊瑞蕨目瘤指蕨目分支系统学

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运用分支系统学方法对逆珊瑚亚科的修订

古生物学报 1994年第1期33卷 118-129页

作者：王向东中国科学院南京地质古生物研究所

运用分支系统学方法，考察有可能归入Ａｎｔｉｐｈｙｌｌｉｎａｅ亚科的各属。根据个体发育极向标准对选取的７个性状进行分析，这７个性状为：主隔壁的长短，主内沟的形状和大小，对隔壁的长短和加厚程度，侧隔壁的长度，一级隔壁的排... 详细信息

运用分支系统学方法，考察有可能归入Ａｎｔｉｐｈｙｌｌｉｎａｅ亚科的各属。根据个体发育极向标准对选取的７个性状进行分析，这７个性状为：主隔壁的长短，主内沟的形状和大小，对隔壁的长短和加厚程度，侧隔壁的长度，一级隔壁的排列，一级隔壁从轴部退缩程度，轴部构造等。据以上各性状在每个属中的表现编制出性状极向数据矩阵，输入计算机运算，得到分支图。并得到以下结果：ＡｎｔｉｐｈｙｌｌｉｎａｅＩｌｉｎａ应包括下列１０属：ＡｃｔｉｎｏｐｈｒｅｎｔｉｓＩｖａｎｏｗｓｋｉ，１９６７；ＦａｌｓｉａｍｐｌｅｘｕｓＦｅｄｏｒｏｗｓｋｉ，１９８７；ＬｏｎｇｉｃｌａｖａＥａｓｔｏｎ，１９６２；ＬｙｔｖｏｌａｓｍａＳｏｓｈｋｉｎａ，１９２５：ＮｅｏｚａｐｈｒｅｎｌｉｓＧｒｏｖｅ，１９３５；ＭｏｎｏｐｈｙｌｌｕｍＦｏｍｉｃｈｅｖ，１９５３：ＦａｓｃｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌｕｍＴｈｏｍｓｏｎ．１８８３：ＢｒａｄｙｐｈｙｌｌｕｍＧｒａｂａｕ．１９２８：ＲｏｔｉｐｈｙｌｌｕｍＨｕｄｓｏｎ，１９４２；ＣｌａｖｉｐｈｙｌｌｕｍＨｕｄｓｏｎ，１９４２。

关键词：分支系统学分类逆珊瑚珊瑚虫纲

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亚鳞木属及其相关属的分支系统学研究

北京大学学报（自然科学版） 2003年第6期39卷 858-870页

作者：王祺郝守刚王德明北京大学地球与空间科学学院地质学系北京100871 中国科学院植物研究所

亚鳞木属被视为中国晚泥盆世的标志性植物大化石之一。分支系统学研究表明 ,亚鳞木属不宜归入传统所认为的原始鳞木目 ,因为它与系统发育上进化的封印木科、鳞木科和奇木科中成员的近共裔性状相似。作者提出该属的新分类系统 :亚鳞木属... 详细信息

亚鳞木属被视为中国晚泥盆世的标志性植物大化石之一。分支系统学研究表明 ,亚鳞木属不宜归入传统所认为的原始鳞木目 ,因为它与系统发育上进化的封印木科、鳞木科和奇木科中成员的近共裔性状相似。作者提出该属的新分类系统 :亚鳞木属隶属于亚鳞木科 ,归入广义的水韭目。在当前的分支图中 ,亚鳞木科的系统发育位置处于封印木科和薄皮木科之间 ,这种分支式样表明系统发育上比较进化的木本石松植物并不是在石炭纪突然出现的 ,而是在晚泥盆世 (法门期 )就已经演化。亚鳞木属可能代表了系统发育上比较高级的木本石松的成员或鳞木科 (或奇木科 )的祖先类群之一。

关键词：亚鳞木属分支系统学水韭目木本石松植物维管植物晚泥盆世

铁线莲属尾叶铁线莲组(毛茛科)基于形态学证据的分支系统学

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植物学通报 2007年第1期24卷 87-98页

作者：孙诚谢磊李良千中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室北京100093

选取铁线莲属(Clematis)尾叶铁线莲组(***)中37个种以及西南铁线莲组(***)中的2个种为内类群,以Clematisalternata作为外类群,通过对全世界10个标本馆的近2000份腊叶标本的形态学特征统计,选取了35个性状进行编码,利用PAUP4.0beta10软... 详细信息

选取铁线莲属(Clematis)尾叶铁线莲组(***)中37个种以及西南铁线莲组(***)中的2个种为内类群,以Clematisalternata作为外类群,通过对全世界10个标本馆的近2000份腊叶标本的形态学特征统计,选取了35个性状进行编码,利用PAUP4.0beta10软件进行系统发育重建。通过最简约法(maximumparsimony)分析共得到182棵最简约分支树,树长为182步,一致性指数(CI)=0.385,保持性指数(RI)=0.685。结果表明:(1)尾叶铁线莲组并非是一个单系类群;(2)以花序发生位置这一性状建立的***不能成立,应并入尾叶铁线莲组;(3)本研究结果不支持在尾叶铁线莲组中建立***或***;(4)***等萼片外面具纵翅的一群植物与本组中萼片红色的种类***和***有较近的亲缘关系;(5)***、***、***和***等几个种聚为一支,且支持率很高,它们具有一系列的共衍征,即萼片质地较厚,花丝扁平,宽条形,被短柔毛,花药被黄色短毛,药隔先端凸起,因此不支持建立***;(6)本组中非洲分布的2个种无论从形态上还是从地理分布和生境上都十分特殊,是本组植物的特化类群。

关键词：分支系统学铁线莲属形态学系统发育尾叶铁线莲组

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基于形态特征的地图衣属地衣分支系统学研究

生物学杂志 2021年第6期38卷 59-64页

作者：古力娜·哈纳特李作森艾尼瓦尔·吐米尔新疆大学生命科学与技术学院乌鲁木齐830046

通过对22种地图衣属地衣的23个形态学和解剖学特征分析为地图衣属地衣种间关系提供形态学依据。对22种地图衣属地衣的23个形态性状进行编码,以地图衣科的表衣属(Epilichen)与瘤衣属(Catolechia)代表种袖珍瘤衣(Catolechia wahlenbergii... 详细信息

通过对22种地图衣属地衣的23个形态学和解剖学特征分析为地图衣属地衣种间关系提供形态学依据。对22种地图衣属地衣的23个形态性状进行编码,以地图衣科的表衣属(Epilichen)与瘤衣属(Catolechia)代表种袖珍瘤衣(Catolechia wahlenbergii)和粗糙表衣(Epilichen scabrosos)作为外类群,利用PAUP对形态学特征矩阵进行最大简约法(MP)分析,同时与基于ITS序列的分子系统学结果进行比较分析。经简约分析,得到同等最大简约分支树,其严格一致树显示:地图衣属地衣根据子囊孢子的类型明显分为两支,分别由子囊孢子双胞型与子囊孢子砖壁型或亚砖壁型地图衣组成,其中,小地图衣与微地图衣,地图衣、淡黄色地图衣与大孢地图衣,蜥羽地图衣和绿孢地图衣分别聚在一个分支,研究结果与分子系统学研究结果大体一致。但是对一些物种的位置,分子系统发育结果和基于形态特征的系统发育树存在差异,从分支系统学结果可知,子囊孢子的类型是地图衣属重要的分类特征,可为地图衣属系统进化位置提供形态学的依据。

关键词：地图衣属形态学特征分支系统学系统发育关系