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圆网蛛类主要类群分子系统发生与网型进化的初步研究

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圆网蛛类主要类群分子系统发生与网型进化的初步研究

作者：吴宝山安徽师范大学

学位级别：硕士

蜘蛛目(Araneae)中的织网蜘蛛由于栖息环境、捕食方式等方面的差异而织不同类型的蛛网,其中只有妖面蛛总科(Deinopoidea)和园蛛总科(Araneoidea)两个类群蜘蛛织圆网(orb-web)。典型的圆网一般为圆形或椭圆形的平面结构,自网中心向外有... 详细信息

蜘蛛目(Araneae)中的织网蜘蛛由于栖息环境、捕食方式等方面的差异而织不同类型的蛛网,其中只有妖面蛛总科(Deinopoidea)和园蛛总科(Araneoidea)两个类群蜘蛛织圆网(orb-web)。典型的圆网一般为圆形或椭圆形的平面结构,自网中心向外有多条辐射丝,用于粘捕昆虫的捕猎丝以辐射丝为骨架呈螺旋形分布。但关于妖面蛛总科和园蛛总科间系统发生关系,即圆网蛛类(妖面蛛总科+园蛛总科)是否为单系起源,换言之,圆网究竟是经历一次进化还是多次进化,多年来始终是悬而未决的蛛形学难题之一。其次,园蛛总科中除部分蜘蛛织典型圆网外,还有部分蜘蛛织与典型圆网结构差异较大的皿蛛片网(sheet web)和球蛛网(gumfoot web),而对园蛛总科中织圆网蜘蛛和不织圆网蜘蛛间系统发生关系还有争议。本文首先测定了包括复杂生殖器类中妖面蛛总科、园蛛总科和非圆网蛛类等3个类群在内的9科10种蜘蛛线粒体12S rDNA、16S rDNA及核18S rDNA、28S rDNA等4个基因片段序列,并基于4个基因序列的整合数据,分别通过邻接(NJ)法、最大简约(MP)法、最大似然(ML)法和贝叶斯法(Bayesian)分析,对园蛛总科和妖面蛛总科蜘蛛之间的分子系统关系进行了探讨。重建的系统发生树表明:园蛛总科和妖面蛛总科蜘蛛不是姊妹群,从而支持这两个类群的圆网是平行演化而非同源演化的观点。另外,依据编码大壶状腺丝蛋白-1(MaSp1)C末端非重复氨基酸序列区段的核酸序列重建的系统发生树也证实圆网蛛类并非单系发生。其次,为进一步探讨园蛛总科主要类群间系统发生关系,又对9种蜘蛛线粒体12S rDNA和核18S rDNA片段序列进行了测定。用NJ法、MP法、以及ML法重建了分子系统树。结果表明:(1)织圆网的园蛛科和肖蛸科蜘蛛在园蛛总科里不是姊妹群;(2)不织圆网的球蛛科和皿蛛科也不是单系的,进一步证实了皿蛛片网和球蛛网独立起源的观点;(3)皿蛛科蜘蛛的分子系统发生地位与肖蛸科较近而与园蛛科较远表明皿蛛科和园蛛科间雄性触肢结构的相似性很可能是类似而不是同源相似。

关键词：圆网蛛类妖面蛛总科园蛛总科圆网皿蛛片网球蛛网分子系统发生

基于COⅠ、12S rDNA和ITS-2基因序列的犬恶丝虫分子系统发生研究

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基于COⅠ、12S rDNA和ITS-2基因序列的犬恶丝虫分子系统发生研究

作者：黄红松四川农业大学

学位级别：硕士

犬恶丝虫（Dirofiliaria immitis）又名心丝虫（heartworm）,为丝虫的一种,在传统形态学分类中被划分于丝虫总科,盘尾丝虫科,恶丝虫属。犬恶丝虫病为人兽共患寄生虫病,呈世界性分布,严重影响多种犬科和猫科动物以及部分野生肉食动物的健... 详细信息

犬恶丝虫（Dirofiliaria immitis）又名心丝虫（heartworm）,为丝虫的一种,在传统形态学分类中被划分于丝虫总科,盘尾丝虫科,恶丝虫属。犬恶丝虫病为人兽共患寄生虫病,呈世界性分布,严重影响多种犬科和猫科动物以及部分野生肉食动物的健康,给社会经济、生态环境带来巨大损失和危害。寄生虫的系统发生研究是寄生虫病防治的理论基础,进行犬恶丝虫的系统发生研究对于全面认识犬恶丝虫及犬恶丝虫病的防治具有重要意义。论文以线粒体基因细胞色素氧化酶亚单位Ⅰ（cytochrome coxidase subunitⅠ,COI）和小亚单位核糖体核糖核酸（small subunit ribosomal RNA,12S rDNA）及核糖体基因内部转录区2（internal transcribed spacer 2,ITS-2）为靶序列,通过对相关序列进行分析,运用不同的进化树构建方法,包括最小进化法、邻接法和最大似然法,从距离距阵和遗传性状两个方面构建系统树,对小熊猫恶丝虫（重庆株、成都株）和犬恶丝虫（雅安株）的分子分类及两者与其它相关丝虫的种系发生关系进行研究。通过分析不同虫种COI、12S rDNA和ITS-2基因序列间的差异和构建系统进化树,结果显示,不同虫种COI基因序列的同源性高于82.8%,小熊猫恶丝虫和犬恶丝虫之间的序列同源性超过了99.8%;各序列间的趋异值在0～19.6之间,小熊猫恶丝虫和犬恶丝虫之间的序列趋异值小于0.2。不同虫种12S rDNA基因序列的同源性高于78.0%,小熊猫恶丝虫和犬恶丝虫之间的序列同源性超过了98.4%;各序列间的趋异值在0.2～26.1之间,小熊猫恶丝虫和犬恶丝虫之间的序列趋异值小于1.6。不同虫种ITS-2基因序列的同源性高于71.20%,小熊猫恶丝虫和犬恶丝虫之间的序列同源性超过了98.5%;各序列间的趋异值在0.4～36.3之间,小熊猫恶丝虫和犬恶丝虫之间的序列趋异值小于1.6。序列分析的结果表明小熊猫恶丝虫和犬恶丝虫具有高度的同源性,应为同一虫种,小熊猫恶丝虫为犬恶丝虫的同种异名。在系统进化树中,包括基于COI基因构建的ME树和MP树,基于12S rDNA基因构建的ME树和MP树以及基于ITS-2基因构建的NJ树和MP树,小熊猫恶丝虫和犬恶丝虫均被聚合到一起,形成一个深的分支树,其置信值高于99%;盘尾丝虫科聚合成为3个大的分支树,即盘尾丝虫属,恶丝虫属及布鲁丝虫属+吴策丝虫属。这一结果表明基于形态学和分子生物学特征的盘尾丝虫超科分类结果存在一定差异,从一定程度上来说,应对盘尾丝虫超科的虫种分类结果进行部分的修订。

关键词：犬恶丝虫小熊猫犬 COI 12S rDNA ITS-2 分子系统发生

线蛱蝶亚科蝶类部分类群线粒体COI基因的分子系统发生分析

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生命科学研究 2007年第1期11卷 64-71页

作者：吴冬霞朱国萍陈娜苏成勇郝家胜安徽师范大学生命科学学院中国安徽芜湖241000

以线粒体细胞色素氧化酶I(COI)基因作分子标记,对线蛱蝶亚科蝴蝶进行序列测定.序列分析的结果表明,经比对和处理后的序列总长度是645bp,其中有199个变异位点,147个简约信息位点;所编码的氨基酸序列中有18个变异位点,7个信息位点.A+T平... 详细信息

以线粒体细胞色素氧化酶I(COI)基因作分子标记,对线蛱蝶亚科蝴蝶进行序列测定.序列分析的结果表明,经比对和处理后的序列总长度是645bp,其中有199个变异位点,147个简约信息位点;所编码的氨基酸序列中有18个变异位点,7个信息位点.A+T平均含量为69.6%,G+C平均含量为30.4%,碱基组成出现AT偏斜.以蛱蝶亚科及秀蛱蝶亚科物种为外类群,用NJ、MP及贝叶斯法重建了该亚科的系统发生树,探讨了它们主要类群间的系统发生关系.分子系统树显示,线蛱蝶亚科由以下3大支系:环蛱蝶族+翠蛱蝶族、线蛱蝶族、丽蛱蝶族构成;其中,环蛱蝶族为单系群(NJ树也支持线蛱蝶族的单系性);翠蛱蝶族与环蛱蝶族亲缘关系较近;丽蛱蝶族可能是该亚科较早分化出的一支.

关键词：蛱蝶科线蛱蝶亚科 Coi基因分子系统发生

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中国绿水螅分子系统发生地位的初步探讨

现代生物医学进展 2015年第3期15卷 417-421页

作者：李晓飞刘敏刘正亮刘蕾汪安泰潘红春安徽师范大学生命科学学院重要生物资源保护与利用研究安徽省重点实验室生物环境与生态安全安徽省高校省级重点实验室安徽芜湖241000 深圳大学生命科学学院广东深圳518060

目的:初步探讨中国绿水螅(Hydra sinensis)分子系统发生地位以及水螅属内部各类群系统发生关系。方法:采用酚-氯仿法提取中国绿水螅总DNA,扩增线粒体COI和16S r RNA基因片段并进行DNA序列测定,再利用Clustal及MEGA等生物信息学分析软件... 详细信息

目的:初步探讨中国绿水螅(Hydra sinensis)分子系统发生地位以及水螅属内部各类群系统发生关系。方法:采用酚-氯仿法提取中国绿水螅总DNA,扩增线粒体COI和16S r RNA基因片段并进行DNA序列测定,再利用Clustal及MEGA等生物信息学分析软件进行系统发生分析。结果:在本研究重建的所有系统发生树中,中国绿水螅始终与绿水螅Hydra viridissima的不同种群一起构成绿水螅单系群。同时,棕色水螅群的单系性被基于COI基因的NJ树以及基于16S r RNA基因的NJ树和ML树支持,唯独基于COI基因的ML树不支持棕色水螅群的单系发生。在基于COI基因的ML树中纤弱水螅族在系统树的基部独立为一支系,而绿水螅群和其他棕色水螅群水螅一起组成另一支系,提示纤弱水螅族水螅的系统发生地位值得进一步探讨。值得注意的是,根据本文的结果,棕色水螅群内3族的划分仍然有一定疑问。基于COI基因的NJ树和ML树支持普通水螅族、寡水螅族和纤弱水螅族各自族内的单系发生,但16S r RNA基因的NJ树和ML树中仅普通水螅族水螅聚为单系群,而寡水螅族和纤弱水螅族水螅各自并非单系发生。结论:把水螅属划分为绿水螅群及棕色水螅群有一定的合理性,但棕色水螅群内寡水螅族、普通水螅族和纤弱水螅族3族的划分还有待商榷。

关键词：中国绿水螅水螅属分子系统发生

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淡水豚类分子系统发生的研究

兽类学报 1999年第1期19卷 19-19页

作者：杨光周开亚南京师范大学生物多样性与分子进化研究室

测定了白暨豚和恒河豚细胞色素ｂ基因３０７ｂｐ的ＤＮＡ序列，并与其它鲸类的相应序列合并，分析了淡水豚类（恒河豚、印河豚、白暨豚、亚河豚和弗西豚）的系统学位置和系统发生。淡水豚类不同属间的序列差异已达到或超过了其它齿鲸类... 详细信息

测定了白暨豚和恒河豚细胞色素ｂ基因３０７ｂｐ的ＤＮＡ序列，并与其它鲸类的相应序列合并，分析了淡水豚类（恒河豚、印河豚、白暨豚、亚河豚和弗西豚）的系统学位置和系统发生。淡水豚类不同属间的序列差异已达到或超过了其它齿鲸类科间的差异水平，因此它们分别归属于不同的科，即恒河豚科、白暨豚科、亚河豚科和弗西豚科。系统发生分析支持淡水豚类和海豚类之间具有下述的关系：（恒河豚科（（白暨豚科（亚河豚科，弗西豚科））海豚总科））。即淡水豚的４个科中，恒河豚科是最早分化的一支，其次是白暨豚科，然后是亚河豚科和弗西豚科的分化。白暨豚科和亚河豚科＋弗西豚科组成海豚总科的姊妹群，并与海豚总科一同组成海豚下目。恒河豚与其它淡水豚类间无直接的亲缘关系。淡水豚类是并系的。把恒河豚类独立为恒河豚总科是合理的。初步认为有理由把白暨豚类也作为一个总科级的支系。恒河豚和印河豚间的序列差异极小，两者可能只是同一个种的２个亚种。

关键词：淡水豚类细胞色素b基因分子系统发生

园蛛总科网型不同的蜘蛛间分子系统发生关系的初步探讨

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蛛形学报 2010年第1期19卷 37-41页

作者：尹峥花潘红春郝家胜安徽师范大学生命科学学院重要生物资源保护与利用研究安徽省重点实验室生物环境与生态安全安徽省高校省级重点实验室芜湖241000

为初步探讨园蛛总科内网型不同的蜘蛛间分子系统发生关系，测定了9种蜘蛛核18S rRNA基因的部分序列。联合GenBank中的2种蜘蛛18S rRNA基因序列数据，用NJ法、MP法和ML法重建分子系统树，结果表明：（1）织圆网的园蛛科和肖蛸科蜘蛛在园... 详细信息

为初步探讨园蛛总科内网型不同的蜘蛛间分子系统发生关系，测定了9种蜘蛛核18S rRNA基因的部分序列。联合GenBank中的2种蜘蛛18S rRNA基因序列数据，用NJ法、MP法和ML法重建分子系统树，结果表明：（1）织圆网的园蛛科和肖蛸科蜘蛛在园蛛总科中不是姊妹群；（2）不织圆网的球蛛科和皿蛛科也不是单系发生，证实了皿蛛片网和球蛛网独立起源的观点；（3）皿蛛科蜘蛛的分子系统发生地位与肖蛸科较近、而与园蛛科较远，这表明皿蛛科和园蛛科问雄性触肢结构的相似性很可能是类似而不是同源相似。

关键词：园蛛总科 18S rRNA基因分子系统发生圆网片网球蛛网

8种唇口目苔藓动物的分子系统发生——基于28S rRNA基因的证据

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安徽师范大学学报（自然科学版） 2003年第1期26卷 51-54页

作者：郝家胜安徽师范大学生命科学学院安徽芜湖241000

对我国沿海较为常见的 8种唇口目苔藓动物的 2 8SrRNA基因的部分序列进行了PCR扩增和序列测定 .用排序软件进行序列比对后 ,以腕足动物为外组群 ,运用MEGA遗传分析软件以邻接法 (NJ)和最大似然法 (MP)构建了系统发生树 .结果表明 ,有囊... 详细信息

对我国沿海较为常见的 8种唇口目苔藓动物的 2 8SrRNA基因的部分序列进行了PCR扩增和序列测定 .用排序软件进行序列比对后 ,以腕足动物为外组群 ,运用MEGA遗传分析软件以邻接法 (NJ)和最大似然法 (MP)构建了系统发生树 .结果表明 ,有囊亚目的 4种苔藓动物 (刺轴拟缘孔苔虫、假缘孔苔虫、拟迷误裂孔苔虫、仿分胞苔虫 )构成一个单系群 ;无囊亚目则是一个复系群 ,其中 2种草苔虫 (匍茎草苔虫、多室草苔虫 )为单系发生。

关键词：分子系统发生 28S rRNA基因唇口目苔藓动物 PCR扩增序列测定腕足动物

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两栖爬行动物的分子系统发生

Zoological Research 2001年第5期22卷 397-405页

作者：周开亚南京师范大学遗传资源研究所南京210097

介绍了两栖爬行动物分子系统发生研究中选用的分子信息的种类及已发表的蛙类、蟾蜍类、龟类、蜥蜴类和蛇类等的分子系统学研究。这些研究中使用的DNA信息主要为mtDNA序列 ,也使用了一些核DNA序列。其研究的内容涉及目间、科间等高级阶... 详细信息

介绍了两栖爬行动物分子系统发生研究中选用的分子信息的种类及已发表的蛙类、蟾蜍类、龟类、蜥蜴类和蛇类等的分子系统学研究。这些研究中使用的DNA信息主要为mtDNA序列 ,也使用了一些核DNA序列。其研究的内容涉及目间、科间等高级阶元的系统发生关系 ,以及属间、种间以及亚种或种群间的系统发生关系。

关键词：线粒体DNA 核DNA 分子系统发生两栖类爬行类

中国涡虫新纪录科微口涡虫属一新种(大口虫目,微口虫科)及其分子系统学分析

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四川动物 2017年第4期36卷 441-449页

作者：林逸涛庄洁怡陈龙钟林宏汪安泰深圳大学生命与海洋科学学院深圳市海洋生物资源与生态环境重点实验室广东深圳518060

本文报道中国涡虫新纪录科,中国微口涡虫,新种Microstomum sinensis ***.。标本采自中国广东省深圳市南山区蛇口码头海边。该新种具有横裂殖和有性生殖个体。所有个体均具雄性生殖器官,其交配刺骨质,整体呈钩状,全长60~75μm,基部呈漏斗... 详细信息

本文报道中国涡虫新纪录科,中国微口涡虫,新种Microstomum sinensis ***.。标本采自中国广东省深圳市南山区蛇口码头海边。该新种具有横裂殖和有性生殖个体。所有个体均具雄性生殖器官,其交配刺骨质,整体呈钩状,全长60~75μm,基部呈漏斗状,从基部到末端刺管直径逐渐缩小。交配刺后1/3弯曲位于基部所在平面之外,弯曲程度接近半圆,末端开口呈尖叶状。另对其16S r DNA和28S r DNA进行了分子系统学分析,确定了其分类地位。

关键词：大口虫目微口虫科微口涡虫属新种形态学分子系统发生