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冠状病毒的糖基化研究进展

生物化学与生物物理进展 2022年第3期49卷 540-552页

作者：惠子夜于汉杰舒健任夏萌陈闻天西北大学生命科学学院功能糖组学实验室西安710069

冠状病毒(coronavirus)为一类具有囊膜结构、单股正链RNA病毒,可感染哺乳动物或禽类等。目前已知7种冠状病毒可造成人际间传播,其中以新型冠状病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus-2,SARS-CoV-2)为代表,可引起严重的呼... 详细信息

冠状病毒(coronavirus)为一类具有囊膜结构、单股正链RNA病毒,可感染哺乳动物或禽类等。目前已知7种冠状病毒可造成人际间传播,其中以新型冠状病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus-2,SARS-CoV-2)为代表,可引起严重的呼吸系统疾病,并感染全球数亿人口,从而对全球公共卫生安全造成严重危害。作为病毒表面蛋白最常见的糖基化修饰,其在识别宿主、免疫逃逸、复制组装和裂解传播等病毒活动中起重要作用。本文以SARS-CoV-2等代表,概括N-与O-糖基化研究在冠状病毒刺突蛋白(spike protein)、膜蛋白(membrane protein)等的最新进展和方法。通过全局性总结冠状病毒科中糖蛋白的糖基化位点分布、糖链结构、生物学功能与研究技术等,以推动冠状病毒相关的诊断、治疗与疫苗开发等。

关键词：冠状病毒新型冠状病毒糖基化修饰刺突蛋白膜蛋白

冠状病毒分类、宿主动物与所致人类疾病研究进展

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中国公共卫生 2022年第6期38卷 815-820页

作者：楚侃侃郭玲陈利张云智大理大学公共卫生学院大理大学预防医学研究所云南省滇西抗病原植物资源筛选研究重点实验室(培育) 云南大理671000 昆明医科大学公共卫生学院

冠状病毒(CoV)是自然界广泛存在的一种人兽共患病病毒。自从SARS暴发以来,感染人的新发CoV出现的频率不断加快,危害程度也越来越大。尤其是当前流行的新型冠状病毒肺炎,已成为了全球关注的重大公共卫生问题。本文对CoV分类、宿主动物以... 详细信息

冠状病毒(CoV)是自然界广泛存在的一种人兽共患病病毒。自从SARS暴发以来,感染人的新发CoV出现的频率不断加快,危害程度也越来越大。尤其是当前流行的新型冠状病毒肺炎,已成为了全球关注的重大公共卫生问题。本文对CoV分类、宿主动物以及所引起人的疾病进行了综述。

关键词：冠状病毒分类宿主动物人类疾病

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冠状病毒气溶胶传播及环境影响因素

环境科学 2021年第7期42卷 3091-3098页

作者：李雪蒋靖坤王东滨邓建国贺克斌郝吉明清华大学环境学院环境模拟与污染控制国家重点联合实验室北京100084

当前,新型冠状病毒肺炎正在全球大范围流行,严重影响了人类健康和生产生活.目前已明确的新型冠状病毒的传播途径包括飞沫传播和接触传播,一些传播感染事件的研究间接证明新型冠状病毒可以通过空气传播,然而对于新型冠状病毒通过气溶胶... 详细信息

当前,新型冠状病毒肺炎正在全球大范围流行,严重影响了人类健康和生产生活.目前已明确的新型冠状病毒的传播途径包括飞沫传播和接触传播,一些传播感染事件的研究间接证明新型冠状病毒可以通过空气传播,然而对于新型冠状病毒通过气溶胶传播机制的认识仍然不足,其对疾病传播的相对贡献等还在研究和论证中.本文分析了引起重症急性呼吸综合征、中东呼吸综合征和新型冠状病毒肺炎的不同冠状病毒通过气溶胶传播的研究结果,评述了病毒气溶胶的产生机制、病毒气溶胶的空气动力学特征、冠状病毒在气溶胶中的存活规律及环境因素的影响、以及冠状病毒在室内外环境气溶胶中的赋存和传播情况,探讨了当前对于明确新型冠状病毒的气溶胶传播研究的不足以及跨学科研究的展望.

关键词：冠状病毒气溶胶传播环境影响因素存活性

冠状病毒3Cpro蛋白酶抑制剂GC376的合成研究

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化学研究与应用 2022年第9期34卷 2135-2141页

作者：刘海彬刘永祥林敬生辽宁科技学院生物医药与化学工程学院辽宁本溪117004 沈阳药科大学无涯创新学院辽宁本溪117004

GC376是一种广谱性冠状病毒3Cpro蛋白酶抑制剂。本文以N-Boc-L-谷氨酸二甲酯作为起始原料,经氰化、环化、去Boc、酰胺化、还原、氧化、磺酸盐化合成了GC376,中间体及目标化合物的结构经~1H NMR表征。设计了两条合成路线,路线2较路线1减... 详细信息

GC376是一种广谱性冠状病毒3Cpro蛋白酶抑制剂。本文以N-Boc-L-谷氨酸二甲酯作为起始原料,经氰化、环化、去Boc、酰胺化、还原、氧化、磺酸盐化合成了GC376,中间体及目标化合物的结构经~1H NMR表征。设计了两条合成路线,路线2较路线1减少了两步反应,提高了反应收率。采用单因素法,考察了还原剂种类,底物的浓度和还原剂PtO的载样量对关键中间体3的合成条件的影响,将3的合成收率由文献报道的58%提高到83%;HOAt作为缩合剂,使中间体5的收率由文献报道的72%提高到82%。本文对于GC376的合成研究具有重要的实际应用价值。

关键词：冠状病毒 3Cpro蛋白酶抑制剂 GC376 合成中间体

冠状病毒非结构蛋白Nsp2的演化、结构与功能

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中国生物化学与分子生物学报 2023年第10期39卷 1375-1382页

作者：薛甜焦亚娟黄耀伟浙江大学动物医学系杭州310058 岭南现代农业科学与技术广东省实验室华南农业大学兽医学院广州510642

以新冠病毒(SARS-CoV-2)为代表的冠状病毒(coronavirus,CoV)主要危害呼吸系统和消化道系统,严重危害人类与动物健康。冠状病毒非结构蛋白2(nonstructural protein 2,Nsp2)是病毒基因Orf1ab编码的多聚蛋白质在病毒木瓜样蛋白酶作用下,经... 详细信息

以新冠病毒(SARS-CoV-2)为代表的冠状病毒(coronavirus,CoV)主要危害呼吸系统和消化道系统,严重危害人类与动物健康。冠状病毒非结构蛋白2(nonstructural protein 2,Nsp2)是病毒基因Orf1ab编码的多聚蛋白质在病毒木瓜样蛋白酶作用下,经切割后形成的成熟加工产物。Nsp2的研究较少,其在病毒复制相关的生命周期、与宿主相互作用等过程中发挥的主要作用至今未得到阐明。尽管Nsp2在不同CoVs中变异程度较大,但其演化分型与不同冠状病毒亚属的分型一致。最近对SARS-CoV-2 Nsp2的高级结构进行了解析和分析,同时也发现了SARS-CoV-2 Nsp2上存在一些与新冠突变株相关的显著突变,但是对Nsp2结构与突变及其生物学功能的联系仍不清楚。虽然Nsp2对于冠状病毒复制是非必须的,但是对于野生毒株达到最大病毒复制量至关重要。Nsp2被招募到被感染细胞的双层膜囊泡结构,与多种病毒蛋白质相互作用,协同参与病毒复制与转录。Nsp2还通过与多种宿主蛋白质相互作用,不仅参与线粒体、溶酶体、内质网等细胞器的生理过程,调节宿主细胞的能量代谢与物质转运,还通过影响干扰素的产生调节宿主先天免疫应答。本文对冠状病毒,特别是新冠病毒的Nsp2的产生、遗传演化、结构、主要变异位点进行了归纳,同时对其参与病毒复制、与病毒蛋白质及宿主蛋白质互作等最新研究进行概述总结,以期为冠状病毒的病原生物学、致病机制研究与防控提供参考。

关键词：冠状病毒新冠病毒非结构蛋白2 演化结构生物学功能

冠状病毒感染动物模型比较转录组学数据库的建立

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中国实验动物学报 2022年第1期30卷 92-99页

作者：吴玥向志光高苒孔琪中国医学科学院医学实验动物研究所北京协和医学院比较医学中心国家卫生健康委员会人类疾病比较医学重点实验室新发再发传染病动物模型研究北京市重点实验室北京市人类重大疾病实验动物模型工程技术研究中心国家中医药管理局人类疾病动物模型三级实验室北京100021

目的构建冠状病毒感染动物模型比较转录组学数据库,从基因表达水平比较冠状病毒感染人和动物模型后的异同,为动物实验与临床研究提供数据支撑。方法从GEO、ArrayExpress等数据库中下载冠状病毒(以SARS-CoV、SARS-CoV-2、MERS-CoV为主)... 详细信息

目的构建冠状病毒感染动物模型比较转录组学数据库,从基因表达水平比较冠状病毒感染人和动物模型后的异同,为动物实验与临床研究提供数据支撑。方法从GEO、ArrayExpress等数据库中下载冠状病毒(以SARS-CoV、SARS-CoV-2、MERS-CoV为主)感染动物模型与人的转录组数据,对测序数据进行质控、标准化、去除批次效应,分析不同病毒株在感染不同物种、细胞或组织后所引起的基因表达变化,构建基于Django网络应用框架的数据库,建立检索界面,提供数据分析与可视化展示功能。结果本研究系统性整理了43套测序数据集,建立了冠状病毒感染动物模型比较转录组学数据库。数据库包含3种冠状病毒、4个物种、14种组织/细胞、2373个样本。数据库展示不同基因在不同物种、不同病毒株、不同感染时间、不同滴度、不同细胞或组织中的表达差异。同时嵌入生物信息学分析工具可挖掘基因表达差异,富集差异基因的分子功能、信号通路,并预测对细胞的潜在影响。结论本文建立了冠状病毒感染动物模型比较转录组学数据库。可为冠状病毒感染动物模型基因表达水平研究提供数据资源和分析工具。

关键词：冠状病毒数据库 SARS-CoV-2 动物模型基因表达比较分析

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冠状病毒非结构蛋白的研究进展

中国生物制品学杂志 2022年第1期35卷 100-111页

作者：汪梦俊(综述) 申硕(审校) 武汉生物制品研究所有限责任公司病毒性疫苗研究一室湖北武汉430207

近20年来,动物冠状病毒(coronavirus,CoV)变异并传播于人,引起严重的烈性传染病,在全球造成巨大的经济损失。因此,对CoV进行基础研究非常重要。CoV的非结构蛋白(non-structural protein,NSP)在病毒复制过程中发挥着重要作用,如抑制宿主... 详细信息

近20年来,动物冠状病毒(coronavirus,CoV)变异并传播于人,引起严重的烈性传染病,在全球造成巨大的经济损失。因此,对CoV进行基础研究非常重要。CoV的非结构蛋白(non-structural protein,NSP)在病毒复制过程中发挥着重要作用,如抑制宿主的固有免疫、帮助病毒逃避宿主细胞感应、形成复制转录复合物(replication transcription complex,RTC)等。本文主要以严重急性呼吸综合征冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus,SARSCoV)和严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)为例,对存在于CoV中的病毒编码蛋白,特别是16种NSP的结构以及在病毒复制过程中的作用作一综述。

关键词：冠状病毒非结构蛋白严重急性呼吸综合征冠状病毒2

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冠状病毒入侵细胞途径的研究进展

微生物学杂志 2023年第1期43卷 1-8页

作者：魏战勇袁一心河南农业大学动物医学院河南郑州450046 龙湖现代免疫实验室河南郑州450046 河南省动物性食品安全重点实验室河南郑州450046

近年来,冠状病毒严重威胁人类和动物的健康。病毒具有专性胞内寄生的特点,其需要利用细胞完成自身的增殖,因此入侵细胞的过程是其感染机制中非常重要的一部分。多项研究表明冠状病毒能通过细胞表面途径和内吞途径入侵细胞。通过对冠状... 详细信息

近年来,冠状病毒严重威胁人类和动物的健康。病毒具有专性胞内寄生的特点,其需要利用细胞完成自身的增殖,因此入侵细胞的过程是其感染机制中非常重要的一部分。多项研究表明冠状病毒能通过细胞表面途径和内吞途径入侵细胞。通过对冠状病毒入侵途径研究有助于了解其生命周期,有利于冠状病毒的防治以及新型药物和疫苗的研发。本文对近年来不同冠状病毒的入侵途径及针对入侵途径所开发的潜在药物的相关研究进行总结,以期为全面了解冠状病毒的入侵方式提供参考。

关键词：冠状病毒入侵方式胞吞作用病毒入侵抑制剂网格蛋白小窝蛋白巨胞饮

冠状病毒感染性疾病尸体检验相关病原学检测回顾与展望

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法医学杂志 2021年第1期37卷 69-76页

作者：王韵怡周南乐嘉诚张凯赵乾皓郑大胡丙杰成建定中山大学中山医学院法医学系广东广州510080 广州医科大学病理学教研室广东广州511436

冠状病毒曾经给世界带来两次严重的人类间大流行,包括严重急性呼吸综合征(severe acute respiratory syndrome,SARS)和中东呼吸综合征(Middle East respiratory syndrome,MERS),2019年岁末新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)再次引发了全球性的重大公共卫生事件。由于新型冠状病毒传染性较强,相关死亡病例的解剖工作难以广泛开展。本文对既往冠状病毒感染性疾病尸体检验相关的病原学检测情况进行回顾,介绍了临床上正在开展的新型冠状病毒的检测手段,旨在为开展COVID-19尸体检验相关的病原学检测和研究提供借鉴和参考。

关键词：法医病理学冠状病毒新型冠状病毒肺炎严重急性呼吸综合征中东呼吸综合征尸体解剖病原学检测综述