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升温胁迫对珊瑚及其共生藻影响的初步研究

热带海洋学报 2008年第5期27卷 55-59页

作者：雷新明黄晖王华接李秀保练健生中国科学院南海海洋研究所广东广州510301 中国科学院海南热带海洋生物实验站海南三亚572000 中国科学院研究生院北京100039 广东省海洋与渔业环境监测中心广东广州510300

石珊瑚失去共生藻或光合色素就会发生白化。以石珊瑚体内、外正常与异常共生藻浓度及比例变化、珊瑚表面共生藻密度为参数,研究了3种珊瑚在3种温度(26℃、31℃、34℃)下的响应。结果表明,在未受(26℃)或受到较小(31℃)温度胁迫时石珊瑚... 详细信息

石珊瑚失去共生藻或光合色素就会发生白化。以石珊瑚体内、外正常与异常共生藻浓度及比例变化、珊瑚表面共生藻密度为参数,研究了3种珊瑚在3种温度(26℃、31℃、34℃)下的响应。结果表明,在未受(26℃)或受到较小(31℃)温度胁迫时石珊瑚体内、外共生藻浓度及比例保持稳定,正常共生藻占优势;受较强温度(34℃)胁迫时异常共生藻迅速占优势,游离出的共生藻增多,且3种石珊瑚都在该温度下48h内白化。石珊瑚及其共生藻处在相对稳定的共生体系中,受温度胁迫后大量共生藻游离出共生体系而发生白化至死亡。

关键词：石珊瑚温度胁迫共生藻白化

运用PCR-RFLP方法研究三亚鹿回头岸礁造礁石珊瑚共生藻的组成

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生物多样性 2008年第5期16卷 498-502页

作者：董志军黄晖黄良民李元超李秀保中国科学院南海海洋研究所海洋生物资源可持续利用重点实验室广州510301 中国科学院研究生院北京100049 中国科学院海南热带海洋生物实验站三亚572000

造礁石珊瑚共生藻的系统分类研究对于理解珊瑚礁生态系统对全球变化的响应具有十分重要的意义。本研究利用PCR技术扩增核糖体基因大亚基片段以及限制性片段长度多态性(RFLP)的方法,对海南三亚鹿回头岸礁的8科14属22种造礁石珊瑚的共生... 详细信息

造礁石珊瑚共生藻的系统分类研究对于理解珊瑚礁生态系统对全球变化的响应具有十分重要的意义。本研究利用PCR技术扩增核糖体基因大亚基片段以及限制性片段长度多态性(RFLP)的方法,对海南三亚鹿回头岸礁的8科14属22种造礁石珊瑚的共生藻组成进行了研究。结果表明鹿回头岸礁造礁石珊瑚共生藻以C系群为优势系群,偶尔发现D系群与鹿角杯形珊瑚(Pocilolpora damicornis)和黄癣蜂巢珊瑚(Favia favus)共生;另外丑鹿角珊瑚(Acropora horrida)和丛生盔形珊瑚(Galaxea fascicularis)可以同时与C系群和D系群共生。共生多型性的发现暗示珊瑚与共生藻的共生关系具有灵活性。研究结果同样显示共生藻的核糖体基因大片段的DNA多态性偏低。未来应该结合其他的分子标记对鹿回头岸礁造礁石珊瑚共生藻的DNA多态性进行更深入的研究。

关键词：中国南海造礁石珊瑚共生藻 DNA多态性

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造礁石珊瑚共生藻的分子分类研究

海洋与湖沼 2012年第4期43卷 718-722页

作者：刘丽陈育盛申玉春刘楚吾广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东省普通高校重点实验室湛江524025

通过nlsrDNA(nuclear large-subunit ribosomal DNA)及nssrDNA(nuclear small-subunit ribosomal DNA)的PCR-RFLP研究广东徐闻地区8科15属25种62个造礁石珊瑚样本的共生藻。结果表明,共生藻nlsrDNA的RsaI酶切基因型只存在一种,属于C系群共生藻;而nssrDNA的MobⅠ和TaqⅠ两种酶切都存在两种基因型。实验进一步通过PCR直接测序法得到62个造礁石珊瑚样品的共生藻ITS序列,与GenBank上的4种虫黄藻ITS序列构建Neighbor-Joining系统发育树,结果表明该区的造礁石珊瑚共生两种不同种类(亚系群)的共生藻,分别为C1亚系群与C15亚系群共生藻,两个亚系群间的遗传距离为0.019。广东徐闻地区造礁石珊瑚共生藻多样性偏低,暗示该地区珊瑚礁生态系统应对环境变化的能力可能较弱。

关键词：造礁石珊瑚共生藻分子分类

深圳杨梅坑海域造礁石珊瑚共生藻分类和遗传多样性研究

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应用海洋学学报 2019年第2期38卷 284-291页

作者：陈文静佟飞陈丕茂朱爱意张露李丹丹龙鑫玲浙江海洋大学浙江舟山316022 中国水产科学研究院南海水产研究所广东广州510300 中国水产科学研究院南海水产研究所深圳实验基地广东深圳518108

通过核糖体ITS(Internal Transcribed Spacer)的核苷酸序列研究了深圳杨梅坑海域20种47个造礁石珊瑚样本的共生藻。通过ITS序列分析,与GenBank上的4种不同的共生藻构建Neighbor-Joining聚类树,进行石珊瑚共生藻分类和遗传多样性分析。... 详细信息

通过核糖体ITS(Internal Transcribed Spacer)的核苷酸序列研究了深圳杨梅坑海域20种47个造礁石珊瑚样本的共生藻。通过ITS序列分析,与GenBank上的4种不同的共生藻构建Neighbor-Joining聚类树,进行石珊瑚共生藻分类和遗传多样性分析。结果表明,该海域的造礁石珊瑚共生藻属于2种不同的种类(亚系群),19个样品属于C1亚系群共生藻,1个样品属于C15亚系群共生藻,C1和C15两个亚系群共生藻之间的遗传距离为0. 01。将深圳杨梅坑海域得到的ITS序列与NCBI数据库上的福建东山海域、广东徐闻地区的C1系共生藻进行比对,只有深圳杨梅坑海域藻类样本平均(A+T)碱基含量为49. 4%,(A+T)含量小于(G+C)含量。构建Neighbor-Joining聚类树表明,深圳杨梅坑海域石珊瑚共生藻与福建东山海域的亲缘关系较近,而与广东徐闻地区的亲缘关系较远,地理隔离是主要的因素。

关键词：海洋生物学造礁石珊瑚共生藻 ITS序列遗传多样性深圳杨梅坑海域

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造礁石珊瑚共生藻对富营养的响应研究

海洋通报 2009年第1期28卷 43-49页

研究了多孔鹿角珊瑚(Acropora millepora)及其共生藻在硝酸盐、铵盐、磷酸盐胁迫条件下的响应。结果表明,石珊瑚共生藻光合效率在各营养盐浓度下分别受到程度不同的抑制;表面共生藻密度及共生藻叶绿素a含量在硝酸盐、磷酸盐和铵盐与磷... 详细信息

研究了多孔鹿角珊瑚(Acropora millepora)及其共生藻在硝酸盐、铵盐、磷酸盐胁迫条件下的响应。结果表明,石珊瑚共生藻光合效率在各营养盐浓度下分别受到程度不同的抑制;表面共生藻密度及共生藻叶绿素a含量在硝酸盐、磷酸盐和铵盐与磷酸盐结合条件下都有所降低,但前者较后者的变化有所滞后;在铵盐作用下表面共生藻密度和共生藻叶绿素a含量均有所升高。以石珊瑚共生藻光合效率及叶绿素a含量作为指示珊瑚共生体系对胁迫的响应指标较为灵敏。

关键词：石珊瑚共生藻超营养作用响应

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一种共生藻PCR模板DNA的快速制备法

应用海洋学学报 2019年第4期38卷 585-591页

作者：龙寒禤金彩广西民族大学海洋与生物技术学院广西海洋微生物资源产业化工程技术研究中心广西多糖材料与改性重点实验室

采用Chelex-100树脂法制备了26个物种(分别属于腔肠动物门、海绵动物门和软体动物门)的共生藻以及一株纯培养共生藻的DNA样品。通过PCR扩增叶绿体23S rRNA基因片段获得了26个有效序列,测序比对结果显示获得的序列与扩增目的基因相符。... 详细信息

采用Chelex-100树脂法制备了26个物种(分别属于腔肠动物门、海绵动物门和软体动物门)的共生藻以及一株纯培养共生藻的DNA样品。通过PCR扩增叶绿体23S rRNA基因片段获得了26个有效序列,测序比对结果显示获得的序列与扩增目的基因相符。该方法不仅样品消耗量小、操作时间短、设备需求低廉,而且可以避免使用有害化学试剂。这是一种高效、环保的DNA提取方法,可为共生藻分子研究提供技术参考。

关键词：海洋生物学 Chelex-100 共生藻 DNA提取

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壳假网衣共生藻对温度变化的响应

山西大学学报(自然科学版) 2015年第3期38卷 522-526页

作者：李博谢树莲太原师范学院地理科学学院山西大学生命科学学院

以产于山西管涔山地区的壳假网衣(Porpidia crustulata)为材料,对其共生藻在不同温度培养条件下的几个与抗性有关的生理指标进行了研究。结果显示,壳假网衣共生藻在5℃和10℃低温培养条件下3d后MDA含量逐渐减少,培养初期共生藻的SOD活... 详细信息

以产于山西管涔山地区的壳假网衣(Porpidia crustulata)为材料,对其共生藻在不同温度培养条件下的几个与抗性有关的生理指标进行了研究。结果显示,壳假网衣共生藻在5℃和10℃低温培养条件下3d后MDA含量逐渐减少,培养初期共生藻的SOD活力和可溶性糖含量较高,培养12d后可溶性蛋白质的量远高于培养初期。研究结果表明,地衣共生藻在长期的共生关系中可能建立了对低温的适应机制,表现出了较好的抗冷性。

关键词：壳假网衣共生藻温度抗冷性

丛生盔形珊瑚群体遗传结构及其内共生藻系群对环境变化的响应

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丛生盔形珊瑚群体遗传结构及其内共生藻系群对环境变化的响应

作者：李福宇海南大学

学位级别：硕士

在全球气候变化和局部生境破坏的扰动下,目前世界范围内的珊瑚礁已经并将继续面临珊瑚覆盖面积的大幅下降和群落组成的变化。石珊瑚与光合作用的鞭毛类共生藻的共生关系可以看作是珊瑚礁生态系统的结构和营养基础,这种共生关系受环境压... 详细信息

在全球气候变化和局部生境破坏的扰动下,目前世界范围内的珊瑚礁已经并将继续面临珊瑚覆盖面积的大幅下降和群落组成的变化。石珊瑚与光合作用的鞭毛类共生藻的共生关系可以看作是珊瑚礁生态系统的结构和营养基础,这种共生关系受环境压力等因素的影响而瓦解从而导致珊瑚白化,进而导致整个珊瑚礁生态系统的崩溃。但造礁珊瑚具有极其复杂的繁殖方式和营养方式,对多方面环境变化会产生多层次的适应。本文聚焦海南岛岸礁的代表性种类—丛生盔形珊瑚,开发并使用12个EST-SSR标记,以三亚湾内西岛和红塘湾的丛生盔形珊瑚集合种群为对象,从时间和空间角度,追踪2015～2019年西岛潜水平台(DP)、西岛牛王岭(NR)与红塘湾(HB)丛生盔形珊瑚群体的遗传结构对全球气候变化及填海和沿岸工程的响应,同时使用ITS2标签探讨其内共生藻群落结构的相应改变。从珊瑚—共生藻这一共生体的角度来解析丛生盔形珊瑚面对压力的分化和适应模式,探究珊瑚的恢复能力以及它们所支持的生态系统对持续的气候变化和局部生境压力的适应能力,得到的主要结果如下:1.丛生盔形珊瑚集合种群的遗传结构与分化根据刺丝囊类型和线粒体基因型,丛生盔形珊瑚可分为显著分化的两类:一类为s L型,一类为h S型。通过本研究开发的丛生盔形珊瑚的EST-SSR微卫星标记进行分析,与刺丝囊类型和线粒体基因型分类相一致。h S型丛生盔形珊瑚的H显著低于s L型(ANOVA,P共生藻群落结构与宿主特性及其遗传结构的关系本研究通过二代测序鉴定出的丛生盔形珊瑚的内共生藻优势种是Durusdinium属的D1和Cladocopium属的C1、C21a,并且共生藻群落结构与宿主珊瑚的特性及其遗传结构的变化显著相关。s L型丛生盔形珊瑚内共生藻群落的α多样性小于h S型,但二者之间差异不显著(Wilcoxon Rank-Sum Test,P>0.05)。前者的内共生藻以D1和C1为主,约占群落丰度的97%。后者除D1和C1之外,同时共生占比达17%的C21a,三者合计占群落丰度的98%。与两种类型丛生盔形珊瑚群体的遗传结构差异相似,各h S型群体的共生藻群落组成存在显著差异,主要表现在C21a(Kruskal Test,P共生藻群落组成则无显著差异。对温度敏感的s L型丛生盔形珊瑚在2016年全球高温胁迫下不仅宿主的遗传结构出现瓶颈效应,其内共生藻也因此密度降低,原来的绝对优势类型D1和C1等大幅下降,导致原来占比极少检测不到的类型得以显示出来,ITS2物种数最多,达到了8个,且出现了仅见的F2b,丰度约8%。2018年西岛牛王岭工程建设影响下h S群体仅有4个ITS2内共生藻物种,是所有群体中数量最少的。该群体遗传结构显示R大幅减小而H异常高,表明该群体的瓶颈效应是由于纯合子经历了纯化选择而消失,这与其共生藻ITS2物种的减少相一致。本文的这些发现为下一步的深入研究提供了新的视角和思路。关于丛生盔形珊瑚两种世系类型—s L型和h S型的起源和演化动力及其基因组对选择应力的响应,将会有助于阐明造礁珊瑚环境适应性生物分子遗传基础,因此对制定科学有效的珊瑚礁

关键词：丛生盔形珊瑚 EST-SSR 群体遗传结构分化适应共生藻群落结构多样性

不同生长基质中叶状地衣及其共生藻的分子鉴定和系统发育分析

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不同生长基质中叶状地衣及其共生藻的分子鉴定和系统发育分析

作者：张青苏州大学

学位级别：硕士

地衣是由真菌和藻类共生联合而成的有稳定形态和特殊结构的复合体,是目前生物界中最突出、最成功的共生现象的典范,被称为“生物的开路先锋”。目前梅衣科地衣中还未见有报道存在共生蓝藻,而且藻菌共生与生长基质的关系也未见报道。因... 详细信息

地衣是由真菌和藻类共生联合而成的有稳定形态和特殊结构的复合体,是目前生物界中最突出、最成功的共生现象的典范,被称为“生物的开路先锋”。目前梅衣科地衣中还未见有报道存在共生蓝藻,而且藻菌共生与生长基质的关系也未见报道。因此本研究采用形态学方法、化学显色法与分子生物学方法相结合鉴定了采自云南省的10个地衣样品,并对其共生藻进行了分离纯化培养及鉴定;探讨了藻菌共生组合与其生长基质之间的关系。采用GADPH和ITS基因序列构建系统发育树分析10个地衣样品（实验室编号分别为D1、D2、D3、D4、D5、D6、D7、D8、D9、D10。其中D1、D4、D5、D6、D9为树生地衣,D2、D10为土生地衣,D3、D7、D8为石生地衣）。结果表明,10个地衣样品隶属于茶渍目（Lecanorales）梅衣科（Parmeliaceae）大叶梅属（Parmotrema）,D1、D3、D4、D5、D6、D7、D8、D9与大叶梅（Parmotrema tinctorum）亲缘关系最近,其中D3、D4、D6隶属于大叶梅（Parmotrema tinctorum）,D2、D10隶属于大叶梅属（Parmotrema）的同一个种Parmotrema perlatum。分离纯化10个地衣共生藻（实验室编号为Z1、Z2、Z3、Z4、Z5、Z6、Z7、Z8、Z9、Z10）,对其进行形态鉴定及rbcL、ITS基因序列分析构建系统发育树。结果表明,5个树生地衣共生藻样品Z1、Z4、Z5、Z6、Z9为念珠藻目（Nostocales）念珠藻科（Nostocaceae）念珠藻属（Nostoc）;2个土生地衣共生藻样品Z2、Z10为四孢藻目（Tetrasporales）胶球藻科（Coccomyxaceae）胶球藻属（Coccomyxa）;3个石生地衣分离藻样品Z3、Z7、Z8是绿球藻目（Chlorococcales）栅藻科（Scenedesmaceae）链带藻属（Desmodesmus）。另外,尽管Z1、Z5、Z9分别是从采自不同区域（姚安县及南华县）的地衣中分离纯化的,但亲缘关系最近;同样Z4、Z6亲缘关系最近;Z2、Z10亲缘关系最近,Z7、Z8亲缘关系最近。所以地衣共生菌与共生藻的共生关系与其生存的地理区域关系不大,但却和其生长基质具有明显的相关性。许多学者曾试图实现地衣菌藻共生的人工重建,然而,除了Stahl、Ahmadjian等人的实验之外,几乎没有成功的报道。Ahmadjian及Heikkila曾重复了Stahl关于壳状地衣（Crustaceous lichen）石果衣（Endocarpon pusillum）的人工重建实验,从而进一步证实了由该地衣的无藻子囊孢子和无菌共生藻细胞重建了共生联合之后能够形成具有子囊壳的地衣体。Stocker-W（o|¨）rg（o|¨）tter等在实验室土壤基质中成功再合成蓝藻型地卷属地衣叶状菌体。只有存在足够数量的共生光合生物细胞才能在琼脂平板中形成地衣真菌菌丝体。地衣的重建在土壤基物上较为成功。本研究结果表明,地衣共生藻类型与地衣生长基质具有明显的相关性,而与生存的地理区域关系不大,因此可以推测地衣菌藻人工重建困难可能是因为人工重建条件与地衣生长的基质和实际环境条件不同所致。地衣中目前报道的共生蓝藻主要存在于地卷目（Peltigerales）,如地卷科（Peltigeraceae）、肺衣科（Lobarlaceae）、胶衣科（Collemataceae）、猫耳衣科（Leptogiummenziesii）等,梅衣科（Parrneliaceae）地衣中还未见有报道。本研究显示树生梅衣科地衣中存在共生念珠藻（Nostoc）,梅衣科地衣共生藻为绿藻的传统观点有待完善。

关键词：地衣共生藻生长基质鉴定系统发育