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基于网络药理学与全转录组学的汉黄芩素诱导BxPC-3细胞凋亡的作用及机制研究

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基于网络药理学与全转录组学的汉黄芩素诱导BxPC-3细胞凋亡的作用...

作者：徐亚晨海南医学院

学位级别：硕士

目的:胰腺癌是恶性肿瘤中一种较为棘手的疾病。目前虽然临床上有许多常见的化疗和/或放疗治疗方法,然而,目前亟待研究新的胰腺癌抗癌药物及治疗方案以改善胰腺癌的治疗效果,本论文通过网络药理学挖掘化合物汉黄芩素(Wogonin)并研究其诱... 详细信息

目的:胰腺癌是恶性肿瘤中一种较为棘手的疾病。目前虽然临床上有许多常见的化疗和/或放疗治疗方法,然而,目前亟待研究新的胰腺癌抗癌药物及治疗方案以改善胰腺癌的治疗效果,本论文通过网络药理学挖掘化合物汉黄芩素(Wogonin)并研究其诱导胰腺癌细胞凋亡的药效及作用机制。方法:基于传统中草药数据库与化合物信息数据库全面挖掘半枝莲活性成分,利用虚拟对接平台预测筛选各组分靶蛋白,通过化合物-蛋白-疾病互作网络确定重要靶点,结合生物信息学手段、GO分析及KEGG信号通路富集,分析Wogonin治疗胰腺癌的潜在靶基因及分子机制;通过CCK-8细胞增殖检测试剂盒检测Wogonin对BxPC-3细胞细胞增殖的影响,通过流式细胞术检测Wogonin对BxPC-3细胞周期和凋亡的影响,通过划痕实验观察Wogonin对BxPC-3细胞迁移修复的影响,并使用transwell实验观察Wogonin对BxPC-3细胞侵袭能力的影响。通过全转录组学分析药物处理的差异mRNA、差异lncRNA靶基因、差异circRNA来源靶基因的GO及KEGG富集结果,深入分析Wogonin诱导胰腺癌BxPC-3细胞凋亡的分子机制。使用荧光定量PCR验证关键基因的表达。结果:网络药理学结果显示Wogonin参与多个细胞组分、生物过程和分子功能,从多重角度产生功能效应;药效学实验显示Wogonin能将胰腺癌细胞遏制在G2/M期,促进BxPC-3细胞凋亡,抑制细胞迁移,并显著抑制胰腺癌细胞的侵袭能力(P全转录组学结果显示Wogonin能对染色体分离的调控、细胞周期的中期/后期转变等功能进行调控,并作用于卵母细胞减数分裂、细胞周期、p53信号通路等信号通路发挥作用。差异lncRNA的靶基因及差异circRNA来源基因显示药物可以作用于癌细胞的代谢途径抑制其增殖。Wogonin重新活化BxPC-3细胞中的p53,上调促凋亡基因BAX和Beclin-1、抑制抗凋亡基因BCL-2(P<0.05)。结论:Wogonin具有阻遏癌细胞周期在G2/M期、促进凋亡、抑制侵袭与迁移,从而达到诱导胰腺癌细胞凋亡的活性;Wogonin可重新激活p53蛋白的正常功能并促进BxPC-3细胞的凋亡;Wogonin可调控非编码基因网络干扰BxPC-3细胞的代谢通路重新编程从而达到诱导胰腺癌细胞凋亡的活性。

关键词： Wogonin 网络药理学全转录组学胰腺癌凋亡

基于全转录组学和代谢组学分析虾夷扇贝响应高静水压力的分子机制研究

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基于全转录组学和代谢组学分析虾夷扇贝响应高静水压力的分子机制...

作者：范琛革大连海洋大学

学位级别：硕士

有研究表明,浅海生物为了躲避高温,被迫开始向深海低温区域迁徙,高静水压力是制约浅海生物向深处迁徙的主要环境因素。同时在深海环境中,发现了许多原本生活在浅海区的生物,通过对其研究发现,深海物种未产生新的基因,而是利用与浅海物... 详细信息

有研究表明,浅海生物为了躲避高温,被迫开始向深海低温区域迁徙,高静水压力是制约浅海生物向深处迁徙的主要环境因素。同时在深海环境中,发现了许多原本生活在浅海区的生物,通过对其研究发现,深海物种未产生新的基因,而是利用与浅海物种同源的基因组来适应深海环境。研究虾夷扇贝(Pationopecten yessoensis)在高静水压环境中的分子机制研究,可以为浅海生物适应深海环境的分子机制提供一定的研究资料。主要研究内如如下:(1)对虾夷扇贝闭壳肌、鳃、外套膜三个组织的转录组测序,不同组织应对高静水压力的生理过程有所不同。闭壳肌作为扇贝贝壳开关的主要器官,在高压环境中与能量相关的通路显著表达,例如聚糖降解、糖胺聚糖降解、酪氨酸代谢通路。鳃在高压环境中与基因调控相关的过程显著富集,例如DNA结合转录因子活性、序列特异性DNA结合、启动子特异性染色质结合、DNA去甲基化的负调控。但在不同组织中,与环境信息处理和细胞凋亡相关的生物过程均显著表达,尤其是热休克蛋白和抗凋亡蛋白在多种免疫通路中显著表达,例如抗原处理和呈递、MAPK信号通路、多种长寿调节途径、内质网的蛋白质加工、NF-k B信号通路、NOD样受体信号通路。说明虾夷扇贝会通过增加能量代谢来应对高压胁迫,同时体内的蛋白质在高压环境中错误折叠,激发信号传导,触发细胞凋亡过程,从而导致虾夷扇贝体内稳态失衡死亡。(2)基于虾夷扇贝外套膜全转录组的差异表达基因分析结果显示,从中筛选出了43个差异表达的miRNAs、687个lncRNAs和21个CircRNAs。显著差异表达的miRNAs包括aga-mi R-184、ame-mi R-2b-5p、bta-mi R-2478、mmu-mi R-133a-3p等,其中多种miRNA与免疫相关。差异表达的lncRNAs靶基因在KEGG中富集于能量代谢过程、NF-k B信号通路,推测其在虾夷扇贝的能量代谢、先天免疫和细胞凋亡中发挥作用。而差异表达的CircRNAs源基因的GO和KEGG分析结果显示,与细胞信号传导和炎症调节过程显著富集,表明CircRNA可能在细胞内外信号交换和维持细胞内稳态中起作用。通过竞争性内源RNA调控关系,预测出13条lncRNA-miRNA-mRNA和29条circRNA-miRNA-mRNA关联互作网络。(3)通过虾夷扇贝外套膜的非靶向代谢组分析结果,共鉴定出67个差异代谢物,其中脂类和类脂类衍生物种类最多。虾夷扇贝会通过消耗自身的能量应对高压环境,AMP作为生物体低能量状态的标志代谢物,在本实验中含量显著增加,可以激活AMP活化蛋白酶,促进葡萄糖和脂肪酸的摄取和氧化,影响m TOR和Fox O信号通路,调节体内能量代谢水平。脂类和类脂类衍生物在代谢组分析中种类最多,主要的通路集中在花生四烯酸代谢、α-亚麻酸代谢、甘油磷酸代谢,功能多集中在细胞膜的不饱和脂肪酸组成和膜间信号传导,提高细胞膜的流动性。肌醇、牛磺酸、肾上腺素被富集在神经系统相关的通路中。说明高压环境中的虾夷扇贝能量被大量消耗、细胞膜流动性降低,神经系统受损,从而导致其无法在高压环境中长时间存活。

关键词：虾夷扇贝高静水压力转录组学全转录组学代谢组学

不同FecB基因型小尾寒羊下丘脑和垂体转录组学研究

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不同FecB基因型小尾寒羊下丘脑和垂体转录组学研究

作者：陈思中国农业科学院

学位级别：硕士

绵羊产羔数遗传力较低,用常规育种技术对该性状进行选择很难较快获得遗传进展。基于课题组前期研究发现FecB基因是影响绵羊产羔数主效基因,且在一个发情周期的不同阶段,不同FecB基因型母羊促卵泡素、促黄体素、雌激素和孕酮等在外周血... 详细信息

绵羊产羔数遗传力较低,用常规育种技术对该性状进行选择很难较快获得遗传进展。基于课题组前期研究发现FecB基因是影响绵羊产羔数主效基因,且在一个发情周期的不同阶段,不同FecB基因型母羊促卵泡素、促黄体素、雌激素和孕酮等在外周血中含量存在显著差异。推测FecB突变可能通过调节激素分泌影响卵泡发育进而导致产羔数变异,而下丘脑和垂体在激素分泌中发挥重要作用。因此,本试验以6只野生型(WW)和6只FecB突变纯合子(BB)小尾寒羊母羊为研究对象,在这两种基因型母羊卵泡期(BB＿F、WW＿F)和黄体期(BB＿F、WW＿F)分别采集下丘脑和垂体组织进行全转录组学分析和加权共表达分析,以期揭示FecB突变后,下丘脑和垂体中影响绵羊产羔数的重要通路以及候选基因。对用于全转录组研究的12只小尾寒羊进行表型数据分析,发现FecB突变型小尾寒羊产羔数极显著高于野生型(P全转录组测序获得数据利用绵羊Oar4.0进行注释,同时利用CNCI、CPAT、Pfam和CPC方法预测lncRNAs。合并BB＿F ***＿L和WW＿F ***＿L间的差异表达结果,获得卵泡期和黄体期的下丘脑、垂体差异基因(differentially expressed genes,DEGs)和lncRNAs(differentially expressed lncRNAs,DELs)。随后通过整合BB＿F ***＿F和BB＿L ***＿L间的差异表达结果,以获得不同FecB基因型的下丘脑、垂体DEGs和DELs。最后取差异表达结果与hub基因结果的交集,确定影响产羔数的关键基因。下丘脑转录组预测到15102个lncRNAs。在不同发情阶段有54个DEGs和41个DELs,其中11个DEGs和16个DELs表达量上调。通过功能注释DEGs和DELs的靶基因富集到雌激素等通路。基于lncRNA和mRNA联合分析,参与下丘脑GnRHRs合成的DRD2由LINC-676顺式调控,GnRHRs结合GnRH配体以激活下游垂体FSH和LH释放。在不同FecB基因型间有40个DEGs和26个DELs,其中14个DEGs和8个DELs表达量上调。DEGs和DELs富集到GnRH分泌等通路。lncRNA和mRNA联合分析表明,富集到GnRH信号通路的DMXL2和IGF2分别由LINC-219386和IGF2-AS调控,这些基因都在基因型BB中高表达,推测这些DELs通过调节靶基因影响绵羊下丘脑GnRH分泌,GnRH调控促性腺激素等影响产羔数。下丘脑加权共表达分析结果表明,BB＿F的Cyan模块中hub基因FKBP5为DEG,表明在下丘脑组织中,它可能在影响小尾寒羊产羔数中起关键调控作用。垂体转录组共预测到12394个lncRNAs。在不同阶段中,125个基因和56个lncRNAs差异表达,其中55个DEGs和35个DELs表达量上调。功能注释富集结果表明,DEGs和DELs的靶基因都富集到类固醇激素和生长激素等通路。lncRNA和mRNA联合分析表明,参与褪黑素等激素分泌的ID1和ID3由MSTRG.47470反式作用,表明MSTRG.47470可能通过调节靶基因参与褪黑素激素分泌,抑制GnRH合成。在不同FecB基因型间有47个DEGs和54个DELs,其中29个DEGs和24个DELs表达量上调。通过功能注释富集,DEGs和DELs的靶基因都富集到MAPK等通路。lncRNA和mRNA联合分析预测MSTRG.125392、MSTRG.125394和MSTRG.83276可能通过促进靶基因SEZ6L和KCNQ3转录影响垂体促性腺激素分泌,促性腺激素调控雌激素和孕酮等影响产羔数。垂体加权共表达分析结果表明,BB＿F的Magenta模块中hub基因SEZ6L、RLN3以及MSTRG.83276和BB＿L的Sienna3模块中hub基因GRID2为DEGs,表明在垂体组织中,它可能在影响小尾寒羊产羔数中起关键调控作用。综上所述,下丘脑lncRNAs(LINC-676、LINC-219386和IGF2-AS)和基因(PRL和FKBP5)间接或直接参与下丘脑GnRH分泌从而影响下游垂体促性腺激素分泌,其中hub基因FKBP5可能影响FecB突变小尾寒羊产羔数的关键基因。垂体lncRNAs(MSTRG.125392、MSTRG.125394和MSTRG.83276)和基因(GRM1和GRID2)可能参与垂体促性腺激素等激素分泌并反馈调节卵巢分泌的雌激素和孕酮,其中hub基因SEZ6L和MSTRG.83276可能影响FecB突变小尾寒羊产羔数的关键基因。

关键词：小尾寒羊产羔数下丘脑垂体全转录组学

组学技术解析赭曲霉毒素A损伤肠到物理屏障的机制

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组学技术解析赭曲霉毒素A损伤肠到物理屏障的机制

作者：杨雪中国农业科学院

学位级别：硕士

赭曲霉毒素A(Ochratoxin A,OTA)是一种存在于食物和动物饲料中常见的霉菌毒素,其对人畜的危害是全球关注的公共卫生问题,引起了人们的重视。以往的研究表明,OTA具有肾毒性、肝毒性、遗传毒性、免疫毒性、细胞毒性和神经毒性。近年来,越... 详细信息

赭曲霉毒素A(Ochratoxin A,OTA)是一种存在于食物和动物饲料中常见的霉菌毒素,其对人畜的危害是全球关注的公共卫生问题,引起了人们的重视。以往的研究表明,OTA具有肾毒性、肝毒性、遗传毒性、免疫毒性、细胞毒性和神经毒性。近年来,越来越多的研究指出了OTA的肠道毒性,但其作用机制尚未阐明,使得其肠道毒性的机制研究变得愈发重要。肠道屏障是机体抵御外来污染物的第一道屏障,承担了机体70%的免疫防御功能,其中肠道上皮细胞和紧密连接(Tight junction,TJ)在维持肠道物理屏障功能中发挥了重要作用。本文利用转录组学和全转录组学揭示OTA损伤体外模型Caco-2细胞和体内模型Balb/c小鼠的肠道物理屏障的机制。1.分别用0.0005、0.005和4μg/m L的OTA处理分化Caco-2细胞48 h后,细胞凋亡呈剂量依赖性,转录组学分析显示共有10090个差异表达基因(Differential Expression Genes,DEGs),主要聚集在两个下调模式中。对这两个模式中的DEGs进行GO和KEGG富集分析发现,这些DEGs主要富集在p53信号通路、细胞周期和MAPK信号通路等。OTA引起的肠道功能损伤可能部分与细胞凋亡有关,OTA通过下调MDM2和上调CASP3蛋白,激活p53介导的细胞凋亡信号通路,从而诱导分化Caco-2细胞发生凋亡。2.3 mg/kg ***灌胃Balb/c小鼠28天后,其体重从灌胃第7天开始显著下降。血清生化指标显示OTA显著升高了与肠道通透性和肠道损伤相关的D-乳酸和肠型脂肪酸结合蛋白的水平。此外,OTA组的小鼠绒毛高度以及杯状细胞的数量显著低于对照组。全转录组学分析显示,共鉴别到差异表达(Different Expression,DE)的m RNA 619个,DEmi RNA 71个,DElnc RNA 493个,DEcirc RNA 144个。生物信息学分析表明,OTA改变了与TJ蛋白相关的m RNAs(FZD4、Wnt5a、Axin2、Cav1、ACTG1和CCND1)的表达,这些m RNA受到一些关键lnc RNAs(Zeb1、Stk36、Phkb、Prss23、Inpp5e和Gm28588)和关键mi RNAs(mi R-1258-x、mmu-mi R-1258-3p)的调控,从而激活了Wnt/Ca信号通路。通过竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ce RNA)分析,确定了参与调控TJ的关键RNAs,lnc RNA Zeb1通过靶向mi R-1258-x:1)调节FZD4与Wnt5a结合从而释放Ca;2)调控Cav1的表达,控制细胞外Ca的内流,降低TJ蛋白的表达,损伤TJ和肠道屏障功能。体外Caco-2细胞试验证实,OTA诱导的Ca水平升高降低了TJ蛋白的表达。综上所述,本文以研究OTA的肠道物理屏障损伤作用为目的,构建了体外Caco-2细胞和体内Balb/c小鼠的试验模型,结果表明OTA损伤了肠道物理屏障功能。通过转录组学和全转录组学技术手段,成功挖掘了OTA诱导的肠道物理屏障毒性的潜在机制。这些结果为OTA的肠道毒理机制提供了强有力的体内和体外毒性数据支撑,将有助于我们找到OTA损伤肠道屏障的靶点,为预防OTA的肠道毒性提供依据。

关键词：赭曲霉毒素A 肠道物理屏障转录组学全转录组学紧密连接

绒山羊脱绒相关关键基因及lncRNA的筛选与验证

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绒山羊脱绒相关关键基因及lncRNA的筛选与验证

作者：冯思毓沈阳农业大学

学位级别：硕士

辽宁绒山羊原产于辽宁省东南部,是中国绒山羊品种中产绒量最高的优良品种,是重点畜禽遗传保护资源。绒山羊的毛囊由初级毛囊和次级毛囊组成,它们分别决定着羊毛与羊绒的生长发育和周期性再生。绒山羊在每年4月份到5月份发生脱绒现象,此... 详细信息

辽宁绒山羊原产于辽宁省东南部,是中国绒山羊品种中产绒量最高的优良品种,是重点畜禽遗传保护资源。绒山羊的毛囊由初级毛囊和次级毛囊组成,它们分别决定着羊毛与羊绒的生长发育和周期性再生。绒山羊在每年4月份到5月份发生脱绒现象,此时处于次级毛囊休止期到生长期的过渡阶段。课题组前期生产实践观察发现,同一群相同年龄、相同性别及相同饲养管理条件生长的绒山羊存在脱绒时间有差异的情况,即群体内有一部分绒山羊已经开始脱绒,但还有一些尚未开始脱绒。因此对绒山羊的脱绒时间差可能产生关键作用的影响因子进行挖掘并深入分析,可对绒山羊次级毛囊重启的分子机制进行探究,也可为后续通过分子育种技术手段对绒山羊的集中脱绒进行提供理论依据。本研究旨在对获得的课题组前期已脱绒和未脱绒辽宁绒山羊皮肤组织全转录组测序数据的基础上,对全转录组测序数据进行基因的差异表达、GO、KEGG等生物信息学分析后,筛选出两组间差异表达lnc RNA及其共表达的靶基因,并对差异lnc RNA和共表达靶基因在基因和蛋白水平进行初步验证,本研究取得的主要研究结果如下:1.对获得的课题组前期已脱绒和未脱绒辽宁绒山羊皮肤组织全转录组测序数据,进行基因的差异表达、GO、KEGG等生物信息学分析。通过对注释基因的表达量进行研究,共得到已脱绒与未脱绒两组样品间450个差异表达基因,其中上调基因有338个,下调基因有112个。GO功能富集分析显示:差异表达基因主要富集在单生物体转运等生物学过程,细胞膜的结构等细胞组分以及氧化还原酶活性等分子功能有关。KEGG通路富集分析显示:差异表达基因主要富集在神经活性配体-受体相互作用通路、c AMP信号通路及破骨细胞的分化通路等上面。在差异表达基因中,随机筛选C7、DCLK1、MAF等9个基因,通过实时荧光定量PCR技术对全转录组测序结果进行相对表达量验证,检测结果与测序结果一致,表明测序数据结果准确,可用于后续分析。2.全转录组测序数据分析共发现352个差异表达lnc RNA,其中168个lnc RNA表达上调,184个表达下调,并发现差异表达lnc RNA-ARHGAP24在已脱绒中的表达量极显著高于未脱绒。根据表达相关性和位置相关性对其靶基因进行预测分析,发现与皮肤组织生长发育相关的FOS和FOSB基因是与之共表达的靶基因,且在两组中的表达量差异显著。3.实时荧光定量PCR对lnc RNA-ARHGAP24、FOS和FOSB基因在两组绒山羊皮肤组织中的相对表达量进行验证,结果显示差异lnc RNA-ARHGAP24以及与之共表达的FOS和FOSB基因均在已脱绒的绒山羊中表达量高于未脱绒的绒山羊。推测lnc RNA-ARHGAP24可能通过影响FOS和FOSB基因对绒山羊的脱绒时间差产生影响。4.进一步通过western blot技术对FOS和FOSB进行蛋白水平的表达量验证。结果表明,FOS和FOSB蛋白在已脱绒的绒山羊中表达量高于未脱绒的绒山羊。综上所述,本研究初步筛选出影响绒山羊已脱绒和未脱绒的关键影响因子lnc RNA-ARHGAP24及其共表达基因FOS和FOSB,并在基因表达水平和蛋白水平进行初步验证,结果表明lnc RNA-ARHGAP24及其共表达基因FOS和FOSB在已脱绒绒山羊皮肤组织中高表达,未脱绒绒山羊皮肤组织中低表达,推测lnc RNA-ARHGAP24可能通过影响FOS和FOSB基因通过促进绒山羊次级毛囊由休止期向生长期过渡而重启毛囊的生长周期,进而影响绒山羊群体的脱绒时间差。本试验将为后续深入研究绒山羊次级毛囊重启的分子机制以及将来通过分子育种手段对绒山羊脱绒时间进行整体调控提供理论依据。

关键词：绒山羊次级毛囊全转录组学 lncRNA

Hsa＿circ＿0044517/hsa-miR-4446-3p在头颈鳞状细胞癌中调控PD-L1的机制研究

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Hsa＿circ＿0044517/hsa-miR-4446-3p在头颈鳞状细胞癌中调控PD-L...

作者：韩笑青岛大学

学位级别：硕士

研究目的:头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)是世界第六大肿瘤,具有发病率高、发病隐匿、治疗敏感性差等特点,尽管目前手术、放疗、化疗以及分子靶向治疗等多种手段用于其治疗,但5年总生存率仍然不足50%... 详细信息

研究目的:头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)是世界第六大肿瘤,具有发病率高、发病隐匿、治疗敏感性差等特点,尽管目前手术、放疗、化疗以及分子靶向治疗等多种手段用于其治疗,但5年总生存率仍然不足50%。所以,进一步解析头颈肿瘤发生发展过程中的分子机制,挖掘早期诊断、预后评测、靶向治疗等新型分子靶标具有重要的意义。相关研究报道包括癌症在内的复杂疾病往往与转录水平和非转录水平的异常基因表达有关,一些实体肿瘤和血液系统恶性肿瘤研究显示,竞争性内源性RNA(competing endogenousRNA,ceRNA)机制在癌症发病机理中起到了至关重要的作用,影响了某些关键致癌基因或抑癌基因的表达,这意味着ceRNA可以成为癌症治疗的潜在靶标。因此,本研究的目的是通过全转录组测序,预测差异表达的circRNA与miRNA、mRNA的相互作用,构建HNSCC相关ceRNA网络,初步探索hsa＿circ＿0044517、hsa-miR-4446-3p和PD-L1子ceRNA网络的调控机制,以期为HNSCC的精准治疗提供依据。研究方法:首先通过对HNSCC癌组织及癌旁组织标本进行全转录组分析,获取差异表达的circRNA,miRNA和mRNA。选择变化差异倍数前10位的circRNA,通过miRDB,Target Scan及miRTar Base预测其结合关系,并利用Cytoscape构建HNSCC相关circRNA/miRNA/mRNA ceRNA网络。对网络中的mRNA进行GO及KEGG富集分析,以阐明ceRNA网络中所包含mRNA的潜在功能;随后在富集分析的关键通路中筛选出了发挥重要作用的mRNA,并构建相关子ceRNA网络。通过qRT-PCR在临床组织中验证子ceRNA网络中circRNA的表达水平,并通过琼脂糖凝胶电泳实验验证circRNA的成环特性;通过qRT-PCR在临床组织中验证子ceRNA网络中miRNA及mRNA的表达水平,并通过Spearman分析揭示了它们之间的相关性;在AMC-HN-8喉癌细胞株中敲低选定的circRNA,利用qRT-PCR分析其对子ceRNA网络中miRNA及mRNA表达水平的影响。研究结果:1.通过全转录组测序,共检测到421个差异表达的circRNAs、112个差异表达的miRNAs和1074个差异表达的mRNAs;2.构建HNSCC的ceRNA网络,共包含9个circRNA,28个miRNA和334个mRNA;***功能富集分析提示核染色质和细胞外基质等细胞成分、细胞外基质组织的发生等生物过程、DNA结合转录因子活性等分子功能可能在HNSCC中发挥关键作用;4.对ceRNA网络中的mRNA进行KEGG信号通路分析显示,细胞粘附分子(CAMs)相关通路,氨基酸代谢、脂质代谢相关通路等与HNSCC的发生发展密切相关;***274(细胞程序性死亡-配体1,programmed cell death 1 ligand 1,PD-L1)是CAMs通路中的关键基因,PD-L1相关的子ceRNA网络中包括hsa＿circ＿0044507、hsa＿circ＿0044517、hsa＿circ＿0026774、hsa-miR-4446-3p以及PD-L1,其中,hsa＿circ＿0044507、hsa＿circ＿0044517、hsa＿circ＿0026774在癌组织中的表达量均高于癌旁组织;***＿circ＿0044507、hsa＿circ＿0044517具有环状结构;***-miR-4446-3p在癌组织中的表达量低于癌旁组织,PD-L1在癌组织中的表达量高于癌旁组织,Spearman相关性分析显示,hsa＿circ＿0044507、hsa＿circ＿0044517、hsa＿circ＿0026774的表达量与hsa-miR-4446-3p的表达量呈负相关,而与PD-L1的表达量呈正相关,hsa-miR-4446-3p的表达量与PD-L1的表达量呈负相关;8.敲低hsa＿circ＿0044517可以上调hsa-miR-4446-3p的表达,下调PD-L1的表达。结论:本研究在HNSCC中发现了异常表达的circRNA,并构建了circRNA/miRNA/mRNA ceRNA网络,揭示了circRNA在HNSCC进展中的可能作用,为今后阐明HNSCC中新的生物标志物提供了基础;包括hsa＿circ＿0044517、hsa-miR-4446-3p和PD-L1在内的ceRNA子网络可能是HNSCC的关键调节通路,为HNSCC的治疗提供了新的思路。

关键词：环状RNA 内源性竞争性RNA机制头颈部鳞状细胞癌细胞程序性死亡-配体1 全转录组学