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鲤鱼微卫星标记与体重、体长和体高性状的相关分析

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遗传 2008年第5期30卷 613-619页

作者：张义凤张研鲁翠云曹顶臣孙效文中国水产科学研究院黑龙江水产研究所及农业部北方鱼类生物工程育种重点开放实验室

利用47个鲤鱼微卫星标记,对柏氏鲤和荷包红鲤抗寒品系自交F2代的92个个体基因组DNA进行检测,得到162个等位基因,各座位等位基因数2～6个,片段长度100～444bp,有效等位基因数1.3069～4.2288,杂合度0.2361～0.7677,位点多态信息含量0.536... 详细信息

利用47个鲤鱼微卫星标记,对柏氏鲤和荷包红鲤抗寒品系自交F2代的92个个体基因组DNA进行检测,得到162个等位基因,各座位等位基因数2～6个,片段长度100～444bp,有效等位基因数1.3069～4.2288,杂合度0.2361～0.7677,位点多态信息含量0.5368。利用统计软件SPSS的GLM程序对47个微卫星标记与鲤鱼体重、体长和体高相关性进行了分析,结果表明HLJ695、HLJ716、HLJ739、HLJ759、HLJ774、K16与体重、体长和体高相关,HLJ776与体高相关。对同一标记不同基因型间进行多重比较,找到与3种性状相关的基因型。

关键词：鲤鱼微卫星体重体长体高相关分析

拷贝数变异全基因组关联分析及数量性状基因座定位联合鉴定猪体高性状候选基因

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畜牧兽医学报 2020年第7期51卷 1515-1524页

作者：欧阳峰正王立刚岳静伟颜华张龙超侯欣华刘欣王立贤中国农业科学院北京畜牧兽医研究所农业部动物遗传育种与繁殖(家禽)重点实验室北京100193

旨在利用全基因组拷贝数变异区域(copy number variation regions,CNVRs)关联分析以及全基因组数量性状基因座(quantitative trait locus,QTLs)定位联合筛选出影响猪体高性状的候选基因。本研究利用快速检测基因组拷贝数变异软件CNVcal... 详细信息

旨在利用全基因组拷贝数变异区域(copy number variation regions,CNVRs)关联分析以及全基因组数量性状基因座(quantitative trait locus,QTLs)定位联合筛选出影响猪体高性状的候选基因。本研究利用快速检测基因组拷贝数变异软件CNVcaller对本实验室构建的大白×民猪F2代资源群体的重测序数据进行拷贝数变异检测。利用混合线性模型(mixed-linear model,MLM)将性别和胎次作为固定效应对体高性状进行拷贝数变异全基因组关联分析(CNVR-GWAS)。采用软件R/qtl进行QTL分析,并使用置换检验(permutation test,PT)进行检验。将CNVR-GWAS与QTL结果进行联合注释,结合GO富集和KEGG通路分析,对影响猪体高的位点和基因进行挖掘。利用实时荧光定量PCR(qPCR)方法验证候选基因。结果表明,本群体在全基因组范围内共有3099个CNVRs,其中有两个CNVRs与体高性状在全基因组范围内显著相关,分别位于7号染色体的25358001~26696400 bp处(CNVR1)和54087201~54090000 bp处(CNVR2)。在混合线性模型分析的结果中发现,CNVR1拷贝数增加(P体高性状具有显著影响。基因组显著水平可找到2个显著影响猪体高的QTLs,分别为BH-1和BH-2,其中BH-2对体高性状的影响较大。CNVR1和BH-2重叠区存在1个嗅觉受体基因OR12D3和18个未被注释的基因。qPCR验证OR12D3的拷贝数变异与利用混合线性模型统计推断出的结果一致。初步推测,OR12D3基因的拷贝数变异可能与猪体高性状相关。

关键词：大白×民猪F2代猪群体拷贝数变异数量性状基因座体高全基因组关联分析

鲤的微卫星标记与体质量、体长、体高和吻长的相关分析

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中国水产科学 2010年第4期17卷 721-730页

作者：杨晶张晓峰储志远孙效文中国水产科学研究院黑龙江水产研究所及农业部北方鱼类生物工程育种重点开放实验室大连水产学院生命科学与技术学院

利用24个鲤(Cyprinus carpio L.)EST-SSRs标记和41个SSRs标记对柏氏鲤和荷包红鲤抗寒品系回交子代的84个个体基因组DNA进行检测,共得到182个等位基因,各座位等位基因数2～4个,片段长度142～329bp,有效等位基因数1.3913～3.9353,观察杂合... 详细信息

利用24个鲤(Cyprinus carpio L.)EST-SSRs标记和41个SSRs标记对柏氏鲤和荷包红鲤抗寒品系回交子代的84个个体基因组DNA进行检测,共得到182个等位基因,各座位等位基因数2～4个,片段长度142～329bp,有效等位基因数1.3913～3.9353,观察杂合度0.3214～1.0000,期望杂合度0.2829～0.7535,平均位点多态信息含量0.5120。利用统计软件SPSS的GLM程序对65个微卫星标记与鲤鱼体质量、体长、体高和吻长的相关性进行了分析,其中与体质量、体长显著相关的标记是HLJE365;与体质量、体高显著相关的标记是HLJ816;与体质量显著相关的标记是HLJ726,与体长显著相关的标记是HLJ107、HLJ1098;与体高显著相关的标记是HLJ111、HLJ817;与吻长显著相关的标记是HLJE331、HLJ906、HLJ1330。对同一标记不同基因型间进行多重比较,找到与4种性状相关的基因型,并运用数学建模的思想定位等位基因对性状的影响。

关键词：鲤微卫星标记体质量体长体高吻长相关分析

鲤头长、体厚、体高性状的QTL定位及遗传效应分析

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水产学报 2010年第11期34卷 1645-1655页

作者：王宣朋张晓峰李文升张天奇孙效文中国水产科学研究院黑龙江水产研究所上海海洋大学水产与生命学院大连海洋大学生命科学与技术学院

用174个SSR、41个EST、345个SNP标记对以镜鲤良种后代为祖父母本所培育的杂交F2群体的68个个体进行基因型检测,运用JoinMap4.0软件包构建遗传连锁图。利用MapQTL5.0区间作图法(interval mapping,IM)和多QTL区间定位法(MQM mapping,MQM)... 详细信息

用174个SSR、41个EST、345个SNP标记对以镜鲤良种后代为祖父母本所培育的杂交F2群体的68个个体进行基因型检测,运用JoinMap4.0软件包构建遗传连锁图。利用MapQTL5.0区间作图法(interval mapping,IM)和多QTL区间定位法(MQM mapping,MQM)进行QTL检测,通过置换实验(1000次重复)确定连锁群显著性水平阈值。在对体高、头长、体厚的区间定位中,共检测到6个与体高性状相关的QTLs区间,分布在LG1(SNP1339-SNP1490)、LG10(HLJE469-SNP1491)、LG12(SNP0922-HLJ1316)、LG13(SNP0937-HLJ328)、LG25(SNP1041-HLJ594)、LG35(SNP1425-SNP0389)等6个连锁群上,解释表型变异范围为20.0%～43.3%。其中,SNP1339-SNP1490区间LOD值最大为3.64,解释表型变异35.4%。6个与头长相关的QTLs,分布在LG1(SNP1339-SNP1490)、LG12(HLJ071-HLJ336)、LG13(SNP0937-HLJ328)、LG24(SNP1359-SNP0586)、LG24(SNP1016-SNP0326)、LG25(HLJ382-HLJ348)等5个连锁群上,其中LG24(SNP1359-SNP0586)解释表型变异达到50.2%。检测到10个与体厚相关的QTLs,分布在LG1、LG8、LG9、LG10、LG12、LG34、LG35、LG38、LG41等9个连锁群上,解释表型变异范围是16.1%～68.8%,其中LG38(HLJ1331-HLJ487)和LG41(HLJ688-HLJE6)解释表型变异分别达到60.8%和68.8%,是体厚性状的主效QTLs区间。

关键词：鲤头长体高体厚数量性状定位

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半导体高功率量子阱激光器退火后的电噪声

吉林大学学报（理学版） 2004年第4期42卷 600-602页

作者：石英学李靖郭树旭张素梅王雪丹石家纬集成光电子学国家重点联合实验室吉林大学电子科学与工程学院长春130023

在环境温度和工作电流下,对808nm高功率量子阱激光器进行老化实验,发现在老化过程中一些劣质器件电噪声谱密度呈下降趋势,产生退火效应.本文应用初始性缺陷(高温高能条件下所形成的缺陷)和非初始性缺陷理论,探讨了器件发生退火及早期失... 详细信息

在环境温度和工作电流下,对808nm高功率量子阱激光器进行老化实验,发现在老化过程中一些劣质器件电噪声谱密度呈下降趋势,产生退火效应.本文应用初始性缺陷(高温高能条件下所形成的缺陷)和非初始性缺陷理论,探讨了器件发生退火及早期失效的原因.

关键词：电噪声量子阱激光器高功率退火效应半导体器件工作电流体高劣质环境温度

市场价格整体高于去年同期前三季度我国水产品批发市场运行情况分析

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中国水产 2011年第11期 69-71页

作者：农业部渔业局市场与加工处农业部渔业局市场与加工处

根据对全国80家水产品批发市场成交价格统计，2011年1月～9月份水产品批发市场综合平均价格18．22元／公斤，同比上涨5．14％。其中海水产品综合平均价格32．95元／公斤，同比上涨5．41％；淡水产品综合平均价格12-3元／公斤，同比上涨4... 详细信息

根据对全国80家水产品批发市场成交价格统计，2011年1月～9月份水产品批发市场综合平均价格18．22元／公斤，同比上涨5．14％。其中海水产品综合平均价格32．95元／公斤，同比上涨5．41％；淡水产品综合平均价格12-3元／公斤，同比上涨4．8％。另据对可比的36家水产品批发市场成交情况统计，成交量376．13万吨，同比增加3．48％；成交额809．42亿元，同比增加11．33％。

关键词：水产品批发市场市场价格运行情况体高海水产品淡水产品平均成交量

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