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青藏高原青稞育成品种的亲缘系数分析

中国农业科学 2019年第16期52卷 2758-2767页

作者：李健丰先红蔡一林西南大学农学与生物科技学院甘孜藏族自治州农业科学研究所

【目的】分析青藏高原青稞育成品种的遗传多样性,评估其遗传基础,探索拓宽其遗传基础的对策,推动青稞新品种选育工作。【方法】以1950s后,影响力高、推广面积大的105个藏区青稞育成品种和3个引进品种为研究对象,采用亲缘系数分析法分析... 详细信息

【目的】分析青藏高原青稞育成品种的遗传多样性,评估其遗传基础,探索拓宽其遗传基础的对策,推动青稞新品种选育工作。【方法】以1950s后,影响力高、推广面积大的105个藏区青稞育成品种和3个引进品种为研究对象,采用亲缘系数分析法分析参试品种的遗传基础,进而以亲缘系数为基础,采用兰氏距离、类平均法对参试品种进行聚类分析;采用累积直系亲缘系数,筛选藏区主要骨干亲本。【结果】18.01%的品种组合间存在亲缘关系,各组合亲缘系数的变异范围为0.000—0.750,组合平均亲缘系数为0.053,显著高于中国大麦主栽品种以及北美大麦品种。根据参试品种的育成时间,以十年为期,将参试品种划分为7个时期,1970s和1980s 2个时期,参试育成品种的组合平均亲缘系数较高,分别达到0.115和0.107;1990s和最近十年,参试育成品种的组合平均亲缘系数较低,分别为0.040和0.032。西藏自治区、青海省、四川省、甘肃省的参试育成品种数分别为48、27、17和12个;甘肃省的参试育成品种组合平均亲缘系数最高,达到0.220,西藏自治区、青海省、四川省的参试育成品种组合平均亲缘系数较为接近,分别为0.094、0.122和0.138。聚类分析的结果显示,参试品种聚为7类,Ⅱ、Ⅲ类群共包含25个参试品种,各类群的组合平均亲缘系数较低;其他5个类群共包含83个参试品种,各类群的组合平均亲缘系数较高。40个参试品种的累积直系亲缘系数大于0,其中9个育成品种是藏区青稞的重要骨干亲本,其衍生了67个参试品种。9个骨干亲本及其67个衍生种占参试育成品种总量的72.38%。1960s,骨干亲本及其衍生种的数量占该时期参试品种总量的41.76%,之后的4个时期,骨干亲本及其衍生种的数量占各时期参试育成品种总量的比例分别达到80.00%、80.77%、76.47%和72.22%;最近十年,该指标虽有所下降,但仍然高达68.75%。对于西藏自治区、青海省、四川省和甘肃省,骨干亲本及其衍生品种数占各地区参试育成品种总量的比例分别达到79.17%、62.96%、70.59%和75.00%。参试育成品种所使用的亲本合计118个,其中本地亲本97个,占比82.20%,外引亲本15个,占比12.71%;剩余6个亲本的来源信息缺失。【结论】藏区青稞的9个骨干亲本及其67个衍生品种构成了育成品种的主体,外引大麦种质利用率低,从而导致青藏高原青稞育成品种的遗传多样性较低,遗传基础相对狭窄、脆弱。

关键词：青藏高原青稞育成品种亲缘系数遗传多样性

亲缘系数在近亲婚配子女复发风险计算中的应用范围

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生物学教学 2010年第12期35卷 50-51页

作者：杨军厚杨玥单长民山东省滨州医学院药学院医学遗传学教研室

本文结合实例就亲缘系数在近亲婚配子女发病风险率计算中的应用范围进行讨论。

关键词：亲缘系数发病风险应用范围

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大麦主栽品种亲缘系数和对叶斑病的抗性分析

植物遗传资源学报 2016年第4期17卷 586-598页

作者：郭焕强王文峰姚全杰孙丹姚小波王翠玲田世富包海柱王凤涛冯晶蔺瑞明徐世昌中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室北京100193 西藏自治区农牧科学院农业研究所拉萨850032 黑龙江省农业科学院耕作栽培研究所哈尔滨150086 甘肃农业大学农学院兰州730070 内蒙古自治区农牧业科学院作物育种与栽培研究所呼和浩特010031

为明确我国大麦主栽品种的遗传多样性及其对叶斑病的抗性来源,采用亲缘系数（COP,coefficient of parentage）分析方法对155个主栽大麦品种的遗传系谱进行聚类分析,同时对其中79个供试大麦品种在苗期和成株期分别接种2个强毒性菌株进行... 详细信息

为明确我国大麦主栽品种的遗传多样性及其对叶斑病的抗性来源,采用亲缘系数（COP,coefficient of parentage）分析方法对155个主栽大麦品种的遗传系谱进行聚类分析,同时对其中79个供试大麦品种在苗期和成株期分别接种2个强毒性菌株进行抗性鉴定。结果显示,155个品种聚为6个类群,有亲缘关系的品种占全部品种14.77%。在品种间组成的11935个组合中,1763个组合间存在亲缘关系,其COP值变化范围在0~0.7500之间,亲缘系数总和为157.5867,平均值为0.0132。根据系谱分析发现了不同育种单位所育品种的核心亲本,并追溯其主要的祖先亲本。此外,通过对叶斑病的抗性鉴定,发现大多数供试的大麦品种感叶斑病,高抗品种主要集中在垦啤麦系列品种和蒙啤麦3号,部分华大麦和驻大麦系列的品种在苗期或成株期中抗叶斑病。系谱分析及抗性鉴定结果揭示了我国大麦叶斑病抗性基因存在不同来源,分析结果有利于提高抗叶斑病基因筛选效率和缩小筛选范围,也将促进抗叶斑病新基因资源的发掘和利用。

关键词：系谱分析亲缘系数遗传多样性叶斑病核心亲本

建国以来山东省小麦品种及其亲本的亲缘系数分析

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中国农业科学 2006年第4期39卷 664-672页

作者：王江春胡延吉余松烈王振林刘爱峰王洪刚山东农业大学农学院/国家小麦改良中心泰安分中心/山东省作物生物学重点实验室仲恺农业技术学院山东省农业科学研究院作物研究所

目的探讨山东省小麦品种的遗传多样性。方法对山东省建国以来历经9次更换的66个小麦品种的2145个组合进行了亲缘系数(coefficientofparentage,COP)分析。结果67.44%品种组合间存在亲缘关系,所有品种COP值变异范围为0.00～0.8203,平均为0... 详细信息

目的探讨山东省小麦品种的遗传多样性。方法对山东省建国以来历经9次更换的66个小麦品种的2145个组合进行了亲缘系数(coefficientofparentage,COP)分析。结果67.44%品种组合间存在亲缘关系,所有品种COP值变异范围为0.00～0.8203,平均为0.06249,系谱亲缘系数高于平均值的占21.53%。随着时间的推移,各个年代之内品种间亲缘系数有逐渐增大的趋势,到90年代有所降低,然后又再增大。各年代内品种的亲缘系数普遍高于年代间品种的亲缘系数。早期的品种与以后年代的品种间的亲缘系数较小,中期和近期品种与以后年代的品种间的亲缘系数较大。同一个年代的品种,对后代的遗传贡献率,则随着年代的推移而逐渐减小。对品种间COP值按WAP法进行了聚类分析,除徐州438、齐大195、烟农78在COP为0处单独聚在一起外,其余63个品种可以聚为6个大类群,大多是同一年代的品种聚在一起,体现了不同年代的特点。山东省历史上年种植面积较大或推广时间较长的17个小麦品种,大都是较早利用引进亲本进行组配选育而成,亲本的亲缘系数较小,遗传差异较大。从系谱上看,山东省小麦的种质资源可基本上追溯到碧玉麦、VillaGlori(中农28)、洛夫林系、蚰子麦等四大骨干亲本体系。结论自50年代以来,品种间的遗传差异日趋狭窄,遗传多样性逐渐降低。

关键词：小麦亲缘系数遗传多样性系谱

2009-2010年河南、河北、山东三省小麦区试品种(系)的亲缘系数分析

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麦类作物学报 2013年第3期33卷 455-460页

作者：吕晓欢冯晶蔺瑞明林凤徐世昌中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室北京100193 沈阳农业大学生物科学技术学院辽宁沈阳110866

为了解2009-2010年度河南、河北及山东参加区试品种(系)小麦的遗传背景丰富度,追溯了这三个省份供试的85个小麦品种(系)信息,采用亲缘系数(coefficient of parentage,COP)和聚类分析的方法对其进行分析。结果表明,在供试的85个品种(系)... 详细信息

为了解2009-2010年度河南、河北及山东参加区试品种(系)小麦的遗传背景丰富度,追溯了这三个省份供试的85个小麦品种(系)信息,采用亲缘系数(coefficient of parentage,COP)和聚类分析的方法对其进行分析。结果表明,在供试的85个品种(系)的3 570对组合中,所有组合的COP值变异范围为0.000～0.750,亲缘系数总和为77.244,平均值为0.021。聚类分析将这85个品种(系)聚为8类。三个省份中河南参试的品种(系)遗传多样性相对较低,主要因为这些品种(系)是利用豫麦2号及其衍生品种(系)培育而成的;河北、山东参加区试的小麦品种(系)遗传多样性相对较高,主要由于这些地区广泛利用了当地的种质资源,其中山东省小麦品种培育主要选用了20世纪50年代以来生产上比较重要的多个品种,包括鲁麦14、鲁麦23、泰山21号及济南13号的衍生品种莱州95021等。在以后的育种工作中应加强对重要小麦品种(系)的应用及引进新的种质资源。

关键词：小麦区试品种(系) 亲缘系数遗传相似性

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河南小麦主栽品种亲缘系数分析

麦类作物学报 2011年第4期31卷 653-659页

作者：徐晓丹冯晶蔺瑞明赵蕾林凤徐世昌中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室北京100193 沈阳农业大学生物科学技术学院辽宁沈阳110866

为探讨河南省小麦遗传背景丰富度,追溯了河南省57份小麦主栽品种的系谱信息,计算并分析了品种亲本间及品种组合间的亲缘系数（coefficient of parentage,COP）。结果表明,供试品种中只有7个品种的父母本之间有亲缘关系。1 596对组合中,... 详细信息

为探讨河南省小麦遗传背景丰富度,追溯了河南省57份小麦主栽品种的系谱信息,计算并分析了品种亲本间及品种组合间的亲缘系数（coefficient of parentage,COP）。结果表明,供试品种中只有7个品种的父母本之间有亲缘关系。1 596对组合中,757对存在亲缘关系,所有组合的COP值变异范围为0.0000~0.7500,亲缘系数总和为65.8393,平均值为0.0413。聚类分析将57份品种分为7个类群。骨干亲本豫麦2号、豫麦18号、豫麦21号、豫麦25号与57份主栽品种的共祖先度分析表明,这几个品种的利用价值很高。由此判断,供试材料的遗传背景丰富,品种组合选育优良品种还有很大潜力。骨干亲本大都是早期培育品种,今后需加强对小麦种质资源的挖掘和利用。

关键词：小麦主栽品种系谱亲缘系数

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混合家系随机抽样群体期望亲缘系数的计算

中国农业大学学报 2008年第1期13卷 42-46页

作者：张哲张勤中国农业大学动物科学技术学院北京100094

为了对多仔动物所构成的"全同胞半同胞"混合家系,在不能获得详细系谱资料的情况下,快速、有效的计算抽样群体期望亲缘系数,使用递归和迭代设计特定算法,实现对后代随机抽样情况下样本个体在家系内各雌亲间分布情况的计算,并对各种符合... 详细信息

为了对多仔动物所构成的"全同胞半同胞"混合家系,在不能获得详细系谱资料的情况下,快速、有效的计算抽样群体期望亲缘系数,使用递归和迭代设计特定算法,实现对后代随机抽样情况下样本个体在家系内各雌亲间分布情况的计算,并对各种符合参数要求的样本后代分布进行同胞对数和频数的统计,最终实现抽样群体期望亲缘系数的计算机自动求解和输出。对采用本算法和近似公式计算得到的亲缘系数进行对比分析,结果表明:当雌亲数d≥5时,2种方法计算的亲缘系数差值亲缘系数的计算;依照本算法编制程序计算亲缘系数,计算结果精确,运行速度快。本算法可为动物遗传育种工作提供比较可靠的参数估计。

关键词：混合家系亲缘系数遗传参数动物育种算法

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应用亲缘系数分析江苏花生品种的遗传多样性

华北农学报 2011年第B12期26卷 16-19页

作者：陈志德沈一刘永惠谢吉先张祖明王州飞江苏省农科院粮食作物研究所江苏南京210014 泰兴市农科所江苏泰兴225433 江苏徐淮地区徐州农科所江苏徐州225321 南京农业大学农学院江苏南京210095

为评价花生品种的遗传差异性,本研究应用亲缘系数对江苏审(认)定的28个品种进行遗传多样性分析。结果表明,71.2%品种间组合存在亲缘关系,供试品种亲缘系数(COP)变异范围在0～0.750之间,平均为0.238。同一系列品种间平均亲缘系数并不高,... 详细信息

为评价花生品种的遗传差异性,本研究应用亲缘系数对江苏审(认)定的28个品种进行遗传多样性分析。结果表明,71.2%品种间组合存在亲缘关系,供试品种亲缘系数(COP)变异范围在0～0.750之间,平均为0.238。同一系列品种间平均亲缘系数并不高,部分品种间亲缘关系较近;不同年代育成品种的亲缘关系均较远,2000年以后品种间亲缘系数仅为0.079 3。通过COP值聚类分析,在欧式距离2.3处,可将供试材料分为5个类群,类群内品种亲缘关系相对较近。江苏花生品种的遗传相似性不高,品种遗传差异较大。

关键词：花生亲缘系数遗传多样性

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华南地区常规籼稻主栽品种间亲缘系数分析

华南农业大学学报 2012年第3期33卷 277-281页

作者：刘传光周新桥陈达刚周汉钦冯道基李丽君李巨昌张桂权陈友订广东省农业科学院水稻研究所广东省水稻育种新技术重点实验室广东广州510640 华南农业大学农学院广东广州510642

品种间亲缘系数是研究作物品种间遗传关系和遗传多样性的重要方法.对华南地区不同年代育成的常规籼稻主栽品种的亲缘系数进行了分析.结果显示,近50年来华南地区基于亲缘系数的水稻品种遗传多样性呈"W"型变化,3个高点分别出现在1957年前... 详细信息

品种间亲缘系数是研究作物品种间遗传关系和遗传多样性的重要方法.对华南地区不同年代育成的常规籼稻主栽品种的亲缘系数进行了分析.结果显示,近50年来华南地区基于亲缘系数的水稻品种遗传多样性呈"W"型变化,3个高点分别出现在1957年前、1970—1979年和2000—2008年,3个低点分别出现在1957—1969年和1980—1989年.基于亲缘系数的品种聚类结果较直观地反映了近50年来华南地区籼稻品种的遗传关系及其品种演变特点,与该地区不同时期主要围绕着少数几个骨干亲本进行品种改良的特点相吻合.本研究获得的华南地区近50年来水稻品种遗传多样性呈"W"型变化这一结果说明,基于品种间亲缘系数的华南地区品种遗传多样性未经历持续的下降或上升,而是在一定范围内波动.

关键词：华南地区常规籼稻亲缘系数