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Common genetic variations in CLOCK transcription factor are associated with nonalcoholic fatty liver disease

World Journal of Gastroenterology 2007年第31期13卷 4242-4248页

作者： Silvia Sookoian Gustavo Castao Carolina Gemma Tomas Fernández Gianotti Carlos Jose Pirola Instituto de Investigaciones Medicas A. Lanari. Universidad de Buenos Aires CONICET Combatiente de Malvinas 3150 1427-Ciudad Autonoma de Buenos Aires Argentina Consejo de Investigación GCBA Buenos Aires Argentina Consejo de Investigación GCBA Buenos Aires Argentina Instituto de Investigaciones Medicas A. Lanari. Universidad de Buenos Aires CONICET Combatiente de Malvinas 3150 1427-Ciudad Autonoma de Buenos Aires Argentina

AIM: To investigate the role of gene variants and derived haplotypes of the CLOCK transcription factor in nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) and their relation with the disease severity. METHODS: A total of 136 patients with NAFLD and 64 healthy individuals were studied. Liver biopsy was performed in 91 patients. Six tag SNPs showing a minor allele frequency > 10% (rs1554483 C/G; rs11932595 A/G; rs4580704 C/G; rs6843722 A/C; rs6850524 C/G and rs4864548 A/G) encompassing 117 kb of chromosome 4 and representing 115 polymorphic sites (r2 > 0.8) were genotyped. RESULTS: rs11932595 and rs6843722 showed signifi cant associations with NAFLD (empiric P = 0.0449 and 0.023, respectively). A significant association was also observed between clinical or histologic spectrum of NAFLD and rs1554483 (empiric P = 0.0399), rs6843722 (empiric P = 0.0229) and rs6850524 (empiric P = 0.00899) and between fibrosis score and rs1554483 (empiric P = 0.02697), rs6843722 (empiric P = 0.01898) and rs4864548 (empiric P = 0.02697). Test of haplotypic association showed that CLOCK gene variant haplotypes frequencies in NAFLD individuals significantly differed from those in controls (empiric P = 0.0097). CONCLUSION: Our study suggests a potential role of the CLOCK polymorphisms and their haplotypes insusceptibility to NAFLD and disease severity.

关键词：生理节奏蛋白质基因变异肝疾病

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