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Linkage graph analysis:A linkage-group-based QTL synthesis analysis approach

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Chinese Science Bulletin 2011年第11期56卷 1092-1099页

作者： KUANG FengLei WANG Xia ZHOU Ling ZHANG YuanMing State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement Nanjing Agricultural University Nanjing 210095 China

Consensus quantitative trait loci (QTL) in meta-analysis of multiple independent QTL mapping experiments provides a strong foundation for marker-assisted selection and gene ***,meta-analysis suffers from the lack of available genomic information and the results vary when different reference linkage maps are ***,to overcome these limitations,we propose a linkage-group-based QTL synthesis analysis approach that we have named linkage graph ***,a graph model is constructed from derived linkage ***,an unsupervised classification approach is used to obtain marker intervals with co-segregating patterns among multiple ***,a frequent itemset mining technique is used to identify the markers (or intervals) closely linked to the *** proposed method was validated by one Monte Carlo simulation study and by real data analysis of cotton *** major advantages of the new method are:(i) A reference linkage group is not required;(ii) the effect of the initial QTL is reduced because false QTLs can be detected and excluded from the *** ability to reliably identify the markers associated with a true QTL is valuable in crop breeding.

关键词： QTL效应综合分析方法连锁群连锁图基础分子标记辅助选择基因组信息数量性状位点

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多QTL定位的压缩估计方法(英文)

Acta Genetica Sinica 2006年第10期33卷 861-869页

作者：章元明南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/国家大豆改良中心南京210095

本文综述了多标记分析和多QTL定位的压缩估计方法。对于前者,Xu(Genetics,2003,163:789-801)首先提出了Bayesian压缩估计方法。其关键在于让每个效应有一个特定的方差参数,而该方差又服从一定的先验分布,以致能从资料中估计之。由此,能... 详细信息

本文综述了多标记分析和多QTL定位的压缩估计方法。对于前者,Xu(Genetics,2003,163:789-801)首先提出了Bayesian压缩估计方法。其关键在于让每个效应有一个特定的方差参数,而该方差又服从一定的先验分布,以致能从资料中估计之。由此,能够同时估计大量分子标记基因座的遗传效应,即使大多数标记的效应是可忽略的。然而,对于上位性遗传模型,其运算时间还是过长。为此,笔者将上述思想嵌入极大似然法,提出了惩罚最大似然方法。模拟研究显示:该方法能处理变量个数大于样本容量10倍左右的线性遗传模型。对于后者,本文详细介绍了基于固定区间和可变区间的Bayesian压缩估计方法。固定区间方法可处理中等密度的分子标记资料;可变区间方法则可分析高密度分子标记资料,甚至是上位性遗传模型。对于上位性检测,已介绍的惩罚最大似然方法和可变区间Bayesian压缩估计方法可供利用。应当指出,压缩估计方法在今后的eQTL和QTN定位以及基因互作网络分析等研究中也是有应用价值的。

关键词： Bayesian分析上位性多QTL模型数量性状基因座压缩估计

考虑风电随机性的微电网热电联合调度(英文)

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电力系统自动化 2011年第9期35卷 53-60,66页

作者：徐立中杨光亚许昭董朝阳 J.ΦSTERGAARD 曹一家浙江大学电气工程学院浙江省杭州市310027 Technical University of Denmark 香港理工大学电机工程学系 Technica lUniversity of Denmark 湖南大学电气与信息工程学院湖南省长沙市410082

提出了一种微电网热电联合调度的优化模型,考虑了系统运行约束和风电出力的波动性。风电出力的随机性,通过场景生成和削减方法产生的不同场景表示。该模型以系统总运行费用最小为目标函数,同时通过罚函数,把考虑了微电网和大电网连接点... 详细信息

提出了一种微电网热电联合调度的优化模型,考虑了系统运行约束和风电出力的波动性。风电出力的随机性,通过场景生成和削减方法产生的不同场景表示。该模型以系统总运行费用最小为目标函数,同时通过罚函数,把考虑了微电网和大电网连接点处的功率波动引入目标函数,使得在系统总成本最小的同时减小了风电出力波动性对电网的影响。根据模型,在考虑风电波动的情况下,调度计划中发电机出力不随风电出力的波动而改变,系统只调整发电机以外的设备实现对风电波动的补偿。仿真结果表明了该模型对含风电的微电网优化调度的有效性。

关键词：微电网热电联产风力发电经济调度随机优化

一种可变步长的暂态稳定自适应修正牛顿组合算法

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中国电机工程学报 2011年第34期31卷 105-112页

作者：江涵江全元浙江大学电气工程学院浙江省杭州市310027

为满足日益扩大的复杂互联电网的暂态仿真需求,讨论一种基于自适应修正牛顿(Shamanskii)算法和非诚实牛顿法(very dishonest Newton method,VDHN)的可变步长暂态稳定仿真组合算法。本算法在微分代数方程组联立求解框架下,首先根据隐式... 详细信息

为满足日益扩大的复杂互联电网的暂态仿真需求,讨论一种基于自适应修正牛顿(Shamanskii)算法和非诚实牛顿法(very dishonest Newton method,VDHN)的可变步长暂态稳定仿真组合算法。本算法在微分代数方程组联立求解框架下,首先根据隐式梯形积分局部截断误差理论,对步长进行控制,在保证精度的条件下,减少了积分步数;其次,在每时步非线性方程组迭代求解中,考虑牛顿类算法的收敛性,引入Shamanskii算法,自适应控制雅可比矩阵的更新,并进一步应用VDHN法对迭代过程中电压向量的计算进行简化。针对多组算例进行测试,讨论该算法的有效性及局限性。计算结果表明:该算法可适应不同规模算例,在故障较严重情况下,仍可较好地提升仿真效率。

关键词：暂态稳定仿真变步长非诚实牛顿法自适应修正牛顿算法

基于GPU的交直流电力系统暂态稳定双层并行仿真

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电力系统保护与控制 2012年第21期40卷 102-108页

作者：江涵江全元浙江大学电气工程学院浙江杭州310027

我国交直流电力系统的日益扩大与复杂化对暂态稳定仿真的速度与精度提出了更高的要求。为此,提出了一种基于图形处理器(Graphics Processing Unit,GPU)计算平台的暂态稳定双层并行算法。第一层为'交-直并行',考虑直流系统动态的独立性,... 详细信息

我国交直流电力系统的日益扩大与复杂化对暂态稳定仿真的速度与精度提出了更高的要求。为此,提出了一种基于图形处理器(Graphics Processing Unit,GPU)计算平台的暂态稳定双层并行算法。第一层为'交-直并行',考虑直流系统动态的独立性,将交流系统与直流系统解耦,分别部署在CPU和GPU上计算。第二层为'直流系统时间并行',直流系统在小步长下采用详细模型仿真,进一步在时间并行算法的框架下,使用GPU模拟实现了流水线计算,可灵活设置流水线条数,对多个直流系统多积分时步并行求解。最后,使用2个算例验证了该算法的有效性与实用性。计算结果表明:该算法可有效提高计算速度,为交直流系统稳定分析提供了新的解决思路。

关键词：交直流电力系统暂态稳定图形处理器时间并行流水线技术

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独立运行模式下的微网实时能量优化调度

中国电机工程学报 2012年第16期32卷 26-35页

作者：石庆均耿光超江全元浙江大学电气工程学院浙江省杭州市310027

针对独立运行模式下的微网能量管理问题,提出微网实时能量优化调度方法。该方法将作为压频控制单元的储能装置的能量状态划分为4个区间,并缩减作为压频控制单元的可控型微电源的基点运行功率范围,以确保压频控制单元有足够功率调节裕量... 详细信息

针对独立运行模式下的微网能量管理问题,提出微网实时能量优化调度方法。该方法将作为压频控制单元的储能装置的能量状态划分为4个区间,并缩减作为压频控制单元的可控型微电源的基点运行功率范围,以确保压频控制单元有足够功率调节裕量吸纳微网内的非计划瞬时波动功率。根据实时监测到的储能装置能量状态所处的不同区间及系统净负荷功率大小,采用不同的调度策略,并引入负荷竞价策略,增加了切负荷和卸荷作为功率调节手段。提出运行调度策略,建立负荷优化分配模型与负荷可中断优化模型。该方法不仅能实现独立运行的微网可靠、经济运行,还可减小微网对储能装置的容量配置需求。通过算例验证所提出方法的有效性。

关键词：微网独立运行调度策略负荷竞价

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大豆对豆卷叶螟抗性的QTL定位

中国油料作物学报 2009年第3期31卷 365-369页

作者：李广军李河南程利国章元明南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室国家大豆改良中心江苏南京210095 临沂师范学院山东临沂276005

豆卷叶螟是南京地区的主要食叶性害虫。以抗性亲本溧水中子黄豆和感性亲本南农493-1杂交组合正交F2群体为材料,在田间自然虫源条件下F2单株叶片损失率为抗性指标,利用已构建的SSR分子标记图谱和Windows QTL Cartographer V2.5软件包的... 详细信息

豆卷叶螟是南京地区的主要食叶性害虫。以抗性亲本溧水中子黄豆和感性亲本南农493-1杂交组合正交F2群体为材料,在田间自然虫源条件下F2单株叶片损失率为抗性指标,利用已构建的SSR分子标记图谱和Windows QTL Cartographer V2.5软件包的复合区间作图法和多区间作图法,定位大豆对豆卷叶螟抗性的QTL。结果表明:利用复合区间作图法检测到位于D1b和K连锁群上的2个QTL;利用多区间作图法则检测到位于A2、D1b、K和N连锁群上的4个QTL和6个互作QTL;其中有两个共同的QTL,至少解释表型变异的19.2%。这些结果为抗性性状的遗传剖析和标记辅助育种提供理论依据。

关键词：豆卷叶螟 QTL 大豆多区间作图