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基于从头设计及ADMET的木姜子属中木脂素类化合物5-LOX抑制剂筛选研究(Ⅱ)

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云南大学学报（自然科学版） 2022年第4期44卷 800-811页

作者：夏侯真如汪欣怡潘捷杨平李碧桃文政琦汪云松杨靖华云南大学教育部自然资源药物化学重点实验室云南省天然产物转化与应用重点实验室化学科学与工程学院云南昆明650091 昆明医科大学基础医学院云南昆明650500 昆明医科大学第一附属医院云南昆明650500

5-脂氧合酶(5-LOX)作为白三烯生物合成的关键酶之一,是炎症反应研究中的重要靶点.目前其相关上市药物存在肝毒性、半衰期短等不足,因此肝毒性较小且抑制活性较高的5-LOX抑制剂具有开发研究的必要.文章在前期研究基础上,发现传统药物资... 详细信息

5-脂氧合酶(5-LOX)作为白三烯生物合成的关键酶之一,是炎症反应研究中的重要靶点.目前其相关上市药物存在肝毒性、半衰期短等不足,因此肝毒性较小且抑制活性较高的5-LOX抑制剂具有开发研究的必要.文章在前期研究基础上,发现传统药物资源木姜子属植物中的木脂素类化合物可能具有一定的5-LOX抑制活性,因此采用从头设计、类药规则和ADMET筛选等计算机辅助药物设计技术,对其进行深入研究.研究发现从头设计碎片生长分子均有较好的筛选结果,且其中有11个小分子,分子对接打分值较高,残基结合模式与齐留通较为类似,特别是其具有肝毒性较小、血浆蛋白结合率较低的优势特性.研究结果显示木姜子属植物中木脂素类化合物的11个从头设计衍生小分子具有一定的潜在5-LOX抑制活性,且具有肝毒性较小、血浆蛋白结合率较低的优势,具有一定深入研究价值,并且通过对残基相互作用模式的分析,为后续研究提供了一定的参考.

关键词：木姜子属木脂素 5-LOX抑制剂从头设计 ADMET筛选

基于分子对接及药效团模型的木姜子属木脂素类化合物5-LOX抑制剂筛选研究(Ⅰ)

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云南大学学报（自然科学版） 2022年第2期44卷 369-379页

作者：夏侯真如薛孟祺汪欣怡张寅燕杨彤文政琦汪云松杨靖华云南大学教育部自然资源药物化学重点实验室云南省天然产物转化与应用重点实验室化学科学与工程学院云南昆明650091 昆明医科大学基础医学院云南昆明650500 昆明医科大学第一附属医院云南昆明650500

脂氧合酶-5(5-LOX)是炎症反应中的关键酶之一,其中目前以其作为炎症治疗靶点的上市药物大多有肝毒性、半衰期短等不足之处,因此新型的5-LOX抑制剂的开发十分有必要性.在前期研究基础上,发现传统药物资源木姜子属植物中的木脂素类化合物... 详细信息

脂氧合酶-5(5-LOX)是炎症反应中的关键酶之一,其中目前以其作为炎症治疗靶点的上市药物大多有肝毒性、半衰期短等不足之处,因此新型的5-LOX抑制剂的开发十分有必要性.在前期研究基础上,发现传统药物资源木姜子属植物中的木脂素类化合物可能具有一定的抗炎活性,于是进一步采用分子对接与药效团模型的虚拟筛选方式,对其进行研究.研究发现35个木脂素类分子均有较好的匹配度,其中32号、33号化合物在两种筛选方式中都有较高的打分结果,且靶点蛋白结合模式与阳性对照齐留通(zileuton)有较高的相似度.研究结果显示,木姜子属植物中的木脂素类化合物可能具有潜在5-LOX抑制活性,且其中的32号、33号分子具有较高的潜在研究价值,值得进一步深入研究.

关键词：木姜子属木脂素 5-LOX抑制剂分子对接药效团模型

基于全新药物设计方法的木姜子属酰胺类化合物5-LOX抑制剂筛选研究

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中草药 2023年第21期54卷 6961-6970页

作者：夏侯真如薛孟祺汪欣怡字慧敏文政琦李碧桃杨靖华云南大学教育部自然资源药物化学重点实验室云南省天然产物转化与应用重点实验室云南大学化学科学与工程学院云南昆明650091 昆明医科大学第一临床医学院云南昆明650500 昆明医科大学第一附属医院云南昆明650500

目的采用基于分子对接及从头设计的方法从木姜子属酰胺类化合物中寻找潜在的5-脂氧合酶(5-lipoxygenase,5-LOX)抑制剂并改造提高其预期活性。方法通过文献资料收集了木姜子属植物中现已分离鉴定的酰胺类化合物10个。应用分子对接技术,... 详细信息

目的采用基于分子对接及从头设计的方法从木姜子属酰胺类化合物中寻找潜在的5-脂氧合酶(5-lipoxygenase,5-LOX)抑制剂并改造提高其预期活性。方法通过文献资料收集了木姜子属植物中现已分离鉴定的酰胺类化合物10个。应用分子对接技术,通过与5-LOX抑制剂筛选相关的蛋白结晶的对接分析,筛选出木姜子属植物中最优的酰胺类化合物。再以该化合物为基础进行分子库扩充,并通过对该分子库进行类药规则和ADMET筛选,选择其中排名前五的分子进行从头设计碎片生长,最后再从设计结果中筛选出更优的5-LOX潜在抑制剂。结果通过分子对接分析筛选出了木姜子属植物中最优的酰胺化合物N-反式-3,4-亚甲基肉桂酰-3-甲氧基酪胺,利用类药规则和ADMET筛选出9个相对符合药理毒理性质要求的类似分子,采用从头设计方法筛选了出打分值较高的候选化合物6个,并初步阐释了优良5-LOX抑制剂可能的活性残基结合情况。结论木姜子属中酰胺类化合物及其衍生物可能通过抑制5-LOX来发挥抗炎活性作用,相对于传统筛选和改造,分子对接和从头设计技术节约了大量的资源,为新型5-LOX抑制剂的研发提供了一定的参考。

关键词：木姜子属酰胺类化合物 5-LOX抑制剂分子对接从头设计 N-反式-3,4-亚甲基肉桂酰-3-甲氧基酪胺

基于分子模拟技术筛选木姜子属阿朴菲型生物碱的COX-2抑制剂研究(Ⅰ)

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云南大学学报（自然科学版） 2020年第2期42卷 325-331页

作者：薛孟祺杨念琦字慧敏杨平杨靖华汪云松教育部自然资源药物化学重点实验室云南大学化学科学与工程学院·药学院云南昆明650091

环氧合酶-2(COX-2)是炎症治疗中的一个重要靶点,但目前市面上的COX-2抑制剂存在心血管副作用,开发新型低毒的COX-2抑制剂十分必要.该文运用Discovery Studio 2016(DS)与Molegro Virtual Docker6.0(MVD)分子模拟软件,采用构建药效团与分... 详细信息

环氧合酶-2(COX-2)是炎症治疗中的一个重要靶点,但目前市面上的COX-2抑制剂存在心血管副作用,开发新型低毒的COX-2抑制剂十分必要.该文运用Discovery Studio 2016(DS)与Molegro Virtual Docker6.0(MVD)分子模拟软件,采用构建药效团与分子对接的方法,对传统药用植物木姜子属(Litsea)中分离到的14个特征性阿朴菲生物碱展开研究.研究发现8个阿朴菲生物碱分子(1, 3, 4, 5, 8, 9, 11, 12)与最优药效团可以匹配,其中单甲氧基取代的3个阿朴菲生物碱(1-3)在分子对接中得分较高,有进一步研究的价值.随甲氧基的增多,对接得分逐步降低.研究结果揭示木姜子属阿朴菲生物碱可能是具有潜在COX-2抑制作用的一类分子,值得进一步深入研究.

关键词：炎症 COX-2 木姜子属阿朴菲生物碱分子对接药效团

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滇产枫香树叶化学成分研究

云南民族大学学报（自然科学版） 2022年第4期31卷 381-384页

作者：周文武潘捷杨彤张寅燕杨靖华文政琦李碧桃汪云松云南大学化学科学与工程学院教育部自然资源药物化学重点实验室云南省天然产物转化与应用重点实验室云南昆明650091 昆明医科大学第一附属医院云南昆明650500

枫香树叶乙醇回流提取所得的浸膏经溶剂分步萃取,经正相硅胶色谱、SephadexLH-20凝胶柱色谱反复层析、分离,结合现代分析技术,共从其乙酸乙酯部分鉴定出11个化合物,根据其理化常数及波谱数据鉴定为香草醛(1)、丁香酸(2)、没食子酸乙酯(3... 详细信息

枫香树叶乙醇回流提取所得的浸膏经溶剂分步萃取,经正相硅胶色谱、SephadexLH-20凝胶柱色谱反复层析、分离,结合现代分析技术,共从其乙酸乙酯部分鉴定出11个化合物,根据其理化常数及波谱数据鉴定为香草醛(1)、丁香酸(2)、没食子酸乙酯(3)、连苯三酚(4)、没食子酸(5)、原儿茶酸(6)、顺式对羟基肉桂酸(7)、正十六烷酸(8)、正十六烷酸甲酯(9)、正二十一烷醇(10)、12-羟基茉莉酸(11),其中化合物11为首次从该属植物中分离得到.

关键词：枫香树属枫香树化学成分

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滇产九里香化学成分研究

云南民族大学学报（自然科学版） 2022年第5期31卷 501-503页

作者：梅宇飞张寅燕杨彤潘捷杨靖华文政琦李碧桃汪云松云南大学教育部自然资源药物化学重点实验室云南省天然产物转化与应用重点实验室化学科学与工程学院云南昆明650091 昆明医科大学第一附属医院云南昆明650500

利用硅胶柱色谱和Sephadex LH-20凝胶柱色谱等多种分离方法对九里香(Murraya exotica L.)枝叶进行化学成分研究,结合核磁共振、质谱、紫外光谱等波谱学方法从九里香枝叶的乙酸乙酯萃取部分共分离鉴定了7个化合物,其中包括3个苯丙素,即... 详细信息

利用硅胶柱色谱和Sephadex LH-20凝胶柱色谱等多种分离方法对九里香(Murraya exotica L.)枝叶进行化学成分研究,结合核磁共振、质谱、紫外光谱等波谱学方法从九里香枝叶的乙酸乙酯萃取部分共分离鉴定了7个化合物,其中包括3个苯丙素,即反式阿魏酸乙酯(1)、反式对羟基肉桂酸(2)、异阿魏酸(3);4个苯环衍生物,即香兰素(4)、对羟基苯甲醛(5)、香草酸(6)、邻苯二甲酸二(2-乙基己)酯(7),其中化合物1为首次从九里香属中分离得到.

关键词：九里香属九里香化学成分

基于分子对接技术筛选木姜子属阿朴菲型生物碱的COX-2抑制剂研究(Ⅱ)

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云南民族大学学报（自然科学版） 2020年第5期29卷 409-418页

作者：薛孟祺汪欣怡夏侯真如夏绫誉杨平杨念琦张菊玉汪云松文政琦杨靖华云南大学化学科学与工程学院教育部自然资源药物化学重点实验室云南昆明650091 昆明医科大学基础医学院云南昆明650500 昆明市妇幼保健院孕产保健部云南昆明650031 昆明医科大学第一附属医院云南昆明650500

木姜子属植物(Litsea)是我国重要的药用植物资源,利用分子对接软件Molegro Virtual Docker 6.0(MVD)研究了木姜子属植物中34个阿朴菲类生物碱与炎症反应中的关键酶—环氧合酶2(COX-2)的抑制作用,综合打分函数与相互作用关系,从一定程度... 详细信息

木姜子属植物(Litsea)是我国重要的药用植物资源,利用分子对接软件Molegro Virtual Docker 6.0(MVD)研究了木姜子属植物中34个阿朴菲类生物碱与炎症反应中的关键酶—环氧合酶2(COX-2)的抑制作用,综合打分函数与相互作用关系,从一定程度上揭示了阿朴菲生物碱与COX-2之间的构效关系,并获得4个打分等于或高于阳性药物艾瑞昔布的分子(1,2,25,26).

关键词：木姜子阿朴菲生物碱抗炎 COX-2 分子对接