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基于生物信息学构建肝癌免疫预后基因模型及初步验证

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华东师范大学学报（自然科学版） 2024年第4期 100-110页

作者：谢琳玎张远蔡亦红安徽医科大学公共卫生学院卫生检验与检疫学系合肥230032 安徽医科大学动物源性传染病安徽省重点实验室/人畜共患病安徽高校省级重点实验室合肥230032 苏州市吴江区儿童医院检验科江苏苏州215234

利用癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)和国际肿瘤基因组协作组(International Cancer Genome Consortium,ICGC)数据库收集肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者的RNA测序信息.首先,通过非负矩阵分解(non-negative matrix factorization,NMF)聚类方法和加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选出参与HCC免疫反应机制的关键基因.利用套索(the least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)回归分析构建预后基因模型,并用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)方法分析生物学功能.随后,对不同风险组患者使用单样本基因集富集分析(single sample genes set enrichment analysis,ssGSEA)评估两组间免疫浸润和相关功能差异.使用“RMS”R软件包结合独立危险因素构建列线图以预测患者的总体生存时间.最后,利用人类蛋白质图谱数据库(Human Protein Atlas,HPA)与实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)进行临床初步验证.总之,本文在风险评分的基础上整合患者临床特征,构建了一个可验证、可重复的列线图,为临床肿瘤患者的精准治疗提供可靠的参考.

关键词：生物信息学加权基因共表达网络分析肝癌免疫相关基因预后模型

血浆脂肪酸乙酯与酒精性急性胰腺炎炎症和疾病严重程度的相关性研究

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国际检验医学杂志 2024年第9期45卷 1096-1100,1105页

作者：臧桂芹叶丹孙艳艳北京航天总医院急诊科北京100076

目的分析血浆脂肪酸乙酯(FAEE)与酒精性急性胰腺炎(AAP)炎症和疾病严重程度的相关性。方法回顾性分析2017年1月至2022年1月该院收治的227例AAP患者及213例非酒精性急性胰腺炎(AP)组患者数据。根据Bathazar计算机断层扫描严重指数将AAP... 详细信息

目的分析血浆脂肪酸乙酯(FAEE)与酒精性急性胰腺炎(AAP)炎症和疾病严重程度的相关性。方法回顾性分析2017年1月至2022年1月该院收治的227例AAP患者及213例非酒精性急性胰腺炎(AP)组患者数据。根据Bathazar计算机断层扫描严重指数将AAP患者的疾病严重程度分为轻度、中度、重度。通过气相色谱分析患者血浆FAEE和游离脂肪酸(NEFA)水平。结果AAP组患者血浆FAEE(P146.61 nmol/L为重度AAP发生的危险因素(P<0.05),且其对重度AAP有较好的预测价值,AUC为0.786(95%CI:0.705~0.867)。Spearman秩相关分析结果显示,AAP患者血浆FAEE水平与白细胞介素(IL)-1β、IL-6及NEFA水平呈正相关(rS=0.298、0.475、0.302,均P<0.001)。结论血浆FAEE有可能成为AAP鉴别诊断和预测疾病严重程度的潜在生物标志物。

关键词：脂肪酸乙酯酒精性急性胰腺炎炎症疾病严重程度

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宫颈癌保留神经手术后排尿功能评价

首都医科大学学报 2024年第5期45卷 853-857页

作者：靳琼董德鑫赵越耿宇宁首都医科大学附属北京妇产医院/北京妇幼保健院妇瘤科北京100026 中国医学科学院北京协和医院泌尿外科北京100005 首都医科大学附属北京妇产医院/北京妇幼保健院内分泌科北京100026

目的探讨宫颈癌保留神经的广泛性子宫切除术(nerve sparing radical hysterectomy,NSRH)治疗宫颈癌的效果及对排尿功能的影响。方法纳入2019年5月至2022年5月于首都医科大学附属北京妇产医院就诊并诊断为宫颈癌的患者55例,国际妇产科联... 详细信息

目的探讨宫颈癌保留神经的广泛性子宫切除术(nerve sparing radical hysterectomy,NSRH)治疗宫颈癌的效果及对排尿功能的影响。方法纳入2019年5月至2022年5月于首都医科大学附属北京妇产医院就诊并诊断为宫颈癌的患者55例,国际妇产科联盟分期分布在ⅠB至ⅡA2。其中28例患者接受了NSRH(NSRH组),27例患者接受了广泛性全子宫切除术(radical hysterectomy,RH)(RH组)。比较2组患者手术相关指标及术后排尿功能。结果NSRH组平均年龄为(51.0±7.9)岁,RH组平均年龄为(46.3±8.5)岁,年龄分布差异有统计学意义(P0.05)。2组患者手术切缘均为阴性。术后病理提示阴道长度、淋巴结转移、间质浸润深度、淋巴脉管浸润比较差异均无统计学意义(P>0.05)。在术后膀胱功能方面,NSRH组残余尿较RH组多(P<0.05),但NSRH组拔尿管的时间较RH组明显缩短(P<0.05)。结论NSRH能够在确保手术范围的同时,减轻对术后排尿功能的影响,缩短术后恢复时间。

关键词：宫颈肿瘤保留神经的广泛子宫切除术排尿功能

敲除PAMM基因对小鼠白色和棕色脂肪组织基因表达的影响

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中国病理生理杂志 2024年第4期40卷 697-705页

作者：孙雪荣徐明锋吴洪福梁杰吴志远陈露珠和文奕李伟玲张之炜刘新光史玉仓广东医科大学广东省医学分子诊断重点实验室衰老研究所广东东莞523808 广东医科大学生理学教研室广东湛江524023 广东医科大学生理学教研室广东东莞523808 广东医科大学附属医院整形外科广东湛江524001 广东医科大学药学院广东东莞523808 广东医科大学医学技术学院广东东莞523808 广东医科大学第二临床医学院广东东莞523808

目的:巨噬细胞集落刺激因子诱导单核细胞活化的类过氧化物酶2(peroxiredoxin-like 2 activated in M-CSF stimulated monocytes,PAMM)是一种具有抗炎、抗氧化功能的蛋白,在脂肪组织中高表达,本文拟利用基因敲除小鼠,探究PAMM对白色和棕... 详细信息

目的:巨噬细胞集落刺激因子诱导单核细胞活化的类过氧化物酶2(peroxiredoxin-like 2 activated in M-CSF stimulated monocytes,PAMM)是一种具有抗炎、抗氧化功能的蛋白,在脂肪组织中高表达,本文拟利用基因敲除小鼠,探究PAMM对白色和棕色脂肪组织形态及基因表达等的影响,以期为其功能研究提供新思路。方法:利用CRISPR-Cas9等技术构建PAMM基因敲除(knockout,KO)小鼠,用野生型(wild-type,WT)小鼠作为对照。收集腹股沟皮下白色脂肪组织(inguinal adipose tissue,IAT)和背部棕色脂肪组织(brown adipose tissue,BAT),通过HE染色观察组织形态,利用RNA-seq和RT-qPCR检测相关基因的表达。结果:通过基因组PCR及测序,证明基因敲除小鼠构建正确。敲除PAMM后IAT和BAT形态无明显变化,但E2F靶点、未折叠蛋白反应等基因集在IAT或BAT中富集。比较WT和KO小鼠组织,发现33个基因的变化趋势在IAT和BAT中保持一致;而仅在IAT中出现变化的基因,分布在胞外、胞膜等部位,参与免疫和趋化反应等,与钙信号通路等相关;仅在BAT中出现变化的基因,分布在胞外基质、胞核等部位,参与葡萄糖稳态、生物节律等过程。RT-qPCR检测钙通路及生物节律相关基因,变化趋势与测序结果类似。本文还观察了敲除PAMM对IAT和BAT之间差异表达基因的影响,发现WT和KO小鼠BAT/IAT的差异基因和通路大多相同,但也有部分基因和通路发生了变化。结论:PAMM敲除对IAT和BAT的形态结构无明显影响,但显著影响了二者的基因表达及相关信号通路,还可能影响IAT和BAT之间的相互作用。

关键词：白色脂肪组织棕色脂肪组织 PAMM基因基因敲除

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海马CRHR1调节慢性应激致老年前期小鼠学习记忆损伤的机制

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安徽医科大学学报 2024年第1期59卷 117-126页

作者：屠心茹徐家雯刘锐陆雨琳王书姚余有安徽医科大学公共卫生学院卫生检验与检疫学系合肥230032 安徽医科大学第一临床医学院合肥230032 安徽医科大学第三附属医院老年医学科合肥230061 人口健康与优生安徽省重点实验室合肥230032

目的探究海马促肾上腺皮质激素释放激素(CRH)受体1型(CRHR1)在慢性应激致老年前期小鼠学习记忆损伤中的作用机制。方法12~14月龄的C57BL/6J小鼠根据性别、基因型以及是否予以慢性不可预测应激(CUS)进行分组,对应激组施加为期30 d的CUS... 详细信息

目的探究海马促肾上腺皮质激素释放激素(CRH)受体1型(CRHR1)在慢性应激致老年前期小鼠学习记忆损伤中的作用机制。方法12~14月龄的C57BL/6J小鼠根据性别、基因型以及是否予以慢性不可预测应激(CUS)进行分组,对应激组施加为期30 d的CUS。使用聚合酶链式反应(PCR)、琼脂糖凝胶电泳和实时荧光定量PCR(RT-qPCR)对小鼠进行基因型鉴定。新物体识别实验和Morris水迷宫测定学习记忆能力。Golgi-Cox染色观察海马神经元树突受损情况,Western blot测定海马组织雷帕霉素靶蛋白(mTOR)、p-mTOR(Ser2448)、核糖体蛋白S6激酶(p70S6K)、p-p70S6K(Thr389/Thr412)蛋白表达,ELISA检测血清CRH水平。结果相较于慢性应激前,WT应激各组小鼠慢性应激后的认知系数下降,差异有统计学意义(P<0.05),而KN应激各组小鼠慢性应激前后认知系数差异无统计学意义。与WT应激组相比,WT对照组小鼠逃避潜伏期均缩短(P<0.05)、穿越平台和目标象限次数上升(P<0.01),KN各组小鼠上述差异无统计学意义。相较于WT对照组,WT应激组小鼠海马CA1、CA3、DG区神经元复杂性降低(P<0.05),海马p-mTOR、p-p70S6K表达水平均降低(P<0.05);而KN应激组与KN对照组相比,除雌性组小鼠海马p-mTOR表达水平降低外(P<0.05),其余均无显著性差异。此外,与对照组相比,应激各组小鼠血清CRH水平均上升,差异有统计学意义(P<0.01)。结论海马CRHR1调控慢性应激所致的老年前期小鼠的学习记忆损伤和神经元树突受损,其机制可能是慢性应激引起的高水平CRH无法与受体CRHR1结合,减轻了高水平CRH所抑制的mTOR/p70S6K信号通路表达。

关键词：慢性应激学习记忆损伤 CRHR1 p-mTOR p-p70S6K

黄体期长方案与拮抗剂方案在首次拮抗剂失败后PCOS患者中的应用比较

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安徽医科大学学报 2024年第6期59卷 976-982页

作者：王田娟王超邢琼徐玉萍张文香周平许孝凤魏兆莲曹云霞安徽医科大学第一附属医院妇产科合肥230032 国家卫生健康委配子及生殖道异常研究重点实验室合肥230032 出生人口健康教育部重点实验室合肥230032

目的探讨首次拮抗剂治疗失败的多囊卵巢综合征(PCOS)患者再次超促排卵时分别采用黄体期长方案和拮抗剂方案诱导排卵的临床效果及妊娠结局的优劣。方法检索首次采用拮抗剂方案行IVF/ICSI-ET助孕失败后再次超促排卵的PCOS患者163例,根据... 详细信息

目的探讨首次拮抗剂治疗失败的多囊卵巢综合征(PCOS)患者再次超促排卵时分别采用黄体期长方案和拮抗剂方案诱导排卵的临床效果及妊娠结局的优劣。方法检索首次采用拮抗剂方案行IVF/ICSI-ET助孕失败后再次超促排卵的PCOS患者163例,根据第二次超促排卵方案,分为黄体期长方案组(共95例)和拮抗剂方案组(共68例)。回顾性分析比较两组患者的基础临床资料、临床及实验室指标及妊娠结局。结果①两组患者的基础临床指标除了LH,其他指标差异均无统计学意义。②黄体期长方案组患者自身超排卵对比,促性腺激素(Gn)启动剂量、Gn总天数、Gn总使用量、hCG注射日雌二醇(E_(2))值、获卵数、卵子成熟率、2PN受精数、2PN卵裂数、囊胚形成率、优质囊胚形成率显著高于首次拮抗剂周期(P临床妊娠率及活产率略高,但差异无统计学意义。首次解冻周期的妊娠结局比较,拮抗剂组的生化妊娠率、临床妊娠率高于黄体期长方案组(P<0.05),但着床率、活产率、新生儿胎龄及出生体质量差异无统计学意义。结论对于首次拮抗剂方案治疗失败的患者,适当增加Gn启动剂量及用量,两种方案均能获得满意的妊娠结局。相较于黄体期长方案,再次使用拮抗剂方案保持了其优势,包括治疗周期短、成本低、患者依从性好。

关键词：多囊卵巢综合征体外受精黄体期长方案拮抗剂方案控制性促排卵

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右美托咪定对肝细胞肝癌肿瘤学行为的影响及Nrf2在其中的作用

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安徽医科大学学报 2024年第1期59卷 15-22页

作者：吴瑞欣周大臣唐赛兰黄春霞安徽医科大学第二附属医院麻醉与围术期医学科合肥230601 麻醉与围术期医学安徽普通高校重点实验室合肥230601 安徽医科大学第二附属医院肝胆外科合肥230601

目的从在体和离体两个层面评价右美托咪定对肝细胞肝癌肿瘤学行为的影响及核转录因子红系2相关因子2(Nrf2)在其中的作用。方法在体层面:将雄性C57BL/6J小鼠随机分为对照(Ctrl)组、肝细胞肝癌(HCC)组、HCC+右美托咪定(HCC+Dex)组。小鼠... 详细信息

目的从在体和离体两个层面评价右美托咪定对肝细胞肝癌肿瘤学行为的影响及核转录因子红系2相关因子2(Nrf2)在其中的作用。方法在体层面:将雄性C57BL/6J小鼠随机分为对照(Ctrl)组、肝细胞肝癌(HCC)组、HCC+右美托咪定(HCC+Dex)组。小鼠经N-亚硝基二乙胺(DEN)/四氯化碳(CCl 4)联合诱导形成HCC,随后2周每日腹腔注射右美托咪定10μg/kg,继续饲养小鼠1个月后,检测小鼠肝脏肿瘤的数量及最长径,利用Ki67免疫组化评估肝癌的增殖能力,通过免疫荧光检测肿瘤组织中Nrf2蛋白的表达水平。离体层面:在Hepa1-6细胞中,给予不同浓度的右美托咪定(0.1、1.0、5.0 nmol/L)孵育48 h,分别采用四甲基偶氮唑盐比色法(MTT法)、Transwell法检测细胞的增殖、侵袭和迁移能力,使用Western blot和免疫荧光检测肝癌细胞中Nrf2蛋白的表达水平。经si-RNA转染敲低Nrf2,继以1 nmol/L右美托咪定孵育48 h后,分别使用MTT、Transwell法检测细胞的增殖、侵袭和迁移能力。结果与HCC组比较,解剖学检查结果显示HCC+Dex组小鼠肝脏肿瘤数量增多、最长径增长(P<0.05);Ki67免疫组化结果显示,HCC+Dex组肝癌组织Ki67阳性细胞数增加(P<0.01);免疫荧光结果显示,HCC+Dex组Nrf2表达水平上调(P<0.01)。MTT结果显示1 nmol/L的右美托咪定增强了Hepa1-6细胞的细胞活力(P<0.05);Transwell法结果显示0.1、1和5 nmol/L的右美托咪定增强了Hepa1-6细胞的侵袭能力,0.1、1 nmol/L的右美托咪定增强了Hepa1-6细胞的迁移能力(P<0.05);Western blot和免疫荧光结果显示,使用1 nmol/L的右美托咪定处理后,细胞的Nrf2表达水平上调(P<0.01);使用si-RNA敲低细胞的Nrf2表达水平,再继以1 nmol/L的右美托咪定处理后,MTT、Transwell检测结果显示,Hepa1-6细胞的活力降低,侵袭和迁移的能力降低(P<0.01)。结论右美托咪定可能通过提高Nrf2的表达水平来促进肝癌的增殖、侵袭和迁移能力。

关键词：右美托咪定肝细胞肝癌核因子E2相关因子2 增殖侵袭迁移

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女性生殖道中肾腺癌临床病理及分子特征分析

现代妇产科进展 2024年第5期33卷 327-331,339页

作者：靳琼磨娜詹阳韩超徐小红首都医科大学附属北京妇产医院/北京妇幼保健院妇瘤科北京100006 首都医科大学附属北京妇产医院/北京妇幼保健院病理科北京100006

目的:探讨女性生殖道中肾腺癌的临床特点、组织病理学形态及免疫表型和分子特征。方法:收集2014年1月至2023年12月于首都医科大学附属北京妇产医院确诊的女性生殖道中肾腺癌5例(宫颈中肾腺癌4例及阴道中肾腺癌1例),回顾分析其临床病理... 详细信息

目的:探讨女性生殖道中肾腺癌的临床特点、组织病理学形态及免疫表型和分子特征。方法:收集2014年1月至2023年12月于首都医科大学附属北京妇产医院确诊的女性生殖道中肾腺癌5例(宫颈中肾腺癌4例及阴道中肾腺癌1例),回顾分析其临床病理资料。结果:5例患者平均年龄55岁(49~63岁)。主要临床表现为异常阴道出血。4例宫颈中肾腺癌均在术前行宫颈活检,但未明确诊断为中肾腺癌。患者均行根治性全子宫切除+双侧附件切除+盆腔淋巴结清扫±腹主动脉旁淋巴结切除术,术前和(或)术后行以铂类为基础的化疗±放疗±抗血管生成治疗。4例宫颈中肾腺癌诊断为FIGOⅠb1~Ⅱb期,1例阴道中肾腺癌诊断为Ⅲ期。宫颈中肾腺癌肿瘤主体位于宫颈管壁深层,肿瘤周边存在中肾管残余/中肾管增生。5例中肾腺癌的免疫组化染色结果基本一致,阳性表达PAX8、GATA3、CD10,并阴性表达TTF-1、ER及PR,且4例为TP53野生型。1例宫颈中肾腺癌和1例阴道中肾腺癌均存在KRAS基因突变,突变位点分别为p.G12D及p.G12A。平均随访51个月(18~115月),1例阴道中肾腺癌患者在随访13个月时发生肺转移。结论:女性生殖道中肾腺癌是起源于中肾管残留或增生的罕见恶性肿瘤。中肾腺癌极易误诊,结合PAX8、GATA-3、CD10、ER、PR及TTF-1等免疫组化特征有助于明确诊断。中肾腺癌常与KRAS/NRAS的分子改变有关,为疾病的分子靶向治疗提供了依据。

关键词：中肾腺癌宫颈癌阴道癌诊断 KARS

磨牙根管治疗后锂基玻璃陶瓷髓腔固位冠修复的回顾性分析

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口腔颌面修复学杂志 2024年第4期25卷 283-291页

作者：曾百进张介冰罗斌孟丹江青松首都医科大学附属北京口腔医院修复科北京100050 首都医科大学附属北京口腔医院种植科北京100050

目的:了解根管治疗后磨牙采用锂基玻璃陶瓷髓腔固位冠(endocrown)修复的临床效果。方法:选择根管治疗后的磨牙,经同一医师评估为大面积牙体缺损或者临床冠较短常规修复无法获得足够的固位力。所有预备体肩台均采用端对端的预备方式,保... 详细信息

目的:了解根管治疗后磨牙采用锂基玻璃陶瓷髓腔固位冠(endocrown)修复的临床效果。方法:选择根管治疗后的磨牙,经同一医师评估为大面积牙体缺损或者临床冠较短常规修复无法获得足够的固位力。所有预备体肩台均采用端对端的预备方式,保证至少1.0 mm的瓷厚度;髓腔深度大于4.0 mm时采用玻璃离子垫底。采用CAD/CAM制作锂基玻璃陶瓷髓腔固位冠后粘接。临床随访并观察和记录相关临床指标。结果:纳入观察的234个患者249个髓腔固位冠在4-9年的观察中,继发龋32颗;修复体折断5颗;脱粘接25颗,脱粘接的25颗中除5颗拔除外其余重新再粘接或重新修复;患根尖周炎8颗,其中7颗拔除;14颗患牙拔除,其中5颗因为预备体折断,1颗因为牙周牙髓联合病变,7颗因根尖周炎,7颗中有3颗合并预备体折断;4颗因继发龋后缺损太大。髓腔固位冠修复4-9年患牙总保存率可达94.38%。性别、年龄、牙位、预备体边缘位置对预备体是否会发生折裂以及是否会产生根尖周炎无明显关系;髓腔垫底会降低患牙根尖周炎及以及最终拔除的风险。第二磨牙脱粘接和患龋率明显高于第一磨牙。预备体边缘位于龈下与患龋、脱粘接以及修复体损坏的风险相关。随着年龄的增加,修复体脱粘接风险增高。结论:锂基玻璃陶瓷瓷髓腔固位冠可满足临床修复效果,是临床冠短患牙修复的理想选择,是大面积牙体缺损需要桩核冠修复患牙的有益补充。对于根管治疗后的患牙采用髓腔固位冠修复时应考虑垫底及避免预备体边缘位于龈下。

关键词：髓腔固位冠磨牙玻璃陶瓷 CAD/CAM