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三株克斯特丛毛单胞菌特性研究

中国热带医学 2024年

作者：王崇圳董灵芝陈东科欧阳汀兰三亚市人民医院检验科/中心实验室

目的本研究对三亚市人民医院2023年9月—10月3例患者粪便样本中分离的3株克斯特丛毛单胞菌进行了一系列生化特性及基因分析，以其增进对该菌的了解，为预防和控制与该菌相关的感染和疾病提供一定的参考依据。方法将患者粪便标本分别... 详细信息

目的本研究对三亚市人民医院2023年9月—10月3例患者粪便样本中分离的3株克斯特丛毛单胞菌进行了一系列生化特性及基因分析，以其增进对该菌的了解，为预防和控制与该菌相关的感染和疾病提供一定的参考依据。方法将患者粪便标本分别接种于哥伦比亚血琼脂平板培养基，充分培养后对使用氧化酶试剂对结果为阳性的菌株进行单菌落分离和纯培养。之后，使用VITEK2-Compact全自动微生物鉴定及药敏分析系统对目标菌落进行生化鉴定和抗生素药物敏感性的测定，使用VITEK MS质谱仪鉴定细菌所在菌属。同时，提取细菌DNA进行16s rRNA测序和细菌框架图测序，使用多种生物信息学分析工具进行测序分析。结果培养到了3株氧化酶阳性单菌落，且质谱仪无法鉴定出具体菌种。药敏试验结果表明3株细菌对大多数的药物敏感，但部分菌株对环丙沙星和复方新诺明耐药。16s rRNA测序将细菌鉴定到了Comamonas属，细菌框架图测序分析表明所有细菌均是克斯特丛毛单胞菌（Comamonas kerstersii）。生物信息学分析表明，3株细菌的毒力因子中，均含有与氧化酶阳性的肠道致病菌相关的基因包括气单胞菌属的flmH基因、弧菌属的vctC基因和rmlB基因、耶尔森菌属的flgG基因和flhC基因。病原与宿主互作（PHI）分析结果提示了目标菌基因组中可能存在引起肠道感染的病原基因。结论克斯特丛毛单胞菌无法被常规质谱仪鉴定，需要借助测序展开分析。该菌对大多数抗菌药物敏感，但个别菌株对环丙沙星和复方新诺明耐药。克斯特丛毛单胞菌与感染，特别是消化道感染，存在一定的相关性，但致病机理有待后续研究。

关键词：克斯特丛毛单胞菌粪便生化特征毒力分析 PHI互作分析

Ⅳ期非小细胞肺癌临床特征与生存预后的相关性分析

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中国热带医学 2024年第5期24卷 571-578页

作者：盛佳丽张慧慧毕小慢郑少江海南医学院第一附属医院肿瘤研究所重大疾病生物样本资源海南省工程研究中心海南海口570102

目的通过探讨Ⅳ期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的临床特征与生存预后情况,为NSCLC预后评价及防治提供参考依据。方法以海南医学院第一附属医院肿瘤内科、呼吸内科2016—2020年收治的经病理学确诊且可供分析研究的19... 详细信息

目的通过探讨Ⅳ期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的临床特征与生存预后情况,为NSCLC预后评价及防治提供参考依据。方法以海南医学院第一附属医院肿瘤内科、呼吸内科2016—2020年收治的经病理学确诊且可供分析研究的195例Ⅳ期NSCLC患者为研究对象进行回顾性分析。收集患者的住院病历资料及随访资料,统计随访截止时患者的生存情况。采用Kaplan-Meier法计算生存率,利用Log-rank法进行分层变量对生存情况的影响进行单因素分析,通过多因素Cox回归模型分析患者生存预后的危险因素。结果Ⅳ期非小细胞肺癌患者中位生存时间为17.05(95%CI:12.64~21.45)个月,1年、2年和3年累积生存率分别是70.7%、41.5%和22.0%。多因素分析结果提示,性别(HR=0.697,95%CI:0.486~0.999,P=0.049),功能状态评分标准(Karnofsky,KPS)(HR=1.535,95%CI:1.038~2.270,P=0.032),计算机断层扫描(computed tomography,CT)肿瘤位置(HR=1.481,95%CI:1.003~2.186,P=0.036),病理类型(HR=1.181,95%CI:0.715~1.950,P=0.019),转移部位(HR=1.710,95%CI:1.214~2.409,P=0.002),N分期(HR=2.094,95%CI:0.973~4.509,P=0.006),基因突变(HR=2.387,95%CI:1.590~3.584,P<0.001),含化疗方案治疗(HR=1.713,95%CI:1.094~2.683,P=0.019),综合治疗(HR=1.874,95%CI:1.253~2.802,P=0.002)是影响Ⅳ期非小细胞肺癌患者生存预后的独立影响因素(均P<0.05)。亚组分析中,转移部位、含化疗治疗方案是影响Ⅳ期NSCLC基因突变阳性患者生存的独立预后影响因素,接受靶向治疗的患者生存期较长。Ⅳ期NSCLC基因突变阴性或未知患者中,转移部位、含化疗治疗方案、综合治疗是影响Ⅳ期NSCLC患者生存预后影响因素。结论本研究中性别、KPS评分、CT肿瘤位置、病理类型、转移部位、N分期、基因突变、含化疗方案治疗、综合治疗是影响Ⅳ期非小细胞肺癌患者生存预后的重要因素;在治疗方案上,化疗仍是不可或缺的基本治疗方案,另外,综合治疗相比较单一治疗方案能够延长生存期,存在基因突变阳性、服用靶向药物的患者生存时间较长。因此,在Ⅳ期NSCLC的治疗中应检测基因突变状态,选择对应的靶向药物延长生存期。

关键词：非小细胞肺癌 Ⅳ期临床特征预后因素

海南省类鼻疽伯克霍尔德菌临床分离株的基因岛特征和毒力因子分析

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中国人兽共患病学报 2024年第4期40卷 359-368,390页

作者：符晓莹李欢李沙王立程王崇圳黎元莉陈海朱雄三亚市人民医院检验科三亚572000

目的分析类鼻疽伯克霍尔德菌(Burkholderia pseudomallei)临床分离株的基因岛(genomic island,GI)特征和毒力因子差异,为类鼻疽病的诊疗研究提供依据。方法收集***临床分离株,PCR检测和测序分析毒力相关GI,在Islandviewr 4平台上提交全... 详细信息

目的分析类鼻疽伯克霍尔德菌(Burkholderia pseudomallei)临床分离株的基因岛(genomic island,GI)特征和毒力因子差异,为类鼻疽病的诊疗研究提供依据。方法收集***临床分离株,PCR检测和测序分析毒力相关GI,在Islandviewr 4平台上提交全基因组序列注释格式文件,整合SIGI-HMM与IslandPath-DIMOB两种算法预测GI,通过序列比对分析GI独特性和毒力因子差异。结果共收集到52株***临床分离株,结果显示,52个基因组按进化距离分为3个分枝,其中82.69%(43/52)菌株集中在分枝1。52个***基因组共识别出828个GI,按序列相似性聚类为157个GI cluster。GI在基因组中占比达2.05%~6.38%。GI cluster1和2存在全部菌株中,但84个(53.50%)GI cluster只聚类到单个基因组。10个GI cluster很可能是特有的,其中5个来源同属细菌,2个来源其他属,3个来源不确定。25个GI cluster与毒力相关,*** BP76和BP169含有其中8个,是所有菌株中毒力相关GI最多的。52株***的毒力基因除了fhaB1、fhaB2、BPSL1661、cheY1、wzM、tssH-5/clpV、tssA-5、boaA和boaB存在差异,其余都表现一致。与泰国和澳大利亚***临床菌株比较,boaA、boaB、cheY1和chbp在两个国家的菌株中都表现出差异,同时fhaB1、fhaB3和bimA在澳大利亚菌株中表现出差异。结论海南地区*** GI具有保守性和独特性,通过特有GI和毒力因子研究,可以发现菌株水平基因转移(Horizontal gene transfer,HGT)的来源和分子水平的毒力差异。

关键词：类鼻疽伯克霍尔德菌基因组基因岛毒力因子水平基因转移

PARP抑制剂治疗转移性去势抵抗性前列腺癌有效性及安全性的Meta分析

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海南医学院学报 2024年第20期30卷 1570-1578页

作者：刘琳盛佳丽卢彦达郑少江海南医学院第一附属医院肿瘤研究所海南海口570102 海南医学院海南省热带心血管病研究重点实验室海南海口571199

目的:系统评价PARPi治疗转移性去势抵抗性前列腺癌(mCRPC)的有效性及安全性,以期为临床决策供循证医学证据。方法:依据纳入和排除标准,网络检索2015年1月~2023年6月PubMed、Web of Science、Embace、***中有关PARPi治疗mCRPC的随机对照... 详细信息

目的:系统评价PARPi治疗转移性去势抵抗性前列腺癌(mCRPC)的有效性及安全性,以期为临床决策供循证医学证据。方法:依据纳入和排除标准,网络检索2015年1月~2023年6月PubMed、Web of Science、Embace、***中有关PARPi治疗mCRPC的随机对照试验文献,使用RevMan5.4及Stata17.0软件对数据进行Meta分析。结果:纳入7篇随机对照试验文献,共1888例患者。Meta分析结果表明,与非PARPi组比较,PARPi组(PARPi联合或不联合抗激素治疗)可提高mCRPC的放射学无进展生存期(HR=0.52,95%CI=0.34~0.78)和总生存期(HR=0.72,95%CI=0.60~0.86),差异均有统计学意义(P0.05)。结论:与非PARPi比较,PARPi联合或不联合抗激素治疗可提高mCRPC的放射学无进展生存期和总生存期,3级及以上不良反应发生率低,值得在临床上推广应用。

关键词：多聚腺苷二磷酸核糖聚合酶抑制剂转移性去势抵抗性前列腺癌有效性安全性 Meta分析

进境植物检疫性有害生物无花果蜡蚧在海南首次报道及其风险分析

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生物安全学报（中英文） 2024年第3期33卷 300-304页

作者：吕朝军芮凯钟宝珠中国热带农业科学院椰子研究所海南文昌571339 海南省农业科学院植物保护研究所海南海口571100

无花果蜡蚧为我国进境植物检疫性有害生物。2023年3月,在海南省三亚市南滨农场首次发现无花果蜡蚧暴发危害槟榔。为明确该虫在海南的风险性等级,本研究从定性和半定量角度开展无花果蜡蚧在海南的风险分析。结果表明,无花果蜡蚧在海南的... 详细信息

无花果蜡蚧为我国进境植物检疫性有害生物。2023年3月,在海南省三亚市南滨农场首次发现无花果蜡蚧暴发危害槟榔。为明确该虫在海南的风险性等级,本研究从定性和半定量角度开展无花果蜡蚧在海南的风险分析。结果表明,无花果蜡蚧在海南的风险性综合评价值R为2.56,属特别危险有害生物,应迅速开展积极防治和监测预警,制定和启动防控应急预案。根据林业有害生物风险分析准则和无花果蜡蚧在海南风险性分析结果,提出了相应风险管理措施。

关键词：无花果蜡蚧海南省风险分析

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帕金森病晚期的识别及治疗策略

中华老年医学杂志 2024年第5期43卷 635-640页

作者：梁慧许吉怡秦斌海南省人民医院海南医学院附属海南医院神经内科海口570311 首都医科大学附属北京安定医院国家精神心理疾病临床医学研究中心精神疾病诊断与治疗北京市重点实验室北京100088 北京医院神经内科国家老年医学中心中国医学科学院老年医学研究院北京100730

帕金森病(PD)是一种临床表现异质性很高的慢性、进展性、多神经系统受累疾病。随着病情逐渐进展运动并发症的出现患者神经功能进一步恶化,生活质量下降及寿命缩短。常规传统药物治疗难以满足患者良好控制症状,此时称为PD晚期(Advanced P... 详细信息

帕金森病(PD)是一种临床表现异质性很高的慢性、进展性、多神经系统受累疾病。随着病情逐渐进展运动并发症的出现患者神经功能进一步恶化,生活质量下降及寿命缩短。常规传统药物治疗难以满足患者良好控制症状,此时称为PD晚期(Advanced PD,APD)。如何早期识别APD并结合病情变化、及时制定患者最佳治疗方案,在调药基础上推荐PD设备辅助治疗,不仅可提高患者服药依从性和治疗满意度,还可提高患者生活质量及减少照料者负担,但目前仍缺乏识别APD的临床表现和诊断的金标准。为此,本文旨在从APD早期识别和治疗策略方面进行阐述。

关键词：帕金森病晚期设备辅助治疗运动并发症人工智能

棕点石斑鱼(♀)×清水石斑鱼(♂)杂交子代与亲本表型比较及遗传特征分析

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水生生物学报 2024年第3期48卷 444-453页

作者：王同方明宇杨扬宋乐玲蔡春有蒙子宁刘晓春中山大学生命科学学院有害生物控制与资源利用国家重点实验室广东省水生经济动物良种繁育重点实验室广州510006 海南晨海水产有限公司三亚572000 南方海洋科学与工程广东省实验室(珠海) 珠海519080

以棕点石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus)为母本、清水石斑鱼(***)为父本,开展了杂交育种试验,成功获得杂交子一代。由于棕点石斑鱼与清水石斑鱼外型相似,其杂交子代也与亲本难以区分,为探究双亲本与杂交子代表型差异和遗传差异,研究... 详细信息

以棕点石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus)为母本、清水石斑鱼(***)为父本,开展了杂交育种试验,成功获得杂交子一代。由于棕点石斑鱼与清水石斑鱼外型相似,其杂交子代也与亲本难以区分,为探究双亲本与杂交子代表型差异和遗传差异,研究利用外部形态数据及外型框架参数进行比较分析,同时使用微卫星标记对双亲本及杂交子代的遗传特征进行分析。在外部形态结构的探究中,杂交子代可量性状及外形框架更偏向于母本棕点石斑鱼。在遗传特征的分析中,采用ddRAD-seq技术在棕点石斑鱼上获得6266个微卫星标记,筛选出7对可以在双亲本及杂交子代中稳定扩增且遗传多样性较高的微卫星引物,其中,6对引物可以在部分群体中扩增出特异性条带以区分3个群体。通过分析,7个微卫星标记位点在杂交子代群体中的平均观测杂合度(H_(o))为0.891,平均期望杂合度(H_(e))为0.768,平均多态信息含量(PIC)为0.717,三者均高于双亲本,表明杂交子代在遗传信息的多样性方面有一定的提高。研究结果可为棕点石斑鱼、清水石斑鱼及两者杂交子代的鉴别提供方法,并为杂交石斑鱼的培育提供一定的理论基础。

关键词：杂交育种表型微卫星标记棕点石斑鱼清水石斑鱼

基于数据增强策略和卷积神经网络的近红外光谱分析研究

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分析化学 2024年第9期52卷 1266-1276页

作者：郑运杨思雨王涛邓焯文兰维杰云永欢潘磊庆海南大学食品科学与工程学院南京农业大学食品科技学院

近红外光谱技术结合化学计量学算法已广泛应用于食品和药品等领域的定性和定量分析。然而，传统化学计量学方法，特别是线性分类方法，在解决多分类问题时的效果不佳。卷积神经网络（CNN）能够提取数据中的深层次特征，适合处理非线性... 详细信息

近红外光谱技术结合化学计量学算法已广泛应用于食品和药品等领域的定性和定量分析。然而，传统化学计量学方法，特别是线性分类方法，在解决多分类问题时的效果不佳。卷积神经网络（CNN）能够提取数据中的深层次特征，适合处理非线性关系，但其建模性能依赖样本量的大小和多样性，而近红外光谱样本数据的采集和预处理过程通常耗时且费力，获取样本成本较高。本研究提出了一种基于数据增强策略和CNN的近红外光谱定性分析方法。此数据增强策略分为两步：（1）分别采用Bootstrap重采样和生成对抗网络（GAN）方法对3个近红外光谱数据集（药片、咖啡和葡萄）进行样本扩增；（2）将原始样本（Y）分别与Bootstrap扩增样本（B）和GAN扩增样本（G）进行组合，得到3种增强数据集（Y-B、Y-G和Y-B-G）。在此基础上，设计了适用于此数据集的CNN模型结构，由2个一维卷积层、1个最大池化层和1个全连接层组成。与偏最小二乘判别分析（PLS-DA）、支持向量机（SVM）和BP神经网络（BP）的最优模型相比，基于Y-B数据集的CNN模型对药片（2类）分析的平均准确率分别提升了3.998%、9.364%和4.689%；基于Y-B-G数据集的CNN模型对咖啡（7类）分析的平均准确率分别提升了6.001%、2.004%和7.523%；基于Y-B数据集的CNN模型对葡萄（20类）分析的平均准确率分别提升了33.408%、51.994%和34.378%。此结果表明，基于数据增强策略和CNN在不同数据集和分类类别中建立的模型均表现出更好的分类准确率和泛化性能。

关键词：数据增强近红外光谱卷积神经网络化学计量学

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不解糖嗜陈菌致血流感染1例

临床检验杂志 2024年第10期42卷 791-793页

作者：许丽霞钟山王崇圳王立程李欢符晓莹黎元莉陈东科三亚市人民医院检验科海南三亚572000

报道1例因脑出血、脑梗死后长期卧床的患者因皮肤多处溃烂而入院,在患者血液和脓液样本中均检出不解糖嗜陈菌,通过VitekMS和16SrRNA技术进行鉴定。为了指导临床治疗,对该菌株进行药物敏感性试验,并根据试验结果调整治疗方案,使患者病情... 详细信息

报道1例因脑出血、脑梗死后长期卧床的患者因皮肤多处溃烂而入院,在患者血液和脓液样本中均检出不解糖嗜陈菌,通过VitekMS和16SrRNA技术进行鉴定。为了指导临床治疗,对该菌株进行药物敏感性试验,并根据试验结果调整治疗方案,使患者病情得到显著改善。鉴于不解糖嗜陈菌在国内的病例报道较少,该文强调加强厌氧菌检测的重要性,有助于提升临床医生对此类细菌的识别与治疗能力。

关键词：血流感染不解糖嗜陈菌厌氧菌