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中医临床研究 2024年第8期16卷 1-10页

作者：符诚潘晔张明利河南中医药大学第一临床医学院河南郑州450008 河南省中西医结合医院河南郑州450004

目的:基于网络药理学方法探讨扶正感康丸治疗甲型流行性感冒、乙型流行性感冒的有效成分及作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取扶正感康丸的有效成分及作用靶点。通过GeneCards、NCBI数据库检索甲型流行性感... 详细信息

目的:基于网络药理学方法探讨扶正感康丸治疗甲型流行性感冒、乙型流行性感冒的有效成分及作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取扶正感康丸的有效成分及作用靶点。通过GeneCards、NCBI数据库检索甲型流行性感冒、乙型流行性感冒疾病基因,获取有效成分-疾病共同靶点,并通过STRING数据库获得蛋白质-蛋白质相互作用网络,再使用Cytoscape软件绘制网络图并筛选核心靶点。其后,使用Metascape数据库对核心靶点进行富集分析,进一步获取通路关键靶点,并结合BioGPS、DisGeNET、GeneCards网站获取关键靶点的组织定位、亚细胞分布的相关信息。结果:获得扶正感康丸6味主要药物的有效成分85个,与甲型流行性感冒的交集靶点有41个,与乙型流行性感冒的交集靶点有106个,其中槲皮素、山柰酚等是核心成分,肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、白细胞介素(Interleukin,IL)-6等是甲型流行性感冒关键靶点,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、IL-6等是乙型流行性感冒关键靶点。基因本体论(GO)富集分析显示,扶正感康丸主要参与细胞死亡的正调控、细胞分化的负调控等生物过程,膜筏、膜侧等细胞组分,RNA聚合酶II特异性DNA结合转录因子结合、蛋白质同源二聚化活性等分子功能。京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析结果显示,扶正感康丸治疗甲型流行性感冒主要参与了肿瘤信号通路、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、小细胞肺癌等通路;扶正感康丸治疗乙型流行性感冒主要参与了肿瘤信号通路、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(Phosphatidylinositol 3-kinase-Akt,PI3K-Akt)信号通路、核因子-κB信号通路等相关通路。根据扶正感康丸治疗甲型流行性感冒和乙型流行性感冒的靶点分布情况,推测免疫细胞在提高机体免疫功能、治疗此类疾病中发挥较大作用。结论:扶正感康丸可以调节核因子-κB、PI3K-Akt等信号通路的AKT1、TNF、基质金属蛋白酶(Matrix Metallopeptidase,MMP)9、IL-10、IL-6等疾病靶点干预生物进程,从而治疗流行性感冒。

关键词：扶正感康丸网络药理学流行性感冒

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基于数据挖掘和网络药理学探究新型冠状病毒感染治疗方的组方规律及作用机制

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中医临床研究 2023年第14期15卷 10-20页

作者：潘晔符诚王欣张明利河南省中西医结合医院河南郑州450004 河南中医药大学第一临床医学院河南郑州450008

目的:研究2019年以来新型冠状病毒感染治疗方组方规律并通过网络药理学方法进行作用机制研究。方法:通过关联规则找到新型冠状病毒感染治疗方的核心药物组合,并使用Cytoscape软件进行药物、成分、基因对应关系的网络药理学分析,并对共... 详细信息

目的:研究2019年以来新型冠状病毒感染治疗方组方规律并通过网络药理学方法进行作用机制研究。方法:通过关联规则找到新型冠状病毒感染治疗方的核心药物组合,并使用Cytoscape软件进行药物、成分、基因对应关系的网络药理学分析,并对共同基因进行蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、基因本体论富集分析与通路分析,研究核心药物组合治疗新型冠状病毒感染的分子机制。结果:178首处方的168味中药分析得到两个核心药物组合:麻黄、苦杏仁、石膏及甘草,人参、附子及山茱萸,对两个组合进行网络药理学分析,发现两个药组与新型冠状病毒感染分别有93及38个交集基因。由网络药理学分析得到的药物-化合物-作用靶点-疾病网络显示:麻黄药组中,槲黄素、木樨草素、山柰酚、柚皮素、芒柄花素、异鼠李素等活性化合物在整个网络中发挥着关键作用;人参药组中人参皂苷、山柰酚、β-谷甾醇等活性化合物在整个网络中发挥着关键作用。结论:麻黄药组与新型冠状病毒感染交集基因的蛋白质-蛋白质相互作用网络中肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、白细胞介素-1β(Interleukin-1β,IL-1β)、肿瘤抑制蛋白p53、Jun原癌基因(Jun Proto-Oncogene,JUN)、白细胞介素-8(CXCL8)、丝裂原活化蛋白激酶3(Mitogen-Activated Protein Kinase 3,MAPK3)、信号转导和转录激活因子(Signal Transducer and Activator of Transcription,STAT)3、缺氧诱导因子-1α、白细胞介素-10(Interleukin-10,IL-10)等靶点起着关键作用,这些靶点共同参与调节细胞因子反应、细胞因子活性、细胞因子产生的正调控等生物过程,发挥抗炎、抗病毒、免疫调节等作用。人参药组与新型冠状病毒感染交集基因的蛋白质-蛋白质相互作用网络中TNF、IL-1β、AKT1、JUN、一氧化氮合酶3、血红素加氧酶1、干扰素γ、RELA癌基因、热休克蛋白90α家族A类成员1(Heat Shock Protein 90 Alpha Family Class A Member 1,HSP90AA1)等靶点起着关键作用,这些靶点共同参与调节蛋白质同源二聚化活性、膜筏、细胞因子反应、对脂多糖的反应、外源性凋亡信号通路的负调控等生物过程,发挥阻断病毒进入细胞及抑制病毒复制的功能,从而治疗新型冠状病毒感染。无论麻黄药组还是人参药组,都通过血脂和动脉粥样硬化、癌症通路、坏死性凋亡、癌症的转录失调通路、糖尿病性心肌病信号通路进行调控,发挥治疗新型冠状病毒感染的作用。

关键词：新型冠状病毒感染治疗方数据挖掘作用机制

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