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生物信息学及分子模拟在蛋白质降解靶向嵌合体(PROTAC)中的研究

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药学学报 2024年第6期59卷 1546-1561页

作者：朱婕聂锦宜刘小益梁中洁苏州大学苏州医学院江苏苏州215123 江苏省精准诊疗药物创制工程研究中心江苏苏州215123

蛋白质降解靶向嵌合体(proteolysis targeting chimera,PROTAC)是一种利用泛素−蛋白酶体系统(ubiquitin proteasome system,UPS)对靶标蛋白进行降解的药物开发技术。与传统小分子药物通过“占位驱动”作用模式调控蛋白质活性的方式不同,... 详细信息

蛋白质降解靶向嵌合体(proteolysis targeting chimera,PROTAC)是一种利用泛素−蛋白酶体系统(ubiquitin proteasome system,UPS)对靶标蛋白进行降解的药物开发技术。与传统小分子药物通过“占位驱动”作用模式调控蛋白质活性的方式不同,PROTAC通过形成稳定的靶蛋白-PROTAC-E3泛素连接酶三元复合物,并利用泛素−蛋白酶体系统降解靶标蛋白而发挥作用。然而,目前只有少数E3泛素连接酶被用到PROTAC分子设计中,PROTAC可靶向的靶标蛋白空间也有待进一步拓展;另一方面,靶蛋白-PROTAC-E3泛素连接酶的三元复合物晶体结构解析难度较大,计算模拟方法为构建三元复合物模型提供了有效的工具。基于此,本文介绍了生物信息学在拓展E3泛素连接酶及扩大靶标蛋白空间方面的研究进展,总结了计算模拟在PROTAC三元复合物结构模拟中的方法研究,并探讨了PROTAC技术的发展趋势。

关键词：蛋白质降解靶向嵌合体 E3泛素连接酶靶标空间三元复合物结构模拟蛋白质翻译后修饰异双功能分子

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猪德尔塔冠状病毒感染新生仔猪的肠道病理及超微结构变化分析

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农业生物技术学报 2024年第7期32卷 1471-1482页

作者：侯宇辰曹亚男杜小妹靳俪雅陈振海吴正常包文斌张帅扬州大学兽医学院扬州大学动物科学与技术学院/江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室扬州大学教育部农业与农产品安全国际合作联合实验室

猪德尔塔冠状病毒(Porcine deltacoronavirus, PDCoV)是近年来新发的猪肠道冠状病毒，给养猪业造成了巨大的经济损失。为了解PDCoV感染新生仔猪(Sus scrofa domesticus)的致病性及肠道的病理超微结构变化，本研究对1日龄新生仔猪攻毒PDC... 详细信息

猪德尔塔冠状病毒(Porcine deltacoronavirus, PDCoV)是近年来新发的猪肠道冠状病毒，给养猪业造成了巨大的经济损失。为了解PDCoV感染新生仔猪(Sus scrofa domesticus)的致病性及肠道的病理超微结构变化，本研究对1日龄新生仔猪攻毒PDCoV CHN-GD16-05毒株后的临床表现、剖检与组织病理学变化、组织嗜性、肠道超微结构变化进行观察及分析。结果发现，新生仔猪攻毒PDCoV后第3天出现严重呕吐、腹泻、精神萎靡、嗜睡等临床症状；剖检发现，攻毒仔猪肠道胀气，肠管扩张，肠壁出血变薄甚至透明，肠腔内积聚黄色液体；PDCoV主要感染仔猪的十二指肠、空肠和回肠；荧光定量PCR和蛋白免疫印迹结果显示，空肠中PDCoV核衣壳蛋白(nucleocapsid, N)基因及其蛋白水平均极显著高于十二指肠和回肠(P<0.01)；进一步空肠组织切片的苏木精伊红染色结果显示，PDCoV感染后破坏肠绒毛结构，引起弥漫性的肠绒毛萎缩甚至融合，隐窝上皮细胞增殖及隐窝深度增加；电镜观察也发现PDCoV感染后的仔猪肠绒毛萎缩，肠上皮细胞的微绒毛断裂脱落，细胞间紧密连接被破坏，胞质空泡状细胞增多，线粒体数目减少且体积增大；此外，PDCoV感染刺激宿主的抗病毒相关基因表达，促进干扰素α (interferon α, IFN-α)、IFN-β、IFN-λ和其下游干扰素刺激基因黏病毒抗性蛋白1 (myxovirus resistance 1, MX-1)、干扰素刺激基因15 (interferon-stimulating gene 15, ISG-15)、干扰素诱导的四肽重复蛋白1 (interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 1, IFIT1)、2'-5'-寡腺苷酸合成酶1 (2'-5'-oligoadenylate synthetase 1, OAS1)、2'-5'寡腺苷酸合成酶样蛋白(2'-5'-oligoadenylate synthetase like, OASL)及炎症因子肿瘤坏死因子α (tumor necrosis factor α, TNF-α)、白细胞介素1β (interleukin 1β, IL-1β)、IL-6、C-C基序趋化因子配体20 (C-C motif chemokine ligand 20, CCL-20)基因的表达。以上结果表明，PDCoV感染新生仔猪后能够迅速入侵小肠，尤其在空肠上皮细胞中大量复制，导致感染的肠上皮细胞变性坏死进而引起肠绒毛萎缩，造成渗透性腹泻。本研究为阐明PDCoV感染仔猪的致病机制提供理论基础。

关键词：猪德尔塔冠状病毒(PDCoV) 新生仔猪肠道超微结构

基于CiteSpace的督灸文献可视化分析

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医学信息 2024年第9期37卷 30-35页

作者：刘洁王秋琴南京中医药大学护理学院

目的分析督灸领域的研究现状及热点，为我国非药物疗法研究提供依据。方法检索中国知网（CNKI）、维普、万方数据库自建库起到2023年3月26日收录的督灸研究相关文献，利用CiteSpace6.2.R1Basic分析纳入文献的发文量、作者、机构、关... 详细信息

目的分析督灸领域的研究现状及热点，为我国非药物疗法研究提供依据。方法检索中国知网（CNKI）、维普、万方数据库自建库起到2023年3月26日收录的督灸研究相关文献，利用CiteSpace6.2.R1Basic分析纳入文献的发文量、作者、机构、关键词等特征。结果共纳入652篇文献，督灸相关文献的发文量总体呈现上升趋势，在2016年之后呈高速增长。杨继国是国内发文量最多的作者，共计25篇，最大的合作团队是杨继国、刘源香和庞亚铮等人合作的团队，团队间合作密切。国内发文量最多的机构是山东中医药大学，但各机构间相对独立，缺乏合作。督灸临床应用及疗效观察是目前研究热点，作用机制研究较少。结论研究者对督灸的关注度越来越高，目前主要聚焦临床应用，作用机制探索较少，各研究者和研究机构之间合作较少，后期需要加强跨机构、跨地区、跨学科的合作交流，促进督灸可持续发展。

关键词：督灸中医非药物疗法 CiteSpace 可视化分析

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荧光磁性碳点对卵巢癌细胞的靶向成像与检测

无机化学学报 2024年第8期40卷 1483-1490页

作者：钟思意林小文刘嘉欣王如意梁涛邓峥峰钟傲韩翠平徐州医科大学医学影像学院徐州221004 徐州医科大学基础医学国家级实验教学示范中心徐州221004 徐州医科大学附属医院影像科徐州221000

利用高温碳化法制备了荧光磁性钆掺杂碳点(Gd-CDs),其具有明亮的绿色荧光发射,荧光量子产率为32.6%,T1弛豫效率高达9.02 L·mmol^(-1)·s^(-1)。将Gd-CDs与卵巢癌特异性抗体Anti-HE4连接,得到的Anti-HE4/Gd-CDs纳米探针能对SKOV-3卵巢... 详细信息

利用高温碳化法制备了荧光磁性钆掺杂碳点(Gd-CDs),其具有明亮的绿色荧光发射,荧光量子产率为32.6%,T1弛豫效率高达9.02 L·mmol^(-1)·s^(-1)。将Gd-CDs与卵巢癌特异性抗体Anti-HE4连接,得到的Anti-HE4/Gd-CDs纳米探针能对SKOV-3卵巢癌细胞进行特异性的荧光成像和T1加权成像,其荧光信号强度与SKOV-3的细胞浓度成正比,对SKOV-3细胞的检测限为658 cell·mL^(-1)。以该方法检测了血液样品中的SKOV-3细胞。

关键词：钆掺杂碳点靶向探针荧光成像磁共振成像卵巢癌细胞

矸石磨料射流冲击煤体的破碎行为及其力学特性研究

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采矿与安全工程学报 2024年第3期41卷 623-633页

作者：王青祥王通唐佳旭刘应科王凤超高天昊钮月中国矿业大学安全工程学院江苏徐州221116 中国矿业大学低碳能源与动力工程学院江苏徐州221116 中国矿业大学深地工程智能建造与健康运维全国重点实验室江苏徐州221116

创新性提出了矸石磨料射流破煤技术,针对矸石磨料射流冲击破碎煤体动态过程,采用SPH-FEM耦合算法,构建了矸石磨料射流破煤数值模型,研究了破煤过程中应力损伤机制及射流参数对煤体破碎效果的影响规律。研究结果表明:随着射流速度由150 ... 详细信息

创新性提出了矸石磨料射流破煤技术,针对矸石磨料射流冲击破碎煤体动态过程,采用SPH-FEM耦合算法,构建了矸石磨料射流破煤数值模型,研究了破煤过程中应力损伤机制及射流参数对煤体破碎效果的影响规律。研究结果表明:随着射流速度由150 m/s增加到350 m/s,煤体的冲蚀深度和冲蚀纵截面面积近似线性增加,冲蚀宽度先增大后趋于稳定值,冲蚀宽度峰值为5.2 mm;随着射流柱直径的增加,煤体冲蚀宽度和冲蚀纵截面面积不断增大,冲蚀深度缓慢减小;磨料粒径由0.8 mm增加到1.2 mm时,最佳破煤粒径为0.8 mm;当t=2μs时,沿轴向深度和径向宽度方向,所选煤体单元的有效应力依次减小;当t>2μs时,径向上所有煤体单元的有效应力随时间增大而逐渐减小;随着磨料射流不断冲击,轴向煤体单元的有效应力峰值接替出现;沿着径向和轴向,从冲击表面中心到射流远端,损伤失效速率逐渐减小,分别呈瞬时和阶梯形损伤失效特征。研究结果为揭示磨料射流冲蚀破煤行为及其机理提供重要理论支撑。

关键词：矸石磨料射流煤体破碎应力损伤机制 SPH⁃FEM耦合

小学生营养教育家校社合作困境量表的编制及信效度检验

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中国学校卫生 2024年第6期45卷 775-779页

作者：罗彩凤吴静徐剑鸥吕妃孙佳萱尚彬张许婷江苏大学医学院镇江212000 江苏大学京江学院

目的编制小学生营养教育家校社合作困境量表,并检验其信效度,为制定有针对性的家校社合作营养教育策略提供依据。方法2022年7月至2023年7月,基于交叠影响域理论,通过质性访谈、文献回顾、德尔菲专家函询和预调查形成初始量表。2023年7—... 详细信息

目的编制小学生营养教育家校社合作困境量表,并检验其信效度,为制定有针对性的家校社合作营养教育策略提供依据。方法2022年7月至2023年7月,基于交叠影响域理论,通过质性访谈、文献回顾、德尔菲专家函询和预调查形成初始量表。2023年7—9月,采用方便抽样方法选取江苏省6所城市的125名小学生家长、118名小学教师、113名社区相关人员进行调查,检验量表的信效度,形成正式量表。结果小学生营养教育家校社合作困境量表包括3个维度、19个条目。探索性因子分析提取3个公因子,累计方差贡献率为69.07%。量表平均内容效度为0.94,各维度与量表的相关系数为0.80~0.91。量表总体的Cronbachα系数为0.95,折半信度为0.87,重测信度为0.98。结论小学生营养教育家校社合作困境量表具有良好的信效度,可用于小学生营养教育中家校社合作困境水平的测评。

关键词：健康教育问卷调查德尔菲技术学生

拔节期喷施纳米锌对水稻产量、品质和籽粒锌含量的影响

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江苏农业学报 2024年第6期40卷 961-968页

作者：陈振玲王锐陈洁浦佳玲杨艳菊张洪程张海鹏江苏省作物栽培生理重点实验室/农业农村部长江流域稻作技术创新中心/江苏省粮食作物现代产业技术协同创新中心扬州大学水稻产业工程技术研究院江苏扬州225009

针对稻米锌含量普遍较低的现状,本研究以南粳9108为材料,通过拔节期不同用量(0 kg/hm^(2)、0.2 kg/hm^(2)、0.4 kg/hm^(2)、0.6 kg/hm^(2)、0.8 kg/hm^(2)、1.0 kg/hm^(2))的纳米锌悬浊液叶面喷施试验,分析喷施纳米锌对水稻产量、品质... 详细信息

针对稻米锌含量普遍较低的现状,本研究以南粳9108为材料,通过拔节期不同用量(0 kg/hm^(2)、0.2 kg/hm^(2)、0.4 kg/hm^(2)、0.6 kg/hm^(2)、0.8 kg/hm^(2)、1.0 kg/hm^(2))的纳米锌悬浊液叶面喷施试验,分析喷施纳米锌对水稻产量、品质及籽粒锌含量的影响。结果表明,拔节期喷施高剂量(0.8~1.0 kg/hm^(2))的纳米锌悬浊液可显著提高水稻每穗粒数、结实率和千粒重;纳米锌施用量为1.0 kg/hm^(2)时,水稻较不施纳米锌处理(CK)增产3.9%,效果显著。与CK相比,拔节期喷施0.8~1.0 kg/hm^(2)纳米锌能显著提高稻米糙米率、精米率和整精米率,降低稻米垩白粒率和垩白度。施用纳米锌对稻米食味值、崩解值和回复值等存在正向影响,而对蛋白质含量和直链淀粉含量整体无显著影响。喷施纳米锌能够显著提高水稻籽粒锌含量,促进锌在可食用部位的富集,提高锌的生物利用率。因此,拔节期喷施0.8~1.0 kg/hm^(2)纳米锌悬浊液有利于提高水稻籽粒锌含量,实现水稻优质丰产。

关键词：纳米锌水稻产量稻米品质叶面喷施锌生物利用率

对位芳香族聚酰胺复合纳滤膜制备及高温纳滤性能

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环境化学 2024年第2期43卷 434-443页

作者：王纯赖星颜鼎荷付梦洁郑文丽上海工程技术大学纤维材料研究中心上海201620 天津工业大学省部共建分离膜与膜过程国家重点实验室天津300387 中化高性能纤维材料有限公司扬州211400

本文以对位芳香族聚酰胺(PPTA)超滤膜为基膜,无水哌嗪(PIP)与1,3,5-苯三甲酰氯(TMC)分别作为水相单体和油相单体,采用界面聚合法制得高通量耐热PPTA/PA复合纳滤膜.研究了反应条件对PPTA/PA复合纳滤膜高温纳滤性能影响,观察了复合纳滤膜... 详细信息

本文以对位芳香族聚酰胺(PPTA)超滤膜为基膜,无水哌嗪(PIP)与1,3,5-苯三甲酰氯(TMC)分别作为水相单体和油相单体,采用界面聚合法制得高通量耐热PPTA/PA复合纳滤膜.研究了反应条件对PPTA/PA复合纳滤膜高温纳滤性能影响,观察了复合纳滤膜表面形貌与致密层结构,考察了渗透通量、耐热性以及抗污染等性能.结果表明,当PIP浓度为15%wt,TMC浓度为2.5%wt,热处理温度和时间分别为60℃和8 min时,所得PPTA/PA复合纳滤膜对不同染料分子截留率可达95%以上,对二价盐截留率可达90%以上.在高温条件下,所得PPTA/PA复合纳滤膜表现出优良的染料脱盐性能,在刚果红染料与Na_(2)SO_(4)截留率保持在99%的同时,渗透通量可达50 L·m^(-2)·h^(-1)·MPa^(-1)以上.

关键词：对位芳香族聚酰胺界面聚合复合纳滤膜耐高温

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外源钙添加对有机物料改良滨海盐碱土固碳潜力的影响

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林业科学 2024年第2期60卷 32-41页

作者：史文竹孙禧邵旭升热由索姆王艮梅张焕朝项剑南京林业大学南方现代林业协同创新中心、南京林业大学林学院南京210037

【目的】研究外源钙添加对有机物料改良滨海盐碱土过程中土壤CO_(2)排放和土壤碳库的影响,以期为滨海盐碱土的改良利用与固碳潜力提升提供理论依据。【方法】采用室内培养试验,在施用玉米秸秆生物炭+鸡粪(BM)以及水稻秸秆+鸡粪(SM)的基... 详细信息

【目的】研究外源钙添加对有机物料改良滨海盐碱土过程中土壤CO_(2)排放和土壤碳库的影响,以期为滨海盐碱土的改良利用与固碳潜力提升提供理论依据。【方法】采用室内培养试验,在施用玉米秸秆生物炭+鸡粪(BM)以及水稻秸秆+鸡粪(SM)的基础上,以氢氧化钙和硅酸钙作为钙源,按照等钙量原则,分别设置了6种处理:不施用硅酸钙和氢氧化钙(CK)、施用12.4 g·kg^(-1)硅酸钙(Ca1)、施用24.8 g·kg^(-1)硅酸钙(Ca2)、施用7.9 g·kg^(-1)氢氧化钙(Ca3)、施用15.8 g·kg^(-1)氢氧化钙(Ca4)以及施用12.4 g·kg^(-1)硅酸钙+7.9 g·kg^(-1)氢氧化钙(Ca5),进行1个月的培养试验。【结果】培养期间外源钙的添加能显著降低CO_(2)累积排放;有机物料的施用会导致土壤有机碳(SOC)的损失,外源钙的添加不会显著影响SOC矿化但会导致土壤无机碳(SIC)含量显著增加,从而弥补SOC的损失,增加土壤的总碳量,实现土壤固碳的目的,适当增加氢氧化钙的添加量对固碳量有促进作用;外源钙添加导致的减排作用主要是通过增加吸收矿化产生的CO_(2),并转化为碳酸钙的形式而固定。【结论】在改良盐碱土的过程中,有机物料配施硅酸钙和氢氧化钙的改良措施能实现土壤固碳减排。

关键词：滨海盐碱土二氧化碳土壤固碳土壤无机碳