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利用cDNA-SRAP分析赤霉素诱导甘蔗节间伸长的差异表达

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中国农业科学 2010年第19期43卷 3937-3944页

作者：吴建明李杨瑞王爱勤杨柳杨丽涛广西甘蔗研究所广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室广西大学广西亚热带生物资源保护利用重点实验室中国农业科学院甘蔗研究中心

【目的】探寻赤霉素诱导甘蔗节间伸长基因表达差异的分子基础,为分离节间伸长相关基因奠定基础。【方法】以新台糖22号为材料,在伸长初期以浓度为200mg·L-1的赤霉素进行叶面喷施,以喷施清水为对照,分别提取总RNA进行等量混合,获得2种... 详细信息

【目的】探寻赤霉素诱导甘蔗节间伸长基因表达差异的分子基础,为分离节间伸长相关基因奠定基础。【方法】以新台糖22号为材料,在伸长初期以浓度为200mg·L-1的赤霉素进行叶面喷施,以喷施清水为对照,分别提取总RNA进行等量混合,获得2种不同处理的样品池,采用cDNA-SRAP技术进行基因差异表达分析。【结果】700对引物组合共扩增到约15000条、大小在50—750bp的cDNA片段。在GA3处理组和对照组中,甘蔗幼茎中的转录水平具有很大的差异,获得134条差异条带。从反向Northern杂交结果阳性的S-TDfs中选取24个片段进行克隆和序列分析,按照功能可以将24个差异表达基因片段S-TDfs(cDNA-SRAP transcriptderive dfragments)分为6类,分别为能量与代谢相关基因(4条,占总数的16.67%)、未知功能蛋白基因(6条,占总数的25%)、未知基因(10条,占总数的41.66%)、细胞壁生物合成与修饰相关基因(1条,占总数的4.17%)、信号传导相关基因(2条,占总数的8.33%)和转录因子相关基因(1条,占总数的4.17%)。【结论】cDNA-SRAP完全适用于差异表达分析,从中获得一些与甘蔗节间伸长相关的差异基因片段,这些基因可用于甘蔗节间伸长的分子机理研究。

关键词：赤霉素甘蔗 cDNA-SRAP 差异表达

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稻褐飞虱新抗源的鉴定和利用

西南农业学报 2009年第6期22卷 1581-1588页

作者：陈英之韦燕萍李孝琼陈乔孙荣科杨朗黄凤宽韦素美刘丕庆黄大辉张月雄李容柏广西亚热带资源保护利用重点实验室广西南宁530005 广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室广西南宁530007 广西农科院农业科技信息研究所广西南宁530007 广西农科院植物保护研究所广西南宁530007 广西农科院水稻研究所广西南宁530007

通过筛选抗源、抗性遗传分析，水稻品系BPHP06对褐飞虱生物型Ⅱ和孟加拉型具有高水平广谱抗性，其抗性遗传受2对显性基因控制。通过抗性基因聚合可以有效地获得高抗广谱的抗虫材料，甚至可以从4—6个抗性基因重组后代中获得1级的高抗材... 详细信息

通过筛选抗源、抗性遗传分析，水稻品系BPHP06对褐飞虱生物型Ⅱ和孟加拉型具有高水平广谱抗性，其抗性遗传受2对显性基因控制。通过抗性基因聚合可以有效地获得高抗广谱的抗虫材料，甚至可以从4—6个抗性基因重组后代中获得1级的高抗材料。同时，利用褐飞虱优异抗源BPHR96，获得一大批抗褐飞虱的创新种质。研究结果表明，BPHR96是具有重要利用价值的BPH抗性资源。抗性基因重组与聚合是培育广谱持久高抗性水稻品种的有效途径，特别是利用BPHR96与其他抗源进行抗性基因重组和聚合可为水稻育种提供更理想的抗性。

关键词：稻褐飞虱抗源 BPHR96 遗传基因重组基因聚合水稻抗性育种普通野生稻

广西来宾市五里塘普通野生稻(Oryza rufipogon Griff．)居群遗传多样性与核心种质研究

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西南农业学报 2008年第2期21卷 245-249页

作者：黄金艳陈淼梁燕理刘驰陈英之马增凤黄大辉杨新庆李丹婷莫良玉李容柏广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室广西农业科学院水稻研究所广西南宁530007 广西大学农学院

以位于北回归线穿越的广西中部西江流域的来宾市五里塘285份普通野生稻样本为材料,利用平均分布于水稻12条染色体上的24个微卫星标记进行遗传多样性分析。结果显示:24对微卫星标记引物共检测到73个等位基因,平均每对引物得到3个,平均多... 详细信息

以位于北回归线穿越的广西中部西江流域的来宾市五里塘285份普通野生稻样本为材料,利用平均分布于水稻12条染色体上的24个微卫星标记进行遗传多样性分析。结果显示:24对微卫星标记引物共检测到73个等位基因,平均每对引物得到3个,平均多态信息含量(PIC)为0.4177,平均遗传杂合度(H)为0.4245,说明这些普通野生稻材料中有丰富的遗传多样性。通过逐步聚类分析,从285份材料中选出30份作为核心种质,该核心种质包含了24个微卫星标记能够检测到的所有基因突变位点,基本上可以代表该居群的遗传多样性。研究结果对居群的种质评估、遗传多样性保护和资源利用提供了参考依据。鉴于广西来宾市五里塘普通野生稻遗传多样性较丰富,建议对该原生地的现有居群进行重点保护和利用。

关键词：普通野生稻核心种质微卫星标记遗传多样性

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改良水稻对稻褐飞虱的抗性研究

西南农业学报 2010年第4期23卷 1099-1106页

作者：陈英之陈乔孙荣科杨朗黄凤宽黄大辉韦素美张月雄刘丕庆李容柏广西亚热带生物资源保护利用重点实验室/广西大学广西南宁530005 广西农业科学院植物保护研究所广西南宁530007 广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室广西南宁530007 广西农业科学院水稻研究所广西南宁530007

稻褐飞虱是危害水稻的主要虫害之一,近年来在我国南方稻作区大发生,对我国的粮食安全构成了严重威胁。选育和利用抗虫品种是控制稻褐飞虱为害的最经济、有效的方法之一。对来源于普通野生稻的5个抗稻褐飞虱(BPH)基因进行了分子标记开发... 详细信息

稻褐飞虱是危害水稻的主要虫害之一,近年来在我国南方稻作区大发生,对我国的粮食安全构成了严重威胁。选育和利用抗虫品种是控制稻褐飞虱为害的最经济、有效的方法之一。对来源于普通野生稻的5个抗稻褐飞虱(BPH)基因进行了分子标记开发,通过杂交、回交和分子标记辅助选择转育和聚合BPH抗性基因到杂交水稻亲本中,获得了与抗BPH基因bph25(t),bph26(t),bph22(t),bph23(t),Bph24(t)紧密或较紧密连锁的SSR分子标记,这些标记的选择正确率达到60%～90%。成功地转育和聚合3～5个BPH抗性基因到5个杂交水稻亲本获得抗性基因聚合系。对其中9个抗性基因聚合系进行遗传背景分析和性状调查表明,遗传背景回复率已达90%以上,苗期和成株期(即全生育期)表现对BPH高抗性,主要经济性状与受体亲本(轮回亲本)基本没有差异。这些抗性基因聚合系在抗BPH水稻品种培育中具有重要的利用价值。研究结果为最终培育出一系列对BPH具有高抗性和持久抗性的水稻品种提供了物质基础和技术支持。

关键词：水稻普通野生稻稻褐飞虱抗性育种标记辅助选择

普通野生稻苗期耐冷性QTL的鉴定与分子定位

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中国水稻科学 2011年第1期25卷 52-58页

作者：郑加兴马增凤宋建东刘驰李永桃黄大辉韦绍丽张月雄密克黄金艳陈淼蒙姣荣李容柏陈保善广西农业科学院广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室广西南宁530007 广西大学农学院/生命科学与技术学院/广西亚热带生物资源保护利用重点实验室广西南宁530005 广西农业科学院水稻研究所广西南宁530007 南宁市第43中学广西南宁530200

以两份普通野生稻核心种质资源DP15和DP30为供体、9311为受体构建染色体片段代换系鉴定苗期耐冷性QTL;利用苗期耐冷性最强的1个代换系构建QTL作图群体,用SSR标记对其主效QTL进行定位。研究结果表明,两个抗源DP15和DP30所含的苗期耐冷性... 详细信息

以两份普通野生稻核心种质资源DP15和DP30为供体、9311为受体构建染色体片段代换系鉴定苗期耐冷性QTL;利用苗期耐冷性最强的1个代换系构建QTL作图群体,用SSR标记对其主效QTL进行定位。研究结果表明,两个抗源DP15和DP30所含的苗期耐冷性QTL的数量、位点及耐冷性效应均存在明显的差异。在基本上覆盖两个亲本全基因组的230份BC4f2代换系中共发现19个苗期耐冷性QTL,分布在水稻12条染色体上,第3和第8染色体上有比较密集的苗期耐冷性QTL分布。这19个分布于全基因组的苗期耐冷性QTL被分别分离到不同的野生稻染色体片段代换系里,效应最小的微效QTL位点所在的代换系在苗期耐冷性鉴定中的活苗率仅为8%,而效应最大的主效QTL位点所在代换系的活苗率达到74%。这个主效QTLqSCT-3-1被定位在第3染色体着丝点附近长臂上的RM15031-RM3400区间,距离最近的标记RM15040、RM1164的遗传距离为1.8 c M。

关键词：耐冷性数量性状基因座普通野生稻染色体片段代换系基因定位

225份水稻新品系对穗瘟的田间抗性初步评价

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南方农业学报 2011年第1期42卷 43-45页

作者：张月雄刘亚利李道远黄大辉刘驰马增凤李容柏广西农业科学院水稻研究所南宁530007 广西大学农学院南宁530005 广西农业科学院玉米研究所南宁530227

【目的】对以抗瘟丝苗、新银占和BE621等3个稻瘟病抗性优良品种为抗源转育的225份水稻新品系进行田间穗瘟抗性鉴定,为水稻新品种(组合)稻瘟病抗性改良奠定基础。【方法】在广西岑溪市梨木镇对255份水稻新品系进行穗瘟田间自然诱发鉴定,... 详细信息

【目的】对以抗瘟丝苗、新银占和BE621等3个稻瘟病抗性优良品种为抗源转育的225份水稻新品系进行田间穗瘟抗性鉴定,为水稻新品种(组合)稻瘟病抗性改良奠定基础。【方法】在广西岑溪市梨木镇对255份水稻新品系进行穗瘟田间自然诱发鉴定,以3个抗源亲本抗瘟丝苗、新银占和BE621为抗病对照,油占八号为感病对照。【结果】225份水稻新品系中有13份表现为1级抗性,约占5.8%;118份表现为3级抗性,达到中抗水平,约占52.4%;65份表现为5级抗性,表现为中感,约占28.9%;14份表现为7级感病,约占6.2%;15份表现为9级高感,约占6.7%。以抗瘟丝苗、新银占和BE621为抗源育成的品系中,抗性达到1～3级的品系分别约占59.6%、59.3%和51.4%。【结论】抗瘟丝苗和新银占的后代比BE621的后代更具抵抗稻瘟病危害的能力;该研究所获得的中高抗品系均能作为广西稻瘟病抗性育种材料,具有较好的应用前景。

关键词：水稻穗瘟抗性鉴定

特殊广亲和系GC13的SSR聚类及与杂种育性相关位点分析

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西南农业学报 2010年第4期23卷 991-995页

作者：农保选夏秀忠梁耀懋陆岗刘开强李丹婷广西农业科学院水稻研究所广西南宁530007

为了阐明GC13的特殊广亲和性遗传机理,从分子水平上分析GC13的籼粳聚类,通过用70对SSR引物对GC13及5个籼稻、5个粳稻和5个广亲和品种进行聚类分析。结果表明,GC13归入粳稻类型,与籼型品种及广亲和品种的亲缘关系较远,并在GC13中定位到... 详细信息

为了阐明GC13的特殊广亲和性遗传机理,从分子水平上分析GC13的籼粳聚类,通过用70对SSR引物对GC13及5个籼稻、5个粳稻和5个广亲和品种进行聚类分析。结果表明,GC13归入粳稻类型,与籼型品种及广亲和品种的亲缘关系较远,并在GC13中定位到两个与育性相关的位点,其一与第6染色体上RM225紧密连锁,根据所在染色体位置,推测此位点与S5等位,且GC13在此位点上的等位基因为S5-n;其二与第8染色体上RM408连锁,暂命名为Sg(t),GC13在此位点上携带Sg(t)-i等位基因,与IR36一致。S5位点的效应大于Sg(t)。

关键词：特殊广亲和系 GC13 杂种育性位点 SSR聚类

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10个玉米自交系主要农艺性状配合力分析

广西农业科学 2007年第5期38卷 495-498页

作者：谭华郑德波陈国品吴永升黄爱花黄开健广西玉米研究所南宁明阳530227

选用10个自选优质蛋白玉米自交系,按GriffingⅣ双列杂交模式组配成45个单交组合,通过对f1代的株高、穗位高、穗长、穗粗、籽行数、穗粒数、单株产量、百粒重和出籽率进行配合力分析,结果表明:9903、9904和9902具有较高穗部性状和产量性... 详细信息

选用10个自选优质蛋白玉米自交系,按GriffingⅣ双列杂交模式组配成45个单交组合,通过对f1代的株高、穗位高、穗长、穗粗、籽行数、穗粒数、单株产量、百粒重和出籽率进行配合力分析,结果表明:9903、9904和9902具有较高穗部性状和产量性状GCA效应优势,有较大的利用价值;9901有较优产量性状优势,可与具有较优穗位性状自交系互补利用;综合性状最差的自交系为3346和2601,需进一步改良方可利用;其余自交系可根据育种目标有目的地选择利用。

关键词：玉米自交系主要农艺性状配合力

粳稻为背景的普通野生稻单片段代换系群体的初步构建

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广西农业科学 2010年第4期41卷 297-302页

作者：宋建东黄悦悦阳海宁郑加兴马增凤刘驰黄大辉张月雄李孝琼黄金艳李容柏广西大学生命科学与技术学院南宁530005 广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室南宁530007 广西大学农学院南宁530005 广西农业科学院水稻研究所南宁530007

以粳稻日本晴(*** *** ***)为受体和轮回亲本,以广西普通野生稻核心种质DP15为供体,通过连续回交和SSR标记辅助选择的方法构建普通野生稻单片段代换系群体(Single segment substitution lines,SSSLs)。用覆盖水稻全基因组的563对SSR引... 详细信息

以粳稻日本晴(*** *** ***)为受体和轮回亲本,以广西普通野生稻核心种质DP15为供体,通过连续回交和SSR标记辅助选择的方法构建普通野生稻单片段代换系群体(Single segment substitution lines,SSSLs)。用覆盖水稻全基因组的563对SSR引物检测供体(DP15)和受体(日本晴)的多态性,从中挑选212对分布在水稻12条染色体上的多态性引物跟踪供体基因型。结果表明,在BC3f1代获得79个代换片段,这些片段基本上能相互重叠并覆盖水稻12条染色体,其中第1、第2条染色体含有的代换片段数最多,均为9个,第9、第10和第12条染色体含有的代换片段数最少且均为5个。79个代换片段长度为12.65～113.55 cM,平均长度为54.3 cM,总覆盖长度为4285.28cM,是水稻整个染色体组长度的2倍多,覆盖野生稻全基因组达98.89%。随机选取其中的6个代换株系用96个多态性引物检测其遗传背景,发现供体DNA残留率为7.3%～15.6%。今后将继续通过回交和标记辅助选择,以获得一整套覆盖普通野生稻全基因组的SSSL库,这将有助于研究稻种的起源、演变和分化以及普通野生稻的功能基因组。

关键词：普通野生稻粳稻单片段代换系标记辅助选择多态性