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氮添加对红锥不同序级细根形态和化学性状的影响

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植物生态学报 2024年第1期48卷 103-112页

作者：舒韦维杨坤马俊旭闵惠琳陈琳刘士玲黄日逸明安刚明财道田祖为中国林业科学研究院热带林业实验中心广西凭祥532600 广西友谊关森林生态系统国家定位观测研究站广西凭祥532600

细根作为植物养分获取和能量运输的重要器官,是根系中最活跃和最敏感的部分,其功能属性沿环境梯度的变化规律能够反映植物对资源的利用策略及对环境变化的适应性。该研究旨在解析不同氮(N)添加水平对红锥(Castanopsishystrix)细根形态... 详细信息

细根作为植物养分获取和能量运输的重要器官,是根系中最活跃和最敏感的部分,其功能属性沿环境梯度的变化规律能够反映植物对资源的利用策略及对环境变化的适应性。该研究旨在解析不同氮(N)添加水平对红锥(Castanopsishystrix)细根形态、化学性状的影响,探究红锥细根对短期N添加的可塑性,为阐明和预测全球气候变化背景下植物根系生理功能变化提供理论支撑。2020年1月,在红锥林内设置4个N添加水平样地:对照(CK,0 kg·hm^(-2)·a^(-1))、低氮(LN,50 kg·hm^(-2)·a^(-1))、中氮(MN,100 kg·hm^(-2)·a^(-1))、高氮(HN,150 kg·hm^(-2)·a^(-1)),每个处理3个重复。利用挖掘法挖取红锥根系,测定其1-5级根在不同N添加水平处理下细根比根长(SRL)、比表面积(SRA)、组织密度(RTD)、平均直径(RD)和化学计量的变化。结果表明,与CK相比,MN、HN显著降低了土壤pH,HN显著增加了土壤硝态氮(NO_(3)^(-)-N)和全磷(P)含量;N添加显著增加了1级细根的碳(C)含量;HN显著增加了2级细根C含量;MN和HN显著增加了1、2级细根的N含量,但显著降低了2级细根的C:N;不同N添加水平下细根的SRL、SRA、RTD和RD均无显著差异。因此短期N添加主要影响细根的元素含量及其化学计量比,而未显著影响细根的形态性状,这些结果将有助于理解南亚热带地区森林地下养分循环以及碳固存对全球环境变化的响应。

关键词：根序氮添加细根形态性状可塑性

一株对羟基苯甲酸降解菌的降解条件优化及缓解黄瓜根际对羟基苯甲酸胁迫效应

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微生物学报 2024年第7期64卷 2465-2478页

作者：吴佩佩袁秀丰丰景广西民族大学海洋与生物技术学院、广西多糖材料与改性重点实验室广西南宁530000 广西民族大学海洋与生物技术学院广西南宁530000

植物根系分泌的自毒物质如对羟基苯甲酸(p-hydroxybenzoic acid,PHBA)等酚酸类物质是造成植物连作障碍的主要因子。【目的】获得对羟基苯甲酸降解菌并提高该降解菌的降解效率。【方法】采用筛选培养基和无机盐培养基,分离到1株PHBA降解... 详细信息

植物根系分泌的自毒物质如对羟基苯甲酸(p-hydroxybenzoic acid,PHBA)等酚酸类物质是造成植物连作障碍的主要因子。【目的】获得对羟基苯甲酸降解菌并提高该降解菌的降解效率。【方法】采用筛选培养基和无机盐培养基,分离到1株PHBA降解菌株,经鉴定为橙色微杆菌(Microbacterium aurantiacum)。利用单因素试验及响应面方法对PHBA初始含量、培养温度、pH及氮源等影响菌株降解因素进行了优化。【结果】该菌株在PHBA含量为0.4 g/L,温度为30℃,pH值为8.0,氮源为硫酸铵时降解率最高,最佳降解条件为温度30.2℃,pH值8.3,PHBA浓度0.18 g/L,降解率达到100%。结合盆栽试验及高效液相色谱法得到该菌株能够有效缓解黄瓜根际PHBA胁迫效应。【结论】本研究筛选得到的菌株橙色微杆菌具有较高的PHBA降解能力,具有应用于连作障碍的潜在价值。

关键词：对羟基苯甲酸橙色微杆菌响应面优化黄瓜盆栽试验

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基于蝙蝠优化算法的智能机器人路径规划方法

沈阳工业大学学报 2024年第2期46卷 191-196页

作者：罗育林胡长江邓敦杰大连理工大学电子信息与电气工程学院辽宁大连116000 南方电网深圳数字电网研究院有限公司广东深圳518000 桂林电子科技大学海洋工程学院广西桂林541004

为了解决智能机器人规划路径时,由于未能获取机器人信号目标强度,路径规划存在适应度值低和规划时间长的问题,提出基于蝙蝠优化算法的智能机器人路径规划方法。建立机器人模型并获取机器人目标信号强度,利用粒子群算法搜索机器人移动目... 详细信息

为了解决智能机器人规划路径时,由于未能获取机器人信号目标强度,路径规划存在适应度值低和规划时间长的问题,提出基于蝙蝠优化算法的智能机器人路径规划方法。建立机器人模型并获取机器人目标信号强度,利用粒子群算法搜索机器人移动目标,结合蝙蝠算法和黄金正弦算法获取种群平均位置,通过分阶段搜索流程,实现机器人移动路径规划。结果表明:所提方法的路径规划时间仅为2.0 s,适应度达到了24.1,不可行解个数为零,该方法有效提高了适应度值,降低了规划时间,具备可行性和实际应用价值。

关键词：蝙蝠优化算法目标信号强度智能机器人路径规划规划方法黄金正弦算法粒子群算法机器人模型

老面中玉米赤霉烯酮消减乳酸菌的筛选、鉴定及机理解析

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微生物学通报 2024年第7期51卷 2521-2533页

作者：贺子元秦菲郭宝元玉万国汪洋广西科技大学生物与化学工程学院、广西糖资源绿色加工重点实验室广西柳州545006 国家粮食和物资储备局科学研究院北京100037 北京联合大学生物与化学工程学院北京100023

【背景】玉米赤霉烯酮(zearalenone,ZEN)是一种由镰刀菌属真菌产生的具有雌激素效应的真菌毒素,是世界范围内严重危害人类健康和农业安全的污染物之一。乳酸菌作为一类被公认安全(generally recognized as safe,GRAS)的食品级非致病微生... 详细信息

【背景】玉米赤霉烯酮(zearalenone,ZEN)是一种由镰刀菌属真菌产生的具有雌激素效应的真菌毒素,是世界范围内严重危害人类健康和农业安全的污染物之一。乳酸菌作为一类被公认安全(generally recognized as safe,GRAS)的食品级非致病微生物,近年研究显示其具有良好的真菌毒素消减能力,为其在保障食品安全方面带来潜在应用前景。【目的】以来自山东、河南和甘肃等7份老面样品作为研究对象,从中筛选具有消减ZEN活性的乳酸菌,探究该菌对ZEN的吸附机理。【方法】利用稀释平板涂布法获得菌株;超高效液相色谱检测具有消减ZEN活性的菌株,质谱(mass spectrometry)确定代谢产物;16S r RNA基因序列分析比对确定菌株属种,透射电镜(transmission electron microscopy,SEM)观察菌株形态;分析不同初始毒素浓度及菌体浓度下的吸附效果,对其进行动力学模型拟合;定位吸附位点并通过傅里叶变换红外光谱(Fourier transform infrared spectroscopy,FTIR)分析确定菌株中参与吸附ZEN的官能团,阐明对ZEN的吸附机理。【结果】初步筛选获得63株乳酸菌,从中复筛获得3株具有消减ZEN活性的乳酸菌,经鉴定:菌株6-8和菌株18-2为短促生乳杆菌(Levilactobacillus brevis),菌株12-6为热带醋杆菌(Acetobacter tropicalis)。两株短促生乳杆菌具有降解效果,在ZEN浓度为10 mg/L的条件下,48 h内降解率分别达到85.5%和87.3%,质谱结果显示降解产物为α-ZEL;另一株具有吸附效果,在菌株浓度为4.26×10^(10)CFU/m L、ZEN浓度为10 mg/L条件下,20 min内吸附率达到62.9%,灭活后吸附率上升20%。吸附过程同时符合准一级(pseudo-first-order)动力学及准二级(pseudo-second-order)动力学模型。傅里叶变换红外光谱结果显示菌株12-6的主要吸附位点为细胞壁上的肽聚糖与磷壁酸分子,羟基、次甲基、羧基和酰胺基等作为主要官能团参与吸附。【结论】菌株6-8和菌株18-2对ZEN有较强的降解能力;菌株12-6对ZEN有较强的吸附能力。其吸附动力学符合准一级及准二级动力学模型,吸附位点为细胞壁上的磷壁酸及肽聚糖分子。本研究为乳酸菌清除食品和饲料中有害物质的应用提供了理论基础。

关键词：玉米赤霉烯酮乳酸菌吸附官能团

肝细胞癌中UBE2S互作蛋白的筛选及预后模型构建

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吉林大学学报（医学版） 2024年第1期50卷 168-177页

作者：王小燕张豪郭泽皓曹骏莫之婧桂林医学院智能医学与生物技术学院实验教学中心广西桂林541199 桂林医学院广西高校生物化学与分子生物学重点实验室广西桂林541199 桂林医学院智能医学与生物技术学院生物化学教研室广西桂林541199

目的:筛选泛素结合酶E2S (UBE2S)互作蛋白并构建肝细胞癌(HCC)基于UBE2S互作蛋白的预后模型(UIPM),分析UIPM评估HCC患者预后的价值。方法:采用免疫共沉淀(Co-IP)技术筛选与Flag-UBE2S结合的蛋白复合体,经十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶... 详细信息

目的:筛选泛素结合酶E2S (UBE2S)互作蛋白并构建肝细胞癌(HCC)基于UBE2S互作蛋白的预后模型(UIPM),分析UIPM评估HCC患者预后的价值。方法:采用免疫共沉淀(Co-IP)技术筛选与Flag-UBE2S结合的蛋白复合体,经十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDSPAGE)和Western blotting法验证后,采用液相色谱-质谱联用仪(LC-MS)分析鉴定UBE2S互作蛋白,并对互作蛋白进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。采用R软件survival包筛选癌症基因组图谱(TGGA)中HCC预后相关蛋白与UBE2S互作蛋白取交集,通过LASSO回归分析从交集蛋白中获取关键蛋白构建UIPM,并建立预后模型风险评分公式,按照风险评分的中位值将TGGA中HCC患者分为高风险组和低风险组,通过受试者工作特征曲线(ROC)评估UIPM的预测准确性,并采用国际癌症基因组联盟(ICGC)数据库对UIPM预测准确性进行再次验证。采用单因素和多因素Cox回归分析评估UIPM风险评分是否为HCC的预后独立危险因素,并进一步构建列线图模型。结果:Co-IP联合LC-MS分析得到97个UBE2S互作蛋白。GO功能和KEGG信号通路富集分析,互作蛋白主要与半胱氨酸型内肽酶活性、氧化应激和细胞死亡有密切关联。TCGA筛选出5 163个HCC预后相关蛋白,与UBE2S互作蛋白取交集,获得40个预后相关互作蛋白,LASSO回归分析得到7个关键蛋白,包括UBE2S、热休克蛋白家族A成员8(HSPA8)、异质性胞核核糖核蛋白H1(HNRNPH1)、含TCP1伴侣蛋白亚基3 (CCT3)、真核翻译起始因子2亚基1 (EIF2S1)、活化蛋白C激酶1受体(RACK1)和肌动蛋白相关蛋白2/3复合体亚基4(ARPC4),并构建了UIPM,高和低风险组HCC患者生存率存比较差异有统计学意义(P<0.05)。ROC曲线,UIPM预测HCC患者1、2和3年UIPM风险评分的ROC曲线下面积(AUC)值均大于0.7,表明预测模型准确度较高。ICGC数据库数据也证实UIPM预测准确度较高。单因素和多因素Cox回归分析,UIPM风险评分是HCC患者的独立预后危险因素(P<0.05)。列线图预测HCC患者生存率与实际生存率之间有较好的一致性。结论:97个互作蛋白与UBE2S相互作用,可能通过氧化应激和铁死亡相关通路的失调促进HCC发生发展。UIPM风险评分是HCC预后的独立危险因素,可以用于预测HCC患者预后。而UBE2S、HSPA8、HNRNPH1、CCT3、EIF2S1、RACK1和ARPC4有望成为HCC新的生物标志物和治疗靶点。

关键词：泛素结合酶E2S 肝细胞癌免疫共沉淀液相色谱-质谱联用仪预后分析

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越南金花茶叶绿体基因组分析

生物工程学报 2024年第1期40卷 280-291页

作者：张进邓永彪赵博桂林医学院药学院生药学教研室广西桂林541199

本研究通过高通量测序技术对越南金花茶(Camellia insularis Orel&Curry)的叶绿体(chloroplast,cp)基因组进行了测序。结果显示,越南金花茶叶绿体基因组长度为156882bp,包含132个基因,其中,88个编码蛋白质,36个编码tRNA,8个编码rRNA。... 详细信息

本研究通过高通量测序技术对越南金花茶(Camellia insularis Orel&Curry)的叶绿体(chloroplast,cp)基因组进行了测序。结果显示,越南金花茶叶绿体基因组长度为156882bp,包含132个基因,其中,88个编码蛋白质,36个编码tRNA,8个编码rRNA。密码子偏好性分析显示,编码亮氨酸的密码子数量最多,且第三位密码子显示出了较高的A/U偏好。此外,共鉴定出了67个简单重复序列(simple sequence repeats,SSR),发现越南金花茶SSR偏好使用A和T碱基。除了少数可变区域之外,越南金花茶与其近缘物种的叶绿体基因组反向重复(inverted repeat,IR)边界区域相当保守。系统发育分析表明,越南金花茶与云南金花茶(Camellia fascicularis)亲缘关系最近。金花茶是基因工程培育黄色山茶花的重要材料,本研究为叶绿体工程提供了基本的遗传信息,为深入研究金花茶组植物的进化、物种鉴定和基因组育种研究提供了宝贵的资源。

关键词：越南金花茶叶绿体基因组结构特征系统发育分析

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增材制造自支撑设计综述

中国激光 2024年第10期51卷 114-137页

作者：魏伟吴海鑫吴晓萱吴金斗龙雨广西大学省部共建特色金属材料与组合结构全寿命安全国家重点实验室广西南宁530004 广西大学机械工程学院激光智能制造与精密加工研究所广西南宁530004

增材制造(AM)的零件若存在悬垂部件,则往往需要添加额外的支撑结构,这不仅会影响打印效率,而且拆除支撑也会引发新的问题。结构自支撑设计能使增材制造摆脱对支撑结构的依赖,现已成为国内外的研究热点。本文首先总结了增材制造结构自支... 详细信息

增材制造(AM)的零件若存在悬垂部件,则往往需要添加额外的支撑结构,这不仅会影响打印效率,而且拆除支撑也会引发新的问题。结构自支撑设计能使增材制造摆脱对支撑结构的依赖,现已成为国内外的研究热点。本文首先总结了增材制造结构自支撑设计的原理,接着综述了增材制造零件整体结构自支撑设计的研究进展以及增材制造填充结构自支撑设计的研究进展。其中,根据不同的结构优化方式,将增材制造零件整体结构自支撑设计进一步划分为基于连续体结构拓扑优化、离散结构拓扑优化和形状优化的结构自支撑设计,并分析了各类优化方法的优缺点。最后,讨论了提升计算效率以及提升结构性能的解决方案,并对未来的应用场景以及未来的研究重点进行了展望。

关键词：增材制造结构优化拓扑优化填充结构结构自支撑

基于CLIP和交叉注意力的多模态情感分析模型

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郑州大学学报（工学版） 2024年第2期45卷 42-50页

作者：陈燕赖宇斌肖澳廖宇翔陈宁江广西大学计算机与电子信息学院广西南宁530000 广西大学广西多媒体通信与网络技术重点实验室广西南宁530000

针对多模态情感分析中存在的标注数据量少、模态间融合不充分以及信息冗余等问题,提出了一种基于对比语言-图片训练(CLIP)和交叉注意力(CA)的多模态情感分析(MSA)模型CLIP-CA-MSA。首先,该模型使用CLIP预训练的BERT模型、PIFT模型来提... 详细信息

针对多模态情感分析中存在的标注数据量少、模态间融合不充分以及信息冗余等问题,提出了一种基于对比语言-图片训练(CLIP)和交叉注意力(CA)的多模态情感分析(MSA)模型CLIP-CA-MSA。首先,该模型使用CLIP预训练的BERT模型、PIFT模型来提取视频特征向量与文本特征;其次,使用交叉注意力机制将图像特征向量和文本特征向量进行交互,以加强不同模态之间的信息传递;最后,利用不确定性损失特征融合后计算输出最终的情感分类结果。实验结果表明:该模型比其他多模态模型准确率提高5百分点至14百分点,F1值提高3百分点至12百分点,验证了该模型的优越性,并使用消融实验验证该模型各模块的有效性。该模型能够有效地利用多模态数据的互补性和相关性,同时利用不确定性损失来提高模型的鲁棒性和泛化能力。

关键词：情感分析多模态学习交叉注意力 CLIP模型 Transformer 特征融合

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内质网应激蛋白激酶RNA样ER激酶(PERK)通路对肝星状细胞激活及Ⅰ型胶原蛋白表达的影响

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临床肝胆病杂志 2024年第5期40卷 968-974页

作者：黎凤炎刘泽峰夏雨艳王文娟李琪唐利瑕张国右江民族医学院研究生院广西百色533000 广西壮族自治区人民医院消化内科南宁530021 中山大学附属第一医院广西医院消化内科南宁530022

目的探讨内质网应激蛋白激酶RNA样ER激酶(PERK)/真核生物翻译起始因子2α(eIF2α)信号通路对肝星状细胞(HSC)活化的影响。方法收集11例肝穿刺病理提示S1~S4肝纤维化患者和9例肝血管瘤、肝腺瘤患者术后周围正常肝组织病理切片,进一步行... 详细信息

目的探讨内质网应激蛋白激酶RNA样ER激酶(PERK)/真核生物翻译起始因子2α(eIF2α)信号通路对肝星状细胞(HSC)活化的影响。方法收集11例肝穿刺病理提示S1~S4肝纤维化患者和9例肝血管瘤、肝腺瘤患者术后周围正常肝组织病理切片,进一步行组织免疫组化检测PERK、eIF2α、C/EBP环磷酸腺苷反应元件结合转录因子同源蛋白(CHOP)表达情况;使用不同浓度的内质网应激诱导剂毒胡萝卜素(0、125、250、500、1000 nmol/L)作用于人HSC-LX2,使用qRT-PCR检测PERK mRNA及Western Blot检测PERK、肌醇需要酶1(IRE1)、激活转录因子6(ATF6)、CHOP及α平滑肌肌动蛋白(α-SMA)表达水平。使用慢病毒转染构建PERK稳定过表达LX-2组及对照组,并通过qRT-PCR检测PERK、eIF2α、α-SMA mRNA,Western Blot检测PERK、p-eIF2α、α-SMA蛋白表达,免疫荧光检测胶Ⅰ型原蛋白(COL1A1)表达。符合正态分布的计量资料两组间比较采用成组t检验,多组间比较采用单因素方差分析,进一步两两比较采用LSD-t检验;不符合正态分布的计数资料,两组间比较采用Mann-Whitney U秩和检验。结果与正常肝组织相比,肝纤维化患者肝组织中PERK、eIF2α及CHOP表达升高,差异均有统计学意义(Z=−3.56、t=−5.75、Z=−3.52,P值均<0.001)。不同浓度毒胡萝卜素作用后,与溶媒组相比,内质网相关蛋白PERK、CHOP、IRE1、ATF6及α-SMA蛋白表达显著升高(P值均<0.05)。与对照空载慢病毒组相比,PERK稳定过表达组PERK mRNA、eIF2αmRNA、α-SMA mRNA表达及PERK、p-eIF2α、α-SMA蛋白表达明显升高(P值均<0.05)。细胞免疫荧光结果提示,PERK过表达组COL1A1表达升高(P<0.05)。结论PERK过表达可诱导LX-2细胞α-SMA、胶原蛋白COL1A1表达,提示PERK信号通路可能是HSC活化的重要机制之一。

关键词：内质网应激真核细胞起始因子2 肝星状细胞胶原Ⅰ型

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