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人支气管上皮样细胞中苯并[a]芘代谢物-DNA加合物图谱:基于染色质免疫共沉淀测序技术

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环境与职业医学 2024年第3期41卷 323-329页

作者：冀婷玉曹彬吕懿佟晓敏孙宏宇郑金平山西医科大学公共卫生学院卫生毒理学教研室山西太原030001 长治医学院公共卫生与预防医学系山西长治046000

[背景]苯并[a]芘(BaP)的活性代谢产物7,8-二羟-9,10-环氧苯并[a]芘(BPDE)可与DNA加合,但BPDE-DNA加合物图谱尚不明确。[目的]采用染色质免疫共沉淀测序技术(ChIP-Seq),在全基因组水平上鉴定BPDE加合位点分布及加合基因,为深入研究BaP的... 详细信息

[背景]苯并[a]芘(BaP)的活性代谢产物7,8-二羟-9,10-环氧苯并[a]芘(BPDE)可与DNA加合,但BPDE-DNA加合物图谱尚不明确。[目的]采用染色质免疫共沉淀测序技术(ChIP-Seq),在全基因组水平上鉴定BPDE加合位点分布及加合基因,为深入研究BaP的毒作用机制提供依据。[方法]人支气管上皮样细胞16HBE培养至第四代达对数生长期。收获细胞并加入染色质免疫共沉淀裂解缓冲液,将裂解产物等分为实验组和对照组,实验组添加终浓度20μmol·L^(–1)的BPDE溶液,对照组添加相同体积的二甲基亚砜溶液,在37℃环境下孵育24 h。超声获得100~500 bp的染色质小片段。使用BPDE特异性抗体(anti-BPDE 8E11)富集与BPDE加合的DNA片段,高通量测序检测BPDE加合位点,使用MEME和DREME软件对前1000个峰序列进行模体分析,注释BPDE在全基因组水平的加合靶基因,并通过生物信息学技术对BPDE加合靶基因进行基因本体论(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。[结果]高通量测序共检测出842个BPDE结合位点,在各染色体上均有分布。BPDE可以与基因编码区和非编码区共价结合,73.9%的结合位点分布在基因间区,19.6%分布在内含子区,上游2千碱基区域、外显子区、下游2千碱基区域及5′非翻译区也有少量分布。对前1000个峰序列进行分析,寻找到4条可靠的模体,发现富含鸟嘌呤(G)和腺嘌呤(A)的位点易于结合。对结合位点进行富集,共鉴定出199个BPDE加合靶基因,大多分布在1号、5号、7号、12号、17号和X染色体上。GO分析显示,靶基因主要富集于核酸和蛋白质结合,参与调节催化活性、转运活性、翻译延伸因子活性,在细胞分裂、分化、运动、物质运输和信息传递方面发挥重要作用。KEGG分析显示靶基因主要富集于心血管疾病、癌症、免疫炎症反应等相关通路。[结论]利用ChIP-Seq在全基因组水平上共鉴定出199个BPDE加合靶基因,主要影响细胞分裂、分化、运动、物质运输和信息传递等生物学功能,与心血管疾病、肿瘤及免疫炎症反应密切相关。

关键词： 7 8-二羟-9 10-环氧苯并[a]芘人支气管上皮样细胞染色质免疫共沉淀测序 DNA加合物生物信息学

基于移动Agent的无线电力移动终端身份认证

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吉林大学学报（工学版） 2024年第3期54卷 815-820页

作者：郑礼闫光辉严天峰兰州交通大学电子与信息工程学院兰州730070 兰州交通大学甘肃省无线电监测及定位行业技术中心兰州730070

为防止大数据环境下信息被盗取,提出了基于移动Agent的无线电力移动终端身份认证方法。利用移动Agent管理电力移动终端的分布式密钥,在移动Agent中完成异构网络数据和资源的互换,获取节点矩阵表得到用户所需的密钥,构建了基于Agent的系... 详细信息

为防止大数据环境下信息被盗取,提出了基于移动Agent的无线电力移动终端身份认证方法。利用移动Agent管理电力移动终端的分布式密钥,在移动Agent中完成异构网络数据和资源的互换,获取节点矩阵表得到用户所需的密钥,构建了基于Agent的系统成员信任模型,确保移动终端身份认证处于良好运行环境中。根据移动Agent得到的用户访问结果,在不可逆计算法下生成用户访问动态密钥,利用得到的认证码将用户认证信息二次加密处理,实现无线电力移动终端身份认证。实验结果表明,本文方法在相同加密程度中具有密钥短、身份认证准确性高以及认证计算量小的优点。

关键词：移动Agent 移动终端身份认证动态密钥信任模型

基于轻量化高效层聚合网络的黄花成熟度检测方法

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农业机械学报 2024年第2期55卷 268-277页

作者：吴利刚陈乐周倩史建华马宇波山西大同大学机电工程学院大同037003 山西大同大学煤炭工程学院大同037003 山西大同大学商学院大同037003 山西大同大学物理与电子科学学院大同037003

针对黄花传统人工识别效率低,辨识标准不统一的问题,提出基于轻量化和高效层聚合过渡网络的黄花成熟度识别方法LSEB YOLO v7。首先,引入轻量化卷积对高效层聚合网络和过渡模块进行轻量化处理,减少模型计算量。其次,在特征提取与特征融... 详细信息

针对黄花传统人工识别效率低,辨识标准不统一的问题,提出基于轻量化和高效层聚合过渡网络的黄花成熟度识别方法LSEB YOLO v7。首先,引入轻量化卷积对高效层聚合网络和过渡模块进行轻量化处理,减少模型计算量。其次,在特征提取与特征融合网络之间增加通道注意力机制,提升模型检测性能。最后,在特征融合网络中,优化通道信息融合方式,使用双向特征金字塔网络替换Concatenate,增加信息融合通道,持续提升模型性能。实验结果表明:与原始模型相比,在黄花成熟度检测中,改进后的LSEB YOLO v7模型参数量和浮点运算量分别减少约2.0×10^(6)和7.7×10^(9)。训练时长由8.025 h降低至7.746 h,模型体积压缩约4 MB。同时,训练精确率和召回率分别提升约0.64个百分点和0.14个百分点,mAP@0.5和mAP@0.5:0.95分别提升约1.84个百分点和1.02个百分点。此外,调和均值性能保持不变,均为84.00%。LSEB YOLO v7算法可均衡模型复杂性与性能,为黄花成熟度检测和智能化采摘设备提供技术支持。

关键词：黄花成熟度深度学习注意力机制信息融合机制轻量化

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高压均质化改性竹笋膳食纤维对虾糜凝胶特性及化学作用力的影响

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食品科学 2024年第11期45卷 192-200页

作者：刘欣姜鹏飞傅宝尚祁立波杨晶琦尚珊大连工业大学食品学院国家海洋食品工程技术研究中心海洋食品加工与安全控制全国重点实验室辽宁大连116034 赣州市全标生物科技有限公司江西赣州360700

为提高竹笋膳食纤维(bamboo shoot dietary fiber,BSDF)的利用率,采用高压均质法对其进行改性处理,探究不同高压均质条件(30、40、50 MPa和60 MPa)对BSDF水合性质和结晶度的影响以及添加高压均质化改性BSDF对虾糜热诱导凝胶强度、持水... 详细信息

为提高竹笋膳食纤维(bamboo shoot dietary fiber,BSDF)的利用率,采用高压均质法对其进行改性处理,探究不同高压均质条件(30、40、50 MPa和60 MPa)对BSDF水合性质和结晶度的影响以及添加高压均质化改性BSDF对虾糜热诱导凝胶强度、持水力、蛋白质二级结构、化学作用力及微观结构的影响。结果显示BSDF的持水力、持油力和膨胀力与压力总体呈显著正相关(P10.04%、17.87%、28.76%和28.49%;持水力分别增加了3.48%、5.74%、13.04%和12.70%。傅里叶变换红外光谱分析结果表明,添加改性BSDF虾糜凝胶的α-螺旋和无规卷曲含量降低,而β-折叠和β-转角含量显著增加,虾糜凝胶蛋白质二级结构更加稳定。化学作用力分析结果表明,改性BSDF促进了虾糜凝胶的疏水相互作用和二硫键的形成,其中添加50 MPa和60 MPa BSDF虾糜组上述作用力强于其他组别。扫描电镜观察结果表明,60 MPa组虾糜凝胶具有更加均匀致密的三维网络结构。综上,高压均质处理可提高BSDF的水合性质并降低其结晶度,显著提高虾糜的凝胶特性;本研究可为促进BSDF在虾糜凝胶体系中的应用提供理论基础。

关键词：竹笋膳食纤维高压均质凝胶特性化学作用力蛋白质二级结构微观结构

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基于博弈论和云模型的滑坡危险性评价

自然灾害学报 2024年第1期33卷 186-196页

作者：余岭燕郭荣昌张蕊兰州交通大学自动化与电气工程学院甘肃兰州730070

针对铁路沿线滑坡危险性评价过程中的不确定性问题,引入博弈论和云模型评价方法,同时采用汉明距离验证相似度比较结果,对铁路沿线上某一滑坡进行滑坡危险性评价。首先选取降雨、地层岩性和土地利用类型等12项评价指标建立危险性评价指... 详细信息

针对铁路沿线滑坡危险性评价过程中的不确定性问题,引入博弈论和云模型评价方法,同时采用汉明距离验证相似度比较结果,对铁路沿线上某一滑坡进行滑坡危险性评价。首先选取降雨、地层岩性和土地利用类型等12项评价指标建立危险性评价指标体系,其次采用改进CRITIC法、变异系数法、G1法和优序图法确定基础权重,然后引入博弈论思想计算最优权重,并根据各评价指标的云模型和最优权重确定综合评价云,最后采用汉明距离验证综合评价云与评价标准云的相似度对比结果,根据最大相似度原则确定滑坡危险性等级,基于ArcGIS生成研究区滑坡危险性分布图。结果表明:滑坡危险性等级为四级,与实际情况基本一致,基于博弈论和云模型的滑坡危险性评价模型能够准确反映滑坡的等级;利用云模型实现定性与定量问题的转换,使滑坡危险性等级更直观,对滑坡灾害风险管理具有一定的参考价值。

关键词：滑坡博弈论云模型汉明距离危险性评价

基于YOLOv8-ABW的黄花成熟度检测方法

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农业工程学报 2024年第13期40卷 262-272页

作者：吴利刚陈乐刘泽鹏武晔秋马宇波史建华山西大同大学机电工程学院大同037003 山西大同大学煤炭工程学院大同037003 山西大同大学建筑与测绘工程学院大同037003 山西大同大学物理与电子科学学院大同037003

为实现黄花成熟度的快速、高精度识别,针对其相似特征识别精确度低以及相互遮挡检测困难的问题,提出一种基于YOLOv8-ABW的黄花成熟度检测方法。该研究在特征提取网络中加入结合注意力机制的尺度特征交互机制(attention based intra-scal... 详细信息

为实现黄花成熟度的快速、高精度识别,针对其相似特征识别精确度低以及相互遮挡检测困难的问题,提出一种基于YOLOv8-ABW的黄花成熟度检测方法。该研究在特征提取网络中加入结合注意力机制的尺度特征交互机制(attention based intra-scale feature interaction, AIFI),更好地提取黄花特征信息,提高检测的精确度。在特征融合网络中,进一步采用加权的双向特征金字塔特征融合网络(bidirectional feature pyramid network, Bi FPN),实现更高层次的跨通道特征融合,有效减少通道中的特征冗余。此外使用WIoUv3作为损失函数,聚焦普通质量的锚框,提高模型的定位性能。试验结果表明:YOLOv8-ABW模型检测精确度为82.32%,召回率为83.71%,平均精度均值mAP@0.5和m AP@0.5:0.95分别为88.44%和74.84%,调和均值提升至0.86,实时检测速度为214.5帧/s。与YOLOv8相比,YOLOv8-ABW的精确度提高1.41个百分点,召回率提高0.75个百分点,mAP@0.5和m AP@0.5:0.95分别提升1.54个百分点和1.42个百分点。对比RT-DETR、YOLOv3、YOLOv5、YOLOv7模型,YOLOv8-ABW参数量最少,仅为3.65×10~6,且模型浮点运算量比YOLOv7少96.3 G。体现出YOLOv8-ABW模型能够在黄花成熟度检测中平衡检测精确度和检测速度,综合性能最佳,为黄花智能化实时采摘研究提供技术支持。

关键词：机器学习模型 YOLOv8 黄花深度学习成熟度检测

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基于转录组测序的变应性鼻炎研究进展

临床耳鼻咽喉头颈外科杂志 2024年第6期38卷 556-560页

作者：张皓翔王艳杰程冯丽安云芳赵长青山西医科大学第二附属医院耳鼻咽喉头颈外科山西省气道炎性疾病神经免疫研究省级重点培育实验室太原030001

目的:传统研究变应性鼻炎(allergic rhinitis,AR)主要通过动物模型和分子生物学方法研究,转录组测序技术的诞生推进了AR基因层面的探索。近年来重点聚焦于常见RNA在AR中作用的研究,提示AR的生物信息学分析已取得突破性进展。本文拟综述A... 详细信息

目的:传统研究变应性鼻炎(allergic rhinitis,AR)主要通过动物模型和分子生物学方法研究,转录组测序技术的诞生推进了AR基因层面的探索。近年来重点聚焦于常见RNA在AR中作用的研究,提示AR的生物信息学分析已取得突破性进展。本文拟综述AR研究进展、转录组测序技术的发展、转录组测序在AR中的应用等,以期为临床挖掘AR潜在的药物靶点,为精准治疗提供参考。

关键词：变应性鼻炎转录组测序生物信息学分析

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鼻腔鼻窦NUT癌的临床诊治研究进展

中华耳鼻咽喉头颈外科杂志 2024年第1期59卷 86-93页

作者：程冯丽冀永进张皓翔付思睿赵长青山西医科大学第二医院耳鼻咽喉头颈外科太原030001 山西省气道炎性疾病神经免疫研究省级重点培育实验室太原030001

鼻腔鼻窦睾丸核蛋白(nuclear protein in testis,NUT)癌临床相对罕见,且侵袭性高、致死性强。该病以中青年多见,好发于头颈部,其半数以上者原发于鼻腔鼻窦。因鼻腔鼻窦NUT癌缺乏特异性临床表现及典型组织学特征,故早期诊断困难,漏诊和... 详细信息

鼻腔鼻窦睾丸核蛋白(nuclear protein in testis,NUT)癌临床相对罕见,且侵袭性高、致死性强。该病以中青年多见,好发于头颈部,其半数以上者原发于鼻腔鼻窦。因鼻腔鼻窦NUT癌缺乏特异性临床表现及典型组织学特征,故早期诊断困难,漏诊和误诊率较高。随着分子免疫学及高通量测序技术的革新,该病的检出率呈现上升趋势,但仍缺乏行之有效的治疗手段。如想达到较为理想的治疗效果,需采用多学科整合诊治模式,未来基因靶向药物及特异性免疫制剂的研发与应用有望更新疾病指南。基于此,本文重点归纳了鼻腔鼻窦NUT癌的疾病特点、鉴别诊断及治疗新进展,以期提升耳鼻咽喉科医生的整体诊疗水平,从而更好地指导临床实践。

关键词：耳鼻咽喉科鼻腔鼻窦疾病特点分子免疫学误诊率组织学特征临床实践高通量测序技术

免疫检查点抑制剂治疗错配修复缺陷/微卫星高度不稳定型胃癌的研究进展

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中国肿瘤临床 2024年第11期51卷 580-584页

作者：刘清华汪浩浩陈庆杰罗瑞英罗长江兰州大学第二医院普外科兰州市730000

错配修复缺陷/微卫星高度不稳定型(mismatch repair-deficient/microsatellite instability-high,dMMR/MSI-H)胃癌是胃癌的一个特殊分子亚型,其因独特的免疫微环境和高突变负荷对免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors,ICIs)高度敏感。ICIs治疗dMMR/MSI-H胃癌在多项临床研究中展现出较好的效果,但仍存在原发耐药与继发耐药的挑战。如何在这一特殊分子亚型的胃癌中选择合适的ICIs和克服耐药性是临床上亟需解决的问题。本文对ICIs的作用机制,及其治疗dMMR/MSI-H胃癌的研究进展和存在的耐药性挑战进行综述,以期为临床治疗提供参考。

关键词：错配修复缺陷/微卫星高度不稳定型胃癌免疫检查点抑制剂耐药性